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Étudier la maladie d'Alzheimer à travers des modèles de souris

Des études de recherche sur des modèles de souris pour mieux comprendre la maladie d'Alzheimer et les traitements potentiels.

Junmin Peng, J. M. Yarbro, X. Han, A. Dasgupta, K. Yang, D. Liu, H. Shrestha, M. Zaman, Z. Wang, K. Yu, D. G. Lee, D. Vanderwall, M. Niu, H. Sun, B. Xie, P.-C. Chen, Y. Jiao, X. Zhang, Z. Wu, Y. Fu, Y. Li, Z.-F. Yuan, X. Wang, S. Poudel, B. Vagnerova, Q. He, A. Tang, P. Ronaldson, R. Chang, G. YU, Y. Liu

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La maladie d'Alzheimer (MA) est un trouble cérébral qui détruit lentement la mémoire et les compétences de réflexion. Ça touche généralement les gens de plus de 65 ans, et des millions d'Américains en souffrent. La maladie entraîne des changements dans le cerveau, provoquant des problèmes de mémoire, de comportement, et des tâches quotidiennes.

Que se passe-t-il dans le cerveau ?

Dans la MA, deux problèmes principaux se produisent dans le cerveau. D'abord, une protéine appelée Bêta-amyloïde s'accumule à l'extérieur des cellules nerveuses, formant des plaques collantes. Ça peut perturber la communication entre les cellules cérébrales. Ensuite, une autre protéine appelée TAU forme des enchevêtrements à l'intérieur des cellules nerveuses, ce qui peut les endommager et conduire à leur mort. Ces changements se produisent longtemps avant l'apparition des symptômes.

Autres Protéines liées

En plus de la bêta-amyloïde et de tau, il y a d'autres protéines qui pourraient contribuer à la maladie d'Alzheimer. Parmi elles, on trouve l'alpha-synucléine, TDP-43, et U1 snRNP. Les scientifiques essaient toujours de comprendre comment ces protéines agissent ensemble et comment elles mènent à la maladie.

Facteurs génétiques

Les chercheurs ont identifié plusieurs gènes qui peuvent augmenter le risque de développer la MA. Trois gènes principaux sont connus pour causer la MA familiale (qui se transmet dans les familles) : APP, PSEN1, et PSEN2. D'autres gènes, comme APOE4 et TREM2, sont liés à un risque plus élevé de développer la maladie, tandis qu'environ 100 autres gènes pourraient avoir un effet plus petit.

Modèles murins de la maladie d'Alzheimer

Pour mieux comprendre la MA, les scientifiques utilisent souvent des modèles murins. Ces souris sont conçues pour avoir des changements génétiques similaires à ceux observés chez les personnes atteintes d'Alzheimer. Plus de 100 modèles murins ont été créés pour étudier le trouble. Certains des modèles les plus courants incluent 5xFAD, 3xTG, et NLF.

Limites des modèles actuels

Bien que ces modèles murins fournissent des informations précieuses, ils ne reproduisent pas totalement tous les aspects de la MA humaine. Le niveau de dommage cérébral observé chez ces souris est souvent moins sévère que chez les patients humains. Les chercheurs doivent connaître les forces et les faiblesses de chaque modèle pour choisir le bon pour leurs études.

Avancées récentes en technologie

Les nouvelles technologies en biologie, surtout les études "omiques", permettent aux scientifiques de regarder de nombreuses molécules dans le cerveau en même temps. Ça aide les chercheurs à évaluer comment différents modèles murins se comparent à la MA humaine.

Changements transcriptomiques et protéomiques

Une étude sur l'activité génique dans les modèles murins a montré des changements dans les protéines impliquées dans la réponse immunitaire et la signalisation cérébrale. Toutefois, parfois, le niveau d'ARN (une molécule liée à l'activité génique) ne correspond pas au niveau des protéines produites à partir de cet ARN. Cela peut être dû à divers processus qui se produisent après la création de l'ARN, comme la façon dont les protéines sont fabriquées et dégradées.

Analyse protéomique des modèles d'Alzheimer

Une étude complète a examiné des milliers de protéines et de phosphoprotéines (un type spécifique de protéine modifiée avec un phosphate) dans différents modèles murins de la MA. Cette étude incluait des modèles couramment utilisés comme 5xFAD et NLGF, ainsi que d'autres modèles 3xTG et BiG. L'objectif était de trouver des changements communs dans les protéines associées à la MA.

Méthodologie

Dans cette recherche, des échantillons de cerveau de ces souris ont été analysés pour identifier les protéines qui ont changé avec l'âge. Les chercheurs voulaient aussi voir comment ces changements se comparent aux données humaines. Ils ont découvert que l'accumulation d'amyloïde affecte la dégradation de certaines protéines, suggérant que l'accumulation d'amyloïde contribue aux changements dans les protéines cérébrales.

Changements protéomiques partagés dans les modèles murins

L'étude a comparé les niveaux de protéines dans trois modèles murins de MA à divers âges, ainsi que des souris de contrôle appariées par âge. En examinant les données de ces modèles, les chercheurs ont trouvé de nombreux changements partagés dans les niveaux de protéines liés à la maladie.

Résultats clés

  • Des schémas similaires de changements protéiques ont été trouvés dans les modèles 5xFAD et NLGF.
  • Même si NLF a montré moins de changements, les autres modèles ont présenté des altérations significatives avec l'âge.
  • Un grand nombre de protéines ont changé en fonction du niveau d'accumulation d'amyloïde, indiquant une association directe entre les niveaux d'amyloïde et les changements protéiques dans le cerveau.

