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Avances en la detección del cáncer colorrectal

Una nueva tecnología mejora la detección temprana del cáncer colorrectal durante la colonoscopia.

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El Cáncer colorrectal (CCR) es un gran problema de salud en todo el mundo, siendo uno de los tipos de cáncer más comunes y una de las principales causas de muerte por cáncer. Detectar el CCR a tiempo puede reducir significativamente el riesgo de complicaciones graves o muerte. Una de las mejores maneras de encontrar este cáncer a tiempo es mediante una prueba llamada colonoscopia. Durante este examen, los doctores pueden buscar signos tempranos de cáncer, llamados pólipos, que pueden convertirse en cáncer si no se eliminan.

Sin embargo, encontrar estos pólipos puede ser complicado. Es común tener altas tasas de omisión durante la colonoscopia, y hay muchos factores que contribuyen a este problema. Estos factores incluyen la habilidad del doctor que realiza el procedimiento, el tiempo que se pasa durante el examen y la apariencia de los pólipos, que pueden variar en color, tamaño y forma. Además, como los pólipos pueden camuflarse con el tejido circundante, identificarlos puede ser bastante difícil.

Para ayudar a mejorar la detección de pólipos, los investigadores han estado trabajando en programas de computadora que utilizan Aprendizaje Profundo. Estos programas están diseñados para ayudar a los doctores al resaltar automáticamente los pólipos durante los videos de colonoscopia. A pesar de algunos éxitos en mejorar las tasas de detección, muchos de estos sistemas automatizados a menudo no pueden procesar la información lo suficientemente rápido durante el procedimiento. Además, su precisión tiende a disminuir cuando se prueba con datos de nuevos pacientes de diferentes hospitales.

Solución Propuesta

Para abordar estos desafíos, se está desarrollando un nuevo programa de computadora llamado TransNetR. Este programa se basa en técnicas avanzadas de aprendizaje profundo, diseñadas específicamente para identificar y delinear pólipos de manera rápida y precisa durante la colonoscopia.

TransNetR utiliza una estructura que incluye un modelo de codificador-decodificador, donde una parte del programa procesa las imágenes para capturar detalles importantes, y la otra parte trabaja para refinar los hallazgos. La parte inicial del modelo se llama ResNet50, que está entrenada para reconocer patrones a partir de muchas muestras de imágenes de pólipos. Luego, pasa la información a través de varias capas para mejorar la segmentación y representación de las áreas de pólipos en las imágenes.

Lo que distingue a TransNetR es su capacidad de funcionar bien incluso cuando se entrena con un conjunto de datos y se prueba con Conjuntos de datos completamente diferentes. Esto es crucial porque los datos médicos de distintos hospitales pueden variar mucho debido a diferentes equipos, demografía de pacientes y otros factores.

Metodología

El rendimiento de TransNetR se evalúa utilizando múltiples conjuntos de datos que incluyen imágenes de pólipos de diferentes centros médicos. Uno de los conjuntos clave es Kvasir-SEG, que sirve como la fuente principal para entrenar el programa. Otros conjuntos de datos, como PolypGen y CVC-ClinicDB, se utilizan para probar la capacidad del modelo de generalizar y detectar con precisión pólipos que no ha encontrado antes.

Para asegurar que el modelo funcione bien en varios entornos, se realizan una serie de pruebas. La fase de entrenamiento implica enseñar a TransNetR a reconocer pólipos del conjunto de datos Kvasir-SEG, seguido de la evaluación de su habilidad en el conjunto de datos PolypGen. Este conjunto incluye imágenes de seis hospitales únicos, mostrando la adaptabilidad del modelo a diferentes condiciones y poblaciones.

Resultados

Los resultados de los experimentos muestran que TransNetR tiene un rendimiento impresionante. Cuando se prueba en el conjunto de datos Kvasir-SEG, el programa logró altas puntuaciones en métricas comúnmente usadas para evaluar la calidad de segmentación, como el promedio de Intersección sobre Unión (mIoU) y el promedio del Coeficiente de Similitud de Dice (mDSC). Notablemente, alcanzó una velocidad de procesamiento de alrededor de 54 cuadros por segundo, lo que lo hace adecuado para aplicaciones en tiempo real en un entorno clínico.

