Chiarire il concetto di sciami ibridi
Lo studio esamina il termine 'sciame ibrido' e le sue implicazioni nella ricerca sull'ibridazione.
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Indice
La Ibridazione succede quando due specie diverse si accoppiano e producono prole. Questo processo può portare a vari risultati, come la creazione di nuove specie, il mescolamento dei geni tra le specie genitrici, o anche la produzione di ibridi che non possono riprodursi. L'ibridazione è stata importante per formare la varietà di specie che vediamo oggi. Per esempio, molti nuovi tipi di pesci cichlidi sono apparsi grazie all'ibridazione naturale tra diverse linee cichlide.
Tuttavia, l'impatto dell'ibridazione sulla biodiversità può essere confuso. È difficile definire le specie quando si mescolano e l'ibridazione avviene in continuazione. Quando le specie si mescolano, può verificarsi una situazione in cui alcuni individui vengono sostituiti da ibridi. Questo mescolamento genetico può rendere difficile classificare le specie, portando a diverse interpretazioni tra i ricercatori su cosa sia effettivamente un Ibrido.
Che cos'è un Alveare Ibrido?
Il termine "alveare ibrido" è stato usato negli studi sull'ibridazione. È stato definito per la prima volta quasi un secolo fa come un gruppo fluttuante di ibridi che mostrano tratti misti, spesso piegandosi verso una specie genitrice. Tuttavia, il modo in cui viene usato questo termine è cambiato nel tempo e può significare cose diverse per persone diverse.
Lo scopo di uno studio recente era chiarire cosa intendono i ricercatori con "alveare ibrido", quanto questo termine è usato in modo coerente tra le diverse specie, e se dovrebbe continuare ad essere usato. Questo studio ha incluso un'analisi dettagliata di come il termine appare nella letteratura scientifica, comprese quali specie sono state studiate, come sono stati identificati gli ibridi, e quante specie erano coinvolte.
Raccolta Dati
I ricercatori hanno raccolto articoli scientifici attraverso un processo dettagliato utilizzando un metodo di ricerca specifico. Hanno impostato una ricerca che si concentrava sugli alveari ibridi e sulla biologia. Dopo le ricerche iniziali, gli articoli non pertinenti al loro argomento sono stati filtrati. I ricercatori hanno raccolto un totale di 148 articoli, di cui 111 sono risultati unici. Hanno classificato gli articoli in base a se discutevano di ibridazione e se era presente un alveare ibrido attivo.
Per raccogliere informazioni dettagliate, due persone hanno letto ogni articolo pertinente ed estratto dati su vari aspetti dell'ibridazione. Questo includeva il tipo di prove per l'ibridazione, quali specie erano coinvolte, quanti individui erano stati studiati e quante generazioni di ibridi erano state notate.
Analizzando i Dati
I ricercatori hanno creato delle linee temporali per mostrare eventi chiave legati al termine "alveare ibrido" e hanno tracciato la frequenza del suo utilizzo nel tempo. Hanno trovato 67 articoli rilevanti per l'ibridazione, di cui 49 descrivevano alveari ibridi attivi. La prima occorrenza del termine nella loro ricerca risale al 1989.
I risultati hanno mostrato che la maggior parte degli studi si è concentrata sulle piante come soggetto principale quando si discuteva di alveari ibridi. I sistemi ibridi a due specie erano i più comuni studiati, mentre quelli con più di due specie erano meno frequenti.
I dati hanno rivelato che la maggior parte degli studi non coinvolgeva molti individui, e c'era una tendenza a mostrare che lo stesso schema era valido per il numero di siti di campionamento e loci genetici utilizzati in uno studio.
Modelli nelle Prove
Negli ultimi anni, gli studi hanno usato sempre di più le varianti di nucleotide singolo (SNP) per descrivere gli alveari ibridi. Questa tendenza è stata accompagnata da un calo nell'uso dei marcatori microsatelliti. Le prove provenienti da studi genetici sono rimaste stabili, mentre l'uso di prove fenotipiche è rimasto costante, ma le prove genetiche sono state citate più spesso in generale.
Gli articoli di ricerca che descrivevano alveari ibridi sono stati pubblicati più frequentemente negli ultimi anni. In modo particolare, le popolazioni di pesci rappresentate come alveari ibridi erano spesso soggette a perturbazioni, a differenza delle popolazioni vegetali.
Risultati dell'Ibridazione
In termini di tipi di ibridi trovati nei sistemi attivi di alveari ibridi, la presenza di ibridi di prima generazione (F1) era comune. I risultati trovati in questi studi variavano ampiamente, con alcuni studi che mostravano esempi di tutti e tre i tipi di ibridi (F1, ibridi di seconda generazione e ricrossamenti) mentre altri non avevano alcuno.
