Progressi nell'identificazione delle specie di lucertole
Nuove tecnologie aiutano a identificare le specie di lucertole amazzoniche in modo efficiente.
― 6 leggere min
Indice
- Il Ruolo delle Trappole Fotografiche nella Ricerca sulla Biodiversità
- Il Passaggio dall'Identificazione Manuale ai Processi Automatizzati
- Utilizzo della Tecnologia Mobile per l'Identificazione delle Specie
- Metodo di Raccolta e Elaborazione dei Dati
- Elaborazione delle Immagini per una Migliore Classificazione
- Scelta dei Modelli Giusti per la Classificazione
- Valutazione delle Prestazioni del Modello
- Dati Raccolti e Miglioramenti Continui
- Conclusione: Rendere l'Identificazione delle Specie Più Accessibile
- Fonte originale
Le lucertole fanno parte di un grande gruppo di rettili chiamato Squamata, che include anche i serpenti. Una delle caratteristiche principali delle lucertole è la loro pelle squamosa. Per identificare le diverse Specie di lucertole, gli scienziati guardano vari tratti fisici, chiamati caratteristiche, in particolare quelli presenti nelle squame sulle loro teste, corpi e code.
Negli ultimi anni, la tecnologia ha reso più facile per gli scienziati studiare e tenere traccia delle lucertole e della fauna selvatica in generale. Con strumenti come registratori audio e trappole fotografiche, i ricercatori possono raccogliere molte informazioni senza spendere troppi soldi. Questo è stato molto utile per rispondere a domande importanti: a) Quali specie di lucertole si trovano in un certo area? b) Quali comportamenti stanno mostrando? e c) Quante lucertole vivono in quella regione? Tenere traccia di queste lucertole nelle foreste è un lavoro difficile che richiede pianificazione e abilità, rendendolo una vera sfida per chi cerca di proteggere questi animali.
Il Ruolo delle Trappole Fotografiche nella Ricerca sulla Biodiversità
Una delle principali fonti di Dati per studiare la biodiversità sono le Immagini delle trappole fotografiche. Queste immagini aiutano gli scienziati a identificare le specie, capire i loro numeri e scoprire dove vivono. Tuttavia, il monitoraggio remoto presenta le sue sfide, specialmente quando si cerca di identificare animali su ampie aree.
I recenti sforzi nell'identificazione automatica delle specie possono essere suddivisi in due gruppi principali: ricerca in laboratorio e ricerca sul campo. Nella ricerca in laboratorio, gli scienziati seguono linee guida rigorose per scattare immagini e di solito lavorano a stretto contatto con un esperto. Al contrario, la ricerca sul campo consente agli scienziati di scattare foto usando dispositivi mobili, il che può essere più facile e flessibile.
Ad esempio, quando si studiano gli insetti, di solito si preferiscono i metodi di laboratorio perché esaminare i campioni richiede tempo e attenzione speciale. D'altra parte, i mammiferi e i pesci vengono solitamente identificati attraverso immagini scattate sul campo. Le piante sono diverse; possono spesso essere studiate sia in laboratorio che in natura.
I ricercatori usano spesso tecniche avanzate come il Machine Learning per analizzare queste immagini. Questa tecnologia consente loro di apprendere dai dati e migliorare la loro capacità di identificare le specie attraverso la Classificazione delle immagini.
Il Passaggio dall'Identificazione Manuale ai Processi Automatizzati
Prima dell'introduzione di tecnologie come la visione artificiale e l'intelligenza artificiale, identificare le specie richiedeva spesso un grosso lavoro manuale. Questo approccio può portare a errori e sottovalutazioni, specialmente quando si conta un grande gruppo di animali come gli uccelli marini o i pipistrelli. Il passaggio verso sistemi di identificazione automatizzati ha cambiato la situazione, consentendo una raccolta di dati più accurata ed efficiente.
