Le processus de vieillissement et l'endocytose médiée par la clathrine chez la levure
Apprends comment le vieillissement affecte la livraison des nutriments dans les cellules de levure et le rôle des vacuoles.
Kenneth Gabriel Antenor, Jaime Lee-Dadswell, Nina Grishchenko, Shaimaa Swaleh, Allie Spangaro, Mojca Mattiazzi Usaj
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Table des matières
L'Endocytose médiée par la clathrine (CME), c'est un peu comme un service de livraison cellulaire. Ça aide les cellules à吸入 des nutriments, des protéines et d'autres éléments essentiels de l'extérieur. Imagine ça comme un petit aspirateur qui ramasse des matériaux importants du monde extérieur, aidant les cellules à garder tout en équilibre et à bien fonctionner.
La CME est super importante pour toutes sortes de fonctions corporelles. Par exemple, ça joue un rôle dans comment les cellules immunitaires présentent des antigènes, comment les cellules nerveuses fonctionnent, et même comment le cancer se propage.
Pourquoi étudier la levure ?
Les chercheurs utilisent souvent un organisme simple appelé levure bourgeonnante (ouais, le truc qui fait lever ton pain !) pour comprendre des processus complexes comme la CME. Les cellules de levure, c'est un peu comme les cobayes du monde scientifique : elles sont faciles à cultiver, et les scientifiques ont compris pas mal de choses sur leur fonctionnement. En étudiant la levure, les chercheurs peuvent découvrir de nouvelles infos sur la CME qui pourraient aussi s'appliquer à des cellules plus complexes chez les animaux et les humains.
Comment fonctionne la CME ?
Dans la levure bourgeonnante, la CME est super bien organisée, avec une série d'étapes qui se passent dans un ordre précis. D'abord, certaines protéines se rassemblent à des endroits précis sur la couche externe de la cellule, connue sous le nom de membrane plasmique. Ces spots sont comme des points de ramassage désignés pour le service de livraison de la cellule.
- Phase de recrutement : Le premier lot de protéines, qu'on appelle le "module précoce", arrive et prépare le site pour l'opération.
- Phase de revêtement : Ensuite, des protéines de revêtement apparaissent pour aider à rassembler la cargaison et à l'attirer.
- Assemblage d'actine : Puis, l'actine, une sorte de protéine qui aide au mouvement, entre en jeu pour créer un mécanisme de traction.
- Assemblage final : Enfin, la vésicule, qui est un peu comme une petite bulle, se forme, contenant toutes les bonnes choses collectées par la cellule.
Pendant que ça se passe, la cellule doit être assez précise sur les objets qu'elle collecte. Si certaines cargaisons ne sont pas présentes, le processus de CME peut être retardé, comme un livreur qui attend que les clients finalisent leurs commandes.
Vieillissement et ses effets sur la CME
Et là, ça devient intéressant. Tout comme nous, les cellules de levure vieillissent. En vieillissant, elles tendent à ralentir. Ce vieillissement influence le processus de CME, rendant la cellule moins efficace pour ramasser les nutriments et matériaux nécessaires.
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Fonctionnement plus lent : Les cellules de levure plus âgées mettent plus de temps à former des vésicules par rapport aux plus jeunes. C'est un peu comme une personne âgée qui essaie de faire les mêmes tâches qu'elle faisait quand elle était plus jeune : tout prend juste un peu plus de temps !
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Fonction altérée : En plus d'être plus lentes, les cellules plus âgées ont aussi du mal à recruter les protéines nécessaires. Imagine l'équipe de livraison qui arrive en retard et n'a pas le bon équipement. C'est comme ça que ces cellules de levure vieillissantes fonctionnent.
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Moins de cargaison : La quantité de cargaison que les cellules plus âgées arrivent à tirer est aussi réduite. C'est comme avoir une cuisine qui n'a pas assez d'ingrédients pour faire tous les délicieux plats que tu veux !
Vacuoles
Le rôle desDans la levure, les vacuoles servent de compartiments de stockage qui, surprise, surprise, aident à maintenir l'équilibre dans la cellule. Elles gardent les choses organisées et empêchent toute accumulation indésirable de matériaux.
Avec le vieillissement de la levure, ses vacuoles tendent à perdre leur acidité, ce qui est important pour leur fonction. Si les vacuoles ne fonctionnent pas correctement, tout le système peut partir en vrille. Cette perte d'acidité a été liée à divers problèmes, y compris le vieillissement des cellules.
