Changements génétiques dans les écosystèmes : L'approche des voiles alléliques
Un aperçu de comment les changements génétiques peuvent aider la conservation et contrôler les écosystèmes.
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Table des matières
- Comment fonctionnent les changements génétiques
- Comprendre l'Allele Sail
- Modification de population
- Facteurs influençant la dynamique d'édition
- Suppression de population utilisant les Allele Sails
- Libérations uniques et multiples de l'Allele Sail
- Le rôle des liaisons dans les modifications
- Applications potentielles de l'Allele Sail
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
Ces derniers temps, le besoin de modifier les écosystèmes a augmenté à cause de divers problèmes comme les maladies propagées par des insectes, la perte de cultures, les plantes et animaux nuisibles, et le changement climatique. Une méthode clé pour aborder ces problèmes est de modifier la composition génétique de populations entières. On peut le faire de deux manières principales : en introduisant des traits utiles (modification de population) ou en supprimant des espèces nuisibles (suppression de population).
Par exemple, on peut ajouter des traits à des espèces menacées pour les aider à mieux survivre ou introduire des changements qui les préparent aux futurs changements environnementaux causés par le changement climatique. Des recherches montrent qu'un ou quelques changements génétiques peuvent entraîner des bénéfices importants pour différentes espèces. Il y a des exemples comme un seul gène qui aide les moules et les bovins à survivre à la chaleur, ou qui aide les plantes à résister aux champignons, ou même qui aide les abeilles à repousser les parasites. Les altérations génétiques peuvent aussi être utilisées pour réduire les dommages, comme rendre les insectes moins susceptibles de propager des maladies ou rendre les espèces envahissantes moins nuisibles.
Comment fonctionnent les changements génétiques
Une manière de diffuser des traits utiles dans une population est de libérer des individus qui portent ces traits. Si les gènes introduits sont favorisés par la sélection naturelle, ils peuvent se propager sur plusieurs générations, mais le processus peut prendre du temps, selon la taille du bénéfice et comment ces traits sont hérités. Si, pour une raison quelconque, le trait utile ne se propage pas rapidement, ou si on veut contrôler des populations nuisibles, on pourrait devoir introduire un grand nombre d'individus. Cette approche peut être coûteuse et pas pratique pour beaucoup d'espèces. De plus, la reproduction contrôlée et l'introduction de nombreux individus peuvent accroître involontairement la présence d'autres traits nuisibles et menacer la diversité génétique existante de l'espèce cible.
Pour faire face à ces défis, les scientifiques ont développé des "gene drives" synthétiques. Ce sont des éléments génétiques spéciaux qui peuvent accélérer leur propre propagation dans une population. Une variété de ces gene drives a été créée, mais leur rapidité et leur persistance soulèvent des préoccupations concernant la régulation et l'acceptation publique.
Les changements génétiques peuvent aussi être plus subtils, impliquant des modifications légères de l'ADN. Dans certaines réglementations, les gènes qui ont été modifiés mais qui ne sont pas considérés comme transgéniques (modifiés avec de l'ADN étranger) pourraient ne pas faire face à une surveillance stricte. Cela peut aider à obtenir l'approbation réglementaire et le soutien du public. Un système proposé s'appelle l'Allele Sail, qui peut aider à diffuser des modifications génétiques sans les complications des gene drives.
Comprendre l'Allele Sail
Un Allele Sail utilise un éditeur de génome pour créer des changements dans le matériel génétique. Cet éditeur agit dans la lignée germinale, ce qui signifie qu'il peut affecter la progéniture. Les altérations faites par l'éditeur peuvent se propager rapidement à travers la population. Contrairement à d'autres systèmes, l'Allele Sail ne fait pas que dupliquer des traits existants mais crée de nouveaux changements.
L'éditeur est hérité de manière simple mendélienne, mais les modifications qu'il produit peuvent se propager rapidement dans la population. Cette approche diffère des méthodes traditionnelles qui augmentent simplement la fréquence d'un gène existant.
