Combattere i batteri con peptidi virali
Gli scienziati esplorano i peptidi batteriofagici per combattere i batteri resistenti agli antibiotici.
Arindam Naha, Todd A. Cameron, William Margolin
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Indice
- Il Processo di Divisione Cellulare
- Mantenere Ordine nel Processo di Divisione
- La Minaccia della Resistenza agli antibiotici
- Iniettare Problemi dai Batteriofagi
- La Struttura del Peptide Kil
- Testare l'Azione di Kil
- Peptidi Kil da Altri Batteriofagi
- Implicazioni per il Trattamento delle Infezioni
- Direzioni per la Ricerca Futura
- Fonte originale
I batteri sono piccole cose viventi che si trovano quasi ovunque sul nostro pianeta. Esistono da miliardi di anni e sono esperti nella sopravvivenza e nella moltiplicazione. Una delle cose più importanti che i batteri devono fare è copiare il loro materiale genetico, che è come il loro manuale di istruzioni, e poi dividersi in due nuovi batteri. Questo processo di divisione si chiama divisione cellulare.
Il Processo di Divisione Cellulare
Per dividersi con successo, i batteri usano un setup speciale chiamato divisoma. Immaginalo come una catena di montaggio in una fabbrica dove le proteine lavorano insieme. Il divisoma inizia con una proteina chiamata FtsZ, che parte come piccoli pezzi chiamati monomeri. Questi monomeri si attaccano insieme per formare un anello nel mezzo della cellula batterica, noto come Z-ring. Questo Z-ring è cruciale perché aiuta a segnare dove la cellula si dividerà eventualmente.
Una volta che lo Z-ring è formato, altre proteine si uniscono per aiutare a completare il lavoro. Ciascuna di queste proteine svolge un ruolo unico, assicurandosi che la cellula possa dividersi perfettamente a metà, dando origine a due cellule figlie identiche.
Mantenere Ordine nel Processo di Divisione
Mettere lo Z-ring al posto giusto è super importante e non succede da solo. La posizione dello Z-ring dipende dalle connessioni di FtsZ con il rivestimento esterno della cellula. Ma ecco il trucco: FtsZ non può afferrare direttamente la membrana cellulare. Quindi, ha bisogno di alcune proteine di supporto per fare la connessione.
Queste proteine di supporto agiscono come ancore, tenendo FtsZ vicino alla membrana dove deve essere. Due dei principali ancoraggi sono FtsA e ZipA. Queste proteine sono come migliori amici che lavorano insieme e sono simili in molti tipi di batteri. Si attaccano alla membrana e aiutano a organizzare le molecole di FtsZ nello Z-ring.
Senza queste ancore, FtsZ non può fare il suo lavoro. Se sia FtsA che ZipA mancano, lo Z-ring non si forma affatto, il che significa che la cellula non può dividersi.
Resistenza agli antibiotici
La Minaccia dellaSappiamo tutti che i batteri a volte possono causare infezioni e curare queste infezioni può essere complicato. Un grande problema è che i batteri possono rapidamente diventare resistenti agli antibiotici, il che significa che non vengono uccisi dai farmaci che prima funzionavano. Questo è un problema serio in sanità, e gli scienziati stanno costantemente cercando nuovi modi per combattere questi batteri resistenti.
Un'area di ricerca entusiasmante si concentra sul divisoma. Poiché questo è cruciale per la divisione batterica, mirare ai suoi componenti potrebbe essere un modo intelligente per combattere i batteri. FtsZ, essendo il capo del divisoma, è particolarmente interessante per gli scienziati. Se possiamo trovare modi per interrompere la funzione di FtsZ, potremmo essere in grado di fermare i batteri sul nascere.
Iniettare Problemi dai Batteriofagi
I batteri sono da tempo in un gioco di nascondino con i virus noti come batteriofagi. Questi virus infettano specificamente i batteri e a volte possono produrre proteine che rovinano la capacità dei batteri di dividersi. Una di queste proteine si chiama Kil, prodotta da un virus noto come batteriofago lambda.
Kil può interferire con la formazione dello Z-ring colpendo FtsZ dove fa male. Quando Kil è presente, può portare i batteri a stirarsi in lunghi filamenti invece di dividersi in due, il che alla fine porta alla loro morte.
La Struttura del Peptide Kil
Gli scienziati sono diventati abbastanza bravi a osservare la struttura di Kil usando modelli informatici avanzati. Hanno scoperto che Kil ha una forma specifica nota come struttura elica-giro-elica (HTH), che lo aiuta a legarsi al bersaglio necessario nei batteri.
Per vedere come funziona Kil, i ricercatori hanno sviluppato diverse versioni per capire quali parti sono essenziali per il suo funzionamento. Hanno scoperto che se modifichi Kil rimuovendo certe porzioni, può ancora funzionare o smettere completamente di essere efficace. Ad esempio, se entrambe le estremità di Kil vengono accorciate troppo, è come togliere il volante a un'auto: le cose semplicemente non andranno avanti!
