Test innovativi per inibitori della nitrificazione in agricoltura
Nuovi test puntano a ridurre la perdita di azoto in agricoltura attraverso inibitori efficaci.
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Indice
L'agricoltura dipende dai fertilizzanti, in particolare dall'azoto, per far crescere i raccolti. Questo è fondamentale per produrre abbastanza cibo per tutti. Però, usare troppi fertilizzanti azotati può creare problemi. Una gran parte dell'azoto usato può perdersi nel terreno attraverso un processo chiamato Nitrificazione. Questo non solo spreca risorse ma porta anche all'inquinamento.
La nitrificazione è un processo microbico in cui l'ammoniaca nel terreno viene trasformata in Nitrito e poi in nitrato. Le piante possono usare sia il nitrito che il nitrato per crescere. Sfortunatamente, durante questo processo, una quantità significativa di azoto può filtrare nelle falde acquifere, il che può essere dannoso. Questo filtraggio può causare problemi come acqua contaminata, fioriture algali nocive e perdita di biodiversità. Può anche rilasciare gas che contribuiscono all'inquinamento atmosferico e ai cambiamenti climatici.
Con la crescita della popolazione mondiale, ci sarà una maggiore domanda di fertilizzanti. Questo significa che trovare modi per ridurre la perdita di azoto è cruciale. Una soluzione efficace è l'uso di inibitori della nitrificazione. Questi chimici aiutano a rallentare il processo di nitrificazione, permettendo alle colture di utilizzare più azoto dai fertilizzanti.
Inibitori della Nitrificazione
Ci sono alcuni inibitori della nitrificazione comunemente usati in agricoltura: dicianodiamide (DCD), fosfato di 3,4-dimetilpirazolo (DMPP) e nitrapirina. Tuttavia, la loro efficacia può variare a seconda di fattori come il tipo di terreno e le condizioni meteorologiche. Ad esempio, il DCD potrebbe richiedere quantità elevate, il che può danneggiare le piante, mentre il DMPP potrebbe non funzionare bene in alcuni terreni. Inoltre, la nitrapirina non è approvata per l'uso nell'Unione Europea.
L'uso ripetuto degli stessi inibitori potrebbe rendere alcuni microbi del suolo resistenti a essi. Questo dimostra la necessità di nuovi tipi di inibitori della nitrificazione. Un'area promettente è l'uso di prodotti naturali provenienti dalle piante. Questi inibitori biologici della nitrificazione (BNI) hanno dimostrato potenziale per ridurre la nitrificazione.
Il Ruolo degli Assay
Per scoprire nuovi inibitori della nitrificazione, gli scienziati devono testare vari composti. Qui entrano in gioco gli assay di inibizione della nitrificazione. Questi test misurano quanto bene un composto può prevenire la nitrificazione nei batteri che convertono l'ammoniaca in nitrito e nitrato. Gli assay tradizionali richiedono molti batteri e possono richiedere tempo.
In questo studio, sono stati sviluppati nuovi metodi per eseguire questi test in un formato miniaturizzato usando piastre da 384 pozzetti. Questo permette agli scienziati di testare molti composti contemporaneamente senza bisogno di grandi quantità di risorse.
Metodi Utilizzati
Coltivazione dei Microbi
Per gli assay, sono stati usati due tipi di batteri ossidanti dell'ammoniaca: Nitrosomonas europaea e Nitrosospira multiformis. Questi batteri sono stati coltivati in mezzi specifici che fornivano i nutrienti giusti. I batteri sono stati coltivati in condizioni controllate, agitando al buio per promuovere la crescita.
Misurazione del Nitrito
Per determinare quanto nitrito è stato prodotto dai batteri, è stato utilizzato un assay colorimetrico. Questo comportava mescolare una piccola quantità di coltura batterica con un reagente che cambia colore in presenza di nitrito. L'intensità del colore viene misurata usando uno spettrofotometro, fornendo una lettura dei livelli di nitrito.
Conservazione delle Colture Batteriche
Quando i ricercatori volevano conservare i batteri per un uso successivo, li congelavano in una soluzione contenente DMSO. Questo aiuta a mantenere i batteri vitali per esperimenti futuri. Quando necessario, i batteri congelati venivano scongelati e redisciolti in un mezzo di crescita fresco.
