Nuove scoperte sull'importazione delle proteine perossisomiali
La ricerca rivela il ruolo fondamentale di PEX39 nella funzione perossisomiale.
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Indice
- Il Ruolo dei Perossini nella Funzione dei Perossisomi
- Scoperta di PEX39
- Indagine sulle Interazioni di PEX39
- L'Impatto dell'Eccesso di PEX39
- Meccanismo di Funzione e Interazioni di PEX39
- La Regione N-terminale di PEX39
- La Connessione tra PEX39 e PEX13
- Implicazioni per la Salute Umana
- Conclusione
- Fonte originale
I Perossisomi sono piccole strutture presenti in quasi tutte le cellule complesse. Questi organelli hanno un ruolo cruciale in vari processi importanti che mantengono le cellule sane e funzionanti correttamente. Uno dei compiti principali svolti dai perossisomi è la scomposizione degli acidi grassi, che sono essenziali per la produzione di energia e la formazione della membrana cellulare. Inoltre, aiutano a disintossicare sostanze nocive come le specie reattive dell'ossigeno, che sono sottoprodotti delle attività cellulari che possono causare danni se non controllati.
Negli mammiferi, i perossisomi aiutano anche a produrre acidi biliari, che sono importanti per la digestione dei grassi, e mielina, che isola le cellule nervose e le aiuta a inviare segnali in modo efficiente. Senza perossisomi sani, questi processi vitali non possono avvenire, portando a gravi problemi di salute.
Il Ruolo dei Perossini nella Funzione dei Perossisomi
Per mantenere i perossisomi funzionanti, la cellula ha bisogno di proteine speciali chiamate perossini. I perossini aiutano a creare nuovi perossisomi e assicurano che ricevano gli enzimi giusti necessari per svolgere i loro compiti. Infatti, più di 60 enzimi diversi devono essere importati dalla parte principale della cellula, il citosol, all'interno dei perossisomi. Se c'è un problema con questi perossini, può portare a malattie gravi, come i Disturbi dello Spettro di Zellweger.
Tutti gli enzimi che lavorano all'interno dei perossisomi vengono creati nel nucleo della cellula e poi prodotti nel citosol. Quindi, quanto bene funzionano i perossisomi dipende molto dai metodi specifici con cui queste proteine vengono importate nell'organello. Il modo in cui gli enzimi entrano nei perossisomi è abbastanza affascinante, dato che anche le proteine già ripiegate possono entrare. Questo è diverso da come vengono importate le proteine in altre parti della cellula come i mitocondri o il reticolo endoplasmatico, dove possono entrare solo le proteine non ripiegate.
I perossisomi hanno segnali specifici, chiamati segnali di targeting perossisomale (PTS), che aiutano a guidare gli enzimi verso la loro destinazione. Ci sono due tipi principali di questi segnali: tipo 1 (PTS1) e tipo 2 (PTS2). Il segnale PTS1 è di solito una piccola catena di tre aminoacidi alla fine della proteina, mentre il PTS2 è una sequenza più complessa presente all'inizio. Anche se ci sono meno proteine PTS2, sono vitali per varie funzioni cellulari.
Nel citosol, due recettori specifici, PEX5 e PEX7, giocano un ruolo importante nel riconoscere questi segnali e avviare il processo di importazione. Affinché il PEX7 funzioni correttamente, spesso deve accoppiarsi con un'altra proteina, che lo aiuta a legare il carico che deve essere trasportato. Una volta che il carico è legato, questi complessi vengono portati in un'area di docking sui perossisomi dove possono entrare nell'organello.
Scoperta di PEX39
Recentemente, i ricercatori hanno scoperto una proteina precedentemente sconosciuta chiamata PEX39 che aiuta nell'importazione delle proteine PTS2. Questa proteina si trova sia nei lieviti che negli esseri umani, suggerendo che abbia funzioni importanti che sono state preservate attraverso l'evoluzione. PEX39, insieme a un'altra proteina chiamata PEX13, possiede una sequenza speciale (il motivo [R/K]PWE) che è cruciale per legarsi a PEX7 e garantire che il processo di importazione funzioni senza intoppi.
