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# Biologie# Biochimie

Nouvelles idées sur les protéines PFKFB et la régulation de l'énergie

La recherche met en avant le rôle des protéines PFKFB dans la gestion de l'énergie et le traitement du cancer.

Craig Eyster, Satoshi Matsuzaki, Atul Pranay, Jennifer R. Giorgione, Anna Faakye, Mostafa Ahmed, Kenneth M. Humphries

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Table des matières

Les protéines PFKFB sont des enzymes spéciales qui jouent un rôle clé dans la gestion de l'énergie dans notre corps, notamment à travers un processus appelé Glycolyse. La glycolyse, c'est comment nos cellules transforment le sucre en énergie. Les protéines PFKFB aident à contrôler la quantité d'une certaine molécule, le fructose-2,6-bisphosphate (F-2,6-BP), disponible dans les cellules. Cette molécule est importante car elle active une autre enzyme appelée phosphofructokinase-1 (PFK-1), qui est une étape cruciale dans la glycolyse. Donc, que PFKFB aide à créer ou à décomposer le F-2,6-BP peut directement influencer la quantité d'énergie produite par nos cellules.

Différents Types d'Isoformes de PFKFB

Il y a quatre types principaux, ou isoformes, de protéines PFKFB. Chacune a un rôle unique dans différents tissus :

  1. PFKFB2 : Cette isoforme se trouve principalement dans le cœur. Elle aide à gérer l'énergie dans les cellules cardiaques, et son activité peut être influencée par diverses protéines qui envoient des signaux en fonction des besoins du corps, surtout en période de stress énergétique ou de famine.

  2. PFKFB1 : Cette forme se trouve dans le muscle squelettique et le foie. Elle ajuste l'utilisation de l'énergie par notre corps selon ce qu'il lui faut à ce moment-là. Donc, que l'on ait besoin de plus d'énergie ou qu'on essaie d'en économiser, PFKFB1 est sur le coup.

  3. PFKFB3 : Cette isoforme apparaît souvent dans beaucoup de cellules cancéreuses. Elle semble aider ces cellules à utiliser l'énergie d'une manière qui leur permet de croître et de se multiplier plus rapidement. Ça peut poser problème, car les cellules cancéreuses ont tendance à prospérer grâce au sucre plus que les cellules normales.

  4. PFKFB4 : Celle-ci reste généralement dans les testicules mais peut devenir plus active dans certains types de cancer.

Vu leur rôle dans la gestion de l'énergie, les enzymes PFKFB sont considérées comme des cibles potentielles pour de nouveaux traitements. Cela pourrait signifier développer des médicaments qui aideraient à équilibrer l'utilisation de l'énergie dans des maladies comme le diabète et le cancer.

Défis dans l'Étude de PFKFB

Bien que les avantages potentiels de cibler PFKFB soient intéressants, il y a des défis. D'une part, il est difficile de mesurer combien ces enzymes sont actives en laboratoire. La molécule clé qu'elles produisent, le F-2,6-BP, ne reste pas assez longtemps pour rendre les mesures faciles, et trouver de bonnes méthodes pour la mesurer n'est pas simple. En plus, il n'y a pas beaucoup de standards commerciaux pour aider les chercheurs.

Objectifs et Approches de Recherche

Pour mieux comprendre PFKFB2, les chercheurs ont voulu créer un moyen de mesurer son activité et de dépister de petites molécules pouvant l'affecter. Ils ont utilisé une méthode où la protéine PFKFB2 était cultivée dans des bactéries. Cela leur a permis de produire la protéine en plus grande quantité. Une fois la protéine créée, elle a été vérifiée pour voir si elle avait été modifiée par ce qu'on appelle la phosphorylation, qui peut changer son activité.

Les chercheurs ont découvert que lorsqu'ils purifiaient PFKFB2 de ces bactéries, elle avait une forme de phosphorylation qui pouvait être inversée. Cela signifie qu'ils pourraient potentiellement apprendre à manipuler son activité en ajustant l'état de phosphorylation.

