Les Complexités du Développement Précoce des Mammifères
Un aperçu de comment les cellules se développent chez les mammifères, d'une seule cellule à des structures complexes.
Ruben Sebastian-Perez, Shoma Nakagawa, Xiaochuan Tu, Sergi Aranda, Martina Pesaresi, Pablo Aurelio Gomez-Garcia, Marc Alcoverro-Bertran, Jose Luis Gomez-Vazquez, Davide Carnevali, Eva Borràs, Eduard Sabidó, Laura Martin, Malka Nissim-Rafinia, Eran Meshorer, Maria Victoria Neguembor, Luciano Di Croce, Maria Pia Cosma
― 9 min lire
Table des matières
- Les éléments de base : cellules et Chromatine
- Que se passe-t-il pendant les premières étapes du développement ?
- Utiliser des Cellules souches pour en savoir plus
- Changements de chromatine dans les cellules de type 2C
- À la recherche de protéines clés
- Enquête plus approfondie
- Le pouvoir de la protéomique de la chromatine
- Le rôle de SMARCAD1 et TOPBP1
- Problèmes dans le développement des embryons
- L'importance de la formation d'hétérochromatine
- Conclusion : Une histoire palpitante de cellules
- Source originale
- Liens de référence
Quand un mammifère commence à grandir à partir d'une seule cellule, quelque chose d'incroyable se passe. Cette petite cellule se divise et se transforme en différents types de cellules. Ces cellules finissent par devenir toutes les parties du corps. Ce processus entier s'appelle le développement précoce des mammifères. C'est un peu comme prendre un petit bloc Lego et construire lentement une maison – mais une maison qui peut bouger, respirer et manger !
Chromatine
Les éléments de base : cellules etAu début, tu n'as qu'une seule cellule, qui est comme une page blanche. Cette cellule s'appelle un zygote. Au fur et à mesure qu'elle se divise, des cellules appelées blastomères se forment. Ces blastomères doivent savoir qui ils vont devenir. C'est un peu comme des enfants à l'école qui essaient de trouver ce qu'ils veulent faire plus tard, mais en beaucoup plus rapide.
Pour aider chaque cellule à comprendre son rôle, certains gènes s'activent pendant que d'autres se désactivent. C'est là que la chromatine entre en jeu. Pense à la chromatine comme un système d'organisation pour de petits livres dans une bibliothèque. Ça aide à garder tout en ordre pour que tout soit facile à trouver quand on en a besoin.
Un type particulier d'organisation s'appelle l'hétérochromatine. C'est comme la partie de la bibliothèque où les livres rarement lus sont rangés – à l'écart mais super importants !
Que se passe-t-il pendant les premières étapes du développement ?
Pendant les toutes premières étapes, les cellules commencent à réorganiser leur chromatine. C'est comme déplacer des meubles dans une pièce pour faire de la place pour de nouvelles choses. Ces réarrangements dans le noyau (le "centre de contrôle" de la cellule) aident à former des structures appelées chromocentres, qui sont des zones d'ADN étroitement empaquetées.
Le truc délicat, c'est de comprendre ce qui fait que tout ce réarrangement se produise. Les scientifiques veulent savoir quels facteurs sont impliqués dans cette nouvelle organisation, mais comme il y a si peu de matériel disponible quand on étudie les Embryons, c'est pas facile !
Cellules souches pour en savoir plus
Utiliser desLes scientifiques ont trouvé un moyen astucieux d'étudier ces processus. Ils utilisent des cellules souches embryonnaires (CSE) parce qu'elles sont comme le couteau suisse des cellules – elles peuvent se transformer en plusieurs types de cellules. Dans certaines conditions, les CSE peuvent imiter les toutes premières étapes du développement des embryons.
Même si les cellules souches peuvent parfois agir comme des embryons précoces, ça n'arrive pas tout le temps. C'est comme si elles étaient timides et ne montraient leur vraie nature que lors d'occasions spéciales. Récemment, des chercheurs ont découvert comment leur donner un petit coup de pouce pour les faire imiter les embryons précoces plus efficacement.
