Que signifie "Séquençage De Novo"?
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Le séquençage de novo, c'est le processus pour déterminer l'ordre des éléments appelés acides aminés dans une protéine sans utiliser d'infos ou de bases de données précédentes. Cette technique est utile dans plein de domaines de la biologie, comme le développement de médicaments et la recherche sur les maladies.
Le Défi
En pratique, trouver la séquence exacte des acides aminés, c'est pas simple. Les scientifiques se basent souvent sur des séquences connues stockées dans des bases de données. Mais ces bases de données peuvent ne pas couvrir toutes les séquences possibles, ce qui rend difficile l'identification de nouveaux composés uniques.
Nouvelles Approches
Des méthodes récentes ont amélioré la capacité à identifier des séquences directement à partir des données collectées lors de la spectrométrie de masse, une technique utilisée pour analyser les protéines. Deux modèles, Cascadia et InstaNovo, utilisent des techniques avancées d'apprentissage machine pour prédire les séquences d'acides aminés à partir de données complexes, même sans infos préalables.
Applications
Ces nouveaux modèles peuvent identifier avec précision des séquences protéiques uniques, ce qui peut aider dans divers domaines comme comprendre comment fonctionne le système immunitaire, trouver de nouvelles cibles médicamenteuses, ou découvrir des protéines inconnues dans différents organismes. L'amélioration de la précision et de l'efficacité rend aussi plus facile la recherche sur des échantillons biologiques complexes.