Tailocines : Un nouvel espoir contre les infections bactériennes
Les tailocines offrent une alternative prometteuse pour lutter contre la résistance croissante aux antibiotiques.
Dorien Dams, Célia Pas, Agnieszka Latka, Zuzanna Drulis-Kawa, Lars Fieseler, Yves Briers
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Table des matières
- C'est Quoi Les Tailocines ?
- Les Tailocines R-type
- Les Tailocines F-type
- Comment Fonctionnent Les Tailocines ?
- Le Besoin de Variété
- Ingénierie de Nouvelles RBP
- La Technique VersaTile
- Prouver le Concept
- La Chaîne de Production
- Tester l'Efficacité
- Résultats
- L'Avenir des Tailocines
- Au-delà des Bactéries
- Tailocines vs Phages
- En Résumé
- Source originale
Les infections bactériennes reviennent comme un gros souci pour notre santé au 21ème siècle. Avec les bactéries qui se répandent partout dans le monde et qui deviennent de plus en plus résistantes aux antibiotiques, les scientifiques se sentent sous pression pour trouver de nouvelles manières de traiter ces infections. Une des idées intéressantes, c'est d'utiliser quelque chose appelé des bactériocines de type queue, ou tailocines pour faire court.
C'est Quoi Les Tailocines ?
Les tailocines sont des paquets de protéines uniques qui ressemblent un peu à des virus qui infectent les bactéries (appelés bactériophages), mais elles n'ont pas la capacité de se reproduire. Imagine un énorme complexe de protéines en costume mais sans chapeau ni mallette. Elles sont comme les cool kids à l'école qui n'ont pas besoin de se reproduire pour faire un effet!
Quand les bactéries se sentent stressées, elles produisent ces tailocines, qui sortent pour attaquer d'autres bactéries concurrentes dans leur communauté. Ça donne un avantage aux bactéries qui produisent les tailocines. Les tailocines viennent en deux variétés : R-type et F-type.
Les Tailocines R-type
Les tailocines R-type ont une conception qui ressemble à un type spécifique de bactériophage appelé T-even phage. Elles ont une partie tubulaire à l'intérieur entourée d'une gaine. Pour tuer une bactérie cible, elles s'accrochent à elle, provoquent quelques réarrangements dans leur structure, puis percent la bactérie comme une aiguille. Ça provoque une fuite pas glop d'ions qui mène à la mort de la bactérie.
Les Tailocines F-type
Les tailocines F-type sont un peu différentes. Elles ressemblent à un autre bactériophage appelé lambda et ont leur propre moyen de tuer les bactéries, mais les scientifiques ne sont pas complètement sûrs de comment ça marche encore. Certaines bactéries, comme Pseudomonas aeruginosa, peuvent fabriquer les deux types de tailocines, ce qui est assez impressionnant!
Comment Fonctionnent Les Tailocines ?
Les tailocines identifient leur cible grâce à des protéines spéciales appelées protéines de liaison aux récepteurs (RBP). Pense à ces RBP comme au GPS des tailocines, les guidant vers leurs cibles bactériennes. Chaque tailocine a son RBP unique qui s'adapte à des récepteurs spécifiques trouvés sur la surface de certaines bactéries. Le top ? Ces RBP sont comme des clés personnalisables – on peut les modifier pour les adapter à différentes portes!
Pour les rendre mieux adaptés à des bactéries spécifiques, les scientifiques travaillent à remodeler ces RBP. En mélangeant et en assortissant différentes parties, ils espèrent créer toute une gamme de tailocines capables de cibler efficacement diverses souches bactériennes.
Le Besoin de Variété
Utiliser des tailocines qui ciblent des bactéries spécifiques devient plus intéressant parce qu'elles épargnent nos bonnes bactéries, aidant à maintenir notre microbiome équilibré. L'intérêt grandissant pour développer une bibliothèque de ces tailocines sur mesure est là, mais le défi, c'est que pour l'instant, les tailocines ne se trouvent que dans quelques espèces de bactéries.
Ingénierie de Nouvelles RBP
Grâce aux avancées en technologie d'ingénierie, il est maintenant possible d'ajuster la gamme d'hôtes des tailocines. En échangeant des parties des RBP d'origines différentes, les scientifiques peuvent créer de nouvelles combinaisons qui pourraient cibler une plus large gamme de bactéries. Le modèle le mieux étudié pour ça, c'est la tailocine R2 de Pseudomonas aeruginosa.
La Technique VersaTile
C'est là que la technique VersaTile entre en jeu, agissant comme un ensemble de blocs LEGO pour construire ces RBP. Elle permet aux scientifiques de créer rapidement une collection de différentes RBP et de les assembler en une seule étape. La flexibilité de cette méthode signifie qu'il est plus facile de créer beaucoup de nouvelles tailocines rapidement.
