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Progressi negli anticorpi ampiamente neutralizzanti per lo sviluppo di vaccini

La ricerca su bnAbs apre la strada a vaccini efficaci contro i virus RNA.

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I virus a RNA possono cambiare in fretta, il che rende difficile creare vaccini che funzionano bene contro di loro. Questi virus si modificano in risposta a come il nostro corpo li affronta. Per questo, i ricercatori stanno cercando modi per sviluppare vaccini che possano fornire una protezione ampia contro tanti tipi di virus a RNA.

Negli ultimi vent'anni, gli scienziati hanno trovato alcuni anticorpi molto potenti chiamati anticorpi neutralizzanti ampiamente (bnAbs). Questi anticorpi possono proteggere contro diversi ceppi dello stesso virus o addirittura contro virus diversi della stessa famiglia. Alcuni esempi noti di questi virus sono il virus dell'influenza, l'HIV, i coronavirus e i flavivirus. La scoperta di questi bnAbs è stata importante per il progresso nella creazione di vaccini che possono proteggere contro un'ampia gamma di virus.

Come Funzionano gli Anticorpi Neutralizzanti Ampiamente

Questi bnAbs di solito partono da un anticorpo antenato comune che ha un'abilità di legame ristretta. Poi sviluppano un'abilità di legame più ampia con diversi virus attraverso un processo chiamato mutazione iper somatica (SHM). I ricercatori spesso usano un metodo chiamato display di lievito per studiare come evolvono questi anticorpi e aumentano la loro capacità di legarsi in modo efficace.

Nel display di lievito tradizionale, gli anticorpi vengono testati contro un virus per volta. Questo può rendere difficile vedere come un anticorpo può diventare efficace contro diversi virus. A volte, far funzionare meglio un anticorpo contro un virus può renderlo meno efficace contro un altro. Per davvero capire come migliorare la capacità di questi anticorpi di combattere più ceppi, è importante poterli testare contro diversi virus contemporaneamente.

Scoperte Recenti con SARS-CoV-2

Negli ultimi anni, le ricerche sulle risposte umane al virus che causa il COVID-19 hanno portato a nuovi bnAbs. Questi anticorpi prendono di mira una parte specifica del coronavirus che ha meno probabilità di cambiare. Uno di questi bnAbs, chiamato S2P6, proviene da qualcuno che si è ripreso dal COVID-19 e può neutralizzare molti ceppi diversi del virus.

I ricercatori hanno scoperto che S2P6 si è sviluppato dopo che una persona è stata infettata da un virus comune del raffreddore e in seguito ha risposto a SARS-CoV-2. Questo significa che capire come è evoluto S2P6 è fondamentale per sviluppare vaccini che possano proteggere contro i coronavirus.

Nuovi Metodi per Testare la Funzionalità degli Anticorpi

Per studiare meglio come funziona S2P6, i ricercatori hanno usato un nuovo metodo di display di lievito che consente loro di esaminare più interazioni proteiche contemporaneamente. Hanno testato una libreria di Peptidi a elica, che sono parti del virus, contro una libreria di varianti di S2P6 che contengono diverse modifiche dall'anticorpo originale.

Questo test innovativo permette agli scienziati di vedere come S2P6 interagisce con diversi peptidi provenienti da vari ceppi del virus allo stesso tempo. Hanno scoperto che l'anticorpo S2P6 aveva diverse forze di legame a seconda del peptide a elica con cui veniva testato. Questo dimostra che la capacità di legame può cambiare a seconda del ceppo specifico del virus, il che è importante per capire come migliorare le risposte anticorpali.

L'Importanza dell'Affinità di Legame

Per capire quanto sia efficace S2P6 contro diversi ceppi virali, i ricercatori hanno esaminato i punteggi di legame. Questi punteggi indicano quanto bene l'anticorpo può attaccarsi ai peptidi a elica del virus. Hanno scoperto che i punteggi di legame medi erano generalmente alti per i ceppi di sarbecovirus, ma più bassi per i ceppi di merbecovirus. Questo modello mostra che la struttura specifica dei peptidi a elica influisce su quanto bene S2P6 possa legarsi ad essi.

Lo studio ha anche rivelato che certi amminoacidi nei peptidi giocano un ruolo significativo in quanto bene S2P6 si lega. Ad esempio, alcuni ceppi del virus avevano cambiamenti specifici in certe posizioni, e quei cambiamenti influenzavano direttamente la capacità di legame dell'anticorpo.

