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# La biologia# Biologia del cancro

Nuove scoperte sul targeting epigenetico per il trattamento del cancro

La ricerca mette in luce il potenziale di mirare ai cambiamenti epigenetici nelle terapie per il cancro.

Luke Gilbert, A. Y. Ge, A. Arab, R. Dai, A. Navickas, L. Fish, K. Garcia, H. Asgharian, J. Goudreau, S. Lee, K. Keenan, M. B. Pappalardi, M. T. McCabe, L. Przybyla, H. Goodarzi

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Il cancro è una malattia complessa dove certi cambiamenti nel funzionamento dei geni possono portare a una crescita cellulare incontrollata. Un grosso problema osservato nelle cellule tumorali è la disregolazione epigenetica. Questo significa che il modo in cui i geni vengono attivati o silenziati è alterato, portando spesso a caratteristiche comuni nel cancro, come la capacità dei tumori di crescere, diffondersi e resistere ai trattamenti.

Ricerche recenti mostrano che molte cellule tumorali hanno anomalie nel modo in cui i loro geni sono regolati da fattori epigenetici. Questi fattori possono cambiare l'Espressione genica senza alterare la sequenza di DNA. Sono state trovate mutazioni in geni che controllano la metilazione del DNA, un processo epigenetico importante, in molti tipi di cancro. Ad esempio, geni come DNMT3A, TET1-3 e IDH1/2 sono spesso mutati nel cancro. Questo suggerisce che mirare a questi cambiamenti epigenetici potrebbe essere un nuovo modo per trattare il cancro.

Mirare ai Cambiamenti Epigenetici nel Trattamento del Cancro

Data questa situazione, c'è stato un crescente interesse nello sviluppo di trattamenti per il cancro che si concentrano su questi cambiamenti epigenetici. Un approccio promettente è l'uso di farmaci che alterano la metilazione del DNA nelle cellule cancerose. Un farmaco specifico chiamato decitabina ha mostrato alcuni successi nel trattare certi tipi di leucemia, in particolare la leucemia mieloide acuta (LMA). La decitabina funziona rendendo il DNA meno metilato, il che può portare a cambiamenti nell'espressione genica che potrebbero uccidere le cellule tumorali.

La decitabina si è rivelata utile per pazienti con certe anomalie genetiche e per quelli con prognosi sfavorevole. Tuttavia, nonostante la sua efficacia, la maggior parte dei pazienti alla fine scopre che il loro cancro torna, portando a un periodo di sopravvivenza di meno di un anno per molti.

Nonostante questi risultati incoraggianti, c'è ancora una comprensione limitata sul perché alcuni pazienti rispondano meglio alla decitabina rispetto ad altri. Studi recenti suggeriscono che mutazioni comuni, come quelle trovate in geni come DNMT3A, IDH1/2 e TP53, non prevedono necessariamente come i pazienti risponderanno alla decitabina. Questo è strano, poiché inizialmente si credeva che queste mutazioni avrebbero reso i tumori più vulnerabili al trattamento.

Indagare il Meccanismo della Decitabina

Capire come funziona la decitabina, specialmente nei tumori con mutazioni di TP53, potrebbe aiutare a sviluppare strategie di trattamento migliori. Alcune teorie suggeriscono che la decitabina potrebbe attivare la morte cellulare attraverso vie che non coinvolgono TP53. Questo significa che potrebbero esserci altri modi in cui la decitabina porta alla morte delle cellule tumorali.

Un'altra idea è che la decitabina potrebbe portare alla produzione di trascritti insoliti che attivano la risposta immunitaria, aiutando il corpo a combattere il cancro. Inoltre, la decitabina potrebbe indurre un processo chiamato differenziazione nelle cellule LMA, rendendole meno aggressive e più simili a cellule normali, il che potrebbe migliorare i risultati del trattamento.

Usare CRISPR per Capire la Risposta ai Farmaci

Per scoprire quali geni sono coinvolti nella risposta delle cellule LMA alla decitabina, i ricercatori hanno usato una tecnologia potente chiamata CRISPR. Questo approccio ha permesso agli scienziati di disattivare diversi geni nelle cellule LMA e vedere come questi cambiamenti influenzassero la sensibilità alla decitabina. Lo studio ha rivelato molti geni che impattano su come le cellule reagiscono al farmaco.

In particolare, i ricercatori hanno trovato che certi percorsi RNA erano essenziali per come le cellule LMA rispondono alla decitabina. Questo significa che i cambiamenti nella funzione e stabilità dell'RNA potrebbero giocare un ruolo significativo nell'efficacia del farmaco nell'uccidere le cellule tumorali.

Attraverso lo studio, i risultati chiave includevano:

  1. Diversi geni legati all'elaborazione dell'mRNA sono stati identificati come cruciali per come le cellule LMA rispondono alla decitabina.
  2. Processi specifici di modifica dell'RNA, in particolare uno chiamato metilazione m6A, sono stati trovati a influenzare la sensibilità.
  3. Lo studio ha confermato che inibire i percorsi di decapping dell'mRNA potrebbe rendere le cellule tumorali più suscettibili alla decitabina.

