KIF5A : Un Acteur Clé dans le Transport Cellulaire
La protéine KIF5A est super importante pour le mouvement et l'organisation des cellules, ça influence la santé.
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Table des matières
Les Kinésines sont des protéines qui aident à la mobilité et à l'organisation des cellules. Elles se déplacent le long de structures appelées microtubules, qui sont comme des autoroutes à l'intérieur des cellules, transportant divers matériaux vers différentes parties de la cellule. Ces protéines utilisent l'énergie d'une molécule appelée ATP pour bouger. Chez les humains, on a un total de 45 gènes qui codent pour différentes kinésines, regroupées en 14 classes.
Structure des kinésines
La plupart des kinésines ont une structure spécifique. Elles ont une partie motrice à une extrémité, qui se lie à l'ATP et aux microtubules, et une partie queue qui les aide à s'attacher à ce qu'elles transportent. La partie motrice les aide à se déplacer vers l'extrémité positive du microtubule, ce qui les éloigne du corps cellulaire et les amène vers les bords de la cellule. Ce type de mouvement est connu sous le nom de transport antérograde.
KIF5A et ses domaines
KIF5A est un type de kinésine composé de plusieurs parties : le domaine moteur, les hélices enroulées et une région queue non structurée à l'extrémité. Il y a une partie spécifique dans la queue, appelée motif IAK, qui interagit avec le domaine moteur quand la kinésine est inactive. La façon dont KIF5A est structuré est cruciale pour sa fonction et son mouvement.
KIF5A fait partie d'un groupe appelé kinésine-1, qui inclut d'autres protéines apparentées, KIF5B et KIF5C. KIF5A a une chaîne lourde qui peut aussi se lier à des chaînes légères, qui aident à transporter les cargaisons. Chacune de ces chaînes lourdes peut déplacer des matériaux comme des organites et des protéines à l'intérieur de la cellule, mais KIF5A et KIF5C se trouvent principalement dans les cellules nerveuses.
Autoinhibition des kinésines
Toutes les protéines kinésine-1, y compris KIF5A, peuvent devenir inactives dans certaines conditions. Quand elles sont dans cet état inactif, le motif IAK dans la queue se lie aux domaines moteurs, empêchant leur fonctionnement. Cette interaction réduit la capacité de la kinésine à utiliser l'ATP et à se lier aux microtubules. Cette régulation est essentielle pour contrôler quand et où les kinésines transportent des matériaux.
Des recherches montrent que seul un des deux motifs IAK se lie aux domaines moteurs et que des mutations dans cette région peuvent affecter le mouvement le long des microtubules, mais pas la capacité à s'y lier.
Compréhension de la structure de KIF5A
Grâce à des techniques d'imagerie avancées, les scientifiques ont pu comprendre comment KIF5A se plie pour permettre à sa queue d'interagir avec ses domaines moteurs quand il est inactif. Des études indiquent que ce pliage se produit dans une section appelée le coude. Cette région particulière aide à créer un point flexible qui permet à KIF5A d'adopter sa forme nécessaire.
Bien que KIF5A partage une grande similitude dans sa structure globale avec KIF5B et KIF5C, il y a des différences, surtout dans la région de la queue. La queue de KIF5A est plus longue et plus variable, ce qui suggère qu'elle pourrait avoir des rôles uniques.
Importance de la région C-terminale
La queue C-terminale de KIF5A est plus longue que celles de KIF5B et KIF5C. Cette queue est censée être désordonnée, et sa fonction spécifique n'est pas encore entièrement comprise. Cependant, elle pourrait jouer un rôle dans la connexion de KIF5A à d'autres protéines de la cellule, comme TRAK2, qui est impliquée dans le transport des mitochondries.
Des mutations dans la queue C-terminale peuvent conduire à des conditions graves comme la sclérose latérale amyotrophique (SLA). Ces mutations peuvent perturber les fonctions normales, remplaçant souvent des séquences importantes par de nouvelles, ce qui peut altérer la façon dont la queue interagit avec d'autres parties de la molécule et affecter son inactivité.
