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# Biologie# Biologie du développement

Conditions de croissance impactant la formation de gastruloïdes à partir de mESCs

Une étude révèle comment les conditions de croissance influencent le développement des gastruloïdes et les types de cellules qui en résultent.

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En 1981, des scientifiques ont réussi à créer la première lignée de cellules souches embryonnaires de souris (MESCs). Ces cellules proviennent de jeunes embryons de souris et peuvent se transformer en plein de types de cellules différents. Elles sont super importantes pour la recherche sur le développement et la spécialisation des cellules.

Création de Différents Types de Cellules

Les chercheurs utilisent des méthodes spécifiques pour guider les mESCs afin qu'elles deviennent des types de cellules particuliers, comme des cellules hépatiques, des cellules nerveuses et des cellules immunitaires. En regroupant les mESCs dans de petits clusters 3D appelés corps embryonaires (EBs), elles peuvent naturellement se différencier en divers types de cellules issus des trois couches germinales du développement embryonnaire. Certains de ces clusters peuvent aussi développer une organisation structurée, ce qui est important pour étudier le développement précoce.

Pour créer ce qu'on appelle des "Gastruloïdes", les chercheurs ont découvert qu'en utilisant un petit nombre de mESCs avec un signal spécifique, on pouvait former des structures qui ressemblent aux premières étapes d'un embryon. Ces gastruloïdes sont particulièrement utiles pour examiner les processus de développement précoce en laboratoire.

Ajout de Facteurs Spécifiques pour le Développement

Bien que les gastruloïdes puissent former plein de types de cellules, ils manquent généralement de certains composants importants comme les tissus extra-embryonnaires ou les structures cérébrales précoces. Les chercheurs peuvent encourager le développement de ces éléments manquants en ajoutant des produits chimiques spécifiques. Par exemple, en ajoutant certains facteurs de croissance, on peut provoquer la création de structures antérieures comme le cerveau, tandis que d'autres facteurs peuvent favoriser le développement du cœur. Utiliser un matériau semblable à un gel pendant la phase de développement peut aider à recréer plus précisément les structures tissulaires.

Maintenir les Conditions des Cellules Souches

Les cellules souches embryonnaires de souris sont généralement cultivées dans un mélange spécial qui inclut du sérum, ce qui donne un groupe de cellules variées. Ces cellules ressemblent à celles qu'on trouve dans des embryons jeunes et sont dans un état particulier connu sous le nom de pluripotence naïve. Alternativement, les mESCs peuvent être maintenues dans un mélange différent sans sérum, ce qui donne des cellules plus uniformes qui reviennent à un état antérieur de pluripotence.

Les principales différences entre ces deux façons de cultiver les mESCs influencent leur capacité à se transformer en différents types de cellules. Des études ont montré que les conditions de croissance peuvent affecter la manière dont les mESCs peuvent contribuer à divers types de cellules lors de leur développement ultérieur en gastruloïdes.

L'Impact des Conditions de Croissance

Les chercheurs ont remarqué que différentes méthodes pour cultiver les mESCs avant de les transformer en gastruloïdes entraînaient des différences dans la structure et la formation. Les conditions dans lesquelles les mESCs sont maintenues peuvent mener à des résultats variés lorsqu'elles sont par la suite transformées en gastruloïdes. Cette variabilité est essentielle à prendre en compte car elle peut influencer les types de cellules qui se forment dans les gastruloïdes et leur développement.

Méthodes de Recherche

Pour comprendre comment différentes conditions de croissance impactent la formation des gastruloïdes, les chercheurs ont cultivé les mESCs dans divers mélanges et ont ensuite observé comment ces conditions influençaient le développement des gastruloïdes. Des méthodes spécifiques ont été suivies pour observer et analyser ces structures, ce qui incluait de les imaginer dans des conditions contrôlées pour mesurer leur taille et leur forme.

Analyse des Gastruloïdes

Après avoir créé des gastruloïdes à partir de différentes conditions de croissance des mESCs, les chercheurs ont utilisé des techniques d'imagerie pour capturer des données visuelles. Ils avaient besoin d'analyser comment différents facteurs influençaient la forme et la structure des gastruloïdes.

En utilisant des programmes informatiques, les chercheurs ont évalué les différentes dimensions des gastruloïdes pour calculer des valeurs comme l'indice d'élongation, la longueur de la colonne vertébrale, et le diamètre. Cette analyse leur a permis de comprendre à quel point différentes conditions influençaient leur développement.