Testare l'Azione di Kil
Per vedere se Kil potesse ancora svolgere il suo lavoro dopo queste modifiche, gli scienziati l'hanno inserito in diversi ceppi di batteri in laboratorio. Nelle giuste condizioni, hanno osservato che Kil a lunghezza completa poteva facilmente rovinare la struttura dello Z-ring, mentre alcune versioni più corte faticavano.
Quando hanno usato un marcatore fluorescente speciale per vedere cosa stava succedendo all'interno dei batteri, hanno scoperto che gli Z-ring si stavano disfacendo quando Kil era presente. D'altra parte, le versioni accorciate di Kil che non avevano le parti necessarie mantenevano intatti gli Z-ring, e i batteri potevano dividersi come al solito.
Peptidi Kil da Altri Batteriofagi
I peptidi Kil non provengono solo da un tipo di batteriofago; altri fagi correlati producono anche peptidi simili. Uno di questi peptidi proviene dall'Enterobacteriophage HK629. Anche se è un po' diverso da Kil, condivide sequenze simili e può fare molto lo stesso—bloccare la divisione batterica.
Quando gli scienziati hanno testato HK629 Kil, hanno scoperto che funzionava proprio come il Kil originale, interrompendo gli Z-ring nei batteri. Questo suggerisce che questo metodo di interferire con la divisione batterica potrebbe essere un trucco popolare tra molti batteriofagi.
Implicazioni per il Trattamento delle Infezioni
Con la comprensione di come funzionano questi peptidi Kil, gli scienziati stanno ora considerando il loro potenziale come nuovi trattamenti contro i batteri che causano infezioni. Ad esempio, in un tipo di E. coli che spesso causa infezioni urinarie, i ricercatori hanno scoperto che introdurre peptidi Kil potrebbe fermare efficacemente la divisione cellulare e causare la morte dei batteri infetti.
Questo punta verso una direzione interessante per i futuri antibiotici, specialmente poiché molti batteri dannosi stanno diventando resistenti ai trattamenti tradizionali. Invece di fare affidamento esclusivamente su farmaci convenzionali, potremmo essere in grado di usare risorse naturali, come questi peptidi provenienti dai batteriofagi, per creare nuove terapie.
Direzioni per la Ricerca Futura
Per quanto entusiasmante possa sembrare tutto questo, c'è ancora molto lavoro da fare. Gli scienziati sono desiderosi di capire esattamente come questi peptidi disturbano il processo di divisione cellulare in modo più dettagliato. Vogliono anche capire come rendere questi peptidi più stabili e facilmente somministrabili come trattamento.
In conclusione, mentre i batteri hanno alcuni trucchi ingegnosi per la sopravvivenza e la divisione, i ricercatori stanno recuperando con strategie innovative per affrontarli. Studiando la meccanica della divisione cellulare batterica e mirando a giocatori chiave come FtsZ con peptidi provenienti dai batteriofagi, il futuro dello sviluppo degli antibiotici potrebbe sembrare più luminoso. Chi lo sapeva che anche virus microscopici potessero dare una mano nella continua battaglia contro le infezioni?
Fonte originale
Titolo: Bacteriophage Kil peptide folds into a predicted helix-turn-helix structure to disrupt Escherichia coli cell division
Estratto: FtsZ, a eukaryotic tubulin homolog and an essential component of the bacterial divisome, is the target of numerous antimicrobial compounds as well as proteins and peptides, most of which inhibit FtsZ polymerization dynamics. We previously showed that the Kil peptide from bacteriophage lambda; inhibits Escherichia coli cell division by disrupting FtsZ ring assembly, and this inhibition requires the presence of the essential FtsZ membrane anchor protein ZipA. To investigate the Kil molecular mechanism further, we employed truncation mutants and molecular modeling to identify the minimal residues necessary for its activity. Modeling suggests that the Kil core segment folds into a helix-turn-helix (HTH) structure. Deleting either the C-terminal 11 residues or the N-terminal 5 residues of Kil still allowed inhibition of E. coli cell division, but removing both termini nearly abolished this activity, indicating that a minimal region within the Kil HTH core is essential for its function. Another Kil-like peptide from a closely related enterobacterial phage also disrupts FtsZ ring assembly and requires ZipA for this activity. Consistent with its broader activity against FtsZ, lambda Kil was able to efficiently inhibit cell division of a uropathogenic E. coli (UPEC) strain. Understanding the function of Kil and similar peptides can potentially reveal how FtsZ functions in bacterial cell division and additional ways to target FtsZ for antimicrobial therapies.
Autori: Arindam Naha, Todd A. Cameron, William Margolin
Ultimo aggiornamento: 2024-12-16 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.16.628577
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.16.628577.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.