Comprendre la chimie des odeurs des fruits
Une étude sur comment les odeurs des fruits changent pendant la maturité et la fermentation.
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Table des matières
La communication chimique est super importante pour capter comment les êtres vivants interagissent dans différents environnements. La plupart des organismes utilisent des signaux chimiques pour des activités essentielles comme trouver de la nourriture, des partenaires et des endroits sûrs pour vivre. Ils en ont aussi besoin pour éviter les prédateurs. Cependant, le monde des Odeurs est vraiment complexe, ce qui rend compliqué l'étude de notre perception. Pour d'autres sens, comme la vue et l'ouïe, c'est facile de catégoriser les signaux selon des propriétés claires, comme les longueurs d'onde de la lumière ou les fréquences sonores. Mais pour les odeurs, c'est pas si évident.
Les protéines qui détectent les odeurs chez les animaux sont nombreuses et variées. Des efforts ont été faits pour classer les odeurs selon leurs propriétés physiques ou chimiques, comme la taille ou la graisse d'une substance. Mais cette méthode n'explique qu'en partie comment on perçoit les différentes odeurs. Cette complexité pousse les chercheurs à trouver de nouvelles façons de cartographier le monde des odeurs.
Notre recherche s'est concentrée sur l'idée qu'on peut mieux comprendre les odeurs en regardant comment différentes odeurs sont liées à des sources naturelles importantes pour les animaux. Dans la nature, des odeurs spécifiques viennent de sources naturelles influencées par divers processus, y compris ceux impliquant de minuscules organismes comme les bactéries et les levures. Les types et les quantités de produits chimiques présents dans ces odeurs peuvent en dire long aux animaux sur la qualité, la sécurité et l'utilité d'une source de nourriture.
On a centré notre étude sur l'espace odorant des Fruits. Les fruits sont des parties nutritives des plantes à fleurs qui se développent à partir de leurs fleurs et servent à protéger les graines. Ils sont conçus pour attirer les animaux, qui mangent les fruits et aident à répandre les graines. Par exemple, les insectes sont souvent attirés par les fruits et leurs odeurs parce qu'ils offrent un bon endroit pour pondre des œufs.
Les fruits mûrs attirent les humains parce qu'ils contiennent beaucoup de sucre, tandis que les fruits pourris sont souvent évités. Certaines odeurs, comme celles issues de la Fermentation, peuvent indiquer qu'un fruit est mûr et nutritif. Différentes espèces d'insectes, comme les mouches à fruits, sont attirées par différents états des fruits, selon leurs besoins alimentaires ou de reproduction.
Chimie des Odeurs de Fruits
Notre étude a examiné comment différents fruits émettent des odeurs à divers stades de Maturité et de fermentation. On s'est concentré sur plusieurs fruits : fraises, bananes, mangues, kiwis et pêches. On a divisé notre recherche en deux ensembles de données : un axé sur les fruits en maturation et l'autre sur les fruits en fermentation.
Le premier ensemble de données portait sur des fraises récoltées à différents stades : non mûres, mûres et trop mûres. On a surveillé les changements d'odeur à mesure que les fraises mûrissaient. Pour le second ensemble, on a utilisé différents fruits dans des conditions de fermentation, soit influencées par des microbes naturels, soit en ajoutant des levures spécifiques.
Pour analyser les odeurs, on a utilisé une technologie pour piéger et identifier les Composés volatils émis par le fruit. En étudiant ces composés, on a voulu trouver des motifs et comprendre comment les odeurs changent avec la maturité et la fermentation.
Nos résultats incluaient de nombreux composés libérés par les fruits, certains étant communs à tous les stades, tandis que d'autres étaient uniques à des stades spécifiques. On s'est concentré sur un ensemble de composés présents dans tous les échantillons, ce qui nous a permis de cibler notre analyse sur les indicateurs les plus significatifs de l'odeur des fruits.
Géométrie Hyperbolique de la Maturité et de la Fermentation des Fruits
Ensuite, on a exploré les formes et les relations des données qu'on a collectées. En utilisant des méthodes avancées, on a cherché à comprendre comment les différentes odeurs s'imbriquent dans une sorte d'espace géométrique. On a découvert que les relations entre les odeurs des fraises et des fruits fermentés pouvaient être mieux représentées en utilisant une forme unique de géométrie connue sous le nom d'espace hyperbolique.
Quand on a tracé nos données, les distances entre les différentes odeurs ont révélé des motifs complexes qui indiquaient des relations non linéaires. En termes simples, la façon dont les odeurs sont disposées ne suit pas une ligne droite, ce qui suggère que les odeurs partagent des connexions plus subtiles liées à leurs sources et à leurs stades de maturité.
On a appliqué des techniques pour visualiser ces relations, ce qui nous a montré que la maturité des fruits suivait une forme spiralée. Cette forme spirale indique que le processus de maturation n'est pas un chemin simple, mais implique plutôt divers stades qui évoluent progressivement dans le temps.
