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Comprendre les fibrilles amyloïdes : structure et formation

Un aperçu de la structure et de la formation des fibrilles amyloïdes liées aux maladies.

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Liens entre les fibrillesLiens entre les fibrillesamyloïdes et les maladiesla santé.protéiques et leurs implications pourSe concentrer sur les structures
Table des matières

Les Fibrilles amyloïdes sont un type spécial de structure protéique qui se forme quand des protéines s'agglutinent. Ce regroupement peut se faire de différentes manières et est lié à de nombreuses maladies humaines, comme Alzheimer et Parkinson. Ces fibrilles ont un élément de base commun mais peuvent prendre plein de formes et de tailles différentes, ce qui entraîne divers effets dans le corps.

Structure des fibrilles amyloïdes

Toutes les fibrilles amyloïdes partagent un motif structural de base appelé motif de feuillet β croisé. Ça veut dire qu'elles ont un cadre commun, mais l'agencement spécifique peut varier énormément. Contrairement aux protéines normales, qui se replient en une forme précise déterminée par leur séquence d'acides aminés, les fibrilles amyloïdes peuvent avoir plusieurs structures stables issues de la même séquence peptidique.

Un aspect intéressant des fibrilles amyloïdes est leur capacité à inciter d'autres protéines à se former aussi en ces structures. Ça veut dire qu'une fois que quelques protéines commencent à s'agglutiner, elles peuvent continuer à produire de plus en plus de fibrilles. Ce processus est similaire à la manière dont certains cristaux se forment.

Polymorphisme dans les amyloïdes

Le polymorphisme fait référence à la capacité d'une substance à exister sous différentes formes. Dans le cas des fibrilles amyloïdes, ça veut dire qu'elles peuvent avoir diverses structures stables à partir d'un même type de protéine. Les différentes formes ont souvent des actions biologiques uniques. Par exemple, différentes versions de la protéine tau peuvent mener à différents types de maladies neurodégénératives, chacune avec des structures amyloïdes distinctes.

Des recherches ont montré que certaines structures amyloïdes, comme celles formées par la protéine tau, sont associées à des maladies spécifiques. Des outils comme la cryo-microscopie électronique aident les scientifiques à étudier ces structures en détail.

Le rôle de l'Environnement dans la formation des amyloïdes

Les conditions dans lesquelles les protéines se regroupent pour former des fibrilles amyloïdes jouent un rôle crucial dans la détermination du type de fibrilles qui se forment. Des facteurs comme le pH et la présence de sels peuvent grandement influencer quelle forme d'amyloïde est produite.

Par exemple, des études ont montré qu'à des niveaux de pH plus bas, certains types de structures amyloïdes se forment plus facilement. Ça suggère que l'environnement peut dicter quelles formes sont possibles et lesquelles ne le sont pas.

Cette variation signifie que dans les milieux de laboratoire, reproduire les mêmes conditions que dans le corps peut être difficile, rendant l'étude des maladies liées aux amyloïdes moins efficace.

Semis dans la formation des amyloïdes

Le semis est un processus par lequel des fibrilles existantes encouragent l'assemblage de nouvelles. Dans ce processus, la structure de la semence peut jouer un rôle important dans la détermination de la forme des nouvelles fibrilles qui se forment. Dans certains cas, les nouvelles fibrilles peuvent avoir l'air complètement différentes des semences originales.

Les recherches indiquent que tandis que certaines structures amyloïdes peuvent être reproduites fidèlement par ce processus de semis, d'autres ne le peuvent pas. Par exemple, des fibrilles prélevées dans des cerveaux malades ne produisent souvent pas les mêmes structures quand elles sont utilisées comme semences en laboratoire. Les différences pourraient être dues à l'influence de l'environnement sur le processus de semis.

Défis dans l'étude des fibrilles amyloïdes

Malgré l'accroissement des recherches, beaucoup de questions restent sans réponse concernant la formation des fibrilles amyloïdes et comment reproduire les formes liées aux maladies en laboratoire. Comprendre ces processus est essentiel pour développer des tests et des traitements pour les maladies liées aux amyloïdes.

Les scientifiques étudient comment divers facteurs, y compris l'environnement de la protéine et la présence d'autres molécules, influencent la formation des fibrilles. Réaliser des expériences dans des conditions contrôlées est vital pour déterminer les facteurs clés qui mènent à la formation de différentes structures amyloïdes.

Découvertes récentes dans la recherche sur les amyloïdes

Des études récentes ont souligné la complexité de la formation des amyloïdes. De nouveaux types de structures amyloïdes sont découverts, et leurs noms peuvent varier selon la manière dont elles ont été formées en laboratoire. Ça a mené à de la confusion dans la communauté scientifique concernant comment classifier et comprendre ces structures.

