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Nuove scoperte sull'importazione delle proteine nei mitocondri

La ricerca rivela come i ribosomi interagiscono con i mitocondri per l'importazione di proteine.

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Indice

I Mitocondri sono piccole strutture all'interno delle nostre cellule e giocano un ruolo fondamentale nella produzione di energia. Spesso vengono chiamati "centrali energetiche" della cellula. I mitocondri sono composti da due Membrane e sono essenziali per diverse funzioni, tra cui la produzione di energia, reazioni chimiche e risposta allo stress. Ogni mitocondrio contiene il proprio materiale genetico e la macchina per produrre proteine, ma solo una piccola parte delle proteine nei mitocondri proviene da questo DNA specifico. La maggior parte delle proteine viene prodotta nel nucleo cellulare e poi inviata ai mitocondri.

Per un'Importazione di proteine nei mitocondri, deve avere segnali speciali all'inizio della sua struttura. Questi segnali aiutano le proteine a trovare la strada per entrare nei mitocondri attraverso la membrana esterna. Canali specifici aiutano a trasportare queste proteine ulteriormente nei mitocondri dove sono necessarie, in particolare nella membrana interna e nello spazio della matrice all'interno dei mitocondri.

Se ci sono problemi nel modo in cui le proteine vengono importate nei mitocondri, possono sorgere vari problemi di salute, come malattie cerebrali, problemi metabolici e altre condizioni di salute. Questo dimostra quanto sia importante che l'importazione di proteine nei mitocondri funzioni correttamente per mantenere le nostre cellule in salute.

Come Le Proteine Entrano Nei Mitocondri

La maggior parte delle proteine che finiscono nei mitocondri vengono prodotte nel citoplasma, la parte fluida della cellula. Dopo essere state create, vengono inviate ai mitocondri per ulteriori elaborazioni. Ci sono prove che alcune di queste proteine possano anche iniziare ad entrare nei mitocondri mentre sono ancora in fase di costruzione. Questo è stato suggerito da studi più vecchi che hanno trovato ribosomi, le parti delle cellule che producono proteine, situati vicino alle membrane mitocondriali.

Studi recenti hanno mostrato che alcuni tipi di RNA messaggero (mRNA), che trasportano istruzioni dal DNA per la produzione di proteine, si trovano anche vicino ai mitocondri. Questo suggerisce che alcune proteine possano essere importate nei mitocondri mentre sono ancora in fase di formazione e che la presenza di mRNA nelle vicinanze possa supportare questo processo.

Anche se è chiaro che alcune proteine entrano nei mitocondri mentre vengono prodotte, i dettagli di questo processo sono ancora un po' confusi. Esiste un complesso di proteine chiamato complesso associato ai polipeptidi nascenti (NAC) che aiuta i ribosomi a interagire con i mitocondri, facilitando l'importazione delle proteine. Sono state identificate alcune proteine sulla membrana esterna mitocondriale come importanti in questo processo. Tuttavia, le specifiche su come funzionano queste interazioni sono ancora oggetto di studio.

Tecniche di imaging cruciali, come la crio-tomografia elettronica, consentono agli scienziati di catturare immagini dettagliate delle cellule, comprese quelle dei mitocondri e delle proteine attorno ad essi. Questo aiuta a visualizzare le interazioni tra ribosomi e mitocondri. Tuttavia, poiché l'importazione di proteine nei mitocondri è meno comune rispetto ai processi simili che avvengono in altre strutture cellulari, studiarla può essere piuttosto difficile.

Lo Studio delle Interazioni Tra Ribosomi e Mitocondri

In uno studio recente, i ricercatori hanno utilizzato tecniche di imaging avanzate per esaminare da vicino come i ribosomi interagiscono con i mitocondri nelle cellule di lievito. Hanno cercato di creare fette sottili delle cellule per vedere le strutture in grande dettaglio. Volevano scoprire quanti ribosomi erano nelle vicinanze e come erano disposti quando le proteine venivano importate nei mitocondri.

