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Esaminando le connessioni neuronali con tecniche avanzate

La ricerca rivela come le risposte simili dei neuroni influenzano le loro connessioni.

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Alla fine del 1800, un scienziato di nome Santiago Ramón y Cajal studiò i Neuroni, che sono i mattoni fondamentali del sistema nervoso. Propose la Dottrina del Neurone, che suggerisce che ogni neurone è un'unità indipendente che gioca un ruolo chiave nel funzionamento del nostro cervello. Questa idea mette in evidenza che il modo in cui un neurone funziona è strettamente legato a come si connette con altri neuroni. Negli anni, molti ricercatori hanno proposto diverse idee su come queste connessioni e funzioni si relazionano tra loro.

Un'idea famosa è quella di Donald Hebb, che suggerì che i neuroni che si attivano insieme tendono a formare connessioni più forti. Questa idea viene spesso riassunta con "neuroni che si attivano insieme, si connettono insieme." Nella parte visiva del cervello, i ricercatori Hubel e Wiesel proposero che i neuroni sono organizzati in un modo che consente a caratteristiche semplici di combinarsi e formare risposte visive più complesse. Ad esempio, cellule specifiche rispondono alla direzione delle linee, mentre altre rispondono alla loro posizione.

Sfide nello Studio delle Connessioni Neurali

Studiare come i neuroni si connettono e funzionano è stato difficile a causa delle sfide tecniche legate alla misurazione sia dell'attività neurale che delle connessioni tra di loro. Nella corteccia visiva, gli scienziati hanno scoperto che i neuroni che rispondono in modo simile a stimoli visivi tendono a connettersi più spesso. Hanno utilizzato varie tecniche avanzate di imaging per osservare queste connessioni e l'attività dei neuroni coinvolti.

Tuttavia, la maggior parte di questi studi si è concentrata su piccoli aree del cervello. Questa limitazione rende difficile rispondere a domande più grandi su come le regole di connessione si applicano a diverse regioni del cervello e a diversi strati di neuroni.

Il Dataset MICrONS

Il dataset MICrONS è la più grande collezione di dati di imaging che combina sia informazioni funzionali che strutturali sui neuroni. I ricercatori hanno studiato un volume di tessuto cerebrale in un topo, esaminando diverse aree responsabili della visione. Hanno analizzato specificamente quanto bene diversi neuroni si connettono in base alle funzioni che svolgono.

Questo dataset permette un'esaminazione più dettagliata di tutti i neuroni nel volume studiato, a differenza di studi precedenti che si concentravano solo su alcuni neuroni. Offre l'opportunità di confrontare neuroni connessi con quelli vicini ma non connessi. Questo è importante per capire come neuroni che sono vicini tra loro possano comunque non connettersi.

Apprendimento Automatico per l'Analisi dei Neuroni

Per aiutare ad analizzare come funzionano questi neuroni, i ricercatori hanno utilizzato tecniche di apprendimento automatico. Allenando un modello per prevedere come i neuroni rispondono a vari stimoli visivi, hanno creato quello che viene chiamato "gemello digitale." Questo gemello digitale può simulare una gamma più ampia di input visivi di quanto potesse essere testato in esperimenti reali.

Il modello consente ai ricercatori di esaminare ulteriormente le caratteristiche di ogni neurone, scoprendo come reagiscono a diverse caratteristiche e dove si trovano i loro campi recettivi. Questa separazione delle caratteristiche e delle informazioni spaziali aiuta a chiarire come questi due aspetti si relazionano alle connessioni tra neuroni.

Raccolta Dati e Analisi dei Neuroni

I dati sono stati raccolti da un topo che era stato addestrato a rispondere a stimoli visivi mentre la sua attività cerebrale veniva registrata. Questo ha comportato l'uso di tecniche avanzate di imaging per catturare il comportamento e l'attività di molti neuroni contemporaneamente. I ricercatori hanno raccolto risposte da oltre 75.000 neuroni eccitatori unici mentre elaboravano vari tipi di film.

Dopo aver raccolto dati funzionali, il tessuto è stato preparato per ulteriori imaging per comprenderne la struttura in dettaglio. Questo includeva l'esame delle connessioni tra neuroni e l'identificazione dei loro ruoli nell'elaborazione delle informazioni visive.