Fattori che Influenzano il Legame

Analisi ulteriori hanno mostrato che mentre alcuni cambiamenti a S2P6 lo rendevano più legante, altri potevano creare un compromesso, rendendolo meno efficace contro altri ceppi. Questo significa che quando si sviluppano vaccini, è cruciale identificare quali cambiamenti miglioreranno la risposta a più ceppi senza ridurre l'efficacia contro uno specifico.

I ricercatori hanno anche scoperto che il modo in cui S2P6 interagisce con i peptidi non è solo determinato dai punti di contatto diretti, ma anche da interazioni a lungo raggio. Questo suggerisce che mutazioni non localizzate nell'area di legame potrebbero comunque migliorare l'efficacia dell'anticorpo stabilizzando la sua forma complessiva.

Metodologia per Testare le Varianti di Anticorpi

I ricercatori hanno creato una libreria di varianti di S2P6 cambiando gli amminoacidi nell'anticorpo per vedere quali combinazioni funzionassero meglio contro i peptidi a elica. Questo è stato fatto usando tecniche avanzate per garantire che ogni variante potesse essere testata in modo ad alta capacità, il che è essenziale per numeri così elevati di combinazioni.

Dopo aver creato le librerie, hanno usato un metodo chiamato citometria a flusso per misurare quanto bene diverse varianti si legassero ai peptidi. Selezionando le cellule che portavano le varianti di legame migliori, i ricercatori potevano concentrarsi su quelle più promettenti per migliorare lo sviluppo dei vaccini.

Analizzare i Risultati

I risultati hanno mostrato una vasta gamma di abilità di legame tra le varianti di S2P6 contro i diversi peptidi a elica. Hanno anche scoperto che la capacità di legame poteva variare considerevolmente tra i diversi ceppi. Questo evidenzia l'importanza di testare gli anticorpi contro varie varianti per avere un quadro più chiaro di quanto saranno efficaci nella realtà.

I ricercatori hanno notato la necessità di vaccini ad ampio spettro che possano adattarsi ai cambiamenti nelle strutture virali. Avanzando nella comprensione di come questi anticorpi evolvono, gli scienziati sperano di progettare vaccini migliori che offrano una protezione più forte e duratura contro i virus a RNA.

Il Futuro dello Sviluppo dei Vaccini

Le scoperte di questa ricerca sono promettenti per lo sviluppo di vaccini ampiamente protettivi. L'approccio adottato qui potrebbe essere applicato anche ad altri virus e malattie, portando potenzialmente a nuove strategie nella progettazione dei vaccini. Concentrandosi sia sul miglioramento del legame a più ceppi che sulla minimizzazione dei compromessi che possono verificarsi durante queste migliorie, i ricercatori stanno aprendo la strada a vaccini più efficaci.

Come sottolinea lo studio, comprendere le diverse risposte degli anticorpi a vari ceppi è cruciale per prevedere quanto bene un vaccino funzionerà nelle situazioni reali. Questo potrebbe portare alla capacità di sviluppare rapidamente vaccini efficaci in risposta a minacce virali emergenti.

Conclusione

L'esplorazione di anticorpi neutralizzanti ampiamente come S2P6 offre agli scienziati intuizioni entusiasmanti su come affrontare i virus a RNA, specialmente nei momenti in cui emergono nuovi ceppi. Migliorando la nostra comprensione delle interazioni e delle affinità di legame degli anticorpi, i ricercatori possono guidare il futuro dello sviluppo dei vaccini per garantire una protezione più forte e più efficace contro una vasta gamma di malattie virali. La collaborazione continua tra varie discipline scientifiche sarà essenziale per affrontare le sfide che i virus a RNA pongono alla salute globale.

Fonte originale

Titolo: A library-on-library screen reveals the breadth expansion landscape of a broadly neutralizing betacoronavirus antibody

Estratto: Broadly neutralizing antibodies (bnAbs) typically evolve cross-reactivity breadth through acquiring somatic hypermutations. While evolution of breadth requires improvement of binding to multiple antigenic variants, most experimental evolution platforms select against only one antigenic variant at a time. In this study, a yeast display library-on-library approach was applied to delineate the affinity maturation of a betacoronavirus bnAb, S2P6, against 27 spike stem helix peptides in a single experiment. Our results revealed that the binding affinity landscape of S2P6 varies among different stem helix peptides. However, somatic hypermutations that confer general improvement in binding affinity across different stem helix peptides could also be identified. We further showed that a key somatic hypermutation for breadth expansion involves long-range interaction. Overall, our work not only provides a proof-of-concept for using a library-on-library approach to analyze the evolution of antibody breadth, but also has important implications for the development of broadly protective vaccines.

Autori: Nicholas C. Wu, M. Y. Ornelas, W. O. Ouyang

Ultimo aggiornamento: 2024-06-10 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597810

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597810.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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