Importance de KIF5A dans les maladies
Les mutations KIF5A sont plus fréquentes que celles des KIF5B et KIF5C. Ces mutations sont liées à diverses maladies neurodégénératives, y compris la paraplégie spastique de type 10, la SLA et la maladie de Charcot-Marie-Tooth. Comprendre comment KIF5A est régulé est crucial non seulement pour saisir sa fonction de base, mais aussi pour explorer des traitements potentiels pour les maladies liées à ses mutations.
Expériences avec KIF5A
Des études récentes se sont concentrées sur l'utilisation de techniques d'imagerie avancées pour observer comment KIF5A forme son état inactif. En purifiant KIF5A et en l'examinant par des méthodes comme la microscopie électronique, les chercheurs peuvent voir comment il est structuré dans cette forme inactive. Ces études ont également inclus un type spécifique de spectrométrie de masse pour apprendre comment différentes sections de KIF5A interagissent entre elles lorsqu'il est inactif.
KIF5A a été exprimé dans une lignée cellulaire spécifique et purifié. Cela a permis aux chercheurs de confirmer son poids et sa structure. Les observations ont indiqué que KIF5A formait des dimères, ce qui signifie que deux protéines KIF5A se rejoignaient, ce qui est attendu lorsque la protéine est dans son état inactif.
Analyse de la structure de KIF5A
À l'aide de la microscopie électronique, les scientifiques peuvent visualiser les structures de KIF5A. Les images ont révélé deux formes globulaires distinctes, correspondant aux domaines moteurs de KIF5A, à partir desquelles s'étendait une longue queue mince. Cette queue pourrait contenir des structures supplémentaires qui fournissent flexibilité et stabilité à KIF5A.
Les mesures prises ont aidé à clarifier comment les différentes parties de KIF5A se rapportent les unes aux autres, y compris la distance entre les domaines moteurs et la longueur de la queue enroulée. Ces informations suggèrent une disposition complexe, plutôt qu'un simple pli.
Le modèle final de KIF5A
Pour mieux comprendre la structure de KIF5A, les chercheurs ont développé un modèle en utilisant diverses sources de données et techniques d'imagerie. Le modèle suggère que le pliage se produit à un endroit spécifique, permettant à des régions critiques d'interagir correctement. Cette organisation est vitale pour que KIF5A adopte son état inactif.
Le modèle développé offre une vue d'ensemble de la façon dont KIF5A est façonné et fonctionne. Il souligne l'importance du motif IAK dans le contrôle de l'interaction entre la queue et les domaines moteurs lorsque la kinésine est inactive.
Résultats de la spectrométrie de masse par liaison croisée
En utilisant la spectrométrie de masse par liaison croisée, les scientifiques ont identifié comment différentes parties de KIF5A se connectent entre elles. Cette méthode a révélé de nombreuses connexions entre les domaines moteurs, ainsi qu'entre la queue et d'autres segments. Les résultats soutiennent l'idée que KIF5A est maintenu dans sa forme inactive par diverses interactions qui stabilisent sa structure.
Les données recueillies montrent que, bien que KIF5A ait une structure claire, certaines zones, en particulier la queue, semblent moins organisées. Cela soutient l'idée que la flexibilité permet à KIF5A d'interagir avec d'autres protéines, bien que le rôle exact de cette région désordonnée reste flou.
Mutations liées aux maladies dans KIF5A
Notamment, KIF5A a de nombreuses mutations associées à des maladies. Ces mutations sont réparties tout au long de la séquence KIF5A, mais celles trouvées dans le domaine moteur sont souvent liées à la paraplégie spastique, tandis que les mutations dans la queue sont corrélées à la SLA.
