Las Primeras Etapas del Desarrollo Animal
Examinando el papel de la genética en las primeras fases del desarrollo animal.
― 7 minilectura
Tabla de contenidos
- El papel de los genes maternos y cigóticos
- Diferencias en los procesos de desarrollo temprano
- La importancia de los elementos reguladores
- Evidencia de regulación específica de linaje
- La interacción de los motivos con otros factores
- El papel de los Elementos Transponibles
- Conclusión y direcciones futuras
- Fuente original
El desarrollo animal comienza cuando un huevo fertilizado, que tiene un conjunto completo de cromosomas, inicia el camino para convertirse en un organismo completo. Esta fase temprana es muy importante porque sienta las bases para todo el desarrollo posterior. En estas etapas iniciales, procesos como la división celular y la formación de ejes corporales ocurren rápido y son similares en muchas especies animales.
El papel de los genes maternos y cigóticos
Al principio, tanto la madre como el huevo fertilizado (llamado cigoto) contribuyen con material genético. Al principio, el embrión utiliza proteínas y ARN que la madre ha proporcionado. Esto es crucial hasta que el cigoto puede empezar a usar su propio ADN. Esta transición de usar genes maternos a genes cigóticos se conoce como transición materno a cigoto.
Por ejemplo, cuando miramos las moscas de la fruta, la madre produce un montón de ARN en células especiales llamadas células nodrizas. Estas células crean una gran cantidad de ARN que luego se da a cada huevo. Este ARN es clave para el desarrollo temprano. Después de que el huevo es fertilizado, el cigoto comienza a tomar el control y empieza a producir su propio ARN.
Aun así, la forma en que estas dos fuentes de ARN trabajan juntas durante las etapas iniciales del desarrollo es un proceso complejo. Mientras que muchas partes de este proceso son similares entre especies, no todas las proteínas y ARN específicos producidos son iguales entre diferentes tipos de animales.
Diferencias en los procesos de desarrollo temprano
Aunque los procesos de desarrollo temprano son a menudo similares entre muchas especies, los productos génicos (proteínas y ARN) que resultan de estos procesos pueden diferir. La investigación ha mostrado que en varios organismos modelo, como ratones, peces cebra y moscas de la fruta, hay diferentes conjuntos de ARN presentes en las etapas muy tempranas antes y después de que se activa el genoma cigótico. Esto plantea preguntas interesantes sobre cómo surgen estas diferencias.
Algunos científicos estudiaron el ARN temprano de diferentes especies de moscas de la fruta y encontraron que incluso especies estrechamente relacionadas pueden tener diferencias significativas en su desarrollo embrionario inicial. Descubrieron que aunque hay muchos genes comunes, algunos genes y su ARN han cambiado de manera única en linajes específicos.
La importancia de los elementos reguladores
En este estudio, nos enfocamos en cómo las diferencias en las secuencias de ADN, conocidas como elementos reguladores, afectan la expresión génica en estas primeras etapas del desarrollo. Nuestro trabajo anterior encontró patrones en elementos reguladores relacionados con la transcripción materna y cigótica. Queremos ver cómo los cambios en las regiones reguladoras se relacionan con cambios en cómo se expresan los genes.
A través de nuestro análisis, encontramos que ciertos motivos, o secuencias específicas en el ADN, pueden diferir mucho en sus efectos sobre la expresión génica dependiendo de la especie. En particular, los cambios a nivel de regulación genética pueden llevar a nuevos patrones de expresión génica.
Evidencia de regulación específica de linaje
Una pregunta clave es cómo la regulación de la expresión génica difiere entre especies. Algunos estudios anteriores mostraron que muchos reguladores, que ayudan a gestionar cómo se encienden y apagan los genes, son compartidos entre especies. Nuestro estudio actual también busca descubrir si reguladores específicos son únicos de ciertos linajes o especies.
Para investigar esto, buscamos motivos específicos en el ADN de 11 especies de moscas de la fruta. Encontramos motivos que estaban enriquecidos en las regiones de genes controlados por la entrada de la madre o por el cigoto después de que se activa. Muchos de los motivos significativos que influyen en los genes maternos eran efectivos solo en especies estrechamente relacionadas, específicamente en el subgrupo pseudoobscura de moscas de la fruta.
