Insights sobre a ativação do Inflamassoma NLRP3
Novas pesquisas mostram como o inflamassoma NLRP3 reage a sinais prejudiciais.
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Índice
- O Inflamassoma e sua Função
- Modificações e Regulação do NLRP3
- Estímulos de Ativação para o NLRP3
- Descobertas Recentes em Tráfego Celular e Ativação do NLRP3
- Investigando Organelas e Interações de Proteínas
- Mudanças nas Proteínas e Funções Celulares em Resposta a Estímulos
- O Papel dos Lisossomos e Mitocôndrias
- Investigando Mudanças Endossomais
- Remodelação do Golgi e Ativação do NLRP3
- Análise Espaciotemporal das Interações NLRP3 e PI4P
- Analisando Proteínas Próximas ao NLRP3
- Conclusão
- Fonte original
O sistema imunológico dos mamíferos ajuda a proteger o corpo de ameaças ruins, como infecções. Dentro desse sistema, existem caminhos que trabalham para detectar essas ameaças e responder a elas. Esses caminhos precisam estar equilibrados; muita ativação pode causar Inflamação, que pode resultar em doenças e contribuir para envelhecimento e distúrbios cerebrais.
A força e a duração da resposta imunológica podem mudar com base em vários fatores. Esses fatores incluem o que desencadeia a resposta, que tipo de células estão envolvidas, a saúde delas e quais caminhos são ativados. Diferentes resultados podem surgir dessas mudanças, incluindo inflamação que pode levar à morte celular. Proteínas no corpo agem como sensores para dar início a essas respostas. Elas detectam substâncias nocivas, protegem certas proteínas ou caminhos nas células ou verificam a saúde das células para iniciar os mecanismos de defesa adequados.
O Inflamassoma e sua Função
Um grupo especial de proteínas sensoras pode se juntar para formar um complexo conhecido como inflamasoma quando detectam um perigo. Quando esses sensores reconhecem sinais nocivos, eles começam a se montar e ativam uma proteína chamada Caspase-1. Isso pode acontecer diretamente ou trazendo antes outra proteína chamada ASC. A caspase-1 ativa então leva à conversão de certas proteínas sinalizadoras chamadas citocinas em suas formas ativas e libera uma parte de outra proteína, Gasdermina-D.
Uma vez ativada, a gasdermina-D cria buracos nas membranas celulares, permitindo a liberação de citocinas ativas das células. Esse processo geralmente leva a um tipo específico de morte celular conhecida como piroptose. Esta é caracterizada por um tipo diferente de ruptura celular que libera moléculas inflamatórias maiores.
Existem muitos sinais que ajudam a controlar cada passo no processo do inflamasoma para ajustar finamente os níveis de inflamação. Diferentes proteínas sensoras conseguem reconhecer padrões nocivos específicos em diferentes tecidos dependendo do seu papel. Por exemplo, certas células imunológicas expressam vários sensores, incluindo um chamado NLRP3. Algumas dessas células precisam de um sinal inicial, como um componente bacteriano, para se prepararem para responder. Esse sinal ativa um fator de transcrição específico que, por sua vez, impulsiona a produção de proteínas envolvidas no processo do inflamasoma.
Embora a ativação do NLRP3 possa ocorrer sem sinalização prévia em algumas células imunes, muitas vezes, o sinal inicial ajuda a definir o limite de estresse que uma célula pode suportar antes de ativar o inflamasoma e quantos sinais inflamatórios são liberados.
Modificações e Regulação do NLRP3
O NLRP3 em si também pode ser modificado após ser produzido, o que ajuda a ajustar sua ativação. Esse processo de modificação pode ocorrer mesmo sem o passo de sinalização anterior. Por exemplo, certas mudanças podem ajustar quanto dessa proteína existe ou tornar o NLRP3 mais ou menos sensível ao que o ativa. Esses processos regulatórios são importantes porque ações anormais do NLRP3 podem levar a várias doenças.
Uma interação que geralmente está ligada à ativação do NLRP3 é sua ligação a uma proteína chamada NEK7. Durante o ciclo celular, a NEK7 pode ficar presa, reduzindo a quantidade disponível para a ativação do NLRP3 durante esse tempo. O motivo exato dessa redução não está claro, mas pode ajudar a prevenir a ativação acidental do inflamasoma enquanto a célula está se dividindo.
No entanto, quando há altos níveis de substâncias que podem ativar o NLRP3, ou após exposição prolongada a elas, alguns tipos de células não precisam da NEK7 para ativar o NLRP3. Em última análise, o NLRP3 permanece inativo até detectar uma substância ativadora.
