L'héritage génétique de l'élevage des chiens
Explore comment la génétique influence les traits et la santé des chiens à travers la consanguinité.
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Table des matières
- Qu'est-ce que la Consanguinité ?
- La Science derrière les Séquences d'Homozygotie (ROH)
- Qu'est-ce que les Traits ?
- Recherche sur le Génome Canin
- La Répartition par Race
- L'Importance du Filtrage des Données
- Analyse des Nombres sur ROH
- Ce que les Chercheurs Ont Trouvé
- Le Facteur de Consanguinité
- Lien entre Génétique et Traits
- La Connexion Génétique aux Traits
- Pratiques de Reproduction Saines
- Traits Non Liés aux Maladies : Un Domaine Sous-étudié
- Conclusion : L'Héritage de la Domestication
- Source originale
Les chiens sont nos compagnons depuis environ 15 000 ans. Ils viennent à l'origine des loups, mais grâce aux humains et à la reproduction sélective, ils ont pris différentes formes, tailles et couleurs. Au fil des ans, cette reproduction soignée a donné lieu à de nombreuses races de chiens que l'on connaît aujourd'hui, mais cela a aussi causé quelques soucis avec leur patrimoine génétique.
Consanguinité ?
Qu'est-ce que laLa consanguinité se produit quand des animaux proches sont élevés ensemble. Ça peut entraîner un manque de variété génétique, ce qui n'est pas top pour la santé. La plupart des races de chiens d'aujourd'hui ont été établies avec un petit nombre d'animaux de départ, ce qui a conduit à beaucoup de consanguinité. Quand les chiens ont trop de l'ADN identique, ça crée de longues séquences génétiques similaires dans leur corps.
La Science derrière les Séquences d'Homozygotie (ROH)
Une façon pour les scientifiques d'étudier la consanguinité est à travers ce qu'on appelle les séquences d'homozygotie, ou ROH pour faire court. ROH se réfère à de longs segments dans l'ADN d'un chien qui sont identiques à cause de la consanguinité. Chez les humains, ces zones ROH peuvent être liées à divers problèmes de santé. Étonnamment, chez les chiens, les scientifiques ont trouvé des motifs similaires liant les ROH à des Traits et maladies spécifiques.
Qu'est-ce que les Traits ?
Quand on parle de traits, on se réfère à des caractéristiques comme la taille, le poids, et même les motifs de fourrure. Les scientifiques cherchent à comprendre comment ces traits sont influencés par la génétique. Par exemple, des chercheurs ont trouvé des liens entre certaines variations génétiques et des traits comme la longueur des pattes ou la couleur du pelage d'un chien.
Fait intéressant, même s'il y a eu beaucoup de recherches sur les traits génétiques liés aux maladies chez les chiens, les traits non liés aux maladies-comme leur niveau de fluffiness ou leur longévité-n'ont pas été autant étudiés.
Recherche sur le Génome Canin
Pour avancer là-dessus, les chercheurs ont rassemblé une énorme quantité d'informations génétiques provenant de diverses races de chiens. Ils ont examiné l'ADN pour voir comment les ROH sont liés à des traits non liés aux maladies chez les chiens. Au total, 556 Génomes de chiens de différentes races ont été analysés, en se concentrant sur 13 traits spécifiques. Ces traits comprenaient le poids, la taille et la durée de vie, ainsi que quelques caractéristiques attrayantes comme une poitrine ou une tête blanche.
La Répartition par Race
Les chercheurs ont groupé les chiens en races selon leur apparence et leurs liens génétiques. Ce regroupement leur a permis de voir comment différentes races variaient dans leur patrimoine génétique. Ils ont examiné 13 groupes de races distincts, allant des Terriers aux Retrievers, et même des races anciennes comme le Spitz Ancien.
L'Importance du Filtrage des Données
Avant de plonger dans l'analyse des traits, les chercheurs ont filtré les données pour se concentrer uniquement sur des marqueurs génétiques fiables. Ils se sont assurés d'utiliser des données génétiques de haute qualité, excluant celles qui n'étaient pas claires, comme les données provenant de races mélangées ou de chiens sans informations de race appropriées. Cette étape était essentielle pour s'assurer que leurs résultats étaient aussi précis que possible.
Analyse des Nombres sur ROH
Pour mesurer les ROH, les scientifiques ont utilisé une méthode qui emploie des scores de probabilité. Ce processus un peu compliqué était nécessaire pour déterminer les longueurs de ces séquences dans l'ADN du chien. Ils ont classé les longueurs de ROH en plusieurs catégories selon la taille, afin d'aider à identifier comment la consanguinité affecte différentes races.