Modification de population
Quand on regarde le système Allele Sail pour la modification de population, il peut être très efficace pour stabiliser des espèces menacées ou lutter contre des maladies sans changer fondamentalement la diversité génétique globale de la population. Utiliser ce système peut aider les scientifiques à comprendre comment ces changements affecteront les populations au fil du temps.
Pour étudier ça, les chercheurs ont utilisé des modèles informatiques pour simuler le comportement de l'Allele Sail. Ces modèles peuvent aider à prédire ce qui se passera quand on introduit un éditeur génétique dans une population. Dans des conditions idéales, lorsque l'édition est très efficace et bénéfique pour la population, l'Allele Sail peut grandement augmenter le taux d'adoption de nouveaux traits.
Les simulations montrent que, quand un éditeur est efficace, les changements désirés peuvent se propager rapidement. Cependant, s'il y a des coûts associés à ces changements, les scientifiques doivent prendre en compte le potentiel de déclin de la fréquence des allèles, car des facteurs comme les bénéfices ou pertes de fitness peuvent influencer comment ces changements se comportent sur plusieurs générations.
Facteurs influençant la dynamique d'édition
Un aspect crucial de l'introduction de changements génétiques est de comprendre comment l'Efficacité de l'édition affecte la propagation des traits. Une haute efficacité d'édition est idéale, mais si le taux d'éditions réussies est bas, cela peut ralentir la propagation des changements désirés.
Des recherches indiquent qu même à des efficacités d'édition plus faibles, les traits peuvent encore se propager beaucoup plus rapidement qu'avec des méthodes traditionnelles. Cependant, si l'éditeur est trop étroitement lié aux modifications faites, cela peut parfois limiter son efficacité dans la propagation de ces traits bénéfiques.
Suppression de population utilisant les Allele Sails
Un autre aspect important de l'utilisation de l'Allele Sail est la suppression de populations. Un exemple de ceci est de cibler des espèces qui ont un gène spécifique déterminant leur sexe. Pour certaines espèces, perdre ce gène peut transformer les femelles en mâles, changeant drastiquement le ratio des sexes.
En utilisant l'éditeur Allele Sail pour supprimer des gènes critiques, les chercheurs ont testé à quel point cela pourrait être efficace pour amener une population vers un ratio des sexes déséquilibré. Les résultats initiaux montrent qu'une introduction modeste de cet éditeur peut entraîner une forte baisse des chiffres au fil du temps, surtout dans les espèces avec des systèmes de détermination du sexe spécifiques.
En comparant les stratégies de suppression de l'Allele Sail à d'autres méthodes comme la libération de mâles nuisibles pour la progéniture femelle, l'éditeur tend à être plus efficace. Cependant, si le gène introduit génère des mutations indésirables ou devient trop fréquent, il pourrait perdre son efficacité.
Libérations uniques et multiples de l'Allele Sail
L'impact des libérations uniques et multiples de l'Allele Sail a été un sujet d'étude. Une seule libération de l'éditeur peut causer une réduction significative de la taille de la population au fil du temps, tandis que des introductions répétées semblent mener à des déclins plus rapides. Le degré de cette réduction dépend souvent de la fréquence des introductions et des mécanismes spécifiques de détermination du sexe des espèces.
En simulant, les chercheurs ont trouvé que des libérations constantes de l'éditeur peuvent mener à un effondrement de population plus rapide comparé à d'autres méthodes. Par exemple, si les libérations sont régulières, même des fréquences basses peuvent entraîner des baisses substantielles dans une courte période.
Aussi, en combinant l'Allele Sail avec d'autres stratégies, comme induire la stérilité en même temps que la conversion sexuelle, cela peut mener à des effondrements de population encore plus rapides.
