MYC et MAX : Acteurs Clés dans la Régulation Génétique
MYC et MAX sont super importants pour contrôler l'activité des gènes et la santé des cellules.
― 9 min lire
Table des matières
- Le rôle de MYC et MAX dans la régulation des gènes
- L'importance des niveaux de MYC et MAX
- Le double rôle de MYC dans l'expression des gènes
- Découvertes récentes sur les sites de liaison de MYC et MAX
- Modèles de liaison de MYC et MAX
- Impact de MYC et MAX sur l'expression des gènes
- Exploration du passage transcriptionnel et de la structure de la chromatine
- Implications pour les longs ARN non codants (lncARN)
- Enquête sur les interactions et les boucles géniques
- La relation de MYC et MAX avec d'autres facteurs de transcription
- Conclusion : L'importance de la liaison de MYC et MAX
- Source originale
MYC et MAX sont des protéines importantes dans nos cellules qui aident à contrôler l'activité de nombreux gènes. Elles agissent comme des Facteurs de transcription, ce qui veut dire qu'elles peuvent influer sur l'activation ou la désactivation des gènes. On sait que MYC favorise l'expression de gènes essentiels pour la croissance et la division cellulaire. MAX, de son côté, collabore avec MYC pour renforcer sa fonction, mais peut aussi interagir avec d'autres protéines pour inhiber l'activité des gènes. Comprendre comment MYC et MAX travaillent ensemble est super important parce qu'ils jouent un rôle significatif dans diverses maladies, y compris le cancer.
Le rôle de MYC et MAX dans la régulation des gènes
MYC et MAX se lient à des séquences spécifiques d'ADN dans nos gènes, appelées E boxes. Quand MYC s’attache à l'ADN avec MAX à ses côtés, ils peuvent collaborer pour recruter d'autres protéines qui aident à détendre l'ADN très compact, permettant ainsi à la machinerie qui lit les gènes, connue sous le nom d'ARN polymérase II (RNAPII), d'accéder au gène et de créer des molécules d'ARN. Ce processus est essentiel pour que les gènes produisent des protéines qui aident la cellule à fonctionner correctement.
Cependant, il y a d'autres protéines connues sous le nom de famille MXD qui peuvent bloquer MYC d'activer des gènes. Ces protéines MXD se disputent les mêmes sites de liaison que MYC sur l'ADN, ce qui signifie qu'elles peuvent réduire les effets de MYC quand elles sont présentes. L'équilibre entre MYC et les protéines MXD est vital pour le bon fonctionnement et le développement des cellules.
L'importance des niveaux de MYC et MAX
Les niveaux de MYC et MAX dans les cellules doivent être strictement contrôlés. Quand il y a trop de protéines MYC, ça peut mener à une croissance cellulaire incontrôlée, ce qui est caractéristique de nombreux cancers. Par exemple, des niveaux élevés de MYC peuvent provoquer la formation de tumeurs. D'un autre côté, s'il n'y a pas assez de MYC ou MAX, ça peut causer des problèmes dans les processus cellulaires normaux. Des études ont montré que retirer le gène MYC ou MAX chez les souris peut entraîner de graves problèmes de développement ou même la mort, mettant en évidence la nécessité de ces protéines pour maintenir des cellules saines.
Le double rôle de MYC dans l'expression des gènes
Alors que MYC est souvent considéré comme un promoteur de l'expression des gènes, il peut aussi réprimer des gènes indirectement. Il peut le faire en interagissant avec d'autres facteurs de transcription qui favorisent normalement l'activité des gènes. Cela signifie que MYC peut avoir à la fois des effets d'activation et de blocage sur l'expression des gènes selon le contexte.
Découvertes récentes sur les sites de liaison de MYC et MAX
Des recherches récentes ont révélé que MYC et MAX ne se lient pas seulement près des débuts des gènes (appelés sites de départ de transcription ou TSS), mais aussi près des fins des gènes (appelés sites de fin de transcription ou TES). Cette découverte a ouvert de nouvelles discussions sur le fonctionnement de la régulation des gènes, car elle suggère que la liaison de ces protéines aux extrémités des gènes peut influencer la quantité d'ARN produite.
L'étude a examiné divers types de cellules humaines et murines et a constaté qu'un nombre significatif de gènes a des sites de liaison pour MYC et MAX près de leurs TES. Cette liaison n'est pas aléatoire ; elle a tendance à se produire dans certains types de gènes, notamment ceux impliqués dans des fonctions cellulaires critiques. De plus, cette liaison semble être liée à la façon dont les gènes s'expriment dans différentes conditions, comme en période de stress ou lorsque des signaux de croissance sont présents.
Modèles de liaison de MYC et MAX
La recherche a décrit où MYC et MAX se lient par rapport aux TSS et TES. Elle a trouvé que la plupart des liaisons se produisent dans une distance spécifique de ces sites. Les modèles de liaison étaient similaires entre différents types de cellules, mais montraient aussi quelques variations, indiquant que la fonction de MYC et MAX peut différer en fonction du type de cellule et de la situation.
La force de liaison de MYC et MAX est généralement plus forte aux TSS par rapport aux TES. Cependant, ça ne veut pas dire que leur rôle aux TES est moins critique. La liaison près des TES suggère que MYC et MAX peuvent aussi influencer la terminaison transcriptionnelle, qui est la dernière étape de l'expression des gènes où la molécule d'ARN est complètement formée et libérée.
Impact de MYC et MAX sur l'expression des gènes
Lorsque MYC et MAX sont présents aux TES, ils peuvent améliorer la production d'ARN à partir des gènes. Cet effet est particulièrement significatif en période de stress ou lorsque les cellules se divisent rapidement. La recherche a montré que la présence de MYC et MAX aux TES correspond à des niveaux plus élevés d'ARN produit par ces gènes.