Quando gli scienziati hanno esaminato una proteina del lievito chiamata Yjr012c e la sua controparte umana C6ORF226, hanno trovato che queste due proteine erano molto simili e probabilmente svolgevano ruoli simili nell'importazione delle proteine PTS2. La loro struttura mostra che hanno gli stessi motivi importanti, indicando la loro capacità di interagire con il macchinario di importazione perossisomale.
Indagine sulle Interazioni di PEX39
Per comprendere meglio come PEX39 aiuti nell'importazione delle proteine PTS2, gli scienziati hanno esaminato le sue interazioni con altre proteine coinvolte in questo processo. Hanno scoperto che PEX39 interagisce specificamente con PEX7 e altre proteine note che svolgono un ruolo nella funzione perossisomale.
Attraverso vari esperimenti, è emerso che la perdita di PEX39 influisce notevolmente sulla capacità della cellula di importare le proteine PTS2. Le cellule di lievito prive di PEX39 hanno avuto difficoltà a crescere quando gli acidi grassi erano la principale fonte di energia, poiché i perossisomi non potevano svolgere i loro compiti in modo efficace. Quando i ricercatori hanno esaminato i livelli di PEX7 nelle cellule mancanti PEX39, hanno trovato che PEX7 era diminuito, il che spiega parte del problema.
Nelle cellule umane in cui PEX39 è stato eliminato, sono stati osservati risultati simili. L'assenza di PEX39 ha portato a un'accumulazione della forma precursore di un enzima cruciale, PHYH, mentre la forma matura era significativamente inferiore. Questo indica un ruolo diretto di PEX39 nell'aiutare il trasporto di questa proteina nei perossisomi.
L'Impatto dell'Eccesso di PEX39
D'altro canto, i ricercatori hanno anche esaminato cosa succede quando c'è un'alta quantità di PEX39. Sorprendentemente, quando gli scienziati hanno aumentato i livelli di PEX39 nelle cellule, hanno notato un'impegnativa importazione delle proteine PTS2. Questa scoperta controintuitiva suggerisce che c'è un equilibrio delicato quando si tratta dei livelli di PEX39 nella cellula. Se c'è troppo PEX39 disponibile, può fermare il processo di importazione, proprio come quando PEX39 è assente.
Negli esperimenti, aggiungere eccesso di PEX39 alle cellule ha portato a un aumento delle forme precursore di varie proteine PTS2 e a una diminuzione delle loro forme mature. Questo impatto è stato osservato sia nei lieviti che nelle cellule umane. I risultati indicano che la regolazione corretta dei livelli di PEX39 è cruciale per una funzione ottimale nell'importazione delle proteine perossisomali.
Meccanismo di Funzione e Interazioni di PEX39
Per comprendere meglio come funziona PEX39, i ricercatori hanno esaminato come interagisce con il carico di PEX7 e PEX2. Hanno trovato che PEX39 stabilizza l'interazione tra PEX7 e la sua proteina di carico. Questa interazione è essenziale per consentire l'importazione efficace delle proteine nei perossisomi.
Gli scienziati hanno utilizzato tecniche di modellazione avanzate per prevedere come PEX39 e PEX7 interagiscono a livello molecolare. Le loro previsioni hanno mostrato che PEX39 si lega a PEX7 attraverso il motivo conservato PWE, il che aumenta la stabilità complessiva dell'interazione. Questo aiuta a garantire che PEX7 possa impegnarsi efficacemente con le proteine PTS2 per l'importazione.
La Regione N-terminale di PEX39
L'importanza della regione N-terminale di PEX39 è stata evidenziata in vari esperimenti. Questa sezione della proteina gioca un ruolo chiave nel legarsi ad altre proteine, in particolare PEX7. Ci sono anche mutazioni che interrompono la funzione di PEX39, mostrando quanto sia critica questa regione per il ruolo biologico della proteina.
Studiano varie mutazioni e versioni troncate di PEX39, i ricercatori hanno determinato che un motivo specifico all'interno della regione N-terminale è essenziale per le sue interazioni con PEX7 e il processo di importazione nel complesso. Quando queste regioni sono state modificate, PEX39 ha perso la sua capacità di stabilizzare le interazioni con PEX7 e non è stata in grado di supportare completamente l'importazione delle proteine PTS2.