Trouver de Nouveaux Inhibiteurs

Une fois qu'ils avaient une bonne méthode pour mesurer PFKFB2, les chercheurs ont voulu trouver des composés qui pourraient soit activer, soit inhiber l'activité de cette enzyme. Ils ont utilisé un programme informatique qui simule comment des petites molécules potentielles pourraient interagir avec PFKFB2. Après avoir dépisté une énorme bibliothèque de petites molécules, ils ont trouvé une qui semblait particulièrement prometteuse en tant qu'inhibiteur. Ce composé a été nommé B2.

Les chercheurs ont testé B2 pour voir à quel point il pouvait bloquer l'activité de PFKFB2 et PFKFB3. Ils ont découvert qu'il était efficace et assez différent des autres inhibiteurs connus. C'est excitant car des inhibiteurs uniques pourraient mieux fonctionner ou différemment par rapport aux traitements existants.

Impact de B2 sur la Glycolyse Cellulaire

Les chercheurs voulaient ensuite vérifier à quel point B2 était efficace pour diminuer la glycolyse dans des cellules vivantes. Ils l'ont testé sur une lignée cellulaire de cancer du rein réputée pour ses taux élevés de glycolyse. Ils ont constaté qu'un traitement avec B2 réduisait la production d'énergie dans ces cellules, semblable à ce qui était observé avec un autre inhibiteur connu. Cependant, B2 affectait aussi différemment la capacité maximale de production d'énergie par rapport à l'autre inhibiteur.

À travers des méthodes avancées comme une analyse Seahorse, ils ont exploré comment B2 changeait les taux de glycolyse dans ces cellules. Ils ont découvert qu'il abaissait significativement les niveaux de certains blocs de construction de sucre utilisés dans la production d'énergie, montrant qu'il avait un impact réel sur l'utilisation de l'énergie par ces cellules cancéreuses.

Métabolomique et Compréhension des Changements Cellulaires

Pour aller plus loin, les chercheurs ont examiné ce qui arrivait à divers produits chimiques impliqués dans les processus d'énergie après un traitement avec B2. Ils ont extrait les métabolites des cellules traitées et les ont analysés avec un équipement sophistiqué. Ce processus a montré des changements intéressants dans les niveaux d'intermédiaires métaboliques importants, fournissant un aperçu de la façon dont B2 affectait le métabolisme énergétique dans les cellules.

Ils ont utilisé une analyse en composantes principales pour mieux comprendre les changements dans la composition cellulaire. Les résultats ont révélé que différents traitements entraînaient des changements distincts dans le métabolisme cellulaire, aidant à clarifier comment B2 fonctionnait par rapport à d'autres inhibiteurs.

Conclusion sur PFKFB2 et Son Potentiel

Le travail réalisé montre que PFKFB2 est un acteur majeur dans la gestion de l'énergie dans nos cellules, surtout en réponse à des conditions comme le diabète et le cancer. En identifiant B2 comme un nouvel inhibiteur, cela ouvre des voies pour des traitements potentiels ciblant la glycolyse dans diverses maladies.

Les chercheurs ont fait face à de nombreux défis, mais leur engagement à comprendre comment PFKFB2 fonctionne et comment il peut être manipulé pour un gain thérapeutique est une étape prometteuse. Cela pourrait conduire à de meilleures thérapies pour des conditions où la régulation de l'énergie déraille, comme dans de nombreux cancers ou maladies métaboliques.

Bien que plus de recherches soient nécessaires pour affiner les mécanismes et voies impliqués, les découvertes mettent en avant l'importance de continuer à explorer comment nous pouvons cibler ces enzymes. L'avenir s'annonce intéressant, et qui sait, peut-être que B2 deviendra la superstar du monde de la recherche métabolique !

