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# La biologia# Genetica

La relazione tra i geni DDX3X e DDX3Y

I geni DDX3X e DDX3Y mostrano interazioni uniche che influenzano l'espressione genica.

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Interazioni tra DDX3X eInterazioni tra DDX3X eDDX3Y svelatetra DDX3X e DDX3Y.Nuove scoperte sulla regolazione genica
Indice

DDX3X e DDX3Y sono geni che si trovano sui cromosomi X e Y degli esseri umani. Anche se sono simili e svolgono funzioni simili, non sono identici. Questi geni giocano ruoli importanti nel modo in cui le cellule gestiscono l'RNA, che è cruciale per la produzione di proteine e per rispondere allo stress. Le Mutazioni in DDX3X possono portare a vari disturbi, inclusi quelli che riguardano lo sviluppo cerebrale e alcuni tipi di cancro.

Sia DDX3X che DDX3Y sono presenti in molti tipi diversi di cellule in tutto il corpo. DDX3X è espresso da entrambe le copie del cromosoma X nelle femmine, mentre nei maschi è espresso dal singolo cromosoma X. DDX3Y, d'altra parte, è studiato principalmente in relazione alla fertilità maschile, poiché è espresso nei testicoli.

Somiglianze e Differenze

A livello proteico, DDX3X e DDX3Y condividono circa il 91% dei loro mattoncini, noti come amminoacidi. Anche se alcune parti delle loro strutture sono cambiate, le aree che si legano all'RNA e aiutano nella sua elaborazione rimangono per lo più le stesse. Alcuni esperimenti hanno suggerito che DDX3Y può svolgere compiti simili a DDX3X in ambienti di laboratorio. Tuttavia, studi recenti suggeriscono che le due proteine hanno ruoli sovrapposti ma distinti, in particolare nel modo in cui gestiscono lo stress e regolano la sintesi proteica.

Come Restano Attivi DDX3X e DDX3Y

Ci sono solo pochi geni che sono sopravvissuti ai cambiamenti evolutivi che hanno trasformato i cromosomi normali in cromosomi sessuali. Il cromosoma X ha ancora un gran numero di geni, mentre il cromosoma Y ne ha persi molti nel tempo. Nonostante ciò, alcuni geni, inclusi DDX3X e DDX3Y, sono rimasti intatti e funzionanti.

È interessante notare che i livelli di DDX3X sono simili nelle cellule maschili e femminili, ma il modo in cui viene espresso può essere influenzato dalla presenza di DDX3Y. Questo ha portato i ricercatori a credere che ci siano controlli speciali per regolare quanto DDX3X e DDX3Y vengano prodotti.

Sensibilità alla Dose di DDX3X e DDX3Y

I ricercatori hanno scoperto che sia DDX3X che DDX3Y sono particolarmente sensibili ai cambiamenti nei loro livelli. Quando ci sono più copie di un gene, di solito ha un effetto a catena sull'altro gene. Ad esempio, nelle cellule con cromosomi Y extra, i livelli di DDX3Y aumentano, mentre i livelli di DDX3X diminuiscono. Al contrario, nelle cellule con più cromosomi X, i livelli di DDX3X aumentano mentre i livelli di DDX3Y diminuiscono. Questa relazione unica tra i due geni non si vede in altre coppie di geni X-Y e mostra che probabilmente si sono evoluti insieme in un modo speciale.

Testare la Sensibilità alla Dose

Per verificare quanto siano sensibili alla dose DDX3X e DDX3Y, i ricercatori hanno esaminato 17 altre coppie di geni umani X-Y. Hanno scoperto che solo DDX3X e DDX3Y mostravano questa risposta distintiva ai cambiamenti nei loro numeri. Hanno misurato l'espressione da entrambi i cromosomi X nelle femmine e hanno osservato quanto a lungo questi geni siano stati conservati in altri mammiferi.

Nella loro analisi, è stato trovato che DDX3X era più sensibile ai cambiamenti nei suoi livelli rispetto ad altri geni, a indicare che la sua espressione è strettamente controllata.

Espressione in Diversi Tessuti

DDX3X e DDX3Y non sono solo altamente sensibili; sono anche ampiamente espressi in vari tessuti del corpo. Questo ampio modello di espressione suggerisce che possano avere ruoli importanti in molti processi biologici. I ricercatori hanno esaminato i geni delle galline per studiare come questi geni potrebbero essere stati espressi in passato.

Confrontando i livelli di espressione sia negli esseri umani che nelle galline, sembra che DDX3X e DDX3Y abbiano mantenuto un requisito simile per una corretta dose nel tempo.

Cambiamenti nei Livelli Genetici

I ricercatori hanno anche studiato cosa succede a DDX3X e DDX3Y quando cambia il numero dei loro cromosomi. In casi in cui gli individui avevano più di un cromosoma Y, i livelli di DDX3Y aumentavano, mentre i livelli di DDX3X scendevano. Al contrario, un aumento del numero di cromosomi X portava a livelli più alti di DDX3X ma a livelli più bassi di DDX3Y.

Hanno scoperto che questo comportamento è unico per DDX3X e DDX3Y rispetto ad altre coppie di geni, suggerendo un meccanismo regolatorio specifico tra di loro.