Il y a un facteur de transcription nommé Dux qui joue un rôle dans ce processus. Pense à Dux comme à un cheerleader, encourageant les cellules à adopter une nouvelle identité. Quand les scientifiques surexpriment Dux, les CSE peuvent se transformer en ce qu'on appelle des cellules de type 2C.
Changements de chromatine dans les cellules de type 2C
Une fois qu'on a ces cellules de type 2C, on peut commencer à étudier comment la chromatine change. Dans ces cellules, l'hétérochromatine devient plus détendue, ce qui est un signe que les choses changent. Ça suggère que les cellules se préparent à se transformer.
Dans notre analogie de la bibliothèque, c'est comme prendre des livres anciens recouverts de poussière et les nettoyer pour qu'ils puissent être lus. Les scientifiques ont également noté que certaines Protéines, comme TOPBP1 et SMARCAD1, sont associées à H3K9me3, une marque d'hétérochromatine. Ces protéines aident à maintenir l'organisation de la chromatine et sont impliquées durant la transition des cellules de type 2C.
À la recherche de protéines clés
Pour comprendre ce que font exactement ces protéines, les chercheurs se sont lancés dans une mission. Ils ont cherché à savoir comment Dux affecte la structure de la chromatine en utilisant des techniques avancées pour étudier les protéines qui y sont associées. En analysant les changements dans le profil protéique durant les transformations cellulaires, ils ont identifié quelques acteurs importants.
Ils ont découvert que les foyers H3K9me3 dans les cellules de type 2C ont changé de taille et de nombre durant la transition. Les foyers sont devenus plus grands mais moins nombreux, suggérant que certains d'entre eux se sont regroupés, un peu comme quand des amis se serrent les coudes par un jour frais.
Enquête plus approfondie
Pour aller plus loin, les chercheurs ont créé différentes lignées de CSE qui leur ont permis de tester le rôle de protéines spécifiques en ajustant leurs niveaux. En réduisant ou en surexprimant certaines protéines, ils pouvaient influencer le comportement des cellules.
Tout au long de leurs expériences, ils ont observé de près comment les cellules de type 2C revenaient à un état semblable à celui des CSE. Ce qui est fascinant, c'est qu'après que ces cellules aient quitté l'état 2C, elles sont rapidement revenues à un état semblable à celui des CSE. C'est comme une fête qui se termine et où tout le monde rentre chez soi en hâte !
Le pouvoir de la protéomique de la chromatine
En utilisant une méthode appelée protéomique de la chromatine, les scientifiques ont pu dresser un profil des changements de protéines liées à la chromatine pendant toutes ces transitions. Cette technique les a aidés à découvrir de nombreuses protéines importantes qui étaient impliquées dans la réorganisation de la chromatine.
Les scientifiques ont trouvé 2396 protéines associées à la chromatine, les aidant à comprendre quelles protéines étaient cruciales durant le développement des cellules précoces. Ils ont réalisé qu'il y avait certaines protéines connues pour être impliquées dans l'état précoce de type 2C, tandis que d'autres étaient moins communes.
Certaines des protéines découvertes incluent celles impliquées dans le maintien des cellules pluripotentes, ce qui signifie qu'elles peuvent devenir n'importe quel type de cellule à l'avenir. Après avoir analysé ces données, les chercheurs ont commencé à comprendre l'interaction complexe des protéines qui guident le développement de ces cellules.
Le rôle de SMARCAD1 et TOPBP1
Alors, zoomons sur deux protéines en particulier : SMARCAD1 et TOPBP1. Ces deux personnages semblent jouer des rôles importants dans le maintien des foyers d'hétérochromatine durant le développement précoce. Quand les chercheurs ont regardé de plus près, ils ont découvert que SMARCAD1 co-localisait généralement avec les foyers H3K9me3 dans les CSE.
Cependant, alors que les cellules passaient à l'état de type 2C, les niveaux de SMARCAD1 diminuaient. Ça a soulevé quelques sourcils ! Est-ce que ça voulait dire qu’il n’était pas nécessaire ? Ou pouvait-il simplement faire une petite pause pendant que les cellules changeaient ?
Pour obtenir des réponses, les chercheurs ont éliminé les protéines SMARCAD1 et TOPBP1. Ils ont remarqué que cela pouvait entraîner des problèmes de développement chez les embryons de souris. Les embryons qui manquaient de l'une de ces protéines avaient du mal à grandir normalement.
