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Entendendo os Receptores NLR das Plantas e Suas Funções

Um olhar sobre como os receptores NLR ajudam as plantas a combater infecções.

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Receptores NLR na DefesaReceptores NLR na Defesadas Plantasimunes das plantas.NLRs têm um papel chave nas respostas
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As plantas têm um sistema complexo pra se defender de infecções causadas por patógenos como bactérias, fungos e vírus. Uma parte crucial desse sistema é chamada de Receptores Nucleotide-binding e leucine-rich repeat (NLR). Esses receptores funcionam como sensores que detectam substâncias nocivas dos patógenos e acionam uma série de respostas protetivas.

Quando um patógeno ataca, ele costuma liberar certas proteínas-chamadas Efetores-dentro das células das plantas pra atrapalhar o funcionamento normal. Pra combater isso, os NLRS das plantas conseguem identificar esses efetores e ativar respostas imunológicas. Em outros organismos, tanto simples quanto complexos, os NLRs também podem se juntar pra formar complexos proteicos maiores e melhorar a resposta imunológica.

Tipos de Receptores NLR nas Plantas

Os receptores NLR podem agir sozinhos ou em pares. Alguns deles são conhecidos como "singleton", onde um receptor lida tanto com a detecção do efetor quanto com a iniciação da resposta imunológica. Outros funcionam em arranjos de ordem superior, como pares de receptores ou redes. No caso de pares de receptores, um receptor detecta o patógeno, enquanto o outro ajuda a ativar as respostas imunológicas.

Apesar da nossa compreensão de como esses receptores reagem aos patógenos, ainda tem muita coisa que a gente não sabe sobre suas estruturas e como eles trabalham juntos. A maior parte do nosso conhecimento vem do estudo de receptores individuais, mas precisamos aprender mais sobre como eles interagem em pares ou redes.

Estrutura dos Receptores NLR

Os NLRs geralmente têm três partes principais: um domínio de sinalização N-terminal, uma parte central que se liga a nucleotídeos e uma série de repetições no final. Nos NLRs das plantas, a parte central é chamada de módulo NB-ARC. Esse módulo é crucial porque ajuda a mudar o receptor de uma forma inativa para uma ativa.

Os domínios N-termais dos NLRs das plantas podem variar, e eles ajudam a classificar diferentes tipos de receptores. Dois tipos comuns encontrados nas plantas são os domínios tipo coiled-coil (CC) e tipo toll-interleukin receptor (TIR).

Como os NLRs Funcionam Juntos

Nas plantas, dois NLRs específicos, AtZAR1 e TmSr35, mostraram que funcionam juntos como estruturas pentaméricas, ou seja, consistem em cinco subunidades ligadas. Quando ativados, essas estruturas se inserem na membrana da célula da planta, levando a uma entrada de íons de cálcio e desencadeando uma resposta de morte celular, ajudando a parar a propagação da infecção.

Por outro lado, pares de NLRs, como Roq1 e RPP1, mostraram funcionar de maneira diferente. Esses receptores formam estruturas tetraméricas que ativam NLRs auxiliares produzindo pequenas moléculas. No entanto, não se sabe muito sobre sensores ou ajudantes do tipo CC ativados.

Evolução dos NLRs

Os NLRs têm uma longa história evolutiva. Pesquisas mostram que dois domínios N-termais CC específicos, tipo RPW8 e tipo G10, foram identificados em plantas com flores. Além disso, alguns NLRs do tipo CC típicos pertencem a uma família mais ampla chamada MADA-CC-NLRs. A diversidade desses domínios N-termais sugere que eles desempenham um papel crucial em como os receptores NLR sinalizam e respondem a infecções.

Características Únicas dos NLRs em Asterídeas

As asterídeas são um grande grupo de plantas com flores que têm um conjunto diversificado de receptores imunológicos. Entre eles estão várias proteínas importantes de resistência a doenças que ajudam a combater vários patógenos. Pesquisas mostraram que, nas asterídeas, os NLRs sensores podem sinalizar redundantemente por meio de uma rede de proteínas auxiliares MADA-type CC-NLR, conhecidas como NRCs.

Dentro dessa rede, quando um NLR sensor detecta um efetor, ele passa por uma mudança que permite ativar os NLRs auxiliares. Essa ativação leva à montagem de complexos oligoméricos que iniciam respostas imunológicas.

Insights de Estudos Recentes

Pesquisas recentes avançaram bastante na compreensão da estrutura e função dos receptores NLR. Uma descoberta importante foi a estrutura do NbNRC2, um NLR auxiliar da planta Nicotiana benthamiana. Os pesquisadores usaram técnicas avançadas, como microscopia eletrônica criogênica (cryo-EM), pra analisar a estrutura do NbNRC2 quando ativado por um patógeno.

Eles descobriram que, ao ser ativado pela proteína de resistência a doenças Rx, o NbNRC2 forma um resistossomo hexamérico-um complexo feito de seis subunidades. Essa descoberta é diferente das estruturas anteriormente relatadas de outros CC-NLRs, que geralmente formavam complexos pentaméricos. Notavelmente, o NbNRC2 não inclui a proteína sensor Rx, fornecendo evidências para o modelo de ativação e liberação das interações dos NLRs.