Progression Spirale Collective de Multiples Fruits
On a aussi regardé comment le processus de fermentation de différents fruits forme une forme spiralée. En rassemblant des données à travers plusieurs cycles de fermentation, on a pu analyser comment chaque type de fruit changeait au fil du temps par rapport à son odeur.
Après avoir corrigé certaines variations qui sont survenues durant nos expériences, on a découvert que tous les types de fruits formaient une forme spirale dans notre représentation visuelle. Cette forme commune suggérait que le progrès de la fermentation entraîne des changements prévisibles dans les odeurs produites par les fruits.
On a remarqué que la fermentation provoquait un changement plus structuré dans les motifs d'odeur, ce qui signifie que la présence de levure semblait limiter la variabilité des odeurs par rapport à une fermentation incontrôlée, où une plus large gamme d'activités microbiennes se produit. Cette découverte indique que le processus de fermentation est plus organisé quand on ajoute des levures spécifiques, résultant en des résultats plus prévisibles en termes d'odeurs produites.
Identification des Odeurs qui Catalysent la Maturité et la Fermentation
La prochaine étape de notre recherche était d'identifier quelles odeurs spécifiques contribuaient le plus aux stades de maturité et de fermentation qu'on observait. On s'est concentré sur une sélection d'odeurs partagées entre notre ensemble de données sur les fraises et l'ensemble de données sur la fermentation de plusieurs fruits.
En examinant les relations entre ces odeurs et le motif spiralé de la maturité des fruits, on a trouvé certaines odeurs qui avaient une forte corrélation avec les changements de maturité. Par exemple, un composé, le styrène, était fortement associé à la maturation, tandis qu'un autre composé, le 1-hexanol, était moins lié aux stades de maturité.
Ces relations nous ont permis de voir comment certaines odeurs pouvaient servir d'indicateurs fiables de l'état d'un fruit. À mesure que les fruits passaient de mûrs à trop mûrs, la concentration de certaines odeurs changeait systématiquement, offrant un aperçu supplémentaire de la façon dont les organismes vivants pourraient réagir à ces changements dans leur environnement.
Estimation des Phénotypes de Source d'Odeur
Enfin, notre recherche visait à relier les odeurs que nous avons étudiées à leur signification comportementale pour différents animaux. On a utilisé des données existantes sur comment certains profils d'odeurs se rapportent à des traits spécifiques dans les fruits, comme la douceur et l'acidité. En faisant cela, on a estimé combien chaque odeur contribuait à la perception globale des fruits à différents stades.
On a pu visualiser ces traits et comment ils changeaient au cours des processus de maturation et de fermentation. La douceur des fruits diminuait généralement à mesure qu'ils passaient à des états trop mûrs, tandis que l'acidité et l'acidité augmentaient. Ces découvertes suggèrent un motif prévisible dans la façon dont les animaux pourraient percevoir la valeur des différents fruits au fur et à mesure de leurs changements.
Conclusion
Cette étude met en avant comment le monde des odeurs de fruits peut être organisé et compris dans un cadre qui relie l'odeur aux processus biologiques qui les créent. En cartographiant les relations entre différentes odeurs et les changements qu'elles subissent, on peut mieux comprendre les stratégies que les animaux utilisent pour localiser et évaluer les sources de nourriture dans leur environnement.
Les motifs et les formes géométriques qu'on a découverts ne fournissent pas seulement des aperçus sur la nature des odeurs, mais suggèrent aussi que l'évolution de l'olfaction a été façonnée par le besoin d'extraire des informations significatives des mélanges complexes d'odeurs dans la nature. Comprendre ces dynamiques pourrait améliorer notre compréhension de la façon dont différents organismes interagissent avec leurs écosystèmes et comment ils réagissent au paysage changeant des signaux chimiques qui les entourent.
Titre: Low-dimensional olfactory signatures of fruit ripening and fermentation
Résumé: Odors provide an important communication channel between plants and animals. Fruits, vital nutrient sources for animals, emit a complex array of monomolecular volatiles. Animals can use the structure of these mixtures to assess properties of fruit predictive of their nutritive and reproductive value. We analyzed the statistics of fruit odor mixtures sampled across stages of ripening and fermentation to find that they fall on a low-dimensional hyperbolic map. Hyperbolic maps, with their negative curvature and an exponentially expanding state options, are adept at describing hierarchical relationships in the data such as those arising from metabolic processes within fruits. In the hyperbolic map, samples followed a striking spiral trajectory. The spiral initiated near the maps core, representing the under-ripe phase with specific profiles of monomolecular volatiles. Progressively mapping along the unfolding spiral trajectory were scent mixtures corresponding to ripening, and then rotting or fermentation. The unfolding process depended on the specific fermentation processes that dominated in the samples, determined largely by the microbes (e.g. bacteria or yeast) present in the sample. These results generalized across fruit types and describe trajectories in the natural odorant space with significant behavioral relevance for insects.
Auteurs: Tatyana O Sharpee, Y. Zhou, T. F. O'Connell, M. Ghaninia, B. Smith, E. J. Hong
Dernière mise à jour: 2024-06-17 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.16.599229
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.16.599229.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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