Con la classificazione automatica delle immagini, i ricercatori possono applicare questi nuovi metodi a diverse specie. Molti studi recenti dimostrano quanto bene funzioni la classificazione automatica utilizzando tecniche di deep learning. Questi studi si concentrano sull'impiego di algoritmi di visione artificiale per classificare varie specie animali.
Utilizzo della Tecnologia Mobile per l'Identificazione delle Specie
In un nuovo studio, i ricercatori hanno creato un programma open-source per classificare automaticamente le immagini delle lucertole della foresta pluviale amazzonica. Hanno progettato questo programma per l'uso sugli smartphone, rendendolo accessibile a chiunque. Utilizzando modelli avanzati per l'elaborazione delle immagini, hanno ottenuto ottimi risultati nella classificazione delle diverse specie di lucertole.
Sebbene molti ricercatori abbiano utilizzato queste tecniche avanzate per altri animali, è emerso che poche persone le hanno applicate a immagini tridimensionali di lucertole amazzoniche. Il team ha convalidato il proprio lavoro attraverso una combinazione di dati sintetici e immagini reali da una collezione museale.
Metodo di Raccolta e Elaborazione dei Dati
Il team di ricerca ha raccolto campioni da un museo in Brasile, che ha una grande collezione di anfibi e rettili. Si sono concentrati su tre specie specifiche di lucertole trovate in Amazzonia. Dopo aver scattato foto di ogni lucertola da diverse angolazioni (dorsale, laterale e ventrale), hanno creato un set di immagini rappresentanti ogni campione.
Per creare un dataset utile per l'analisi, i ricercatori hanno rimosso eventuali immagini di bassa qualità. Hanno finito con una raccolta di 240 immagini di lucertole, assicurando una rappresentazione proporzionale di ogni specie.
Elaborazione delle Immagini per una Migliore Classificazione
L'elaborazione delle immagini ha comportato l'organizzazione in modo che le viste dorsali, laterali e ventrali di ciascuna lucertola fossero rappresentate da diversi canali di colore. Dopo aver ridimensionato le immagini, hanno diviso i dati in set di addestramento e validazione, utilizzando varie tecniche per migliorare i dati. Facendo piccole modifiche alle immagini, sono stati in grado di creare molti più campioni per un migliore addestramento dei loro modelli.
Scelta dei Modelli Giusti per la Classificazione
Il team ha scelto i modelli MobileNet per il loro sistema di identificazione delle specie perché sono efficienti e funzionano bene sui dispositivi mobili. Hanno confrontato diverse versioni di MobileNet e li hanno usati per estrarre caratteristiche dalle immagini. Questa combinazione aiuta a evitare l'overfitting del Modello, che può accadere quando un modello impara troppo dai dati di addestramento, causando risultati scadenti su nuovi dati.
I ricercatori hanno anche selezionato modelli di machine learning tradizionali, che hanno avuto successo negli studi biologici. Hanno usato diversi algoritmi per vedere quali funzionavano meglio con le loro caratteristiche estratte.
Valutazione delle Prestazioni del Modello
Per confrontare le prestazioni dei diversi modelli, i ricercatori hanno impiegato test statistici. Questa valutazione ha mostrato che uno dei modelli più semplici ha funzionato altrettanto bene di uno più complesso. Questa scoperta ha suggerito che un modello meno complicato poteva comunque produrre risultati accurati, rendendolo più facile da usare.
Il team ha creato matrici di confusione per visualizzare quanto bene il loro modello ha classificato le diverse specie di lucertole. Hanno scoperto che il modello ha fatto un ottimo lavoro nell'identificare accuratamente le specie.
Dati Raccolti e Miglioramenti Continui
La collezione del museo è stata usata per raccogliere campioni tridimensionali, consentendo un'analisi approfondita delle specie di lucertole. La ricerca si è concentrata sull'assicurare che i dati venissero raccolti in modo accurato e coerente, cosa importante per gli studi futuri in questo campo.
Invece di usare strumenti costosi come la scansione 3D, i ricercatori hanno optato per un approccio più accessibile basato sugli smartphone. Questa scelta ha permesso loro di catturare immagini senza bisogno di abilità o attrezzature specializzate.
