Aprovechando las comunidades microbianas para una agricultura sostenible
La investigación sobre comunidades microbianas muestra que puede ayudar a mejorar la salud de los cultivos de manera sostenible.
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Mesoamérica es una zona súper importante para la agricultura, especialmente conocida por cultivar plantas como el Maíz, frijoles, chiles y calabazas. Estos alimentos son esenciales para mucha gente. En México, prácticas tradicionales de cultivo como la milpa todavía están en pie, permitiendo cultivar diferentes tipos de maíz sin necesidad de fertilizantes químicos o pesticidas. Estas prácticas son importantes no solo para la comida, sino también para la cultura y tradiciones de las comunidades indígenas.
Los Microbios, o pequeños organismos, juegan un rol crucial en mantener sanas a las plantas y ayudarles a crecer. Pueden ayudar a absorber nutrientes, lidiar con el estrés y mejorar la inmunidad de las plantas. En el suelo, los microbios son atraídos por las raíces de las plantas y ayudan a formar una Comunidad que es clave para la salud de las plantas. Investigaciones recientes muestran que ciertas Bacterias encontradas en semillas de maíz son esenciales para la fertilidad de estas plantas.
En la agricultura de hoy, el uso de productos microbianos se ve como una forma de mejorar la salud de las plantas mientras se minimiza el uso de químicos. Aunque estos productos han mostrado promesas en condiciones controladas, aplicarlos en la agricultura real es un desafío. Esto se debe principalmente a la falta de entendimiento de cómo diferentes microbios trabajan juntos en una comunidad.
El Rol de los Microbios en la Agricultura
Los microbios son vitales para el crecimiento de las plantas. Ayudan a las plantas a acceder a nutrientes del suelo y a enfrentar varios estreses, como la sequía. Algunos tipos de bacterias incluso pueden ayudar a las plantas a resistir enfermedades. La interacción entre raíces y microbios es compleja y crucial para la salud de las plantas.
Las investigaciones han mostrado que ciertas bacterias, particularmente las que se encuentran en las raíces del maíz, contribuyen significativamente a la capacidad de la planta para crecer y prosperar en sistemas agrícolas tradicionales como las milpas. Entender cómo estos microbios interactúan entre sí y con las plantas de maíz puede dar pistas sobre cómo mejorar la agricultura de manera sostenible.
El estudio de cómo estas comunidades microbianas se forman y funcionan aún está en sus primeras etapas. Muchos métodos utilizados para evaluar microbios se enfocan en cepas individuales en lugar de en la comunidad completa. Sin embargo, los esfuerzos científicos están aumentando para generar comunidades que puedan funcionar bien juntas, imitando ecosistemas naturales.
Construyendo una Comunidad Sintética de Bacterias
Los investigadores buscan crear una comunidad sintética de bacterias para entender mejor las interacciones que ayudan al maíz nativo a crecer. La idea es juntar un pequeño grupo de bacterias de las que se encuentran en semillas de maíz que puedan trabajar bien juntas. Esto se hace a través de un proceso de selección cuidadoso donde los investigadores mezclan diferentes cepas y observan cómo se comportan juntas.
En la búsqueda de la mezcla correcta, los científicos descubrieron que ciertos pares de bacterias mostraron características únicas, que eran esenciales para exploraciones posteriores. Esto involucró crear combinaciones de bacterias, observar sus patrones de crecimiento e identificar qué grupos funcionaban mejor juntos.
A partir de sus observaciones, desarrollaron una comunidad sintética de tres miembros llamada Xilonen. Esta comunidad está formada por cepas específicas de bacterias que se encontraron interactuando positivamente entre sí, creando un ambiente complejo y favorable para el crecimiento del maíz.
La Comunidad Xilonen
La comunidad Xilonen consiste en tres tipos de bacterias: Bacillus, Burkholderia y Pseudomonas. Cada una tiene un rol que beneficia a las otras, mejorando la salud general de la planta de maíz. Los científicos utilizaron varios métodos para determinar cómo estas bacterias trabajan juntas e influyen en el crecimiento de unas a otras.
Al examinar cómo crecen cepas individuales en diferentes situaciones, los investigadores pudieron entender cómo pueden apoyarse entre sí cuando se combinan. Notaron que las interacciones en la comunidad Xilonen conducen a un mejor crecimiento y estabilidad en comparación con cuando estas cepas se cultivan por separado.
Esta comunidad representa un gran avance en cómo podríamos usar microbios beneficiosos en la agricultura. Al entender estas interacciones, los agricultores pueden desarrollar estrategias más efectivas para mejorar la salud de los cultivos y los rendimientos.
