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Tailocine: Una Nuova Speranza Contro le Infezioni Batteriche

I tailocini offrono un'alternativa interessante per affrontare la crescente resistenza agli antibiotici.

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Le infezioni batteriche stanno tornando a essere un grosso problema per la nostra salute in questo secolo. Con i batteri che si diffondono in tutto il mondo e che diventano sempre più resistenti agli antibiotici, i scienziati sentono la pressione di trovare nuovi modi per curare queste infezioni. Una delle idee entusiasmanti è usare qualcosa chiamato batteriocine simili a code di fagi, o tailocins per abbreviare.

Che Cosa Sono i Tailocins?

I tailocins sono pacchetti proteici unici che assomigliano un po' ai virus che infettano i batteri (chiamati faghi), ma non hanno la capacità di moltiplicarsi. Immagina un gigantesco complesso proteico in un vestito, ma senza cappello o valigia. Sono come i ragazzi fighi a scuola che non hanno bisogno di replicarsi per fare colpo!

Quando i batteri si sentono stressati, producono questi tailocins, che poi attaccano altri batteri concorrenti nella loro comunità. Questo dà un vantaggio ai batteri che li producono. I tailocins vengono in due varianti: R-type e F-type.

Tailocins R-type

I tailocins R-type hanno un design simile a un tipo specifico di batteriofago chiamato fago T-even. Hanno una parte tubolare all’interno avvolta in una guaina. Per uccidere un batterio bersaglio, si attaccano ad esso, causano alcune riorganizzazioni nella loro struttura e poi penetrano il batterio come un ago. Questo provoca una brutta perdita di ioni che porta alla morte del batterio.

Tailocins F-type

I tailocins F-type sono un po' diversi. Assomigliano a un altro batteriofago chiamato lambda e hanno il loro modo di uccidere i batteri, ma gli scienziati non sono ancora del tutto sicuri di come. Alcuni batteri, come Pseudomonas aeruginosa, possono produrre entrambi i tipi di tailocins, il che è abbastanza impressionante!

Come Funzionano i Tailocins?

Il modo in cui i tailocins identificano il loro bersaglio è attraverso speciali proteine chiamate proteine di legame ai recettori (RBPs). Pensa a queste come al GPS del tailocin, che li guida ai loro bersagli batterici. Ogni tailocin ha il suo RBP unico che si adatta a specifici recettori presenti sulla superficie di alcuni batteri. La cosa bella? Queste RBP sono come chiavi personalizzabili – possono essere modificate per adattarsi a diverse porte!

Per renderli più adatti a batteri specifici, gli scienziati stanno lavorando a rimodellare questi RBP. Mischiando e abbinando diverse parti, sperano di creare una vasta gamma di tailocins che possano colpire vari ceppi batterici in modo efficace.

La Necessità di Varietà

Usare tailocins che colpiscono batteri specifici sta diventando sempre più interessante perché risparmiano i nostri batteri buoni, aiutando a mantenere il nostro microbioma in equilibrio. C'è un crescente interesse nello sviluppare una libreria di questi tailocins appositamente progettati, ma la sfida è che attualmente, i tailocins si trovano solo in alcune specie di batteri.

Ingegnerizzazione di Nuovi RBP

Grazie ai progressi nella tecnologia di ingegneria, ora è possibile adattare la gamma di ospiti dei tailocins. Scambiando parti delle RBP da diverse fonti, gli scienziati possono creare nuove combinazioni che potrebbero colpire un'ampia gamma di batteri. Il telaio meglio studiato per questo è il tailocin R2 da Pseudomonas aeruginosa.

La Tecnica VersaTile

Qui entra in gioco la tecnica VersaTile, che funziona come un set di mattoncini LEGO per costruire queste RBP. Permette agli scienziati di creare rapidamente una collezione di diverse RBP e assemblarle in un processo semplice. La flessibilità di questo metodo significa che è più facile creare rapidamente molti nuovi tailocins.

Prova del Concetto

Come test, i ricercatori sono riusciti a prendere RBP progettate per colpire l'O-antigene (un componente trovato sulla superficie di alcuni batteri) e innestarle sul telaio del tailocin R2. Hanno scoperto che questi tailocins ingegnerizzati potevano attaccare efficacemente batteri con specifici O-antigeni, e anche quelli che erano stati precedentemente trascurati.

La Pipeline di Produzione

Il processo prevede la creazione di una libreria di mattoncini composti da diversi componenti, assemblandoli secondo necessità e poi producendo i tailocins personalizzati in batteri appositamente ingegnerizzati per questo compito. I risultati di questi test sono promettenti, indicando che è possibile per i tailocins colpire batteri desiderati.