La Connessione tra PEX39 e PEX13
Curiosamente, un'altra proteina chiamata PEX13 contiene anche un motivo PWE simile a quello trovato in PEX39. I ricercatori stanno ora indagando se PEX39 e PEX13 interagiscono e come questo potrebbe influenzare la loro funzione nei meccanismi di trasporto perossisomali. La presenza del motivo KPWE in entrambe le proteine suggerisce un possibile ruolo coordinato nei processi di importazione.
Gli studi hanno dimostrato che PEX13 può anche legarsi a PEX7 attraverso il proprio motivo KPWE. Quando PEX39 è legato a PEX7, impedisce a PEX13 di legarsi, il che implica che queste due proteine competono per lo stesso sito di legame su PEX7. Questa esclusività reciproca aggiunge un ulteriore livello di complessità al sistema di trasporto nelle cellule.
Implicazioni per la Salute Umana
Le scoperte relative a PEX39 e alle sue interazioni con i perossini fanno luce su come disturbi in questo processo potrebbero portare a problemi di salute. Con la funzione perossisomale collegata alla scomposizione degli acidi grassi e alla disintossicazione di sostanze nocive, i disturbi in questo sistema possono avere effetti diffusi. Ad esempio, l'incapacità di importare proteine essenziali a causa di mutazioni o perdita di PEX39 potrebbe contribuire a malattie legate a disfunzioni metaboliche o neurodegenerazione.
Comprendendo come funzionano PEX39 e le sue interazioni, i ricercatori sperano di scoprire potenziali bersagli terapeutici per condizioni legate alla disfunzione perossisomale. Questa conoscenza è cruciale per sviluppare trattamenti che potrebbero ripristinare la funzione normale e migliorare i risultati sulla salute.
Conclusione
In sintesi, PEX39 è un attore nuovo ma vitale nel mondo complesso delle funzioni perossisomali. Aiuta a stabilizzare le interazioni necessarie per l'importazione di proteine critiche, consentendo alle cellule di mantenere le loro funzioni essenziali. Bilanciare i livelli di PEX39 è importante; troppo poco o troppo può ostacolare il processo di importazione e portare a problemi.
La connessione tra PEX39 e PEX13 illustra ulteriormente le strategie specializzate che le cellule usano per gestire il trasporto delle proteine. Lo studio continuo di queste proteine aprirà nuove strade per comprendere e potenzialmente trattare le malattie che coinvolgono la disfunzione perossisomale. Man mano che la ricerca avanza, sarà emozionante vedere come questa conoscenza possa essere tradotta in applicazioni pratiche per la salute e la medicina.
Titolo: PEX39 facilitates the peroxisomal import of PTS2 proteins
Estratto: Peroxisomes are metabolic organelles essential for human health. Defects in peroxisomal biogenesis proteins (peroxins/PEXs) cause devastating disease. PEX7 binds newly synthesized proteins containing a type 2 peroxisomal targeting signal (PTS2) to enable their import from the cytosol into peroxisomes, although many aspects of this import pathway remain enigmatic. Utilizing in vitro assays, yeast, and human cells, we show that PEX39, a previously uncharacterized protein, is a cytosolic peroxin that facilitates PTS2-protein import by binding PEX7 and stabilizing its interaction with PTS2 cargo. PEX39 and PEX13, a peroxisomal membrane translocon protein, both possess a KPWE motif necessary for PEX7 binding. Sequential binding of PEX7 to this motif in PEX39 and PEX13 provides a novel paradigm for how PTS2 cargo engage the translocation machinery. Collectively, our work uncovers an ancient and functionally important relationship among PEX39, PEX7, and PEX13, offering insights that will advance our understanding of peroxisomal biogenesis and disease.
Autori: Walter W. Chen, T. A. Rodrigues, D. Wendscheck, A. G. Pedrosa, C. Yang, T. Francisco, T. Mocklinghoff, A. Zografakis, B. Nunes-Silva, R. E. Avraham, A. R. Silva, M. J. Ferreira, H. Das, J. Bender, S. Oeljeklaus, V. Sondhi, M. Schuldiner, E. Zalckvar, K. Hofmann, H. R. Waterham, R. J. DeBerardinis, J. E. Azevedo, B. Warscheid
Ultimo aggiornamento: 2024-05-03 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.30.591961
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.30.591961.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
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