Características Estruturais do NbNRC2

O resistossomo hexamérico do NbNRC2 tem uma estrutura única, com cada um de seus seis componentes interagindo através de interfaces específicas. Essas interações estabilizam a estrutura geral e são cruciais pra sua função. Os pesquisadores identificaram regiões-chave dentro do resistossomo, incluindo uma cavidade central onde foi encontrado que ATP-uma molécula de energia importante-estava ligado, indicando seu potencial papel em manter a estrutura.

Além disso, várias interações entre protômeros foram encontradas pra estabilizar o hexâmero do NbNRC2. Isso incluiu os domínios NB, que foram encontrados com pontos de interação distintos que são essenciais pra estabilidade do resistossomo.

Diferenças na Estrutura e Função Entre NLRs

Uma comparação entre o NbNRC2 e outros Resistossomos NLR conhecidos, como o AtZAR1, revelou diferenças notáveis. O NbNRC2 tem um diâmetro de poro mais amplo e uma disposição diferente dos seus domínios proteicos, o que influencia sua funcionalidade e a dinâmica de como interage com outros componentes celulares.

A arquitetura distinta do NbNRC2 sugere que o tamanho do seu poro pode afetar como íons e outras moléculas se movem dentro e fora da célula, potencialmente impactando a resposta imunológica geral. Isso destaca a importância funcional das variações estruturais entre os NLRs.

Contribuição do AlphaFold para a Pesquisa de NLR

Ferramentas computacionais avançadas, como o AlphaFold 3, permitiram que os pesquisadores previssem as estruturas dos complexos NLR, incluindo o NbNRC2. Ao modelar essas proteínas, os cientistas ganharam insights sobre suas possíveis interações e funções dentro da imunidade das plantas. As previsões do AlphaFold mostraram altos níveis de confiança e correspondem bem a estruturas determinadas experimentalmente.

A inclusão de lipídios nos modelos do AlphaFold também forneceu insights sobre como os NLRs podem interagir com membranas celulares, um aspecto importante de sua funcionalidade. Essa abordagem pode ajudar a preencher lacunas na nossa compreensão das estruturas dos NLRs que antes estavam não resolvidas em estudos experimentais.

Direções Futuras na Pesquisa de NLR

À medida que a pesquisa avança, uma maior compreensão de como os NLRs se montam e funcionam vai surgir. Explorar a dinâmica desses receptores imunológicos em diferentes estados de ativação fornecerá insights críticos sobre seus papéis na imunidade das plantas.

Ainda há muitas perguntas sobre como diferentes NLRs interagem, se eles podem formar várias estruturas e como isso afeta suas respostas imunológicas. Além disso, o potencial impacto de lipídios e membranas celulares nas interações dos NLR é uma área que tá pronta pra ser estudada.

A diversidade de estruturas e mecanismos que os NLRs exibem sugere que pode haver muitos mais tipos de resistossomos esperando pra serem descobertos. O uso contínuo de modelagem avançada e técnicas experimentais provavelmente vai revelar novos aspectos da funcionalidade dos NLRs e sua importância na saúde das plantas e resistência a doenças.

Conclusão

Os NLRs das plantas são essenciais pra se defender contra patógenos. Descobertas recentes melhoraram a compreensão de suas estruturas, especialmente em relação à formação de resistossomos e como eles interagem com outros componentes imunológicos. O quadro em evolução da funcionalidade dos NLRs destaca sua diversidade e adaptabilidade, oferecendo perspectivas empolgantes pra novas pesquisas em biologia vegetal e imunologia.

Fonte original

Título: A disease resistance protein triggers oligomerization of its NLR helper into a hexameric resistosome to mediate innate immunity

Resumo: NRCs are essential helper NLR (nucleotide-binding domain and leucine-rich repeat) proteins that execute the immune response triggered by disease resistance proteins, also known as sensor NLRs. The structure of the resting state of NbNRC2 was recently revealed to be a homodimer. However, the sensor-activated state has not yet been elucidated. In this study, we used cryo-EM to determine the structure of sensor-activated NbNRC2, which forms a hexameric inflammasome-like structure known as resistosome. To confirm the functional significance of the hexamer, we mutagenized the interfaces involved in oligomerization and found that mutations in three nucleotide-binding domain interface residues abolish oligomerization and immune signalling. Comparative structural analyses between the resting state NbNRC2 homodimer and the sensor-activated homohexamer revealed significant structural rearrangements before and after activation, providing insights into NLR activation mechanisms. Furthermore, structural comparisons between the NbNRC2 hexamer and previously reported CC-NLR pentameric assemblies revealed features in NbNRC2 that allow for the integration of an additional protomer. We also used the NbNRC2 hexamer structure to assess the recently released AlphaFold 3 for the prediction of activated CC-NLR oligomers. This revealed that AlphaFold 3 allows for high-confidence modelling of the N-terminal 1-helices of NbNRC2 and other CC-NLRs, a region that has proven difficult to fully resolve using structural approaches. Overall, our work sheds light on the structural and biochemical mechanisms underpinning NLR activation and expands our understanding of NLR structural diversity.

Autores: Sophien Kamoun, J. Madhuprakash, A. Toghani, M. P. Contreras, A. Posbeyikian, J. Richardson, J. Kourelis, T. O. Bozkurt, M. W. Webster

Última atualização: 2024-06-19 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599586

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599586.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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