Investigando Mudanças Cerebrais no Transtorno do Espectro Autista
Pesquisas mostram diferenças chave nos axônios no autismo usando técnicas de aprendizado de máquina.
Basilis Zikopoulos, A. Yazdanbakhsh, K. Dang, K. Kuang, T. Lian, X. Liu, S. Xie
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Índice
- Principais Descobertas nas Mudanças nos Axônios
- O Papel da Substância Branca
- Aprendizado de Máquina como Solução
- Focando no Cortex Cingulado Anterior
- Coleta e Análise de Dados
- Preparando as Imagens para o Aprendizado de Máquina
- Treinando a Rede Neural Profunda
- Avaliando o Desempenho do Modelo
- Usando Mapas de Sensibilidade para Insights
- Imagens DeepDream para Visualizar Características
- Descobertas e Insights
- Desafios e Direções Futuras
- Conclusão
- Fonte original
- Ligações de referência
O Transtorno do Espectro Autista (TEA) impacta como as conexões neurais e a comunicação funcionam no cérebro. Estudos mostraram que há mudanças em áreas específicas do cérebro relacionadas a essa condição. Essas mudanças incluem diferenças nas estruturas chamadas Axônios, que são como fios que transportam sinais por todo o cérebro.
Principais Descobertas nas Mudanças nos Axônios
Pesquisas mostram que em pessoas com TEA, muitas vezes há um aumento no número de axônios finos, enquanto os axônios mais grossos tendem a ser menos densos. Isso pode causar problemas na forma como os sinais são transmitidos no cérebro. Outras mudanças relatadas incluem ramificações excessivas dos axônios devido a proteínas específicas, afinamento da camada protetora em torno dos axônios chamada mielina e variações nos caminhos dos axônios.
Essas diferenças podem afetar a rapidez com que os sinais viajam e quão fortes são as conexões, impactando as funções e comunicações gerais do cérebro. A localização e o tamanho desses axônios também podem dar pistas sobre como eles se conectam a outras áreas do cérebro.
O Papel da Substância Branca
A substância branca no cérebro é importante para as conexões. A substância branca superficial (SBS) contém principalmente conexões de curto alcance, enquanto a substância branca profunda (SBP) contém conexões de longo alcance. Os axônios na SBP tendem a ser mais grossos do que os encontrados na SBS.
Estudar a substância branca é fundamental porque pode nos ajudar a entender os caminhos do cérebro e como eles podem ser interrompidos no autismo. Métodos tradicionais para analisar esses axônios são demorados e requerem conhecimento especializado, tornando-os desafiadores para estudos maiores destinados a identificar problemas no TEA.
Aprendizado de Máquina como Solução
O aprendizado de máquina pode oferecer uma nova forma de analisar imagens detalhadas de axônios mielinizados na substância branca. Redes neurais profundas (RNDs) são um tipo de ferramenta de aprendizado de máquina que tem sido eficaz na classificação de imagens. Elas podem ajudar a distinguir entre imagens de indivíduos neurotípicos e aqueles com TEA.
Para este estudo, uma RND conhecida chamada GoogLeNet foi utilizada. Ela ofereceu uma estrutura para personalizar um modelo que poderia diferenciar imagens de alta resolução de axônios nos cérebros de indivíduos com e sem TEA.
Focando no Cortex Cingulado Anterior
O foco foi na substância branca abaixo do córtex cingulado anterior (CCA), uma parte do cérebro envolvida em atenção, emoções e interações sociais-áreas que costumam ser impactadas no autismo. O CCA mostra diferenças de atividade notáveis em pessoas com TEA, levando os pesquisadores a pensar que examinar sua substância branca poderia revelar informações importantes sobre o transtorno.
Coleta e Análise de Dados
Para criar o modelo, os pesquisadores usaram grandes conjuntos de dados de imagens de amostras do cérebro. Eles prepararam dois tipos de imagens: uma utilizando Microscopia Eletrônica, que fornece imagens estruturais detalhadas, e outra utilizando microscopia de luz. As amostras de tecido vêm de cérebros post-mortem de indivíduos neurotípicos e aqueles com autismo.
As amostras foram processadas e fotografadas de uma maneira específica para garantir que as características fossem capturadas com precisão. O objetivo era criar um conjunto de dados que pudesse ser usado para treinar o modelo de aprendizado de máquina de forma eficiente.
Preparando as Imagens para o Aprendizado de Máquina
Para otimizar o conjunto de dados, duas maneiras foram aplicadas. A primeira envolveu cortar as imagens originais em seções menores. Assim, o modelo poderia aprender a partir de várias partes de cada imagem. A segunda técnica usou uma janela deslizante para criar seções sobrepostas, aumentando o número de imagens disponíveis para o treinamento.
Antes de serem inseridas no modelo, as imagens passaram por um processamento adicional para melhorar a qualidade e garantir consistência. Isso incluiu ajustes de contraste e normalização dos valores, facilitando para o modelo aprender de forma eficaz.
Treinando a Rede Neural Profunda
Para garantir resultados confiáveis, os pesquisadores dividiram as imagens em diferentes conjuntos para treinamento, validação e teste. Eles também usaram técnicas para balancear o número de imagens de cada classe para melhorar a capacidade do modelo de aprender.