Tipi di Coorti di Neuroni

Per capire meglio le relazioni tra neuroni, i ricercatori hanno definito tre gruppi principali per il confronto. Il primo gruppo includeva i neuroni che erano direttamente collegati a un neurone dato. Il secondo gruppo consisteva in neuroni vicini che avevano una prossimità ravvicinata al neurone dato ma non si connettevano. L'ultimo gruppo coinvolgeva neuroni della stessa area che non erano vicini all'assone del primo neurone.

Confrontando questi gruppi, i ricercatori potevano capire meglio come la Connettività si relaziona alla somiglianza funzionale.

Risultati sulla Connettività Neuronale

L'analisi ha trovato che i neuroni che mostravano risposte simili tendevano a connettersi più frequentemente. Questo era vero in diversi strati e aree della corteccia visiva. I neuroni che avevano correlazioni di segnale più elevate erano più propensi a essere connessi. I risultati hanno anche indicato che neuroni simili erano più propensi a viaggiare insieme nel cervello. Questo significa che i percorsi dei loro assoni si sovrapponevano spesso.

Inoltre, lo studio ha mostrato che più simili erano le risposte di due neuroni, più probabili erano le loro connessioni. Questa relazione era coerente in vari tipi di connessioni, sia che fossero localizzate all'interno di un'area della corteccia o diffuse su diverse aree.

Risposte Neuronali e la Loro Forza

I ricercatori hanno anche esaminato come la forza delle connessioni tra neuroni si relazionava alla loro somiglianza funzionale. Hanno scoperto che man mano che la somiglianza funzionale aumentava, aumentava anche il numero di Sinapsi che collegavano i neuroni. Questo suggerisce che i neuroni funzionalmente simili tendono a sviluppare connessioni più forti.

L'analisi ha rivelato che sia la dimensione della sinapsi che il numero di connessioni sinaptiche aumentavano con una maggiore somiglianza funzionale. Questo si allinea con l'idea che i neuroni che rispondono a stimoli simili rafforzano le loro connessioni mentre vengono attivati insieme.

Importanza della Somiglianza dei Pesi delle Caratteristiche

Un'altra area chiave di focus era sulla somiglianza dei pesi delle caratteristiche, che si riferisce a quanto fossero simili i neuroni in termini di quali caratteristiche rispondevano. I ricercatori hanno scoperto che le connessioni tra neuroni erano meglio previste dalla loro somiglianza nelle caratteristiche piuttosto che dalla distanza fisica tra i loro campi recettivi.

Questo significa che anche se due neuroni sono vicini tra loro ma rispondono a caratteristiche diverse, potrebbero non essere connessi. Al contrario, i neuroni che rispondono a caratteristiche simili, anche se più lontani, hanno maggiori probabilità di formare connessioni.

Approfondimenti dal Modello del Gemello Digitale

Il modello del gemello digitale ha permesso ai ricercatori di analizzare e suddividere le risposte neuronali in caratteristiche specifiche e posizioni, contribuendo a una comprensione più profonda delle regole di connettività. Simulando come i neuroni rispondono a una vasta gamma di stimoli, il modello ha fornito un quadro più ricco delle relazioni tra i diversi neuroni.

Questo punto di vista complessivo consente ai ricercatori di prevedere la connettività basata su più di una semplice prossimità fisica, ma piuttosto sulle caratteristiche funzionali dei neuroni. Gli approfondimenti ottenuti da questa analisi potrebbero informare future indagini su come il cervello si organizza attorno a funzioni specifiche.

Organizzazione Funzionale di Ordine Superiore

Inoltre, lo studio ha esplorato come i neuroni che condividono un input comune mostrano maggiore somiglianza di quanto ci si aspetterebbe, suggerendo che le connessioni tra questi neuroni non sono semplicemente basate su connessioni individuali. Indica che ci sono principi organizzativi più complessi in gioco nel cervello.

I risultati suggeriscono che potrebbero esserci motivi o schemi oltre le semplici regole, accennando a una rete di connessioni più sofisticata formata sulla base di proprietà funzionali condivise.

Confronto con Reti Neurali Artificiali

Per fare luce sulle potenziali funzioni della connettività simile vista nel dataset, i ricercatori hanno esaminato le reti neurali ricorrenti. Questi sistemi artificiali hanno dimostrato che principi simili di connettività sono presenti, beneficiando di connessioni simili per quanto riguarda le prestazioni e l'apprendimento.

