Cosa significa "DeepSea"?

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La resistenza antimicrobica (AMR) è un problema serio che influisce su come trattiamo le infezioni. Per tenere traccia dell'AMR, gli scienziati devono identificare e classificare le proteine che mostrano resistenza. Gli strumenti tradizionali per questo compito si basano sul confronto delle sequenze proteiche, ma questo approccio ha i suoi limiti. Spesso perde di vista proteine che sono solo leggermente diverse dai tipi resistenti già noti.

DeepSEA è un nuovo strumento che non si basa su questi confronti di sequenze. Invece, utilizza un metodo diverso per analizzare le proteine associate alla resistenza agli antibiotici. DeepSEA è stato addestrato utilizzando sia set di proteine resistenti che non resistenti, permettendogli di identificare efficacemente proteine correlate, anche se non sono perfettamente corrispondenti.

I test hanno dimostrato che DeepSEA funziona meglio degli strumenti esistenti, aiutando a classificare le proteine in base a come resistono agli antibiotici. Può anche identificare correttamente specifiche proteine coinvolte nella degradazione degli antibiotici, inclusa una nuova tipologia che non era stata identificata prima. Questo rende DeepSEA un importante passo avanti nella lotta contro la resistenza antimicrobica.