Motivos que influyen en la expresión génica
Varios motivos asociados con genes maternos mostraron fuertes efectos específicos de especie. Muchos de estos motivos se encontraron principalmente en dos especies estrechamente relacionadas, lo que sugiere que estos elementos reguladores específicos de genes pueden evolucionar de maneras que cambian sus efectos.
En nuestro examen de las secuencias reguladoras, también encontramos que mientras algunos motivos fueron conservados entre especies, podían comportarse de manera diferente en términos de su impacto en la expresión génica. Esto demuestra la naturaleza dinámica de los elementos reguladores y su influencia en la actividad génica de manera específica para cada especie.
La interacción de los motivos con otros factores
Más allá del contenido de motivos, necesitamos considerar cómo otros factores como la longitud del gen y la proximidad a otros genes influyen en la expresión. En nuestro análisis, descubrimos que estas interacciones podían cambiar según la especie. Por ejemplo, la distancia entre genes era particularmente importante para la expresión de genes maternos, mientras que factores como los niveles de expresión de genes maternos vecinos eran cruciales después de la activación del genoma cigótico.
Cambios en el contenido de motivos
Tanto los genes maternos como los cigóticos exhibieron ejemplos donde cambios en los niveles de expresión correspondían con diferencias en el contenido de motivos. Esto sugiere una relación clara entre los elementos reguladores presentes y cómo esos genes se expresan a lo largo del tiempo.
Elementos Transponibles
El papel de losNuestra investigación reveló que los elementos transponibles (ETs) en el genoma podrían jugar un papel significativo en la evolución de nuevos motivos reguladores. Los ETs son segmentos de ADN que pueden moverse dentro del genoma. Encontramos que muchos motivos específicos de especie estaban enriquecidos en ETs únicos para ciertas especies de moscas de la fruta. Esto indica que los ETs podrían facilitar la propagación de nuevos motivos a través de los genomas de estas especies.
Conclusión y direcciones futuras
Las etapas tempranas del desarrollo animal no solo se conservan entre especies, sino que también exhiben flexibilidad en cómo se pueden regular los genes. Esta flexibilidad permite cambios evolutivos en la expresión génica que pueden ocurrir a través de varios mecanismos, incluidos cambios en las proteínas reguladoras, cambios en cómo funcionan los reguladores conservados e incluso la propagación de nuevos motivos a través de elementos transponibles.
Nuestro estudio ha destacado las complejas interacciones entre diferentes factores que afectan la expresión génica, revelando cómo los cambios regulatorios pueden llevar a diferencias significativas en los procesos de desarrollo temprano. Esta investigación contribuye a nuestra comprensión de cómo funciona el desarrollo y cómo puede variar entre especies.
Al estudiar la evolución de la regulación génica, podemos obtener una visión más profunda de los mecanismos biológicos que impulsan la diversidad en el desarrollo y función animal. Los esfuerzos futuros buscarán desmenuzar aún más estas interacciones complejas y expandir nuestra comprensión en un rango más amplio de especies.
Título: Evolution of maternal and early zygotic transcript regulation across Drosophila
Resumen: The complements of mRNAs in early embryonic development are crucial for setting up developmental trajectories across all animals. The earliest stages of development are regulated by mRNAs deposited into the egg by the mother, until the zygote can become competent to transcribe its own genome. Previously, we showed that the set of maternally deposited and early transcribed zygotic mRNAs in Drosophila are generally conserved across species, but with some notable variation. We also showed that a majority of regulators of these two types of transcripts are shared. In this study, we examine the differences in regulatory motifs associated with maternal deposition and early zygotic transcription across species of Drosophila. For maternal transcripts, while the regulators are mostly conserved, we find the Drosophila pseudoobscura species subgroup appears to contain numerous novel regulatory motifs unique to these species. These novel motifs are enriched in transposable elements exclusive to this group. As this species group had been previously identified as having an exceptional amount of divergence in early embryonic transcripts, this change in regulation may be responsible. However, transcripts that are present at the maternal stage only in these species are equally enriched in novel (group-specific) and conserved binding sites, so the novel regulation is not the sole cause of regulatory divergence in these species. At the zygotic stage, we observe a wide variety of species-specific motifs. Additionally, at both stages we observe motifs conserved across species having different effects on gene expression in different species, and regulating different sets of genes in different species. By examining changes in motif content across species, we find that changes in motif content alone is generally insufficient to drive gene expression changes across species.
Autores: Charles Omura, S. Lott
Última actualización: 2024-10-22 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.28.466359
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.28.466359.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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