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Nouvelle méthode pour mesurer les interactions entre particules

Une nouvelle approche révèle comment de minuscules particules interagissent selon différentes conditions.

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Comprendre comment de minuscules particules, comme les particules colloïdales ou les cellules, interagissent est important dans plusieurs domaines scientifiques, y compris la science des matériaux et la biologie. Ces Interactions peuvent influencer des événements comme la formation de colonies de bactéries ou la propagation du cancer. Cependant, mesurer avec précision comment ces interactions se produisent peut être compliqué et prendre beaucoup de temps. Souvent, les scientifiques doivent créer des conditions très différentes de celles trouvées dans la nature pour le faire.

La plupart des méthodes actuelles pour mesurer comment les particules interagissent se concentrent sur de petits groupes de particules au repos. Cela limite ce que les scientifiques peuvent découvrir sur des groupes plus larges ou des systèmes plus complexes.

Nouvelle Approche de Mesure

Une nouvelle méthode est proposée qui examine le mouvement des particules interagissant pour déduire comment elles interagissent entre elles. Cette approche utilise les trajets réels que prennent les particules et applique des lois physiques connues pour découvrir quels types de forces sont en jeu. Cette méthode fonctionne aussi bien pour les systèmes équilibrés que pour ceux qui ne le sont pas, et elle peut gérer de grands groupes de particules dans des conditions normales. Importamment, elle ne suppose pas un type spécifique de force d'interaction entre les particules.

En utilisant cette méthode, les chercheurs ont pu analyser comment les sphères colloïdales interagissent en se basant sur leurs mouvements. Ils ont réussi à identifier la portée et la force d'une interaction causée par la déplétion, qui se produit lorsque les particules sont regroupées.

Informations Provenant des Mesures

Mesurer comment les particules interagissent peut révéler de nouvelles informations sur des phénomènes physiques. Par exemple, les chercheurs ont découvert qu'il existe des interactions à longue portée dans les sphères colloïdales lorsque d'autres petites particules sont présentes. Ils ont également mis en évidence des attractions inattendues entre des particules ayant des charges similaires, ce qui peut aider à expliquer diverses interactions dans des systèmes complexes.

La mesure directe des interactions entre particules a amélioré des processus comme la sélection d'anticorps monoclonaux pour des traitements médicaux. Au-delà des systèmes physiques, comprendre ces interactions peut donner des indices sur des systèmes biologiques complexes. Par exemple, la façon dont les cellules communiquent peut influencer des processus comme la propagation du cancer et la création de tissus.

La façon dont les particules interagissent peut aussi aider à simplifier la dynamique de systèmes compliqués, les rendant plus faciles à interpréter ou à modéliser. Bien que les interactions entre les cellules aient été bien étudiées à un petit niveau, comprendre des processus biologiques plus larges a été un défi.

Intégration avec la Théorie

Au lieu d'essayer de modéliser complètement des systèmes biologiques complexes, les chercheurs peuvent combiner des modèles théoriques avec les interactions identifiées par les mesures. Cette intégration peut aider à créer des simulations qui imitent plus étroitement des scénarios réels, réduisant ainsi le besoin d'expériences coûteuses. Des descriptions précises de ces interactions peuvent conduire à de meilleurs designs computationnels pour des matériaux qui pourraient fonctionner avec des composants biologiques ou imiter des processus naturels.

De plus, connaître les interactions entre particules peut aider à prédire comment elles vont se déplacer. Lorsque les chercheurs ont inclus les nouveaux potentiels d'interaction mesurés dans des expériences de suivi de particules, ils ont constaté que leurs prédictions devenaient beaucoup plus précises. Ce progrès permet d'effectuer un plus large éventail d'expériences.

Défis des Méthodes Actuelles

La plupart des méthodes traditionnelles pour mesurer les interactions examinent un nombre limité de particules étroitement contrôlées. Ces particules sont souvent piégées dans des environnements spécifiques, comme maintenues dans des pièges optiques ou attachées à des surfaces, ce qui complique la simulation des conditions naturelles. Même lorsque les particules sont libres de se déplacer, de nombreuses méthodes supposent que ces systèmes sont équilibrés, ce qui n'est pas toujours le cas dans des scénarios réels.