Altri studi hanno messo in evidenza la complessità delle dinamiche di ibridazione. Alcuni documenti descrivevano gli alveari ibridi come aventi molti individui ricrossati, mentre altri non trovavano differenze chiare nei tipi di ibridi.
L'Ambiguità dell'Alveare Ibrido
Anche dopo approfondite ricerche, la vera definizione di un alveare ibrido rimane poco chiara. Molti articoli definivano gli alveari ibridi con criteri variabili relativi ai ricrossamenti o a caratteristiche specifiche degli ibridi. Il termine è stato usato in modi diversi per descrivere situazioni diverse riguardanti l'ibridazione, portando a ulteriore confusione.
Nonostante le assunzioni iniziali che gli alveari ibridi sarebbero stati facilmente definiti, la realtà è diversa. Gli studi indicano una mancanza di accordo su cosa costituisca un alveare ibrido, e molti articoli hanno faticato a chiarire i tipi di ibridi coinvolti.
Tendenze di Utilizzo nel Tempo
L'uso del termine alveare ibrido ha mostrato un aumento graduale dagli anni '90 fino a un picco intorno al 2016-2019, dopo di che il termine è diventato meno comune. Questo aumento è probabilmente legato a un incremento degli studi sull'ibridazione, alimentato dai progressi nelle tecnologie di sequenziamento che hanno reso più economico studiare molti individui.
La maggior parte dei documenti rivisti si concentrava su sistemi a due specie, il che indica che gli studi che coinvolgono più specie sono ancora relativamente rari. Questo evidenzia come il termine alveare ibrido possa semplificare eccessivamente le complessità dell'ibridazione in contesti naturali.
Mancanza di una Definizione Chiara
La relazione tra i concetti di stabilità, durata e alveari ibridi è anche poco chiara. Alcuni studi suggerivano che le zone ibride siano aree stabili di ibridazione, mentre gli alveari ibridi sono più dinamici e possono minacciare la sopravvivenza delle specie genitrici.
I ricercatori hanno trovato che il termine alveare ibrido è stato usato senza considerare per quanto tempo una zona ibrida fosse stata presente o la sua stabilità nel tempo. Non c'erano prove che il termine fosse legato a risultati specifici dell'ibridazione o che indicasse una categoria unica che richiedesse una propria definizione.
Fitness e Ibridazione
La fitness ibrida, o quanto bene si comportano gli individui ibridi rispetto alle loro specie genitrici, spesso non è un fattore chiave nella definizione degli alveari ibridi. Negli studi in cui è stata esaminata la fitness, molti non avevano misurazioni dirette disponibili per confrontare il vigore ibrido rispetto alle popolazioni genitrici.
Le stesse descrizioni generali di variabilità tra gli ibridi possono applicarsi a qualsiasi popolazione in cui esistano ibridi. Ciò significa che semplicemente etichettare un gruppo come un alveare ibrido non cattura le complessità coinvolte.
Conclusione
Il modo in cui i ricercatori usano il termine alveare ibrido varia notevolmente e spesso porta a confusione. Molti hanno notato che termini come "zona ibrida" e "ibridazione" potrebbero fungere da sostituti adeguati nella maggior parte dei casi. Questi termini vengono usati in modo intercambiabile in alcuni studi e potrebbero fornire descrizioni più precise delle dinamiche riguardanti la prole ibrida.
La takeaway principale è che il termine alveare ibrido non rappresenta un concetto unico che non può essere descritto con un linguaggio più chiaro. Man mano che il campo dell'ibridazione continua a crescere, è essenziale riflettere sulla terminologia utilizzata per garantire una comunicazione efficace e una comprensione dei risultati in quest'area di ricerca.
Titolo: The ambiguity of "hybrid swarm": inconsistent definitions and applications in existing research
Estratto: 1Hybridization is common in wild taxa and often increases in frequency following anthropogenic disturbance to an environment. Next-generation sequencing techniques make genomic analysis of a large number of individuals feasible, vastly improving the analysis for and promoting a greater frequency of studies on hybridization. However, terminology surrounding hybridization can be inconsistent; in particular, the term "hybrid swarm" has been used extensively in the literature but lacks a consistent definition. In this paper, we conducted a comprehensive review of the literature that uses the term "hybrid swarm" in reference to hybridization between taxa and challenged putative definitions of the term. We found that the term "hybrid swarm" is used in a variety of contexts, including some contradictory to other literature, and that there is little consensus on what constitutes a hybrid swarm in terms of hybrid outcomes, frequency relative to disturbances, or duration of existence. We dissuade researchers from use of the term "hybrid swarm" and instead suggest more specific and clear terminology to describe aspects of hybridization. Consequently, we hope that this paper promotes consensus surrounding hybridization terminology and improves the quality of future research on hybridization.
Autori: Amanda Vivian Meuser, J. N. Campbell, E. G. Mandeville, N. C. Lewis
Ultimo aggiornamento: 2024-10-12 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.11.617831
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.11.617831.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.