Hanno scoperto che l'uso di condizioni di crescita specifiche potrebbe aiutare ad aumentare il numero di ribosomi vicini ai mitocondri. Trattando le cellule con inibitori dell'allungamento della traduzione, potevano arrestare il processo di produzione di proteine e aumentare la quantità di ribosomi trovati sulla superficie mitocondriale.

Utilizzando la crio-microscopia a fluorescenza, gli scienziati hanno valutato i campioni per trovare le aree migliori per ulteriori analisi. Applicando una tecnica di fresatura con fascio ionico focalizzato, hanno creato sezioni sottili delle cellule e poi hanno usato la crio-tomografia elettronica per ottenere immagini 3D delle strutture all'interno di queste sezioni sottili.

Durante il loro lavoro, sono stati in grado di localizzare singoli ribosomi sulla superficie mitocondriale e confermare che il trattamento aumentava la quantità di ribosomi associati ai mitocondri. Questo ha confermato scoperte precedenti e ha mostrato che trattamenti specifici potevano migliorare lo studio dell'importazione di proteine nei mitocondri.

Analizzando Le Disposizioni E Le Interazioni Dei Ribosomi

Per dare un senso ai ribosomi trovati vicino ai mitocondri, i ricercatori hanno sviluppato un metodo per analizzare le posizioni e le orientazioni di questi ribosomi in relazione alla membrana esterna mitocondriale. Guardando le distanze tra i ribosomi e la superficie della membrana, potevano identificare quali ribosomi erano probabilmente coinvolti nel processo di importazione delle proteine.

Hanno scoperto che specifici ribosomi erano disposti in modo tale da suggerire che stessero lavorando insieme. Questo è simile a ciò che si vede nei polisomi, dove più ribosomi traducono lo stesso mRNA. Il modo in cui questi ribosomi si raggruppavano era significativo, poiché poteva indicare cooperazione nell'importare proteine nei mitocondri.

È interessante notare che i ricercatori hanno anche scoperto che le distanze tra le membrane esterna e interna dei mitocondri erano più piccole dove si trovavano questi ribosomi. Questo indicava che potrebbero esserci cambiamenti nella struttura delle membrane per facilitare il processo di movimento delle proteine nei mitocondri.

Il loro studio ha mostrato che un gruppo selezionato di ribosomi era posizionato in modo ottimale per importare proteine nei mitocondri e che si erano create connessioni fisiche tra questi ribosomi e la membrana mitocondriale. Queste connessioni probabilmente giocano un ruolo nel stabilizzare il processo di importazione delle proteine.

La Struttura Delle Interazioni Dei Ribosomi Con I Mitocondri

I ricercatori hanno creato un modello 3D dettagliato dei ribosomi che interagiscono con la membrana mitocondriale. Hanno identificato molteplici punti di contatto dove i ribosomi e la membrana esterna mitocondriale si collegano attorno all'area dove le proteine tipicamente escono dal Ribosoma. Questi punti di contatto erano specifici per ribosomi che erano probabilmente impegnati nell'importazione di proteine.

Utilizzando modelli delle strutture ribosomiali, potevano adattare questi ribosomi ai loro risultati di imaging. Questo ha rivelato come specifici componenti di RNA ribosomiale potrebbero interagire con la membrana mitocondriale. Hanno osservato che alcuni di questi contatti sono simili a contatti osservati in altre strutture cellulari, come il reticolo endoplasmatico, dove i ribosomi importano anche proteine.

Le loro scoperte evidenziano che, sebbene ci possano essere somiglianze nel modo in cui le cellule gestiscono le importazioni di proteine attraverso diversi organelli, le specifiche possono variare. Comprendere questi dettagli fornisce un quadro più chiaro di come i ribosomi lavorano ai mitocondri.

L'Importanza Del Raggruppamento Dei Ribosomi E Dell'Architettura Delle Membrane

Lo studio ha anche esaminato come i ribosomi si sistemassero e si raggruppassero sulla superficie mitocondriale. Questi gruppi si pensa possano migliorare l'efficienza dell'importazione delle proteine. I ricercatori hanno utilizzato strumenti statistici per determinare quanto fossero associati strettamente i ribosomi, e i loro risultati indicavano che quelli coinvolti nell'importazione delle proteine si raggruppavano effettivamente più strettamente di quelli che non lo erano.