Les systèmes de matière active ou ceux avec de nombreuses particules interagissant de manière complexe sont souvent ignorés par les méthodes standard.

Approche Basée sur les Données

Une nouvelle alternative est d'inférer les interactions directement à partir des mouvements observés des particules. Les approches précédentes se concentraient principalement sur le mouvement déterministe mais avaient moins d'accent sur les systèmes impliquant le hasard. La plupart des études passées qui prenaient en compte le mouvement stochastique se limitaient à une ou deux particules et nécessitaient souvent de supposer un certain type de force.

Au lieu de se concentrer sur un modèle d'interaction spécifique dès le départ, les chercheurs peuvent ajuster un potentiel d'interaction plus général en utilisant des outils comme les Graph Neural Networks (GNNs). Ces réseaux incluent des principes de localité et de distance entre les particules, ce qui peut être utile pour extraire des informations à partir des interactions des particules. Bien que les GNNs aient été adaptés avec succès pour des systèmes déterministes, ils n'ont pas été appliqués de manière exhaustive aux dynamiques stochastiques jusqu'à présent.

Méthodologie

La nouvelle méthode repose sur la maximisation de la probabilité d'observer le mouvement des particules au fil du temps. Cela signifie déterminer le meilleur modèle potentiel qui explique les trajectoires des particules sous des lois physiques connues. La méthode peut gérer à la fois des systèmes équilibrés et déséquilibrés et s'applique à la fois à de petits groupes et à de plus grandes masses de particules.

Les chercheurs ont appliqué cette méthode aux Données expérimentales recueillies à partir de particules colloïdales pour extraire les interactions causées par la déplétion. Ils ont validé leurs découvertes en comparant le potentiel d'interaction déduit à des données précédemment connues et ont trouvé que c'était précis.

Utilisation de Formes Fonctionnelles Connues

Le focus initial de cette méthode est de déterminer des paramètres pour un potentiel d'interaction avec une forme connue, comme le potentiel de Morse. En définissant comment les particules passent d'une position à une autre au fil du temps, les chercheurs peuvent calculer la probabilité d'observer l'ensemble de la trajectoire des particules. Pour trouver le meilleur ajustement pour le potentiel, ils calculent la probabilité moyenne pour toutes les trajectoires observées.

Lorsqu'ils examinent comment les particules interagissent par le Mouvement brownien, les chercheurs peuvent utiliser des relations connues entre position, vitesse et forces externes pour calculer les probabilités de transition. Cela leur permet de construire un cadre qui cartographie comment les particules changent de position au fil du temps et infère ainsi les potentiels d'interaction.

Compréhension du Mouvement Brownien

Le mouvement brownien concerne les particules suspendues dans un fluide. Il implique des interactions complexes influencées par des forces thermiques aléatoires. La nouvelle méthode tient compte de ces forces tout en s'appuyant sur des statistiques concernant le comportement des particules dans cet environnement aléatoire.

En connaissant la physique derrière le mouvement brownien, les chercheurs peuvent déterminer la probabilité que des particules se déplacent d'une position à une autre en fonction des forces qui agissent sur elles. Cela est réalisé même dans les cas où les effets de la vitesse ne sont pas pris en compte, en se concentrant principalement sur la façon dont les particules se déplacent par rapport les unes aux autres.

Généralisation de l'Approche

Bien que l'ajustement des paramètres pour des potentiels connus soit informatif, les chercheurs reconnaissent que de nombreux systèmes complexes pourraient ne pas s'inscrire parfaitement dans des catégories prédéfinies. En utilisant un Réseau de neurones, ils peuvent gérer des formes fonctionnelles arbitraires de potentiels d'interaction. Cette étape élargit la gamme des interactions potentielles pouvant être analysées.

Le réseau de neurones utilisé s'appelle NequIP, conçu pour capturer une variété de formes d'interaction. En formant le réseau avec les données disponibles sur le mouvement des particules, les chercheurs peuvent extraire des relations plus complexes sans être limités à une forme d'interaction spécifique.

Validation par des Expériences

Après avoir démontré la méthodologie par le biais de simulations, les chercheurs l'ont testée contre des données réelles. Ils ont travaillé avec des sphères colloïdales suspendues dans une solution contenant certains polymères. Dans ces conditions, les particules colloïdales subissent des forces répulsives en raison de leurs charges électriques. Cependant, l'ajout de polymères a créé une attraction entropique, incitant les particules à vouloir se regrouper.

