Abordando la contaminación de referencia en estudios cerebrales
Investigadores abordan la contaminación de referencias para mejorar la precisión de los datos de conectividad cerebral.
Eleonora Bartoli, H. Huang, J. A. Adkinson, M. A. Jensen, M. Hasen, I. A. Danstrom, K. R. Bijanki, N. M. Gregg, K. J. Miller, S. A. Sheth, D. Hermes
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Tabla de contenidos
En los últimos años, los científicos han estado estudiando las conexiones entre diferentes partes del cerebro usando un método llamado Estimulación Eléctrica de Pulso Único (SPES). Esta técnica consiste en enviar breves pulsos eléctricos a áreas específicas del cerebro y luego registrar la respuesta del cerebro en otros lugares. Estas respuestas ayudan a los investigadores a entender cómo se comunican las diferentes regiones del cerebro.
Sin embargo, surge un problema con la forma en que se hacen estas grabaciones. Si el electrodo de referencia usado para grabar está demasiado cerca de un área de actividad cerebral fuerte, puede causar resultados engañosos en los datos. Esto puede llevar a conclusiones incorrectas sobre cómo están conectadas las diferentes áreas del cerebro.
El Problema de la Contaminación de Referencia
La contaminación de referencia ocurre cuando el electrodo de referencia recoge señales fuertes de regiones cerebrales cercanas. Como resultado, estas señales pueden esparcirse a otros electrodos de grabación, haciendo que parezca que hay una conexión fuerte entre diferentes áreas del cerebro cuando, en realidad, es solo un artefacto del sistema de grabación.
Por ejemplo, cuando los investigadores analizaron datos recogidos de dos hospitales diferentes, encontraron una señal común en muchos electrodos, lo que sugería una conexión fuerte. Esta señal común fue probablemente el resultado de la contaminación de referencia, en lugar de una comunicación real entre las regiones del cerebro.
Métodos para Abordar el Problema
Para abordar el problema de la contaminación de referencia, los investigadores propusieron dos enfoques principales. El primer método consiste en cambiar el electrodo de referencia por uno que tenga menos probabilidad de recoger señales no deseadas. El segundo método es una técnica basada en software llamada re-referenciación, que busca corregir los datos una vez que han sido recogidos.
En este estudio, los investigadores probaron ambos métodos. Realizaron experimentos con diferentes electrodos de referencia y luego aplicaron la técnica de re-referenciación conocida como CARLA, que ayuda a reducir la influencia de las señales de referencia contaminadas.
Configuración Experimental
El estudio involucró a dos sujetos humanos, cada uno monitoreado por epilepsia en dos hospitales diferentes. En ambos casos, se implantaron electrodos en el cerebro para medir la actividad eléctrica mientras se aplicaba SPES. Los investigadores realizaron dos corridas experimentales separadas para cada sujeto: una con una referencia contaminada y otra con una referencia más neutral.
En el primer sujeto, se colocaron 15 electrodos en varias ubicaciones del cerebro, mientras que el segundo sujeto tenía 13 electrodos. Cada sujeto pasó por el mismo procedimiento, que consistía en enviar pulsos eléctricos a áreas específicas del cerebro y grabar las respuestas.
Recolección y Análisis de Datos
Una vez que se recogieron los datos, los investigadores examinaron las señales grabadas. Usaron técnicas específicas para eliminar señales de los electrodos de referencia que podrían haber contaminado las grabaciones. Este paso es crucial para asegurarse de que los resultados reflejen la actividad real del cerebro en lugar de artefactos del sistema de grabación.
Luego, los investigadores compararon los resultados de ambas corridas experimentales. Observaban qué tan similares eran las respuestas al usar diferentes electrodos de referencia y cuán efectiva fue la técnica de re-referenciación para corregir los datos contaminados.
Hallazgos de los Experimentos
Los resultados mostraron que la técnica de re-referenciación fue efectiva en reducir la influencia de la contaminación de referencia. Cuando se analizaron los datos de las dos corridas, se encontró que los potenciales evocados por el pulso (PEPs) grabados se volvieron más similares después de la re-referenciación. Esto indicó que el método de corrección fue exitoso.