Questo comportamento di raggruppamento è interessante perché assomiglia a come i ribosomi sul reticolo endoplasmatico lavorano insieme per importare proteine. I risultati suggerivano che i ribosomi sui mitocondri potrebbero anche formare disposizioni simili per facilitare la loro funzione.

I ricercatori hanno anche esaminato come le regioni associate ai ribosomi influenzassero l'architettura locale delle membrane mitocondriali. Hanno trovato che c'erano cambiamenti nello spazio tra le membrane esterna e interna in regioni in cui i ribosomi erano coinvolti nell'importazione delle proteine. Questo indicava che l'atto di importare proteine potrebbe causare cambiamenti strutturali nelle membrane per abilitare il processo.

In generale, il loro lavoro ha evidenziato l'importanza di comprendere come ribosomi e mitocondri interagiscono, poiché questo può aiutare a chiarire come le proteine vengano importate in modo efficiente nei mitocondri.

Conclusione

In sintesi, lo studio mirava a capire come i ribosomi interagiscono con i mitocondri durante l'importazione delle proteine. Attraverso tecniche avanzate di imaging e analisi, i ricercatori hanno identificato specifici ribosomi coinvolti nell'importazione delle proteine nei mitocondri. Hanno dimostrato come questi ribosomi si raggruppano e come questo raggruppamento si relaziona alla struttura delle membrane mitocondriali. Inoltre, hanno rivelato connessioni fisiche tra ribosomi e membrana mitocondriale, facendo luce sui meccanismi dietro il processo di importazione delle proteine.

Le loro scoperte potrebbero portare a una comprensione più profonda della funzione cellulare e della salute, specialmente riguardo a malattie che influenzano la funzione mitocondriale. Comprendere come le proteine entrano nei mitocondri è essenziale per afferrare come le cellule mantengano la produzione di energia e la salute cellulare generale. La ricerca futura in questo campo potrebbe aiutare a sviluppare nuove strategie per trattare malattie legate a disfunzioni mitocondriali.

Fonte originale

Titolo: Cytoplasmic ribosomes on mitochondria alter the local membrane environment for protein import

Estratto: Most of the mitochondria proteome is nuclear-encoded, synthesized by cytoplasmic ribosomes, and targeted to mitochondria post-translationally. However, a subset of mitochondrial-targeted proteins is imported co-translationally, although the molecular mechanisms governing this process remain unclear. We employ cellular cryo-electron tomography to visualize interactions between cytoplasmic ribosomes and mitochondria in Saccharomyces cerevisiae. We use surface morphometrics tools to identify a subset of ribosomes optimally oriented on mitochondrial membranes for protein import. This allows us to establish the first subtomogram average structure of a cytoplasmic ribosome on the surface of the mitochondria in the native cellular context, which showed three distinct connections with the outer mitochondrial membrane surrounding the peptide exit tunnel. Further, this analysis demonstrated that cytoplasmic ribosomes primed for mitochondrial protein import cluster on the outer mitochondrial membrane at sites of local constrictions of the outer and inner mitochondrial membrane. Overall, our study reveals the architecture and the spatial organization of cytoplasmic ribosomes at the mitochondrial surface, providing a native cellular context to define the mechanisms that mediate efficient mitochondrial co-translational protein import. SUMMARYChang et al. present a membrane-guided approach for identifying a subset of cytoplasmic ribosomes oriented for protein import on the mitochondrial surface in Saccharomyces cerevisiae using cryo-electron tomography. They show that ribosomes cluster, make multiple contacts with, and induce local changes to the mitochondrial membrane ultrastructure at import sites.

Autori: Danielle A Grotjahn, Y.-T. Chang, B. A. Barad, H. Rahmani, B. M. Zid

Ultimo aggiornamento: 2024-07-19 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.17.604013

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.17.604013.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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