Les chercheurs ont recueilli des données de leurs expériences et utilisé la nouvelle méthode pour analyser comment ces particules interagissaient. Ils ont trouvé une gamme d'interactions cohérentes avec les modèles existants, validant l'approche à travers des données simulées et expérimentales.

Défis dans les Données Réelles

En examinant des données réelles, les chercheurs ont noté qu'il y avait un certain bruit et une variabilité présents, rendant plus compliqué de tirer des conclusions exactes. Cependant, même avec ce bruit, la méthode a réussi à récupérer de manière précise des caractéristiques importantes des interactions.

Bien qu'il y ait eu quelques écarts dans les données, probablement dus à la nature complexe des interactions dans la vie réelle, les résultats globaux indiquaient que la méthode a capturé avec succès les caractéristiques essentielles des interactions entre particules.

Comparaison des Méthodes

Les potentiels d'interaction dérivés de la nouvelle méthode ont été comparés aux résultats d'autres approches, comme l'Algorithme d'Inversion de Boltzmann Itératif. Cette méthode traditionnelle consiste à commencer par un potentiel et à le raffiner en fonction des corrélations observées dans les données. Cependant, elle présente des limites dans des situations hors d'équilibre et peut être influencée par la manière dont les données sont catégorisées.

En revanche, la nouvelle méthode se concentre uniquement sur les données collectées sans imposer d'hypothèses préalables, ce qui la rend plus robuste et flexible. Elle capture les relations directes des positions des particules pendant le mouvement et fournit des résultats précis indépendamment des conditions de données sous-jacentes.

Perspectives Futures

La nouvelle approche pour mesurer les potentiels d'interaction ouvre des possibilités pour étudier un plus large éventail de systèmes. De la compréhension de processus biologiques complexes à l'exploration d'applications délicates en science des matériaux, le potentiel de découvertes est considérable.

Alors que les techniques computationnelles s'améliorent et que les réseaux de neurones évoluent, cette méthode deviendra probablement encore plus efficace. Elle peut être appliquée à des systèmes actifs, comme des essaims de particules ou des groupes de cellules, enrichissant notre compréhension de la façon dont les interactions façonnent les comportements dans divers domaines.

Conclusion

Dans l'ensemble, la nouvelle méthodologie pour inférer des potentiels d'interaction à partir de trajectoires de particules représente un avancement significatif dans la mesure d'interactions complexes. En combinant des principes physiques établis avec des méthodes computationnelles modernes, les chercheurs peuvent mieux comprendre comment les particules se comportent et interagissent dans leurs environnements. Cette connaissance pourrait mener à des percées dans de nombreuses disciplines scientifiques, ouvrant la voie à des solutions et des designs innovants dans les systèmes matériels et biologiques.

Source originale

Titre: Inferring interaction potentials from stochastic particle trajectories

Résumé: Accurate interaction potentials between microscopic components such as colloidal particles or cells are crucial to understanding a range of processes, including colloidal crystallization, bacterial colony formation, and cancer metastasis. Even in systems where the precise interaction mechanisms are unknown, effective interactions can be measured to inform simulation and design. However, these measurements are difficult and time-intensive, and often require conditions that are drastically different from in situ conditions of the system of interest. Moreover, existing methods of measuring interparticle potentials rely on constraining a small number of particles at equilibrium, placing limits on which interactions can be measured. We introduce a method for inferring interaction potentials directly from trajectory data of interacting particles. We explicitly solve the equations of motion to find a form of the potential that maximizes the probability of observing a known trajectory. Our method is valid for systems both in and out of equilibrium, is well-suited to large numbers of particles interacting in typical system conditions, and does not assume a functional form of the interaction potential. We apply our method to infer the interactions of colloidal spheres from experimental data, successfully extracting the range and strength of a depletion interaction from the motion of the particles.

Auteurs: Ella M. King, Megan C. Engel, Caroline Martin, Alp M. Sunol, Qian-Ze Zhu, Sam S. Schoenholz, Vinothan N. Manoharan, Michael P. Brenner

Dernière mise à jour: 2024-06-03 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2406.01522

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2406.01522

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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