Le rôle des liaisons dans les modifications
La relation entre l'éditeur et les modifications faites est un autre facteur important. Quand l'éditeur et les modifications cibles sont étroitement liés génétiquement, cela peut limiter la capacité à diffuser ces changements efficacement. Les situations où ils sont plus librement combinés tendent à permettre plus de flexibilité et une meilleure diffusion des modifications.
Exemple de changements de détermination du sexe
Une des découvertes frappantes de l'utilisation de l'Allele Sail est son impact potentiel sur la détermination du sexe. En introduisant un changement génétique qui affecte un gène important pour la viabilité des femelles, les scientifiques peuvent potentiellement changer le système de détermination du sexe d'une population.
Dans une étude, l'introduction de modifications spécifiques a conduit à un changement rapide dans le mécanisme de détermination du sexe d'une population. En analysant les résultats de ces changements, les chercheurs ont constaté que la détermination du sexe pouvait se faire en fonction de l'état des modifications introduites, menant à une population composée de systèmes de sexe entièrement différents au fil du temps.
Applications potentielles de l'Allele Sail
La polyvalence de l'Allele Sail ouvre diverses applications tant dans les efforts de conservation que dans le contrôle des espèces envahissantes.
Conservation des espèces menacées
Pour les populations menacées, l'Allele Sail peut être utilisé pour augmenter rapidement la diversité génétique. En introduisant des traits bénéfiques d'autres populations, ces outils peuvent aider à améliorer la survie des espèces en difficulté.
Préparation pour les futurs changements environnementaux
Une autre application significative est pour les changements environnementaux anticipés. Dans ces cas, les scientifiques peuvent prévoir des menaces futures et introduire préventivement des gènes qui pourraient être bénéfiques à l'avenir.
Lutte contre les espèces envahissantes
Pour les espèces envahissantes, l'Allele Sail peut aider à atténuer leurs effets nuisibles. En modifiant génétiquement les espèces envahissantes pour qu'elles produisent moins de toxine ou deviennent moins nuisibles, cela peut aider la faune locale à mieux survivre.
Conclusion
L'utilisation de l'Allele Sail représente une avancée excitante dans le génie génétique visant à la fois la conservation et la résolution des problèmes dans les écosystèmes. En permettant des modifications rapides et efficaces de populations, cela offre un nouveau moyen de relever les défis qui découlent du changement climatique, des espèces envahissantes et des populations menacées. Comprendre comment ces systèmes fonctionnent et leurs implications plus larges sera crucial alors que nous continuons à naviguer dans les complexités de notre monde naturel en mutation.
Titre: Allele Sails: launching traits and fates into wild populations with DNA sequence modifiers
Résumé: Population-scale genome editing can be used to alter the composition or fate of wild populations. One approach to achieving these aims utilizes a synthetic gene drive element--a multi-gene cassette--to bring about an increase in the frequency of an existing allele. However, the use of gene drives is complicated by the multiple scientific, regulatory, and social issues associated with transgene persistence and gene flow. Alternatives in which transgenes are not driven could potentially avoid some of these issues. Here we propose an approach to population scale gene editing using a system we refer to as an Allele Sail. An Allele Sail consists of a genome editor (the Wind) that introduces DNA sequence edits (the Sail) at one or more sites, resulting in progeny that are viable and fertile. The editor, such as a sequence-specific nuclease, or a prime- or base-editor, is inherited in a Mendelian fashion. Meanwhile, the edits it creates experience an arithmetic, Super-Mendelian increase in frequency. We explore this system using agent-based modeling, and identify contexts in which a single, low frequency release of an editor brings edits to a very high frequency. We also identify conditions in which manipulation of sex determination can be used to bring about population suppression. Current regulatory frameworks often distinguish between transgenics as genetically modified organisms (GMOs), and their edited non-transgenic progeny as non-GMO. In this context an Allele Sail provides a path to alter traits and fates of wild populations in ways that may be considered more acceptable.
Auteurs: Maciej Maselko, M. L. Johnson, B. Hay
Dernière mise à jour: 2024-04-10 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585647
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585647.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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