V-ATPase
La connexionUn acteur clé dans le maintien de l'acidité des vacuoles est une protéine appelée V-ATPase. Tu peux penser à V-ATPase comme une pompe qui garde les vacuoles acides, les aidant à fonctionner efficacement. Malheureusement, en vieillissant, les cellules de levure, la V-ATPase peut ne plus fonctionner aussi bien, ce qui entraîne une réduction de l'acidité à l'intérieur des vacuoles.
Quand la V-ATPase ne fait pas son boulot, les effets sur la CME peuvent être significatifs. Pense-y : si ton service de livraison ne peut pas accéder aux bons outils, comment peuvent-ils livrer ? C'est là que les changements de pH vacuolaire entrent en jeu.
L'impact de la restriction calorique
Fait intéressant, il y a quelques bonnes nouvelles ! Les chercheurs ont trouvé que réduire l'apport alimentaire, un processus appelé restriction calorique, peut aider à restaurer certaines fonctions perdues avec le vieillissement. Ça veut dire que les cellules de levure plus âgées peuvent améliorer leur dynamique de CME pour revenir à un état plus jeune. C'est un peu comme donner à ton ami âgé un bon régime pour le garder en forme !
Quand les levures ont eu moins de sucre (mais pas trop peu !), leurs vacuoles ont retrouvé leur acidité et ont commencé à mieux fonctionner. Ça a non seulement aidé les cellules à collecter les nutriments plus efficacement, mais aussi à les garder en meilleure santé plus longtemps.
TORC1 et NPR1
Le rôle deMaintenant, ajoutons quelques autres acteurs dans le mix : TORC1 et Npr1. Ces protéines aident à gérer la façon dont les cellules réagissent aux nutriments et contrôlent divers aspects du comportement cellulaire, y compris la régulation de la CME.
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TORC1 : C'est comme le manager du service de livraison de protéines. Il aide à s'assurer que les bonnes décisions sont prises concernant l'activité des protéines en réponse aux niveaux de nutriments.
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Npr1 : Ce petit gars inhibe l'action des alpha-arrestins, qui sont des protéines nécessaires pour étiqueter la cargaison pour la livraison. Quand TORC1 ne fonctionne pas bien (comme quand les vacuoles perdent leur acidité), Npr1 peut devenir moins efficace, ce qui entraîne une baisse de l'efficacité de la livraison de cargaison.
Sans le bon fonctionnement de ces protéines, les cellules de levure plus âgées ont du mal à internaliser les nutriments efficacement.
Conclusion
À mesure que les cellules de levure vieillissent, elles deviennent lentes et leur service de livraison interne pour les nutriments décline. La perte d'acidité dans les vacuoles, les inefficacités dans le recrutement des protéines et l'activité réduite des protéines cruciales TORC1 et Npr1 contribuent tous à ces effets de vieillissement.
Mais comme dans un bon rebondissement, la restriction calorique peut aider à rajeunir ces processus, veillant à ce que nos amis les levures puissent toujours bien fonctionner jusqu'à leur vieux âge. Alors, la prochaine fois que tu dégusteras une tranche de pain, souviens-toi : il se passe plus de choses dans ces cellules de levure que tu ne le penses !
Elles vieillissent, ralentissent, mais avec un peu de soin, elles peuvent toujours livrer les marchandises.
Titre: Vacuolar pH regulates clathrin-mediated endocytosis through TORC1 signaling during yeast replicative aging
Résumé: Clathrin-mediated endocytosis (CME) is a critical cellular process that regulates nutrient uptake, membrane composition and signalling. While cellular aging is associated with functional changes across many cellular components contributing to the collective decline in cellular function, little is known about how it affects CME. Here we show that CME dynamics are significantly altered during replicative aging in budding yeast, with older cells having slower assembly of early and coat CME modules, resulting in longer endocytic turnover and reduced cargo internalization. This change in CME dynamics is mother cell-specific and is not observed in daughter cells. We identified vacuolar pH, a key driver of aging phenotypes in budding yeast, as a central player in this modulation of CME dynamics during aging. Perturbing vacuolar pH in young cells mimics aging-like CME dynamics, while maintaining an acidic vacuolar pH in aging cells preserves CME dynamics typical of young cells. Finally, we demonstrate that the vacuolar pH effect on CME is regulated through TORC1 via the effector kinase Npr1. These findings establish vacuolar pH as a critical regulator of CME during cellular aging, and strengthen its role in the overall cellular aging process in budding yeast.
Auteurs: Kenneth Gabriel Antenor, Jaime Lee-Dadswell, Nina Grishchenko, Shaimaa Swaleh, Allie Spangaro, Mojca Mattiazzi Usaj
Dernière mise à jour: 2024-11-29 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.28.625547
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.28.625547.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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