Interazioni Tra DDX3X e DDX3Y

I ricercatori hanno esplorato cosa succede se un gene è notevolmente ridotto - come nei casi in cui DDX3Y è eliminato. Hanno scoperto che i livelli di DDX3X aumentavano significativamente in quegli individui, confermando che la produzione di DDX3X è compensativa quando DDX3Y è assente.

In esperimenti in cui hanno intenzionalmente ridotto i livelli di DDX3X o DDX3Y in cellule coltivate, hanno osservato l'aumento opposto nell'altro gene. Questa regolazione incrociata negativa indica che DDX3X e DDX3Y lavorano insieme per mantenere un equilibrio nei loro livelli, influenzando come funzionano.

Regolazione Generale dei Geni

Lo studio ha sottolineato che la regolazione incrociata tra DDX3X e DDX3Y non si applica solo in un contesto. Mostra che questo meccanismo è probabilmente operativo in vari tessuti e tipi cellulari. Ciò significa che i cambiamenti nei livelli di un gene possono influenzare l'espressione dell'altro gene, aiutando a mantenere sotto controllo le loro attività.

I ricercatori hanno anche esaminato da vicino i cambiamenti nell'Espressione genica in persone con trisomia 21. Hanno scoperto che i livelli di DDX3X e DDX3Y non fluttuavano nel contesto dell'aggiunta del cromosoma 21, confermando che le loro interazioni regolatorie non erano semplicemente una risposta ai cambiamenti nei numeri dei cromosomi, ma specificamente tra i due geni DDX.

Il Meccanismo Dietro la Regolazione

È stata ipotizzata l'idea che la regolazione di DDX3X e DDX3Y possa derivare da un sistema più antico di regolazione trovato nel loro antenato comune, che non era legato al sesso. Le prove mostrano che in lieviti, un gene simile si comporta in un modo che suggerisce che possa auto-regolare i suoi livelli.

Questo significa che il modo in cui DDX3X e DDX3Y si regolano a vicenda e gestiscono la loro espressione probabilmente è evoluto da un meccanismo ancora più antico, accennando a una lunga storia di funzioni regolatorie che sono perseverate attraverso l'evoluzione.

DDX3X e Stabilità dell'Espressione

Si sa che DDX3X si lega al proprio RNA, il che significa che potrebbe avere un modo di influenzare quanto a lungo il suo messaggio rimanga stabile nella cellula. Gli esperimenti indicano che quando i livelli di DDX3Y erano alti, l'RNA di DDX3X diventava meno stabile, portando a livelli complessivi più bassi. In situazioni in cui i livelli di DDX3Y aumentavano, i livelli di DDX3X scendevano significativamente, indicando un impatto diretto sulla stabilità di DDX3X.

Questo suggerisce che DDX3Y potrebbe giocare un ruolo nella regolazione della quantità di RNA di DDX3X presente, offrendo un'idea su quanto sia delicato il loro rapporto.

Conclusione e Implicazioni Più Ampie

Il rapporto intricato tra DDX3X e DDX3Y mette in evidenza le complessità della regolazione genica sui cromosomi sessuali. La regolazione incrociata e l'auto-regolazione di questi geni suggeriscono un meccanismo altamente evoluto che aiuta a mantenere l'equilibrio nell'espressione genica.

Questo lavoro apre nuove strade per capire come questi geni siano coinvolti nella salute e nella malattia, specialmente in condizioni legate ai cromosomi sessuali. Le ricerche future potrebbero concentrarsi su come funzionano questi meccanismi regolatori in diversi contesti, illuminando ulteriormente i ruoli di DDX3X e DDX3Y nella biologia umana. I risultati sottolineano non solo l'importanza di specifici geni, ma anche la necessità di considerare come questi geni interagiscano tra di loro nel grande schema della genetica.

Fonte originale

Titolo: Post-transcriptional cross- and auto-regulation buffer expression of the human RNA helicases DDX3X and DDX3Y

Estratto: The Y-linked gene DDX3Y and its X-linked homolog DDX3X survived the evolution of the human sex chromosomes from ordinary autosomes. DDX3X encodes a multi-functional RNA helicase, with mutations causing developmental disorders and cancers. We find that, among X-linked genes with surviving Y homologs, DDX3X is extraordinarily dosage-sensitive. Studying cells of individuals with sex chromosome aneuploidy, we observe that when the number of Y chromosomes increases, DDX3X transcript levels fall; conversely, when the number of X chromosomes increases, DDX3Y transcript levels fall. In 46,XY cells, CRISPRi knockdown of either DDX3X or DDX3Y causes transcript levels of the homologous gene to rise. In 46,XX cells, chemical inhibition of DDX3X protein activity elicits an increase in DDX3X transcript levels. Thus, perturbation of either DDX3X or DDX3Y expression is buffered - by negative cross-regulation of DDX3X and DDX3Y in 46,XY cells, and by negative auto-regulation of DDX3X in 46,XX cells. DDX3X-DDX3Y cross-regulation is mediated through mRNA destabilization - as shown by metabolic labeling of newly transcribed RNA - and buffers total levels of DDX3X and DDX3Y protein in human cells. We infer that post-transcriptional auto-regulation of the ancestral (autosomal) DDX3 gene transmuted into auto- and cross-regulation of DDX3X and DDX3Y as these sex-linked genes evolved from ordinary alleles of their autosomal precursor.

Autori: David C Page, S. Rengarajan, J. Derks, D. W. Bellott, N. Slavov

Ultimo aggiornamento: 2024-07-10 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.08.602613

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.08.602613.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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