Para ambos sujetos, el análisis reveló diferencias significativas en las señales grabadas antes y después de aplicar la técnica de re-referenciación. La fuerza de las desviaciones comunes en los datos disminuyó, y las respuestas comenzaron a reflejar con precisión la verdadera actividad del cerebro sin la influencia de la contaminación de referencia.
Métricas Clave para Evaluar Resultados
Los investigadores utilizaron varias métricas para evaluar el éxito de los métodos empleados. Analizaron las diferencias en las respuestas entre las corridas con referencia contaminada y neutral, centrándose en mediciones clave como latencias máximas y duraciones de respuesta.
Además, los investigadores calcularon la similitud entre las señales grabadas en diferentes electrodos. Una disminución en la similitud después de la re-referenciación indicó una corrección exitosa de la contaminación de referencia, lo que llevó a interpretaciones más precisas de los datos.
Implicaciones para La Investigación Futura
Estos hallazgos enfatizan la importancia de usar electrodos de referencia apropiados y técnicas de re-referenciación en experimentos de SPES. Al abordar el problema de la contaminación de referencia, los investigadores pueden asegurarse de que sus conclusiones sobre la conectividad cerebral se basen en datos precisos.
Aunque los investigadores en teoría buscan grabar datos con un electrodo de referencia neutral, esto no siempre es práctico. El estudio proporciona un marco para identificar y mitigar la contaminación de referencia. Este enfoque puede mejorar la fiabilidad de los resultados en estudios futuros y aumentar nuestra comprensión de la comunicación cerebral.
Conclusión
En resumen, este estudio destaca un problema común en la investigación sobre la conectividad cerebral relacionado con la contaminación de referencia. Al emplear tanto ajustes de hardware (cambiando el electrodo de referencia) como soluciones de software (re-referenciación), los investigadores pueden obtener medidas más precisas de la actividad y conectividad cerebral.
Los resultados obtenidos a través de los experimentos muestran la efectividad de estas estrategias, abriendo el camino para metodologías mejoradas en investigaciones futuras. Con las técnicas adecuadas, los científicos pueden entender mejor cómo se comunican diferentes regiones del cerebro, contribuyendo en última instancia a avances en la neurociencia y aplicaciones clínicas.
A medida que los investigadores continúan refinando estos métodos, mejorarán la calidad y fiabilidad de los datos en estudios sobre actividad cerebral, llevando a mejores conocimientos y posibles avances en el campo de la neurociencia.
Título: Proper reference selection and re-referencing to mitigate bias in single pulse electrical stimulation data
Resumen: Single pulse electrical stimulation experiments produce pulse-evoked potentials used to infer brain connectivity. The choice of recording reference for intracranial electrodes remains non-standardized and can significantly impact data interpretation. When the reference electrode is affected by stimulation or evoked brain activity, it can contaminate the pulse-evoked potentials recorded at all other electrodes and influence interpretation of findings. We highlight this specific issue in intracranial EEG datasets from two subjects recorded at separate institutions. We present several intuitive metrics to detect the presence of reference contamination and offer practical guidance on different mitigation strategies. Either switching the reference electrode or re-referencing to an adjusted common average effectively mitigated the reference contamination issue, as evidenced by increased variability in pulse-evoked potentials across the brain. Overall, we demonstrate the importance of clear quality checks and preprocessing steps that should be performed before analysis of single pulse electrical stimulation data. HighlightsO_LIA reference electrode close to active tissue can contaminate intracranial EEG signals C_LIO_LIInterpretation of pulse-evoked potentials can be biased by reference contamination C_LIO_LILow response variability between channels is indicative of reference contamination C_LIO_LIReference contamination can be resolved through data recollection or re-referencing C_LI
Autores: Eleonora Bartoli, H. Huang, J. A. Adkinson, M. A. Jensen, M. Hasen, I. A. Danstrom, K. R. Bijanki, N. M. Gregg, K. J. Miller, S. A. Sheth, D. Hermes
Última actualización: 2024-10-22 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.21.619449
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.21.619449.full.pdf
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