Al evaluarse en otros conjuntos de datos, TransNetR continuó mostrando un fuerte rendimiento. Mantuvo alta precisión cuando se probó en secuencias de video de PolypGen, confirmando su fiabilidad en escenarios del mundo real. El modelo mostró una notable capacidad para detectar pólipos pequeños y planos, que a menudo son pasados por alto por métodos tradicionales.

Generalizabilidad

Una de las grandes ventajas de TransNetR es su generalizabilidad. El programa fue diseñado para funcionar bien no solo con los datos con los que fue entrenado, sino también con nuevos datos no vistos. Esto es especialmente importante en contextos médicos donde la demografía de los pacientes puede variar ampliamente.

La capacidad de mantener el rendimiento a través de diferentes conjuntos de datos indica que TransNetR puede ayudar a los doctores a identificar pólipos, sin importar las variaciones en el equipo de imagen o las características del paciente. Esta característica es esencial para que la herramienta sea valiosa en entornos clínicos donde se tratan poblaciones diversas.

Comparación con Métodos Existentes

TransNetR fue comparado con otros modelos líderes en el campo. En estas comparaciones, se encontró que TransNetR generalmente superó a otros modelos en términos de precisión y velocidad. Incluso con mejoras mínimas en las métricas de rendimiento, esto puede tener implicaciones significativas en entornos clínicos, ya que incluso un pequeño aumento en las tasas de detección puede traducirse en mejores resultados para los pacientes.

Conclusión

TransNetR representa un avance significativo en la detección asistida por computadora de pólipos durante la colonoscopia. Su capacidad para proporcionar resultados precisos en tiempo real lo posiciona como una herramienta valiosa para los profesionales de la salud. Al mejorar las tasas de detección temprana del cáncer colorrectal, TransNetR puede contribuir a un mejor cuidado del paciente y potencialmente salvar vidas.

En resumen, TransNetR es una solución prometedora para mejorar la detección de pólipos durante los procedimientos de colonoscopia. Sus resultados actuales sugieren que puede ayudar a los clínicos a hacer diagnósticos más precisos, permitiendo intervenciones más rápidas y mejorando los resultados de salud para los pacientes en riesgo de cáncer colorrectal. El desarrollo y perfeccionamiento continuo de estas tecnologías será crucial en la lucha constante contra esta enfermedad prevalente.

Fuente original

Título: TransNetR: Transformer-based Residual Network for Polyp Segmentation with Multi-Center Out-of-Distribution Testing

Resumen: Colonoscopy is considered the most effective screening test to detect colorectal cancer (CRC) and its precursor lesions, i.e., polyps. However, the procedure experiences high miss rates due to polyp heterogeneity and inter-observer dependency. Hence, several deep learning powered systems have been proposed considering the criticality of polyp detection and segmentation in clinical practices. Despite achieving improved outcomes, the existing automated approaches are inefficient in attaining real-time processing speed. Moreover, they suffer from a significant performance drop when evaluated on inter-patient data, especially those collected from different centers. Therefore, we intend to develop a novel real-time deep learning based architecture, Transformer based Residual network (TransNetR), for colon polyp segmentation and evaluate its diagnostic performance. The proposed architecture, TransNetR, is an encoder-decoder network that consists of a pre-trained ResNet50 as the encoder, three decoder blocks, and an upsampling layer at the end of the network. TransNetR obtains a high dice coefficient of 0.8706 and a mean Intersection over union of 0.8016 and retains a real-time processing speed of 54.60 on the Kvasir-SEG dataset. Apart from this, the major contribution of the work lies in exploring the generalizability of the TransNetR by testing the proposed algorithm on the out-of-distribution (test distribution is unknown and different from training distribution) dataset. As a use case, we tested our proposed algorithm on the PolypGen (6 unique centers) dataset and two other popular polyp segmentation benchmarking datasets. We obtained state-of-the-art performance on all three datasets during out-of-distribution testing. The source code of TransNetR will be made publicly available at https://github.com/DebeshJha.

Autores: Debesh Jha, Nikhil Kumar Tomar, Vanshali Sharma, Ulas Bagci

Última actualización: 2023-03-13 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://arxiv.org/abs/2303.07428

Fuente PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.07428

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

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