Foi utilizado o aprendizado por transferência, usando um modelo pré-treinado para ajudar com o novo conjunto de dados, melhorando a eficiência e a precisão. Diferentes modelos pré-treinados foram testados, e os mais eficazes foram ajustados para a tarefa específica de classificar as imagens dos axônios.
Avaliando o Desempenho do Modelo
Vários métodos foram usados para avaliar o quão bem o modelo se saiu. Técnicas de validação cruzada garantiram que o modelo aprendesse de forma eficaz com diferentes grupos de imagens. Matrizes de confusão ajudaram a visualizar o quão bem o modelo classificou diferentes classes e identificar áreas para melhorias.
O estudo também calculou métricas de precisão e recall, oferecendo insights mais profundos sobre o desempenho do modelo. A área sob a curva da característica de operação do receptor (AUC) foi outra medida importante para avaliar a eficácia geral.
Usando Mapas de Sensibilidade para Insights
Para analisar ainda mais os resultados, mapas de sensibilidade foram gerados para destacar quais partes das imagens influenciaram as decisões do modelo. Esses mapas ajudaram a identificar características específicas que contribuíram para classificações corretas e incorretas, oferecendo pistas sobre as diferenças subjacentes na estrutura do cérebro entre indivíduos neurotípicos e aqueles com TEA.
Imagens DeepDream para Visualizar Características
Imagens DeepDream foram criadas para ilustrar as características aprendidas pelo modelo. Essas imagens ajudam a visualizar padrões e características que são importantes para as tarefas de classificação. Ao realçar detalhes específicos das imagens, os pesquisadores puderam ver características distintas que ajudaram a distinguir entre diferentes classes.
Descobertas e Insights
Os resultados mostraram que o modelo poderia classificar imagens dos grupos TEA e neurotípicos com alta precisão. No entanto, distinguir entre diferentes profundidades da substância branca foi mais desafiador. A análise destacou a dificuldade em classificar corretamente a substância branca superficial em indivíduos com TEA, indicando uma variabilidade significativa nessas regiões.
As descobertas apontaram para uma mistura de áreas da substância branca nos cérebros de pessoas com TEA. Isso sugere que as diferenças estruturais nos axônios podem ser mais pronunciadas abaixo do CCA, mostrando mudanças generalizadas que impactam como o cérebro se comunica.
Desafios e Direções Futuras
Embora o modelo tenha se saído bem, vários desafios permanecem. O tamanho limitado do conjunto de dados e a variabilidade nas imagens podem afetar a capacidade do modelo de generalizar para novos dados. Estudos futuros devem se concentrar em expandir conjuntos de dados e explorar outras regiões do cérebro para identificar mais padrões e insights relacionados ao TEA.
A abordagem adotada neste estudo tem potencial para entender a conectividade cerebral em indivíduos neurotípicos e aqueles com transtornos mentais. Ao analisar sistematicamente imagens de estruturas cerebrais e usar aprendizado de máquina, os pesquisadores podem descobrir informações vitais que podem guiar futuros diagnósticos e intervenções para o autismo.
Conclusão
O uso de aprendizado de máquina para analisar imagens do cérebro oferece novos insights sobre as diferenças estruturais no TEA. Este estudo demonstra a eficácia de combinar imagens de alta resolução com métodos analíticos avançados. As descobertas destacam características axonais específicas que poderiam ser alvo de mais pesquisas, levando a uma melhor compreensão e opções de tratamento para indivíduos com autismo.
Título: Artificial intelligence networks combining histopathology and machine learning can extract axon pathology in autism spectrum disorder
Resumo: Axon features that underlie the structural and functional organization of cortical pathways have distinct patterns in the brains of neurotypical controls (CTR) compared to individuals with Autism Spectrum Disorder (ASD). However, detailed axon study demands labor-intensive surveys and time-consuming analysis of microscopic sections from post-mortem human brain tissue, making it challenging to systematically examine large regions of the brain. To address these challenges, we developed an approach that uses machine learning to automatically classify microscopic sections from ASD and CTR brains, while also considering different white matter regions: superficial white matter (SWM), which contains a majority of axons that connect nearby cortical areas, and deep white matter (DWM), which is comprised exclusively by axons that participate in long-range pathways. The result was a deep neural network that can successfully classify the white matter below the anterior cingulate cortex (ACC) of ASD and CTR groups with 98% accuracy, while also distinguishing between DWM and SWM pathway composition with high average accuracy, up to 80%. Multidimensional scaling analysis and sensitivity maps further underscored the reliability of ASD vs CTR classification, based on the consistency of axon pathology, while highlighting the important role of white matter location that constrains pathway dysfunction, based on several shared anatomical markers. Large datasets that can be used to expand training, validation, and testing of this network have the potential to automate high-resolution microscopic analysis of post-mortem brain tissue, so that it can be used to systematically study white matter across brain regions in health and disease. One Sentence StatementHistopathology-trained AI can identify ASD network disruptions and guide development of diagnostics and targeted therapeutics.
Autores: Basilis Zikopoulos, A. Yazdanbakhsh, K. Dang, K. Kuang, T. Lian, X. Liu, S. Xie
Última atualização: 2024-10-26 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620308
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620308.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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