Directions Futures

Pour l'avenir, il y a plusieurs domaines à explorer. Un domaine clé est d'examiner comment B2 interagit spécifiquement avec PFKFB2 et si cela affecte d'autres molécules impliquées dans le métabolisme énergétique. Comprendre cela pourrait mener à un développement plus précis de médicaments.

Un autre domaine intéressant est de savoir si des composés similaires peuvent être trouvés pour cibler sélectivement différents isoformes de PFKFB. Étant donné que chaque isoforme a des fonctions et des rôles uniques dans divers tissus, trouver des composés qui peuvent se concentrer sur une isoforme plutôt qu'une autre pourrait conduire à des thérapies adaptées à des maladies spécifiques.

Des expériences pourraient aussi examiner comment B2 et d'autres inhibiteurs pourraient fonctionner en combinaison avec des traitements anticancéreux existants. Cela pourrait améliorer leur efficacité et offrir de nouvelles façons de combattre les cellules cancéreuses.

Enfin, les chercheurs devraient envisager d'étudier les effets à long terme de ces inhibiteurs sur le métabolisme et la régulation de l'énergie chez des organismes vivants. Cela donnera une vue plus large de la façon dont ils pourraient se comporter dans des contextes thérapeutiques réels.

À Retenir

En résumé, les enzymes PFKFB servent de régulateurs cruciaux du métabolisme énergétique dans notre corps. Leurs rôles dans des maladies comme le cancer et le diabète en font des cibles attrayantes pour de nouvelles thérapies. L'inhibiteur nouvellement découvert B2 offre une nouvelle voie pour explorer comment nous pouvons manipuler ces enzymes pour gérer plus efficacement la production d'énergie dans différents contextes de maladie. Les chercheurs ne font que commencer, mais l'avenir réserve des possibilités passionnantes pour comprendre et exploiter ces enzymes afin d'améliorer les résultats en matière de santé.

Avec chaque étude et chaque découverte, la communauté scientifique se rapproche de l'élucidation des complexités du métabolisme, et qui sait ? Peut-être qu'un jour, la bonne combinaison d'inhibiteurs mènera à des avancées qui nous aident tous à vivre plus sainement. Qui aurait pensé qu'une petite protéine pouvait être un gros deal dans le monde de la santé ?

Source originale

Titre: Mechanistic studies of PFKFB2 reveals a novel inhibitor of its kinase activity

Résumé: The 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase (PFKFB) family of proteins are bifunctional enzymes that are of clinical relevance because of their roles in regulating glycolysis in insulin sensitive tissues and cancer. Here, we sought to express recombinant PFKFB2 and develop a robust protocol to measure its kinase activity. These studies resulted in the unexpected finding that bacterially expressed PFKFB2 is phosphorylated in situ on Ser483 but is not a result of autophosphorylation. Recombinant PFKFB2 was used to develop an enzymatic assay to test a library of molecules selected by the Atomwise AtomNet(R) AI platform. This resulted in the identification of a new inhibitor, B2, that inhibits PFKFB2 (IC50 3.29 M) and PFKFB3 (IC50 11.89 M). A-498 cells, which express both PFKFB2 and PFKFB3, were treated with B2. Seahorse XFe analysis revealed B2 inhibited cellular glycolysis and glycolytic capacity. Targeted LC/MS analysis showed B2 decreased fructose-1,6-bisphosphate and downstream glycolytic intermediates but increased fructose-6-phosphate levels, which is consistent with an inhibitory effect on PFK-1 activity. The LC/MS metabolic profile of A-498 cells treated under identical conditions with the known PFKFB3 inhibitor, PFK158, was distinct from that induced by B2. These results thus demonstrate the identification and validation of a new PFKFB kinase inhibitor.

Auteurs: Craig Eyster, Satoshi Matsuzaki, Atul Pranay, Jennifer R. Giorgione, Anna Faakye, Mostafa Ahmed, Kenneth M. Humphries

Dernière mise à jour: 2024-12-25 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.25.630325

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.25.630325.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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