Comprendre les changements du phosphoprotéome

La Phosphorylation est un autre processus important dans la MA. Les changements dans l'ajout de groupes phosphate aux protéines peuvent affecter leur fonction et leur stabilité. Dans la même étude, les scientifiques ont analysé comment les niveaux de phosphorylation différaient dans les différents modèles murins.

Identification des changements cohérents

Les chercheurs ont trouvé plusieurs protéines avec des niveaux de phosphorylation altérés communs à plusieurs modèles murins. Ils ont lié ces changements à des voies impliquées dans la réponse immunitaire et la signalisation neuronale.

Comparaison avec les données humaines sur l'Alzheimer

Pour comprendre comment les modèles murins se rapportent à la MA humaine, les chercheurs ont comparé les changements protéiques chez les souris avec les changements connus observés dans les études humaines. Ils ont identifié un ensemble de protéines qui étaient affectées de manière similaire dans les deux espèces, indiquant que les modèles murins peuvent aider à comprendre les maladies humaines.

Activités des voies

En examinant les protéines partagées, plusieurs voies biologiques clés se sont révélées significativement actives. Ces voies sont liées à la réponse immunitaire, au métabolisme des protéines, et à la communication cellulaire.

Pathologies supplémentaires dans les modèles d'Alzheimer

Bien que les modèles communs soient utiles, ils ne capturent pas tous les aspects de la MA. Certains modèles plus récents, comme 3xTG et BiG, présentent des caractéristiques supplémentaires de la maladie, comme des enchevêtrements tau et des problèmes d'épissage de l'ARN.

Changements protéiques uniques

Par exemple, 3xTG a montré des protéines liées aux voies tau, tandis que BiG a présenté des changements liés à l'épissage de l'ARN et à la fonction synaptique. Comparer ces modèles révèle que la présence de pathologies supplémentaires les rend plus similaires à la MA humaine.

Intégration multi-omique et aperçus

Rassembler des données de différentes couches "omiques" peut fournir une meilleure image de ce qui se passe dans la MA. En intégrant des données concernant les protéines, l'ARN, et d'autres activités moléculaires, les chercheurs peuvent mieux comprendre la maladie.

Identification des protéines clés

À travers leur analyse, les chercheurs ont identifié plusieurs protéines qui ne sont pas encore bien étudiées mais qui pourraient jouer des rôles importants dans la MA. Cela inclut des protéines liées à la fonction synaptique et à la réponse immunitaire qui pourraient aider à développer des thérapies ciblées.

Changements des taux de turnover des protéines

Une découverte significative de la recherche a été l'altération de la vitesse à laquelle les protéines se décomposent dans le cerveau. Dans la MA, certaines protéines s'accumulent car elles ne se décomposent pas aussi vite qu'elles le devraient.

Enquête sur la durée de vie des protéines

Les scientifiques ont utilisé des techniques spéciales pour suivre combien de temps les protéines durent dans le cerveau. Ils ont découvert que dans les modèles de MA, certaines protéines ont des durées de vie beaucoup plus longues, ce qui conduit à leur accumulation. Cette présence prolongée de protéines pourrait contribuer à la progression et aux symptômes de la maladie.

Conclusion

Cette étude approfondie met en lumière l'importance d'utiliser plusieurs modèles pour étudier la maladie d'Alzheimer. En comprenant les différences et similitudes entre les modèles murins et les données humaines, les scientifiques peuvent mieux identifier les cibles potentielles pour le traitement.

Directions futures

Les résultats suggèrent aussi que se concentrer sur des protéines et des processus peu étudiés pourrait mener à des percées dans notre compréhension et notre traitement de la maladie d'Alzheimer. Cette approche complète pourrait ouvrir la voie à des thérapies plus efficaces pour relever les défis de cette condition.

En continuant à analyser et à intégrer les résultats de divers modèles, les chercheurs espèrent débloquer de nouvelles stratégies pour combattre l'Alzheimer. Le travail en cours dans ce domaine reste crucial pour améliorer la vie de ceux qui sont touchés par cette maladie dévastatrice.

Source originale

Titre: Human-mouse proteomics reveals the shared pathways in Alzheimer's disease and delayed protein turnover in the amyloidome

Résumé: Murine models of Alzheimers disease (AD) are crucial for elucidating disease mechanisms but have limitations in fully representing AD molecular complexities. We comprehensively profiled age-dependent brain proteome and phosphoproteome (n > 10,000 for both) across multiple mouse models of amyloidosis. We identified shared pathways by integrating with human metadata, and prioritized novel components by multi-omics analysis. Collectively, two commonly used models (5xFAD and APP-KI) replicate 30% of the human protein alterations; additional genetic incorporation of tau and splicing pathologies increases this similarity to 42%. We dissected the proteome-transcriptome inconsistency in AD and 5xFAD mouse brains, revealing that inconsistent proteins are enriched within amyloid plaque microenvironment (amyloidome). Determining the 5xFAD proteome turnover demonstrates that amyloid formation delays the degradation of amyloidome components, including A{beta}-binding proteins and autophagy/lysosomal proteins. Our proteomic strategy defines shared AD pathways, identify potential new targets, and underscores that protein turnover contributes to proteome-transcriptome discrepancies during AD progression.

Auteurs: Junmin Peng, J. M. Yarbro, X. Han, A. Dasgupta, K. Yang, D. Liu, H. Shrestha, M. Zaman, Z. Wang, K. Yu, D. G. Lee, D. Vanderwall, M. Niu, H. Sun, B. Xie, P.-C. Chen, Y. Jiao, X. Zhang, Z. Wu, Y. Fu, Y. Li, Z.-F. Yuan, X. Wang, S. Poudel, B. Vagnerova, Q. He, A. Tang, P. Ronaldson, R. Chang, G. YU, Y. Liu

Dernière mise à jour: 2024-10-25 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620263

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620263.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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