Problèmes dans le développement des embryons
Quand on a introduit des oligonucléotides antisens morpholino (une façon sophistiquée de dire qu'on a dit aux cellules d'ignorer ces protéines), les embryons ont montré de clairs signes de problèmes de développement. Ces embryons avec des niveaux réduits de SMARCAD1 ne se développaient pas correctement. Ils sont restés bloqués avant d'atteindre le stade de blastocyste, un peu comme un enfant qui reste coincé sur un niveau particulièrement difficile d'un jeu vidéo.
En revanche, les embryons avec des niveaux réduits de TOPBP1 avaient des issues encore plus graves. Ils ne se développaient même pas au-delà du stade à quatre cellules ! C'était comme appuyer sur le bouton pause d'un film – pas de progrès du tout.
L'importance de la formation d'hétérochromatine
Un des principaux enseignements de toute cette recherche est le rôle vital de l'hétérochromatine durant le développement précoce des mammifères. Les chercheurs ont montré que la formation de l'hétérochromatine est essentielle pour la transition réussie des cellules de l'état 2C vers des cellules pluripotentes.
En comprenant comment les protéines comme SMARCAD1 et TOPBP1 travaillent ensemble, les scientifiques ont acquis des éclaircissements précieux sur les processus qui guident le développement précoce des mammifères. Cette connaissance pourrait ouvrir la voie à de nouveaux traitements médicaux ou technologies à l'avenir.
Conclusion : Une histoire palpitante de cellules
En résumé, l'aventure du développement précoce des mammifères est comme un roman captivant rempli de rebondissements, de virages et de drame. Alors que les cellules passent par différents états, elles subissent des changements remarquables. Les rôles joués par des protéines très spécifiques, comme SMARCAD1 et TOPBP1, sont comme des héros méconnus travaillant dans l'ombre pour s'assurer que tout se passe bien.
Tout cela montre une compréhension plus profonde de comment la vie commence et grandit à partir d'une seule cellule humble. Le voyage d'un zygote à un organisme complètement formé est une histoire de coopération, de transformation et du mystère de la vie ! Et tout comme dans toute bonne histoire, il y a encore beaucoup à découvrir.
Donc, la prochaine fois que tu penses à la complexité de la vie, souviens-toi que tout a commencé avec une toute petite cellule – et beaucoup de travail d'équipe !
Titre: SMARCAD1 and TOPBP1 contribute to heterochromatin maintenance at the transition from the 2C-like to the pluripotent state
Résumé: Chromocenters are established after the 2-cell (2C) stage during mouse embryonic development, but the factors that mediate chromocenter formation remain largely unknown. To identify regulators of 2C heterochromatin establishment, we generated an inducible system to convert embryonic stem cells (ESCs) to 2C-like cells. This conversion is marked by a global reorganization and dispersion of H3K9me3-heterochromatin foci, which are then reversibly formed upon re-entry into pluripotency. By profiling the chromatin-bound proteome (chromatome) through genome capture of ESCs transitioning to 2C-like cells, we uncover chromatin regulators involved in de novo heterochromatin formation. We identified TOPBP1 and investigated its binding partner SMARCAD1. SMARCAD1 and TOPBP1 associate with H3K9me3-heterochromatin in ESCs. Interestingly, the nuclear localization of SMARCAD1 is lost in 2C-like cells. SMARCAD1 or TOPBP1 depletion in mouse embryos leads to developmental arrest, reduction of H3K9me3, and remodeling of heterochromatin foci. Collectively, our findings contribute to comprehending the maintenance of chromocenters during early development.
Auteurs: Ruben Sebastian-Perez, Shoma Nakagawa, Xiaochuan Tu, Sergi Aranda, Martina Pesaresi, Pablo Aurelio Gomez-Garcia, Marc Alcoverro-Bertran, Jose Luis Gomez-Vazquez, Davide Carnevali, Eva Borràs, Eduard Sabidó, Laura Martin, Malka Nissim-Rafinia, Eran Meshorer, Maria Victoria Neguembor, Luciano Di Croce, Maria Pia Cosma
Dernière mise à jour: 2024-11-28 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.15.537018
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.15.537018.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.