Une découverte importante est que le pH de l'environnement est un facteur majeur dans la détermination du type d'amyloïde qui se forme. Par exemple, les chercheurs ont observé que certains types de fibrilles amyloïdes ont tendance à apparaître dans des conditions basiques, tandis que d'autres se forment dans des milieux plus acides. C'est crucial pour les chercheurs de prendre ça en compte quand ils essaient de reproduire ces conditions pour étudier.

De plus, des mutations spécifiques dans les protéines amyloïdes peuvent mener à des structures uniques qui diffèrent de la protéine originale. Comprendre ces mutations et comment elles affectent la formation des fibrilles pourrait donner des insights sur les mécanismes des maladies et les traitements potentiels.

L'importance des interactions protéiques

Comment les protéines interagissent entre elles joue aussi un rôle crucial dans la formation des structures amyloïdes. L'agencement des acides aminés à la surface de la protéine peut mener à différents schémas d'interactions, contribuant à la diversité des structures de fibrilles.

De plus, certaines protéines peuvent influencer la formation des amyloïdes en modifiant l'environnement ou en fournissant une structure de soutien pour la croissance des fibrilles. Cette interaction entre différentes protéines et leur environnement est un domaine clé de la recherche sur les amyloïdes.

Techniques utilisées dans la recherche sur les amyloïdes

Les chercheurs utilisent différentes techniques pour étudier les fibrilles amyloïdes. Des méthodes comme la cryo-microscopie électronique permettent aux scientifiques de visualiser les différentes formes d'amyloïdes à une échelle très petite. C'est super important pour comprendre la forme et la structure de ces aggrégats.

Une autre méthode, la fluorescence de thioflavine T, aide à surveiller la cinétique de formation des fibrilles amyloïdes. En suivant la rapidité et l'efficacité de la formation des fibrilles, les scientifiques peuvent recueillir des informations sur les conditions qui favorisent certains types d'amyloïdes.

Directions futures dans la recherche sur les amyloïdes

Le domaine de la recherche sur les amyloïdes évolue rapidement, avec de nouvelles techniques et découvertes qui émergent régulièrement. Un objectif important est de trouver des moyens de reproduire les types d'amyloïdes pertinents pour la maladie en laboratoire. C'est crucial pour développer des thérapies et des diagnostics pour des maladies comme Alzheimer et Parkinson.

Pour relever ces défis, les chercheurs explorent diverses stratégies. Ça inclut l'optimisation des conditions de tampon, l'ajustement des concentrations de protéines et l'exploration de l'utilisation d'agents chimiques qui peuvent influencer le processus d'agrégation.

Identifier les bonnes conditions pour étudier les amyloïdes peut mener à une meilleure compréhension de leur rôle dans les maladies et comment les cibler efficacement.

En conclusion, les fibrilles amyloïdes sont des structures protéiques complexes qui jouent un rôle significatif dans plusieurs maladies. La recherche continue sur leur formation, leur structure et leur impact biologique aidera à ouvrir la voie à de nouveaux outils diagnostiques et traitements pour les affections liées à l'agrégation amyloïde.

Source originale

Titre: On the pH-dependence of α-synuclein amyloid polymorphism and the role of secondary nucleation in seed-based amyloid propagation

Résumé: The aggregation of the protein -synuclein is closely associated with several neurodegenerative disorders and as such the structures of the amyloid fibril aggregates have high scientific and medical significance. However, there are dozens of unique atomic-resolution structures of these aggregates, and such a highly polymorphic nature of the -synuclein fibrils hampers efforts in disease-relevant in vitro studies on -synuclein amyloid aggregation. In order to better understand the factors that affect polymorph selection, we studied the structures of -synuclein fibrils in vitro as a function of pH and buffer using cryo-EM helical reconstruction. We find that in the physiological range of pH 5.8-7.4 a pH- dependent selection between Types 1, 2 and 3 polymorphs occurs. Our results indicate that even in the presence of seeds, the polymorph selection during aggregation is highly dependent on the buffer conditions, attributed to the non-polymorph-specific nature of secondary nucleation. We also uncovered two new polymorphs that occur at pH 7.0 in phosphate-buffered saline. The first is a monofilament Type 1 fibril that highly resembles the structure of the juvenile-onset synucleinopathy polymorph found in patient-derived material. The second is a new Type 5 polymorph that resembles a polymorph that has been recently reported in a study that used diseased tissues to seed aggregation. Taken together, our results highlight the shallow amyloid energy hypersurface that can be altered by subtle changes in the environment, including the pH which is shown to play a major role in polymorph selection and in many cases appears to be the determining factor in seeded aggregation. The results also suggest the possibility of producing disease-relevant structure in vitro.

Auteurs: Jason Greenwald, L. Frey, D. Ghosh, B. M. Qureshi, D. Rhyner, R. Guerrero-Ferreira, A. Pokharna, W. Kwiatkowski, T. Serdiuk, P. Picotti, R. Riek

Dernière mise à jour: 2024-07-08 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.25.546428

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.25.546428.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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