Menace croissante de Klebsiella pneumoniae en Afrique
La mortalité infantile augmente à cause des infections résistantes de Klebsiella pneumoniae.
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Table des matières
- Contexte sur Klebsiella pneumoniae
- Augmentation de la résistance
- Collecte de données à l'Hôpital Central Queen Elizabeth
- Changements dans les taux d'infection
- Modèles de résistance antimicrobienne
- Impacts sur le traitement
- Développement de vaccins pour Klebsiella pneumoniae
- Défis en santé publique et contrôle des infections
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
La mortalité infantile, surtout chez les moins de cinq ans, est un gros souci dans plein de pays à revenus faibles et moyens. Une des principales causes de ces décès vient des infections, y compris celles causées par une bactérie appelée Klebsiella Pneumoniae (Kpn). Avant, les infections à Kpn étaient souvent traitables avec certains antibiotiques, mais récemment, ça a changé car les bactéries sont devenues résistantes à ces médicaments. Cette résistance est surtout due à l'acquisition par les bactéries d'enzymes spécifiques qui compliquent leur traitement. La montée de ces souches résistantes, surtout en Afrique, rend de nombreuses infections difficiles à gérer. Ça pose des défis sérieux pour traiter les groupes vulnérables, en particulier les nouveau-nés.
Contexte sur Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae est un type de bactérie qui peut causer des infections graves, surtout dans les hôpitaux. Elle fait partie d'un groupe plus large de bactéries appelées Enterobacterales. Ces bactéries peuvent être inoffensives ou provoquées des maladies selon les circonstances. La population de Kpn est complexe et varie selon les régions, ce qui peut influencer les stratégies de traitement et de Contrôle des infections. Comprendre comment ces bactéries évoluent au fil du temps est super important pour que les soignants puissent développer de meilleures façons de traiter les infections et prévenir les épidémies.
Augmentation de la résistance
Ces dernières années, il y a eu une forte hausse des cas de Kpn résistants aux céphalosporines de dernière génération (3GC), une classe d'antibiotiques qui était la première ligne de traitement. Dans certaines zones d'Afrique, le pourcentage de bactéries Kpn produisant des enzymes les rendant résistantes à ces antibiotiques est passé de 12% à plus de 90%. Malheureusement, l'option de traitement restante, un type d'antibiotique connu sous le nom de carbapénèmes, n'est pas facilement accessible dans beaucoup de ces régions. La situation est encore plus grave pour les nouveau-nés avec des infections, car ils nécessitent des approches de traitement différentes.
Collecte de données à l'Hôpital Central Queen Elizabeth
Pour mieux comprendre la situation, des chercheurs ont étudié des échantillons d'un grand hôpital au Malawi, l'Hôpital Central Queen Elizabeth (QECH). Cet hôpital collecte des données sur les infections depuis de nombreuses années. Les chercheurs ont examiné des échantillons de sang prélevés sur des patients pour identifier combien de cas de Kpn étaient présents et comment ces cas évoluaient. Ils ont scruté des échantillons de 1996 à 2020, y compris ceux des nouveau-nés, pour identifier des tendances en matière de résistance et d'infections.
Changements dans les taux d'infection
D'après les données collectées, les chercheurs ont constaté que le nombre d'infections à Kpn était stable de 2000 à 2015. Cependant, à partir de 2016, il y a eu une augmentation spectaculaire des cas de Kpn, particulièrement chez les nouveau-nés. Ça laisse penser à de possibles épidémies au sein de l'hôpital. Les chercheurs ont noté que le nombre d'infections chez les adultes n'avait pas beaucoup changé, et que ces infections n'étaient pas aussi fréquentes que celles chez les nouveau-nés. L'augmentation des infections chez les nouveau-nés suggérait une transmission continue au sein de l'hôpital.
Modèles de résistance antimicrobienne
La résistance antimicrobienne était un point crucial de cette étude. Les chercheurs ont trouvé que beaucoup de bactéries Kpn montraient une résistance aux antibiotiques qui avaient auparavant été efficaces. En particulier, la résistance à la céftriaxone, un traitement courant, était répandue et attribuée principalement à une enzyme spécifique appelée blaCTX-M-15. Cette montée des souches résistantes était préoccupante, suggérant un schéma qui risquait de se poursuivre si ce n'était pas pris en charge.
Fait intéressant, il y a eu une légère amélioration de la sensibilité au chloramphénicol, un autre antibiotique, qui semblait plus efficace ces dernières années. Cette tendance montre que certains traitements plus anciens pourraient encore être des options viables.
Impacts sur le traitement
Avec la montée de la résistance, les options de traitement pour les patients, surtout les nouveau-nés, se sont réduites. L'étude a souligné l'importance de comprendre les modèles de résistance actuels. Cette compréhension pourrait mener à des stratégies de traitement et de gestion plus efficaces pour les infections à Kpn.