Des recherches indiquent qu'un nombre significatif de mutations affectent la zone responsable de la liaison à l'ATP, cruciale pour le mouvement de la kinésine. Bien qu'il n'y ait pas de mutations affectant directement le motif IAK dans la queue, des résidus voisins sont souvent liés à des maladies comme la maladie de Charcot-Marie-Tooth.
Impact des mutations C-terminales
Dans la queue C-terminale, les mutations sont moins bien définies, bien que certaines mutations ici aient été liées à des maladies. Les effets de ces changements ne sont pas entièrement compris, mais ils peuvent influencer la façon dont KIF5A interagit avec d'autres composants cellulaires.
Des expériences récentes se sont concentrées sur une mutation spécifique qui saute une région de la queue C-terminale. Ce changement a fait en sorte que KIF5A adopte un état plus actif, ce qui peut entraîner des problèmes cellulaires tels que l'agrégation. Une telle agrégation peut interférer avec les fonctions cellulaires normales et mettre en évidence l'importance de la régulation de KIF5A.
Directions futures
Pour l'avenir, il sera crucial d'examiner quand et où la forme inactive de KIF5A opère dans les cellules vivantes. Comprendre son comportement peut éclairer comment il interagit avec les cargaisons et si les kinésines auto-inhibées peuvent directement s'engager avec des matériaux à transporter.
Des recherches ont montré que des mutations dans KIF5A peuvent perturber son état inactif normal, suggérant que ces mutations ont un impact significatif sur la santé et la fonction cellulaires globales. En examinant davantage les interactions et les comportements de KIF5A, les scientifiques pourraient découvrir des moyens de traiter les maladies liées à son dysfonctionnement.
Conclusion
Les protéines kinésines, en particulier KIF5A, jouent des rôles essentiels dans le transport cellulaire. En examinant leurs structures et l'impact des mutations, les chercheurs peuvent améliorer notre compréhension de la façon dont les cellules maintiennent leurs fonctions et explorer des traitements potentiels pour les maladies connectées au dysfonctionnement des kinésines. Les résultats révèlent que bien que KIF5A soit structurellement complexe et étroitement régulé, les mutations qu'il présente peuvent entraîner des conséquences sévères, soulignant la nécessité de poursuivre la recherche dans ce domaine.
Titre: A Multiscale approach reveals the molecular architecture of the autoinhibited kinesin KIF5A.
Résumé: Kinesin-1 is a microtubule motor that transports cellular cargo along microtubules. KIF5A is one of three kinesin-1 isoforms in humans, all of which are autoinhibited by an interaction between the motor and an IAK motif in the proximal region of the C-terminal tail. The C-terminal tail of KIF5A is [~]80 residues longer than the other two kinesin-1 isoforms (KIF5B and KIF5C) and it is unclear if it contributes to autoinhibition. Mutations in KIF5A cause neuronal diseases and could affect autoinhibition, as reported for a mutation that skips exon 27, altering its C-terminal sequence. Here, we combined negative-stain electron microscopy, crosslinking mass spectrometry (XL-MS) and AlphaFold2 structure prediction to determine the molecular architecture of the full-length autoinhibited KIF5A homodimer, in the absence of light chains. We show that KIF5A forms a compact, bent conformation, through a bend between coiled coils 2 and 3, around P687. XL-MS of WT KIF5A revealed extensive interactions between residues in the motor, between coiled-coil 1 and the motor, between coiled-coils 1 and 2, with coiled coils 3 and 4, and the proximal region of the C-terminal tail and the motor in the autoinhibited state, but not between the distal C-terminal region and the rest of the molecule. While negative stain electron microscopy of exon-27 KIF5A splice mutant showed the presence of autoinhibited molecules, XL-MS analysis suggested that its autoinhibited state is more labile. Our model offers a conceptual framework for understanding how mutations within the motor and stalk domain may affect motor activity.
Auteurs: Michelle Peckham, G. Carrington, U. Fatima, I. Caramujo, T. Lewis, D. Casas-Mao
Dernière mise à jour: 2024-01-23 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.18.576271
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.18.576271.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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