Il Ruolo della Metilazione m6A

Una scoperta interessante è stata che il trattamento con decitabina aumentava la quantità di metilazione m6A sui trascritti mRNA nelle cellule LMA. La m6A è una modifica chimica che può influenzare quanto sia stabile una molecola di RNA e quanto proteina produce. Se alti livelli di m6A portano a una diminuzione di certi trascritti, questo potrebbe essere uno dei meccanismi attraverso cui agisce la decitabina.

I ricercatori hanno convalidato che quando geni chiave coinvolti nella scrittura e lettura delle modifiche m6A sono stati silenziati, le cellule LMA mostrano resistenza alla decitabina. Questo suggerisce che queste modifiche giocano un ruolo significativo nella capacità del farmaco di indurre la morte cellulare.

Capire la Stabilità dell'mRNA

Per ottenere ulteriori informazioni, gli scienziati hanno esaminato come la decitabina influenzasse la stabilità dell'RNA nelle cellule LMA. Hanno scoperto che il trattamento con decitabina alterava la stabilità di molti diversi mRNA, con alcuni destabilizzati. Questo significa che la decitabina non solo influisce su come i geni vengono espressi, ma anche su quanto a lungo durano i loro prodotti di RNA.

Concentrandosi su geni specifici che erano sia downregolati nel trattamento con decitabina sia mostrava un aumento della metilazione m6A ha portato all'identificazione di alcuni geni chiave. Questi geni potrebbero essere essenziali per come le cellule LMA rispondono alla decitabina.

Esaminare Altre Linee Cellulari LMA

Nel nome di un'indagine approfondita, i ricercatori hanno cercato di confrontare i risultati tra varie linee cellulari LMA per vedere se emergevano schemi simili. Hanno creato nuovi modelli usando diverse linee cellulari LMA e hanno eseguito schermi CRISPR simili per identificare geni coinvolti nella risposta alla decitabina.

Questo confronto ha rivelato che mentre alcuni geni influenzavano la risposta alla decitabina in modo coerente attraverso le linee cellulari, altri erano unici per certi modelli. Ad esempio, la presenza di certe mutazioni influenzava quali geni erano essenziali per la risposta al farmaco, evidenziando la diversità genetica nell'LMA.

Implicazioni Pratiche per il Trattamento

Da questi risultati, sono emersi nuovi spunti sul trattamento dell'LMA. Lo studio suggerisce che una migliore comprensione della dinamica dell'RNA e delle interazioni geniche potrebbe portare a strategie di trattamento migliori con l'uso della decitabina. Inoltre, identificare geni e percorsi specifici potrebbe permettere ai medici di prevedere con maggiore accuratezza chi beneficerà di più di questo farmaco.

Alla fine, i ricercatori sperano che il loro lavoro renda più facile adattare i trattamenti per i singoli pazienti in base ai loro genotipi tumorali unici.

Conclusione

In conclusione, la ricerca sottolinea l'importanza di comprendere come i cambiamenti epigenetici e la dinamica dell'RNA influenzano le risposte ai trattamenti per il cancro. Esaminando più da vicino come questi processi lavorano insieme, in particolare nel contesto del trattamento con decitabina, potrebbe essere possibile sviluppare terapie per il cancro più efficaci che migliorino i risultati per i pazienti.

Fonte originale

Titolo: A multiomics approach reveals RNA dynamics promote cellular sensitivity to DNA hypomethylation

Estratto: The search for new approaches in cancer therapy requires a mechanistic understanding of cancer vulnerabilities and anti-cancer drug mechanisms of action. Problematically, some effective therapeutics target cancer vulnerabilities that have poorly defined mechanisms of anti-cancer activity. One such drug is decitabine, a frontline therapeutic approved for the treatment of high-risk acute myeloid leukemia (AML). Decitabine is thought to kill cancer cells selectively via inhibition of DNA methyltransferase enzymes, but the genes and mechanisms involved remain unclear. Here, we apply an integrated multiomics and CRISPR functional genomics approach to identify genes and processes associated with response to decitabine in AML cells. Our integrated multiomics approach reveals RNA dynamics are key regulators of DNA hypomethylation induced cell death. Specifically, regulation of RNA decapping, splicing and RNA methylation emerge as important regulators of cellular response to decitabine.

Autori: Luke Gilbert, A. Y. Ge, A. Arab, R. Dai, A. Navickas, L. Fish, K. Garcia, H. Asgharian, J. Goudreau, S. Lee, K. Keenan, M. B. Pappalardi, M. T. McCabe, L. Przybyla, H. Goodarzi

Ultimo aggiornamento: 2024-10-17 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.12.14.518457

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.12.14.518457.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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