Probando y Caracterizando la Comunidad
Una vez que se formó la comunidad Xilonen, los investigadores empezaron pruebas extensivas para evaluar cómo funcionaba. Miraron cómo crecía cada tipo de bacteria solo y en la comunidad, monitoreando cómo interactuaban y si estas interacciones llevaban a un mejor crecimiento.
Los investigadores descubrieron que aunque la comunidad Xilonen tenía una estructura única, no necesariamente significaba que los miembros individuales crecerían mejor como parte de la comunidad. En cambio, la estructura ayudó a crear un ambiente propicio para el crecimiento, permitiendo que las bacterias prosperaran juntas.
A través de una serie de experimentos, evaluaron cómo cada cepa afectaba a las otras. Algunas cepas parecían influir positivamente en el crecimiento de otras, mientras que algunas interacciones resultaron ser antagonistas, lo que significa que podían obstaculizar el crecimiento de las otras. Entender estas interacciones es crucial para mantener una comunidad estable y productiva.
La Importancia de la Formación de Biofilmes
Uno de los procesos clave observados en la comunidad Xilonen es la formación de biofilmes. Los biofilmes son grupos de microorganismos que se adhieren entre sí y forman una capa protectora. Esta estructura es importante para muchos ecosistemas naturales y puede mejorar la capacidad de las bacterias para colonizar las raíces de las plantas.
En sus estudios, los investigadores probaron cómo se forman biofilmes en diferentes entornos. Descubrieron que mientras cepas individuales podían crear biofilmes, la combinación de cepas en la comunidad Xilonen llevó a una arquitectura de biofilme más compleja y beneficiosa. Esta disposición compleja puede ayudar a mejorar la colonización de raíces y la salud de las plantas.
Los biofilmes juegan un papel significativo en la protección de las plantas contra enfermedades y en mejorar la absorción de nutrientes. Al estudiar cómo mejorar la formación de biofilmes, los investigadores esperan mejorar prácticas agrícolas que dependen de microbios beneficiosos.
El Camino a Seguir
El trabajo con la comunidad Xilonen proporciona un marco valioso para futuras investigaciones sobre comunidades microbianas en la agricultura. Al entender mejor cómo diferentes cepas trabajan juntas, los científicos pueden desarrollar productos microbianos más efectivos que se pueden usar en la agricultura.
El enfoque tomado para construir la comunidad Xilonen tiene implicaciones más amplias. Puede aplicarse a otros cultivos y sistemas de suelo, promoviendo la sostenibilidad en la agricultura y reduciendo la dependencia de fertilizantes químicos y pesticidas.
Los estudios futuros buscarán explorar más a fondo la dinámica de estas comunidades, cómo se pueden optimizar para una mejor salud de las plantas y cómo se pueden aplicar en escenarios agrícolas reales.
Conclusión
La comunidad Xilonen demuestra el potencial de usar microbios beneficiosos para mejorar las prácticas agrícolas. Al enfocarse en cómo estos microbios interactúan dentro de una comunidad, los investigadores pueden diseñar mejores estrategias para apoyar el crecimiento saludable de los cultivos. Los hallazgos de esta investigación no solo resaltan la importancia de las interacciones microbianas, sino que también allanan el camino para futuros avances en la agricultura sostenible.
Al promover el uso de comunidades microbianas naturales, podemos lograr cultivos más saludables mientras respetamos el medio ambiente, abriendo paso a una nueva comprensión de la agricultura que sea eficiente y sostenible.
Título: Harnessing Emergent Properties of Microbial Consortia: Assembly of the Xilonen SynCom
Resumen: Synthetic communities (SynComs) are valuable tools for addressing fundamental questions in microbial ecology regarding community assembly. They could also potentially aid in successfully manipulating microbial communities for clinical, biotechnological, and agricultural applications. SynCom design is complicated since interactions between microbes cannot be predicted based on their individual properties. Here, we aimed to assemble a higher-order SynCom from seed-endophytic bacteria isolated from native maize landraces. We screened co-cultures that included strains from the Bacilli class, and the Burkholderia and Pseudomonas genera since these taxa have been previously shown to be important for the fertility of native maize landraces. We developed a combinatorial, bottom-up strategy aimed at the detection of a complex colony architecture as an emergent collective property. Using this simplified approach, we assembled a SynCom composed of Bacillus pumilus NME155, Burkholderia contaminans XM7 and Pseudomonas sp. GW6. The strains exhibited positive and negative interactions when evaluated in pairs, but their higher-order assembly results in a complex colony architecture, which is considered a proxy of biofilm formation. This SynCom was named Xilonen after the Aztec goddess of young maize and fertility. The Xilonen SynCom will aid in studying the molecular and ecological basis mediating maize fertility.
Autores: Jorge Rocha, G. Gastelum, B. Gomez-Gil, G. Olmedo-Alvarez
Última actualización: 2024-04-24 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.24.590952
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.24.590952.full.pdf
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