Le défi continu est de surveiller et d'adapter les traitements en fonction des types de résistance détectés chez les bactéries. L'étude a indiqué qu'il était essentiel pour les soignants de continuer à évaluer l'efficacité des antibiotiques disponibles, surtout dans des milieux avec peu de ressources comme beaucoup de pays en Afrique subsaharienne.
Développement de vaccins pour Klebsiella pneumoniae
En plus d'améliorer les options de traitement, il y a aussi un besoin de développer des vaccins pour prévenir les infections causées par Kpn. Les bactéries ont diverses structures de surface connues sous le nom de polysaccharides, qui peuvent être ciblées pour le développement de vaccins. La recherche a mis en avant une grande diversité dans ces polysaccharides, rendant la conception des vaccins plus complexe.
L'étude a montré que certains types de polysaccharides étaient plus courants dans des populations spécifiques de patients, notamment ceux les plus à risque, comme les nouveau-nés. Un vaccin adapté qui cible les souches spécifiques présentes dans une zone donnée pourrait potentiellement couvrir la plupart des infections.
Défis en santé publique et contrôle des infections
Les résultats de cette recherche soulignent l'importance d'améliorer la prévention et le contrôle des infections (IPC) dans les hôpitaux. Beaucoup d'infections causées par Kpn sont acquises à l'hôpital. L'étude a souligné que lorsque les établissements de santé amélioraient leurs mesures IPC, les épidémies pouvaient être contrôlées plus efficacement. Des mesures simples comme l'hygiène des mains, le nettoyage de l'environnement et une bonne gestion des patients sont essentielles pour réduire la charge des infections à Kpn.
Les systèmes de santé dans les zones à faibles ressources rencontrent de nombreux obstacles, y compris l'accès irrégulier à de l'eau propre, des fournitures limitées pour les pratiques d'hygiène, et des conditions de surpopulation qui peuvent faciliter la propagation des infections. S'attaquer à ces défis pourrait aider à atténuer l'impact des bactéries résistantes.
Conclusion
L'étude de Klebsiella pneumoniae à l'Hôpital Central Queen Elizabeth a fourni des informations importantes sur les tendances d'infection et de résistance dans un cadre à faible revenu sur deux décennies. Elle a souligné le besoin urgent de surveiller en continu le comportement bactérien et les modèles de résistance pour développer des stratégies de traitement efficaces.
Cette recherche a également souligné le rôle vital des mesures de contrôle des infections ciblées pour prévenir la propagation des infections, surtout parmi les populations vulnérables comme les nouveau-nés. Enfin, elle a mis en avant la nécessité future de développer des vaccins ciblés pour prévenir efficacement les infections à Kpn. En priorisant ces domaines, les systèmes de santé publique peuvent mieux protéger les communautés, surtout celles à risque élevé d'infections graves.
Titre: Longitudinal analysis within one hospital in sub-Saharan Africa over 20 years reveals repeated replacements of dominant clones of Klebsiella pneumoniae and stresses the importance to include temporal patterns for vaccine design considerations
Résumé: Infections caused by multidrug-resistant gram-negative bacteria present a severe threat to global public health. The WHO defines drug-resistant Klebsiella pneumoniae as a priority pathogen for which alternative treatments are needed given the limited treatment options and the rapid acquisition of novel resistance mechanisms by this species. Longitudinal descriptions of genomic epidemiology of Klebsiella pneumoniae can inform management strategies but data from sub-Saharan Africa are lacking. We present a longitudinal analysis of all invasive K. pneumoniae isolates from a single hospital in Blantyre, Malawi, southern Africa, from 1998-2020, combining clinical data with genome sequence analysis of the isolates. We show that after a dramatic increase in the number of infections from 2016 K. pneumoniae becomes hyperendemic, driven by an increase in neonatal infections. Genomic data show repeated waves of clonal expansion of different, often ward-restricted, lineages, suggestive of hospital associated transmission. We describe temporal trends in resistance and surface antigens, of relevance for vaccine development. Our data highlight a clear need for new interventions to prevent rather than treat K. pneumoniae infections in our setting. Whilst one option may be a vaccine, the majority of cases could be avoided by an increased focus on and investment in infection prevention and control measures, which would reduce all healthcare associated infections and not just one.
Auteurs: Eva Heinz, O. Pearse, A. Zuza, S. Bilima, C. Msefula, P. Musicha, P. Siyabu, E. Tewesa, F. E. Graf, R. Lester, S. Lissauer, J. Cornick, J. M. Lewis, K. Kawaza, N. R. Thomson, N. A. Feasey
Dernière mise à jour: 2023-10-09 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.26.23296137
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.26.23296137.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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