Assay di Inibizione della Nitrificazione
L'attenzione principale era sullo sviluppo di assay ad alta capacità di screening (HTS) per identificare inibitori della nitrificazione. In questi assay, i batteri venivano esposti a vari composti per vedere se potevano prevenire la conversione dell'ammoniaca in nitrito.
Test di Efficacia
Per controllare quanto bene funzionava ogni composto, sono stati utilizzati dei controlli come riferimenti. Un controllo positivo è un inibitore noto ed efficace, mentre un controllo negativo è una soluzione senza alcun inibitore. Confrontando i risultati dei composti con questi controlli, si poteva determinare l'efficacia degli inibitori.
Considerazioni sulla Concentrazione
La concentrazione dei composti testati è cruciale. Se la concentrazione è troppo alta, può complicare i risultati, ma se è troppo bassa, si potrebbero perdere potenziali composti utili. Testare diverse concentrazioni aiuta a trovare un equilibrio per uno screening efficace.
Risultati
Attraverso gli assay sviluppati, sono stati testati vari composti per la loro capacità di inibire la nitrificazione. Alcuni prodotti naturali hanno mostrato promesse come potenziali BNI. Ad esempio, il 5-etinile-1,3-ossazolidina-2-tione, conosciuto anche come goitrina, è emerso come un nuovo inibitore.
Importanza dei Risultati
I risultati indicano che questi nuovi assay possono aiutare a scoprire inibitori della nitrificazione efficaci, sia sintetici che naturali. Questo potrebbe portare a pratiche migliori in agricoltura, promuovendo l'uso efficiente dei fertilizzanti e riducendo l'inquinamento.
Direzioni Future
C'è ancora molto da imparare su come funzionano gli inibitori della nitrificazione e su come possono essere ottimizzati per l'uso agricolo. Maggiore ricerca sugli inibitori naturali, in particolare quelli derivati dalle piante, potrebbe portare a alternative ecologiche ai chimici sintetici.
Conclusione
Lo sviluppo di questi nuovi assay ad alta capacità di screening per l'inibizione della nitrificazione offre opportunità entusiasmanti per scoprire nuovi inibitori che possano aiutare gli agricoltori a usare i fertilizzanti in modo più efficiente. Mentre il mondo affronta sfide legate alla produzione alimentare e alla sostenibilità ambientale, soluzioni innovative come queste saranno essenziali per migliorare le pratiche agricole e proteggere i nostri ecosistemi.
Titolo: New high-throughput screening assays for nitrification inhibitors identify an oxazolidine-thione as biological nitrification inhibitor
Estratto: Nitrification is a microbial two-step process whereby ammonia (NH3) is first oxidized into nitrite (NO2-), by ammonia-oxidizing microorganisms, and then into nitrate (NO3-) by nitrite-oxidizing bacteria (NOB) in a mutualistic symbiosis. Due to high nitrogen (N) input in agriculture, this process needs to be slowed down as NO2- and NO3- easily leach, becoming unavailable for plants and leading to eutrophication. Moreover, they may be further processed into the very strong greenhouse gas nitrous oxide (N2O). Nitrification thus results in inefficient use of fertilizer and leads to detrimental environmental impact. Inhibitors can be used to mitigate these negative effects and are shown to positively affect plant growth and crop yield and strongly reduce nitrogen (N) pollution. However, currently, only a limited portfolio of nitrification inhibitors is commonly available. These show a variable efficiency and come with logistic complexities. As such, there is a high demand for a broader portfolio of novel molecules. To contribute to the discovery phase of new inhibitors and enable the evaluation of a large number of molecules, we developed miniaturized high-throughput screening assays on the soil-borne ammonia-oxidizing bacteria (AOB) Nitrosomonas europaea and Nitrosospira multiformis. We give a detailed overview of the procedure and illustrate its use by testing structural variants of oxazolidine-thiones that were previously discovered as nitrification inhibitors. This led to the discovery of the natural compound goitrin as a new biological nitrification inhibitor (BNI). Overall, the presented assays are promising discovery tools, as demonstrated by the newly discovered BNI, and may contribute to the advancement of a more sustainable agriculture.
Autori: Hans Motte, F. Beeckman, A. Drozdzecki, A. De Knijf, D. Audenaert, T. Beeckman
Ultimo aggiornamento: 2024-03-27 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.27.586932
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.27.586932.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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