Estímulos de Ativação para o NLRP3
Existem vários tipos de estímulos que podem ativar o NLRP3, muitos dos quais envolvem o movimento de íons de potássio para fora da célula. Exemplos desses estímulos incluem cristais de substâncias como ácido úrico e colesterol, certas partículas e agentes que desestabilizam lisossomos. Alguns ativadores específicos, como imiquimod e seu derivado CL097, não precisam de potássio para desencadear uma resposta do inflamasoma. Em vez disso, eles interrompem funções mitocondriais e podem causar mudanças desconhecidas em endossomos.
Essas várias substâncias perturbam o equilíbrio usual dentro das células, mas as maneiras precisas de como fazem isso ainda não são totalmente compreendidas. Elas provavelmente afetam o movimento de um lipídeo chamado fosfatidilinositol 4-fosfato (PI4P) e desestabilizam o tráfego celular normal.
Descobertas Recentes em Tráfego Celular e Ativação do NLRP3
Pesquisas recentes mostraram que vários ativadores do inflamasoma podem interromper o movimento de proteínas dentro das células e afetar como os organelas interagem entre si. Por exemplo, existem locais nas células onde o retículo endoplasmático (RE) encontra outros organelas como o Golgi e endossomos. Esses locais ajudam na transferência de lipídeos entre essas estruturas. Se esses movimentos forem interrompidos, pode levar ao acúmulo de certos lipídeos e proteínas nos endossomos.
Quando certos ativadores do inflamasoma estão presentes, eles podem levar ao acúmulo de PI4P em endossomos, que então traz o NLRP3 para esses locais. O NLRP3 se liga às membranas através de regiões específicas que se ligam ao PI4P, o que significa que ele pode se localizar no Golgi e outras membranas. Modificações no NLRP3 de várias maneiras podem aumentar sua ligação a essas membranas.
Remover a área que se liga ao PI4P torna o NLRP3 incapaz de ativar, mas restaurar essa área de ligação por outros meios pode reverter sua habilidade de ativação. Além disso, bloquear o acúmulo de PI4P ou promover sua degradação pode impedir a ativação do NLRP3. Essas observações apoiam a ideia de que os endossomos são importantes para a ativação do NLRP3 e que certas interações lipídicas são necessárias para seu funcionamento adequado.
Investigando Organelas e Interações de Proteínas
Para entender como os ativadores do inflamasoma NLRP3 perturbam as funções normais da célula, os pesquisadores desenvolveram inventários detalhados de proteínas em organelas-chave tanto em repouso quanto quando respondendo a diferentes tipos de ativadores do NLRP3. Eles descobriram que esses ativadores causam mudanças significativas no movimento de proteínas dentro das células, refletindo distúrbios nos processos celulares normais.
Ao monitorar como o NLRP3 se move em resposta a ativadores, os pesquisadores descobriram que o NLRP3 rapidamente perde contato com o RE e, em vez disso, interage mais com actina e proteínas relacionadas a endossomos. Isso sugere que o NLRP3 forma o complexo do inflamasoma a partir de endossomos ricos em PI4P quando os contatos habituais com o RE são perdidos.
Mudanças nas Proteínas e Funções Celulares em Resposta a Estímulos
A pesquisa analisou como a composição geral de proteínas das células muda quando tratadas com ativadores do NLRP3. Embora apenas algumas proteínas mostrassem mudanças significativas nas quantidades, duas proteínas conhecidas como CDC25A e CDC25B diminuíram em ambas as condições de tratamento. Essas proteínas ajudam a controlar o ciclo celular, e sua redução poderia levar a pausas no ciclo celular em resposta ao estresse.
Os investigadores também exploraram se os tratamentos causaram mudanças globais nas organelas celulares, revelando uma reorganização em larga escala dentro dessas estruturas. Por exemplo, descobriram que nigericina e outro ativador, CL097, geraram mudanças distintas em várias organelas, especialmente nos lisossomos e mitocôndrias.
O Papel dos Lisossomos e Mitocôndrias
Os lisossomos são conhecidos por desempenharem um papel no processo de ativação do inflamasoma NLRP3. Agentes que prejudicam lisossomos podem ativar o NLRP3, e os pesquisadores buscaram entender os padrões gerais associados ao dano lisossomal durante essas respostas. Eles usaram métodos específicos para examinar o proteoma lisossomal e descobriram que tanto nigericina quanto CL097 não pareciam desestabilizar a marcação de marcadores lisossomais, sugerindo que a integridade lisossomal foi mantida apesar da ativação.
Por outro lado, a atividade mitocondrial também influencia a ativação do NLRP3. Os pesquisadores exploraram como os ativadores remodelam o proteoma mitocondrial. Eles descobriram que algumas proteínas associadas a respostas antioxidantes foram reduzidas, sugerindo que a saúde mitocondrial pode estar conectada às respostas do inflamasoma.