Évaluation des Types de Cellules

La prochaine étape consistait à examiner les types de cellules qui se développaient dans chaque gastruloïde. En comparant les gastruloïdes provenant de cultures de mESCs variées, les chercheurs espéraient observer des différences dans les types de cellules dérivant de chaque condition. Ils ont spécifiquement cherché des cellules qui pouvaient être regroupées en différentes catégories selon leurs fonctions, comme celles liées aux couches endodermiques, mésodermiques, et ectodermiques.

Résultats des Différentes Conditions de Préculture

Quand des gastruloïdes ont été formés à partir de différentes cultures de mESCs, les chercheurs ont noté que certaines conditions produisaient un ratio plus élevé de types de cellules spécifiques. Par exemple, une culture a abouti à un plus grand nombre de cellules nerveuses, tandis que d'autres ont produit plus de cellules associées à la couche mésodermique. Ces distinctions étaient cruciales pour comprendre comment les conditions initiales ont façonné les résultats du développement des gastruloïdes.

Comprendre les Changements Transcriptionnels et Épigénétiques

Une analyse plus approfondie a révélé que les diverses conditions de croissance entraînaient des différences notables dans la composition génétique et épigénétique des mESCs. En utilisant des techniques avancées, les chercheurs pouvaient profiler l'expression des gènes dans les cellules et évaluer l'état des marqueurs épigénétiques qui aident à réguler l'activité génique.

Ces découvertes ont montré que différentes cultures de mESCs avaient des schémas d'expression génique distincts, influençant leur capacité de développement. Certains gènes associés au potentiel de croissance étaient plus actifs dans certaines cultures que dans d'autres, ce qui était en accord avec les résultats observés dans le développement des gastruloïdes.

Conclusion sur l'Importance des Conditions de Croissance

Dans l'ensemble, la recherche a mis en évidence que les conditions de croissance spécifiques des mESCs ont un impact significatif sur la formation et les caractéristiques des gastruloïdes. Les variations dans les conditions de préculture ont conduit à différents types de cellules au sein des gastruloïdes et ont affecté leur organisation globale. Cela démontre qu'en changeant la manière dont les mESCs sont traitées avant la différenciation, les chercheurs peuvent contrôler les résultats et améliorer la fiabilité de la production de types de cellules spécifiques pour l'étude.

En résumé, l'étude renforce le concept que la gestion soigneuse des conditions de croissance des cellules souches est vitale non seulement pour obtenir les types de cellules souhaités, mais aussi pour améliorer la compréhension des processus de développement précoce. Les recherches futures continueront d'explorer ces liens en profondeur, visant un meilleur contrôle de la différenciation des cellules souches et de meilleures applications en médecine régénérative.

Source originale

Titre: Stem cell culture conditions affect in vitro differentiation potential and efficiency of mouse gastruloid development

Résumé: By aggregating low numbers of mouse embryonic stem cells (mESCs) followed by exposure to Wnt activation, structures termed gastruloids are produced that display an anteroposterior organisation of cell types derived from all three germ layers. Since current gastruloid protocols display considerable heterogeneity between experiments in terms of morphology, elongation efficiency, and cell type composition, we investigated whether an optimised mESC pluripotency state would provide more consistent results. By growing mESCs in different intervals of ESLIF and 2i medium the pluripotency state of cells was modulated, and mESC culture as well as the resulting gastruloids were analysed. Microscopy analysis showed a pre-culture-specific effect on gastruloid formation, in terms of efficiency, elongation index and reproducibility. RNA-seq analysis of the mESC start population confirmed that short-term pulses of 2i and ESLIF modulate the pluripotency state, and result in different cellular states. With multiple epigenetic regulators among the top differentially expressed genes we further analysed genome-wide DNA methylation and H3K27me3 distributions. We observed the same divergence between conditions, most dominantly displayed in the promoter regions of developmental regulators. Lastly, when we investigated the cell type composition of gastruloids grown from these different pre-cultures, we observed that mESCs subjected to 2i-ESLIF preceding aggregation generated gastruloids more consistently, including more complex mesodermal contributions as compared to the ESLIF-only control. This indicates that optimisation of the mESCs pluripotency state allows the modulation of cell differentiation during gastruloid formation.

Auteurs: Marloes Blotenburg, L. Suurenbroek, V. Bhardwaj, P. Zeller

Dernière mise à jour: 2024-05-09 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.09.593319

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.09.593319.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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