Fait intéressant, l'expression de certains gènes qui ont MYC et MAX liés à leurs TES diffère de ceux qui n'en ont pas. Cela implique que la présence de MYC et MAX aux TES pourrait fournir une couche de contrôle supplémentaire sur l'expression des gènes, affectant comment les gènes réagissent à divers stimuli.
Exploration du passage transcriptionnel et de la structure de la chromatine
L'étude a également examiné comment la liaison de MYC et MAX aux TES est liée à ce qu'on appelle le passage transcriptionnel. Ce phénomène se produit lorsque la machinerie de transcription continue de lire au-delà de la fin d'un gène au lieu de s'arrêter au site d'arrêt habituel. La liaison de MYC et MAX semble promouvoir ce processus, conduisant à des molécules d'ARN plus longues qui peuvent avoir des fonctions différentes.
De plus, la recherche a lié la liaison de MYC et MAX à des changements dans la structure de la chromatine. Quand MYC et MAX s'attachent à l'ADN, cela entraîne des modifications dans la chromatine, la rendant plus accessible à la transcription. Cette accessibilité ressemble à ce qu'on observe dans les régions d'activateurs, connues pour leur rôle dans l'augmentation de l'expression des gènes.
Implications pour les longs ARN non codants (lncARN)
Les longs ARN non codants (lncARN) sont un type d'ARN qui ne code pas pour des protéines mais joue des rôles essentiels dans la régulation de l'expression des gènes. Les découvertes suggèrent que la liaison de MYC et MAX est enrichie aux TES des gènes lncARN. Cette association indique que MYC et MAX pourraient aussi aider à réguler l'expression des lncARN, influençant potentiellement divers processus cellulaires, y compris le développement et la réponse aux changements environnementaux.
Enquête sur les interactions et les boucles géniques
L'étude s'est également concentrée sur comment MYC et MAX influencent les interactions entre différentes parties du génome. Elle a examiné comment la liaison de MYC et MAX aux TSS et TES pourrait faciliter les connexions entre ces régions, formant des boucles qui les rapprochent. Cette capacité est censée permettre une transcription et une régulation des gènes plus efficaces.
Grâce à des techniques avancées, les chercheurs ont démontré que lorsque MYC et MAX sont liés aux TES, il y a une probabilité plus élevée d'observer des connexions entre les TSS et TES, menant à une augmentation de l'expression des gènes. La présence de MYC et MAX à ces sites favorise non seulement la transcription directe des gènes mais aussi les interactions nécessaires pour une régulation efficace des gènes.
La relation de MYC et MAX avec d'autres facteurs de transcription
MYC et MAX n'agissent pas seuls ; ils interagissent avec divers autres facteurs de transcription et co-facteurs qui aident à réguler l'expression des gènes. L'étude a trouvé que des protéines comme CTCF, p300 et Mediator se trouvent souvent à des sites où MYC et MAX se lient. Ces facteurs sont essentiels pour créer la structure et l'environnement nécessaires permettant à MYC et MAX d'accomplir leurs fonctions efficacement.
La coopération entre ces protéines indique que la régulation des gènes est un processus complexe et dynamique impliquant de nombreux acteurs qui travaillent ensemble pour assurer que les gènes s'expriment correctement selon les besoins de la cellule.
Conclusion : L'importance de la liaison de MYC et MAX
La recherche met en lumière le rôle crucial que MYC et MAX jouent dans la régulation de l'expression des gènes par leur liaison à la fois aux TSS et TES. Leur capacité à influencer non seulement le début de la transcription, mais aussi sa terminaison reflète un mécanisme sophistiqué de régulation des gènes. Les résultats soulignent la nécessité d'explorer davantage ces interactions et leurs implications tant dans les fonctions cellulaires normales que dans des maladies comme le cancer.
Comprendre l'équilibre et la dynamique des interactions MYC et MAX avec d'autres facteurs de transcription et leur impact sur l'expression des gènes sera vital pour développer de nouvelles stratégies thérapeutiques visant les maladies causées par la dysrégulation de ces protéines clés. Grâce à une compréhension plus approfondie de ces mécanismes, on peut mieux comprendre comment les cellules s'adaptent à leur environnement, croissent et maintiennent leurs fonctions, ainsi que comment ces processus peuvent mal tourner dans des états pathologiques.
Titre: MYC Binding Near Transcriptional End Sites Regulates Basal Gene Expression, Read-Through Transcription and Intragenic Contacts
Résumé: The MYC oncoprotein regulates numerous genes involved in cellular processes such as cell cycle and mitochondrial and ribosomal structure and function. This requires heterodimerization with its partner, MAX, and binding to specific promoter and enhancer elements. Here, we show that MYC and MAX also bind near transcriptional end sites (TESs) of over one-sixth of all annotated genes. These interactions are dose-dependent, evolutionarily conserved, stabilize the normally short-lived MYC protein and regulate expression both in concert with and independent of MYCs binding elsewhere. MYCs TES binding occurs in association with other transcription factors, alters the chromatin landscape, increases nuclease susceptibility and can alter transcriptional read-through, particularly in response to certain stresses. MYC-bound TESs can directly contact promoters and may fine-tune gene expression in response to both physiologic and pathologic stimuli. Collectively, these findings support a previously unrecognized role for MYC in regulating transcription and its read-through via direct intragenic contacts between TESs and promoters.
Auteurs: Edward V Prochownik, H. Wang, B. Ma, T. Stevens, J. Knapp, j. Lu
Dernière mise à jour: 2024-07-16 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.11.603118
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.11.603118.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.