Confrontando le prestazioni di una rete neurale addestrata con connessioni casuali, i ricercatori hanno scoperto che le connessioni basate sulla somiglianza erano più efficaci per il funzionamento della rete. Questo solleva domande interessanti su come strutture organizzative simili possano esistere sia nei sistemi biologici che in quelli artificiali.

Direzioni Future nella Ricerca

Capire come le strutture cerebrali si relazionano alle loro funzioni è un obiettivo centrale nelle neuroscienze. I risultati provenienti da questo dataset, in particolare le relazioni tra le funzioni dei neuroni e le connessioni, forniscono spunti preziosi. L'uso di tecniche avanzate di imaging e algoritmi di apprendimento automatico apre nuove strade per l'esplorazione.

Man mano che più dati diventano disponibili, i ricercatori possono continuare a svelare le complessità dell'organizzazione cerebrale. I futuri studi potrebbero concentrarsi su strutture di rete più ampie o connessioni a livello di compartimenti sub-cellulari, aiutando a chiarire come proprietà funzionali più complesse emergano da regole semplici.

Conclusione

In sintesi, gli studi condotti sul dataset MICrONS evidenziano l'importanza di comprendere le connessioni tra neuroni e la loro funzione. I risultati supportano l'idea che i neuroni che rispondono in modo simile sono più propensi a connettersi tra loro, rivelando principi essenziali della connettività neurale.

Questa ricerca fornisce una base per studi futuri che continueranno a esplorare le intricate relazioni all'interno del cervello e ad ampliare la nostra conoscenza di come reti interconnesse di neuroni elaborano informazioni.

Fonte originale

Titolo: Functional connectomics reveals general wiring rule in mouse visual cortex

Estratto: Understanding the relationship between circuit connectivity and function is crucial for uncovering how the brain implements computation. In the mouse primary visual cortex (V1), excitatory neurons with similar response properties are more likely to be synaptically connected, but previous studies have been limited to within V1, leaving much unknown about broader connectivity rules. In this study, we leverage the millimeter-scale MICrONS dataset to analyze synaptic connectivity and functional properties of individual neurons across cortical layers and areas. Our results reveal that neurons with similar responses are preferentially connected both within and across layers and areas -- including feedback connections -- suggesting the universality of the like-to-like connectivity across the visual hierarchy. Using a validated digital twin model, we separated neuronal tuning into feature (what neurons respond to) and spatial (receptive field location) components. We found that only the feature component predicts fine-scale synaptic connections, beyond what could be explained by the physical proximity of axons and dendrites. We also found a higher-order rule where postsynaptic neuron cohorts downstream of individual presynaptic cells show greater functional similarity than predicted by a pairwise like-to-like rule. Notably, recurrent neural networks (RNNs) trained on a simple classification task develop connectivity patterns mirroring both pairwise and higher-order rules, with magnitude similar to those in the MICrONS data. Lesion studies in these RNNs reveal that disrupting like-to-like connections has a significantly greater impact on performance compared to lesions of random connections. These findings suggest that these connectivity principles may play a functional role in sensory processing and learning, highlighting shared principles between biological and artificial systems.

Autori: Andreas S. Tolias, Z. Ding, P. G. Fahey, S. Papadopoulos, E. Y. Wang, B. Celii, C. Papadopoulos, A. Chang, A. Kunin, D. Tran, J. Fu, S. Patel, L. Ntanavara, R. Froebe, K. Ponder, T. Muhammad, J. A. Bae, A. L. Bodor, D. Brittain, J. Buchanan, D. J. Bumbarger, M. A. Castro, E. Cobos, S. Dorkenwald, L. Elabbady, A. Halageri, Z. Jia, C. Jordan, D. Kapner, N. Kemnitz, S. Kinn, K. Lee, K. Li, R. Lu, T. Macrina, G. Mahalingam, E. Mitchell, S. S. Mondal, S. Mu, B. Nehoran, S. Popovych, C. M. Schneider-Mizell, W. Silversmith, M. Takeno, R. Torres, N. L. Turner, Wong

Ultimo aggiornamento: 2024-10-15 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.13.531369

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.13.531369.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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