Prouver le Concept
Comme test, les chercheurs ont réussi à prendre des RBP conçues pour cibler l'O-antigène (un composant trouvé à la surface de certaines bactéries) et les greffer sur le modèle de tailocine R2. Ils ont constaté que ces tailocines ingénieries pouvaient attaquer efficacement les bactéries avec des O-antigènes spécifiques, et même celles qui étaient auparavant intactes.
La Chaîne de Production
Le processus consiste à créer une bibliothèque de tuiles composées de différents composants, à les assembler au besoin, et ensuite à produire les tailocines sur mesure dans des bactéries spécialement conçues pour ça. Les résultats de ces tests sont prometteurs, indiquant que la capacité des tailocines à cibler des bactéries désirées est possible.
Tester l'Efficacité
En laboratoire, les scientifiques ont testé l'efficacité des tailocines originales et ingénieries. Ils ont fait ça par divers méthodes, y compris des essais de survie pour voir combien de bactéries étaient tuées à différentes concentrations de tailocine.
Résultats
Ils ont découvert que la tailocine R2 native était très efficace, capable de tuer à faibles concentrations, tandis que les versions ingénieries étaient parfois moins puissantes mais montraient toujours du potentiel. Ça suggère que même si modifier ces protéines peut mener à des résultats intéressants, obtenir l'ingénierie juste est crucial pour maintenir ou améliorer leur efficacité.
L'Avenir des Tailocines
La recherche continue de pousser les limites de ce qu'on peut faire avec ces tailocines. L'objectif n'est pas juste de créer plus de tailocines, mais de faire celles qui peuvent cibler efficacement une large variété de bactéries nuisibles. Avec des améliorations et des études continues, ces options de tailocines sur mesure pourraient devenir une alternative viable aux antibiotiques traditionnels.
Au-delà des Bactéries
Fait intéressant, les tailocines et les RBP n'ont pas que des propriétés antibactériennes. Elles peuvent aider dans les diagnostics pour identifier des souches bactériennes, offrant une alternative astucieuse à l'utilisation d'antibiotiques dans certaines situations. Leur précision pourrait même les rendre meilleurs candidats pour certaines applications médicales que les bactériophages traditionnels.
Tailocines vs Phages
C'est important de noter les différences entre les tailocines et les phages. Alors que les phages se reproduisent et peuvent s'adapter avec le temps, les tailocines restent constantes. Ça veut dire qu'elles pourraient être une option plus stable pour concevoir des traitements.
En Résumé
Pour résumer, le développement des tailocines et l'ingénierie des RBP est un domaine excitant. Bien que les scientifiques travaillent encore à perfectionner ces outils en laboratoire, le potentiel de lutter contre les infections bactériennes sans perturber notre microbiome sain est une lueur d'espoir dans un tunnel très sombre. Si on a appris quelque chose de ce parcours, c'est que la résistance bactérienne est là pour rester, mais il y a aussi des esprits créatifs prêts à y faire face. Avec les tailocines en tête, il y a de l'espoir pour un avenir avec des patients plus sains et moins d'infections!
Titre: A VersaTile approach to reprogram the specificity of the R2-type tailocin towards different serotypes of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae
Résumé: Phage tail-like bacteriocins, or tailocins, provide a competitive advantage to producer cells by killing closely related bacteria. Morphologically similar to headless phages, their narrow target specificity is determined by receptor-binding proteins (RBPs). While RBP engineering has been used to alter the host range of a selected R2 tailocin from Pseudomonas aeruginosa, the process is labor-intensive, limiting broader application. We introduce a VersaTile-driven R2 tailocin engineering platform to scale up RBP grafting. This platform achieved three key milestones: (1) engineering R2 tailocins specific to Escherichia coli serogroups O26, O103, O104, O111, O145, O146 and O157; (2) reprogramming R2 tailocins to target for the first time capsule and a new species, specifically the capsular serotype K1 of E. coli and K11 and K63 of Klebsiella pneumoniae; (3) creating the first bivalent tailocin with a branched RBP and cross-species activity, effective against both E. coli K1 and K. pneumoniae K11. Over 90% of engineered tailocins were effective, with clear pathways for further optimization identified. ImportanceWhile tailocin engineering is a proven and promising concept, the current engineering approach lacks scalability, limiting a vast exploration. This study advances tailocin engineering by increasing its throughput. Implementing a scaled up approach, we have shown the flexibility of the R2 tailocin scaffold to accommodate diverse receptor-binding domains, expanding its functionality to target a new type of receptor (capsule) and a previously untargeted species. In addition, functional tailocins with branched receptor-binding proteins portraying dual, cross-genus activity were produced. This work lays the groundwork for a scalable platform for the development of engineered tailocins, marking an important step towards making R2 tailocins a practical therapeutic tool for targeted bacterial infections.
Auteurs: Dorien Dams, Célia Pas, Agnieszka Latka, Zuzanna Drulis-Kawa, Lars Fieseler, Yves Briers
Dernière mise à jour: 2024-10-31 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.29.620980
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.29.620980.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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