Conclusione: Rendere l'Identificazione delle Specie Più Accessibile
Utilizzando metodi innovativi di raccolta e elaborazione dei dati, i ricercatori hanno iniziato a rendere l'identificazione delle specie più facile e accessibile. Questo è particolarmente utile per gli sforzi di conservazione e lo studio della biodiversità. Con i progressi tecnologici, è diventato possibile monitorare la fauna selvatica con maggiore precisione ed efficienza.
Il lavoro svolto nello studio delle lucertole amazzoniche illustra l'importanza di utilizzare strumenti moderni per migliorare la nostra comprensione della fauna selvatica. Man mano che la tecnologia continua a progredire, il potenziale per nuove scoperte e migliori strategie di conservazione è immenso.
Attraverso questo studio, i ricercatori hanno dimostrato che anche con risorse limitate, è possibile fare progressi significativi nell'identificazione e comprensione delle specie. Questo approccio può servire da modello per studi futuri nella conservazione della fauna selvatica in tutto il mondo.
Titolo: LizardNet: A mobile hybrid deep learning tool for classification of 3D representations of Amazonian lizards
Estratto: Image classification is a highly significant field in machine learning (ML), especially when applied to address longstanding and challenging issues in the biological sciences. In this study, we present the development of a hybrid deep learning-based tool suitable for deployment on mobile devices. This tool is aimed at processing and classifying three-dimensional samples of endemic lizard species from the Amazon rainforest. The dataset used in our experiment was collected at the Museu Paraense Emilio Goeldi (MPEG), Belem-PA, Brazil, and comprises three species: a) Anolis fuscoauratus; b) Hoplocercus spinosus; and c) Polychrus marmoratus. We compared the effectiveness of four artificial neural networks (ANN) for feature extraction: a) MobileNet; b) MobileNetV2; c) MobileNetV3Small; and d) MobileNetV3Large. Additionally, we evaluated five classical ML models for classifying the extracted patterns: a) Support Vector Machine (SVM); b) GaussianNB (GNB); c) AdaBoost (ADB); d) K-Nearest Neighbors (KNN); and e) Random Forest (RF). Our most effective model, MobileNetV3-Small + Linear SVM, achieved an accuracy of 0.948 and a f1-score of 0.955. Notably, it not only proved to be the least complex model among all combinations but also demonstrated the best performance after a statistical comparison. These results indicate that the combination of deep learning (DL) models with less complex classical ML algorithms, which have a lower error propensity, emerges as a viable and efficient technique for classifying three-dimensional lizard species samples. Such an approach facilitates taxonomic identification work for professionals in the field and provides a tool adaptable for integration into mobile data recording equipment, such as smartphones. Author summaryThe taxonomic classification of lizards requires an exceptional level of knowledge and attention to minute details beyond the ordinary to accurately categorize specimens. Such tasks impose significant mental and visual costs on humans, unlike computer vision algorithms capable of extracting visual patterns from images imperceptible to the human eye. In this research, we utilized a dataset from the herpetarium of the Emilio Goeldi Museum in Belem-PA, Brazil. The data were self-captured, with each sample comprised of three photos: dorsal, lateral, and ventral views of each specimen. The sample size was constrained by the quality and abundance of preserved specimens, necessitating the application of a data augmentation method on the pre-separated training and validation sets. This augmentation led to a considerable increase in the number of samples per species, from a few dozen to several hundred. Our experimental approach involved utilizing pre-trained neural networks to extract 3D sample characteristics, subsequently classified using classical machine learning algorithms. This hybrid strategy was adopted due to the nature of data collection and synthetic data augmentation. Our method enables specimen identification through three-dimensional representations, allowing for a more comprehensive utilization of morphological information by the model.
Autori: Bruno Duarte Gomes, A. G. da Silva, R. P. de Oliveira, E. A. de Carvalho, C. d. O. Bastos
Ultimo aggiornamento: 2024-01-17 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.15.575627
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.15.575627.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.