Investigando Mudanças Endossomais
Dado que se pensa que o inflamasoma NLRP3 co-localiza com marcadores endossomais, os pesquisadores investigaram como os ativadores do inflamasoma impactam o tráfego endossomal. Eles descobriram que tanto nigericina quanto CL097 causaram alterações significativas no comportamento das proteínas endossomais. Algumas proteínas envolvidas no tráfego endossomal foram enriquecidas após o tratamento, demonstrando que essas vias sofrem mudanças em larga escala durante a ativação do NLRP3.
Essas descobertas ilustram que os sinais desencadeados por agonistas do NLRP3 podem perturbar os padrões normais de tráfego dentro das células, propondo um vínculo direto entre a dinâmica endossomal e a ativação do inflamasoma.
Remodelação do Golgi e Ativação do NLRP3
O aparato de Golgi é outro organela-chave no processo de ativação do NLRP3. Os pesquisadores examinaram como nigericina e CL097 influenciam o proteoma do Golgi. As descobertas indicaram que ambos os tratamentos causaram mudanças na composição e dinâmica das proteínas associadas ao Golgi. Essa desestabilização sugere que o Golgi pode desempenhar um papel em como o NLRP3 se reúne e responde a sinais inflamatórios.
Análise Espaciotemporal das Interações NLRP3 e PI4P
Para entender melhor como o NLRP3 interage com outras proteínas e organelas, os pesquisadores usaram técnicas avançadas para monitorar como o NLRP3 trafega durante a ativação do inflamasoma. Eles descobriram que, ao serem ativados, o NLRP3 interage com proteínas de uma maneira que reflete seu movimento em direção aos locais onde a montagem do inflamasoma ocorre.
Usando biossensores especializados, eles rastrearam como o NLRP3 interage com o PI4P, sugerindo que esse lipídeo desempenha um papel crucial no processo de montagem. Os resultados confirmaram que, conforme o NLRP3 é ativado, ele se afasta do RE e se envolve com proteínas associadas ao citoesqueleto e endossomos.
Analisando Proteínas Próximas ao NLRP3
Os pesquisadores buscaram construir uma compreensão mais abrangente das proteínas que cercam o NLRP3 durante sua ativação. Ao empregar técnicas que rotulavam seletivamente proteínas próximas, eles puderam identificar quais proteínas se tornaram proximais ao NLRP3 em condições inflamatórias. Muitos interatores conhecidos aumentaram sua proximidade ao NLRP3, apoiando a conclusão de que essas interações são importantes para a atividade do inflamasoma.
Conclusão
Entender como o inflamasoma NLRP3 responde a ameaças é crucial para desenvolver estratégias para enfrentar várias doenças inflamatórias. As descobertas destacam a importância das interações entre organelas e modificações nas proteínas na regulação da atividade do NLRP3. A exploração adicional desses mecanismos pode revelar novas alvos para terapias contra doenças ligadas à ativação inadequada do inflamasoma. Ao expandir nosso conhecimento sobre como o NLRP3 e seus interatores funcionam em resposta a diferentes estímulos, os pesquisadores podem entender melhor as complexidades das respostas imunológicas e suas implicações para a saúde e a doença.
Título: Spatiotemporal proteomic profiling of cellular responses to NLRP3 agonists
Resumo: Nucleotide-binding domain and leucine-rich repeat pyrin-domain containing protein 3 (NLRP3) is an innate immune sensor that forms an inflammasome in response to various cellular stressors. Gain-of-function mutations in NLRP3 cause autoinflammatory diseases and NLRP3 signalling itself exacerbates the pathogenesis of many other human diseases. Despite considerable therapeutic interest, the primary drivers of NLRP3 activation remain controversial due to the diverse array of signals that are integrated through NLRP3. Here, we mapped subcellular proteome changes to lysosomes, mitochondrion, EEA1-positive endosomes, and Golgi caused by the NLRP3 inflammasome agonists nigericin and CL097. We identified several common disruptions to retrograde trafficking pathways, including COPI and Shiga toxin-related transport, in line with recent studies. We further characterized mouse NLRP3 trafficking throughout its activation using temporal proximity proteomics, which supports a recent model of NLRP3 recruitment to endosomes during inflammasome activation. Collectively, these findings provide additional granularity to our understanding of the molecular events driving NLRP3 activation and serve as a valuable resource for cell biological research. We have made our proteomics data accessible through an open-access Shiny browser to facilitate future research within the community, available at: https://harperlab.connect.hms.harvard.edu/inflame/. We will display anonymous peer review for this manuscript on pubpub.org (https://harperlab.pubpub.org/pub/nlrp3/) rather than a traditional journal. Moreover, we invite community feedback on the pubpub version of this manuscript, and we will address criticisms accordingly.
Autores: J. Wade Harper, L. R. Hollingsworth, P. Veeraraghavan, J. A. Paulo
Última atualização: 2024-04-20 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590338
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590338.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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