Test di Efficacia

In laboratorio, gli scienziati hanno testato l'efficacia sia dei tailocins originali che di quelli ingegnerizzati. Hanno fatto questo attraverso vari metodi, tra cui saggi di sopravvivenza per vedere quanti batteri venivano uccisi a diverse concentrazioni di tailocin.

Risultati

Hanno scoperto che il tailocin R2 nativo era altamente efficace, in grado di uccidere a basse concentrazioni, mentre le versioni ingegnerizzate erano a volte meno potenti ma mostrano comunque promesse. Questo suggerisce che mentre modificare queste proteine può portare a risultati interessanti, ottenere l'ingegneria giusta è cruciale per mantenere o migliorare la loro efficacia.

Il Futuro dei Tailocins

La ricerca continua a spingere i limiti di ciò che possiamo fare con questi tailocins. L'obiettivo non è solo creare più tailocins, ma farne quelli che possano colpire efficacemente una vasta varietà di batteri dannosi. Con i miglioramenti e gli studi in corso, queste opzioni di tailocin su misura potrebbero diventare un'alternativa valida agli antibiotici tradizionali.

Oltre i Batteri

È interessante notare che i tailocins e le RBP non hanno solo proprietà antibatteriche. Possono assistere nei test diagnostici per identificare ceppi batterici, offrendo un'alternativa intelligente all'uso di antibiotici in alcune situazioni. La loro precisione potrebbe anche farli diventare candidati migliori per alcune applicazioni mediche rispetto ai faghi tradizionali.

Tailocins vs Faghi

È importante notare le differenze tra tailocins e faghi. Mentre i faghi si moltiplicano e possono adattarsi nel tempo, i tailocins rimangono costanti. Questo significa che potrebbero essere un'opzione più stabile quando si tratta di progettare trattamenti.

In Sintesi

In sintesi, lo sviluppo dei tailocins e l'ingegnerizzazione delle RBP è un campo entusiasmante. Anche se gli scienziati stanno ancora lavorando per perfezionare questi strumenti in laboratorio, il potenziale di combattere le infezioni batteriche senza disturbare il nostro microbioma sano è una luce alla fine di un tunnel molto buio. Se c'è qualcosa che abbiamo imparato in questo viaggio, è che la resistenza batterica è qui per restare, ma anche le menti creative pronte ad affrontarla. Con i tailocins che guidano la strada, c'è speranza per un futuro di pazienti più sani e meno infezioni!

Fonte originale

Titolo: A VersaTile approach to reprogram the specificity of the R2-type tailocin towards different serotypes of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae

Estratto: Phage tail-like bacteriocins, or tailocins, provide a competitive advantage to producer cells by killing closely related bacteria. Morphologically similar to headless phages, their narrow target specificity is determined by receptor-binding proteins (RBPs). While RBP engineering has been used to alter the host range of a selected R2 tailocin from Pseudomonas aeruginosa, the process is labor-intensive, limiting broader application. We introduce a VersaTile-driven R2 tailocin engineering platform to scale up RBP grafting. This platform achieved three key milestones: (1) engineering R2 tailocins specific to Escherichia coli serogroups O26, O103, O104, O111, O145, O146 and O157; (2) reprogramming R2 tailocins to target for the first time capsule and a new species, specifically the capsular serotype K1 of E. coli and K11 and K63 of Klebsiella pneumoniae; (3) creating the first bivalent tailocin with a branched RBP and cross-species activity, effective against both E. coli K1 and K. pneumoniae K11. Over 90% of engineered tailocins were effective, with clear pathways for further optimization identified. ImportanceWhile tailocin engineering is a proven and promising concept, the current engineering approach lacks scalability, limiting a vast exploration. This study advances tailocin engineering by increasing its throughput. Implementing a scaled up approach, we have shown the flexibility of the R2 tailocin scaffold to accommodate diverse receptor-binding domains, expanding its functionality to target a new type of receptor (capsule) and a previously untargeted species. In addition, functional tailocins with branched receptor-binding proteins portraying dual, cross-genus activity were produced. This work lays the groundwork for a scalable platform for the development of engineered tailocins, marking an important step towards making R2 tailocins a practical therapeutic tool for targeted bacterial infections.

Autori: Dorien Dams, Célia Pas, Agnieszka Latka, Zuzanna Drulis-Kawa, Lars Fieseler, Yves Briers

Ultimo aggiornamento: 2024-10-31 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.29.620980

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.29.620980.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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