Ce que les Chercheurs Ont Trouvé
Après avoir examiné les données ROH, les chercheurs ont découvert des motifs intéressants. Certaines races avaient des comptages de ROH plus élevés, indiquant des niveaux plus élevés de consanguinité. Par exemple, on a trouvé que les Terriers avaient moins de ROH par rapport aux grandes races comme les Mastiffs. Ce constat était attendu puisque les races plus petites sont généralement moins susceptibles d'être consanguines en raison de leurs divers arrière-plans génétiques.
Le Facteur de Consanguinité
Les chercheurs ont calculé un coefficient de consanguinité connu sous le nom de FROH, qui mesure le pourcentage de l'ADN d'un chien provenant de ces régions identiques. Ils ont découvert que les chiens de race pure, élevés pour des traits spécifiques, avaient des niveaux de consanguinité plus élevés que les chiens mélangés ou de village. Ce résultat suggère un patrimoine génétique plus partagé parmi les chiens de race pure comparés à leurs homologues de village ou indigènes.
Lien entre Génétique et Traits
Une fois qu'ils ont établi comment la consanguinité influençait le patrimoine génétique des chiens, les chercheurs ont exploré comment ces facteurs génétiques se rapportaient à certains traits. Ils ont découvert qu'à mesure que le niveau de consanguinité (FROH) augmentait, certains traits comme la taille et le poids augmentaient aussi. Cependant, une surprise a été trouvée concernant la durée de vie-plus de consanguinité était liée à des durées de vie plus courtes.
La Connexion Génétique aux Traits
Les découvertes ne se sont pas arrêtées là. Certains gènes spécifiques étaient associés à la taille et au poids, ce qui a des implications significatives. Par exemple, certains gènes qui affectent la croissance corporelle et la prise de poids ont été identifiés, réfléchissant un schéma similaire vu chez les humains.
Pratiques de Reproduction Saines
Avec ces éclairages, il y a de l'espoir que les éleveurs vont en tenir compte et utiliser ces informations à l'avenir. Savoir comment la génétique influence les traits peut aider les éleveurs à faire de meilleurs choix pour promouvoir des chiens plus sains. Cette recherche ouvre la voie à de futures études qui pourraient conduire à des améliorations dans l'élevage de chiens et leur santé.
Traits Non Liés aux Maladies : Un Domaine Sous-étudié
La plupart des recherches existantes se sont concentrées sur les effets de la génétique sur la santé, tandis que les traits non liés aux maladies ont été négligés. Cette étude vise à mettre en lumière ces traits quotidiens et comment la consanguinité peut les influencer. C'est essentiel car cela peut guider les pratiques d'élevage, garantissant que les chiens restent non seulement attrayants mais aussi en bonne santé.
Conclusion : L'Héritage de la Domestication
En résumé, l'étude des ROH chez les chiens révèle beaucoup sur leur relation complexe avec les humains. Grâce à une reproduction soignée, nous avons façonné les chiens en les diverses races que nous connaissons et aimons. Cependant, cela a aussi apporté des défis, notamment en ce qui concerne la diversité génétique.
Alors qu'on en apprend plus sur la façon dont la génétique influence à la fois la santé et les traits chez les chiens, on peut contribuer à préserver les races que nous chérissons. Comprendre ces facteurs génétiques nous permet d'apprécier l'effort mis dans l'élevage et l'importance de maintenir la diversité chez nos amis canins.
En gardant ces éclairages à l'esprit, les amoureux des chiens et les éleveurs peuvent travailler ensemble pour assurer un avenir radieux et sain à nos précieux animaux de compagnie. Après tout, ils méritent une vie pleine de queues qui remuent et de gratouilles au ventre !
Titre: Genotypic and phenotypic consequences of domestication in dogs
Résumé: Runs of homozygosity (ROH) are genomic regions that arise when two copies of identical haplotypes are inherited from a shared common ancestor. In this study, we leverage ROH to identify associations between genetic diversity and non-disease phenotypes in Canis lupus familiaris (dogs). We find significant association between the ROH inbreeding coefficient (FROH) and several phenotypic traits. These traits include height, weight, lifespan, muscled, white coloring of the head and chest, furnishings, and fur length. After correcting for population structure, we identified more than 45 genes across the examined quantitative traits that exceed the threshold for suggestive significance. We observe distinct distributions of inbreeding and elevated levels of long ROH in modern breed dogs compared to more ancient breeds, which aligns with breeding practices during Victorian era breed establishment. Our results highlight the impact of non-additive variation and of polygenicity on complex quantitative phenotypes in dogs due to domestication and the breed formation bottleneck.
Auteurs: Sweetalana, Jazlyn A Mooney, Zachary A Szpiech
Dernière mise à jour: 2024-12-02 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.01.592072
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.01.592072.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.