Tecnologia de SIM acessível para pesquisa biológica
Novas soluções de código aberto tornam a microscopia de fluorescência mais acessível para os pesquisadores.
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Índice
- Desafios nas Técnicas de Imagem Atuais
- Entendendo a Microscopia de Iluminação Estruturada
- Desenvolvimentos Recentes na Microscopia de Iluminação Estruturada
- A Necessidade de Soluções de Código Aberto
- Solução Proposta de Baixo Custo
- Imagem Multicolorida com Tecnologia DMD
- Principais Recursos da Nossa Configuração
- Automação e Facilidade de Uso
- Desempenho e Resultados
- Capacidades de Imagem de Células Vivas
- Conclusão: Tornando a Imagem Avançada Acessível
- Considerações Finais
- Fonte original
A microscopia de fluorescência é um método chave usado para estudar processos biológicos de perto, até na escala de micrômetros. Mudou a forma como os pesquisadores enxergam as ciências da vida. No entanto, ainda tem uns desafios que limitam nossa capacidade de ver grandes áreas com detalhes claros e em velocidades rápidas. Ferramentas de imagem mais novas foram criadas pra ajudar com esses desafios, mas muitas vezes exigem muito conhecimento técnico e podem ser bem caras pra laboratórios típicos de ciências biológicas.
Desafios nas Técnicas de Imagem Atuais
A pesquisa, especialmente em imagem óptica, tá pedindo mais detalhes, áreas maiores e análises mais rápidas. Isso é crucial pra entender como os vírus interagem com seus hóspedes ou como nosso sistema imunológico funciona. Infelizmente, muitos dispositivos de ponta exigem habilidades técnicas altas pra configurar ou operar. Outros que estão disponíveis comercialmente têm preços altos, tornando difícil reutilizar equipamentos já existentes.
Pra conseguir uma Resolução melhor além do chamado limite de difração, muitos pesquisadores criaram novos métodos nos últimos vinte anos. Esses métodos incluem várias técnicas que muitas vezes precisam de corantes fluorescentes específicos e altas intensidades de luz. Isso pode prejudicar células vivas, dificultando a visualização do comportamento celular em tempo real.
Microscopia de Iluminação Estruturada
Entendendo aA microscopia de iluminação estruturada (SIM) é um desses métodos. É uma técnica de imagem de campo amplo que pode melhorar a resolução em até 2x. Ela precisa de menos fótons do que outros métodos, o que a torna ótima pra imagem de células vivas, pois causa menos danos. A SIM funciona projetando padrões de luz em amostras fluorescentes e capturando imagens de diferentes posições. Esses dados são então processados em um computador pra criar uma imagem final mais clara.
Embora a SIM tenha um limite teórico de resolução semelhante ao de um microscópio confocal, ela oferece uma melhor relação sinal-ruído, especialmente ao olhar pra detalhes finos. Isso significa que consegue capturar imagens mais nítidas dos detalhes que queremos estudar.
Desenvolvimentos Recentes na Microscopia de Iluminação Estruturada
Desde a introdução da SIM, muitos melhoraram suas capacidades usando padrões de luz diferentes pra simplificar montagens ou agilizar a coleta de dados. Avanços recentes incluem o uso de algoritmos inteligentes como aprendizado profundo pra processar imagens mais rápido, ou chips fotônicos e outras ferramentas criativas pra gerar padrões de luz.
No entanto, muitos dos métodos existentes hoje, como aqueles que usam componentes ópticos caros, ainda podem ser muito complexos pra laboratórios que não são especializados em óptica. Isso deixa muitos pesquisadores sem conseguir aproveitar esses métodos poderosos de imagem.
A Necessidade de Soluções de Código Aberto
O campo da "Microscopia Aberta" busca resolver esses problemas, fornecendo planos fáceis de seguir pra criar seus próprios sistemas de imagem. Isso ajuda a manter os custos baixos pros laboratórios que tentam acessar métodos avançados de imagem. Nosso trabalho contribui pra esse objetivo desenvolvendo um complemento SIM de baixo custo que pode ser anexado a microscópios comerciais.
Ao tornar o equipamento acessível e barato, ajudamos cientistas a responder perguntas críticas em suas pesquisas sem precisar gastar uma fortuna em equipamentos de alto nível.
Solução Proposta de Baixo Custo
Nossa abordagem inovadora envolve criar um complemento SIM que funcione com microscópios de fluorescência comuns. Esse complemento é feito de componentes baratos e inclui o software necessário pra operação. Fornecemos instruções detalhadas e materiais de suporte, garantindo que os laboratórios possam replicar e se beneficiar do nosso design.
Nosso sistema SIM utiliza um dispositivo de microespelhos digitais (DMD) pra criar padrões de luz estruturada. Esse sistema promete melhorar a resolução em até 1,5 vezes melhor do que os métodos tradicionais. Com documentação clara e um processo de configuração fácil, esperamos quebrar as barreiras que mantiveram muitos cientistas longe das técnicas de super-resolução.
Imagem Multicolorida com Tecnologia DMD
Um DMD é um dispositivo que pode gerar padrões de luz usando espelhos minúsculos. Geralmente, é encontrado em projetores e foi usado recentemente em várias aplicações científicas. Um dos desafios com DMDs é que eles são principalmente projetados pra tipos específicos de luz, o que torna complicado usá-los com múltiplas cores.
Pra superar isso, desenvolvemos uma forma de usar DMDs pra imagem multicolorida. Ao planejar cuidadosamente os ângulos da luz que entra e sai, conseguimos minimizar os problemas que surgem ao tentar usar mais de uma cor de uma só vez.
Nosso objetivo é garantir que tanto a luz de 488 nm quanto a de 635 nm possam ser usadas efetivamente, permitindo que os pesquisadores apliquem diferentes corantes fluorescentes pra observar vários processos biológicos.
Principais Recursos da Nossa Configuração
O design do nosso complemento SIM é compacto e adaptável, permitindo que funcione com uma ampla gama de microscópios existentes. A configuração do hardware visa equilibrar custo, facilidade de uso e a capacidade de alcançar uma resolução melhorada. Temos uma carcaça projetada sob medida que mantém todos os componentes no lugar, o que torna a montagem simples e minimiza o tempo necessário para o alinhamento.
Usamos dois lasers diferentes que emitem luz em 488 nm e 635 nm. Essas entradas podem ser controladas pra ajustar sua potência, aprimorando as capacidades de imagem. A configuração utiliza várias lentes e espelhos pra alinhar a luz com precisão pra uma imagem ideal.
Automação e Facilidade de Uso
Programamos nosso sistema pra funcionar em tempo real. Isso significa que, enquanto os pesquisadores observam experimentos com células vivas, podem ver imagens de alta resolução quase instantaneamente. Pra garantir que tudo funcione direitinho, nosso sistema é controlado por um software amigável que sincroniza todos os componentes de hardware envolvidos no processo de imagem.
Pro software, construímos um plugin que permite que os pesquisadores comecem e controlem experimentos facilmente por uma interface gráfica. Diferentes algoritmos pra reconstruir imagens a partir de dados brutos já estão integrados, facilitando a visualização dos resultados logo após a coleta de dados.
Desempenho e Resultados
Nossa configuração foi testada usando amostras biológicas, e encontramos um aumento significativo na resolução com a técnica SIM em comparação aos métodos padrão. Usando padrões de luz específicos, conseguimos alcançar uma resolução de cerca de 120 nm, uma melhoria notável em relação ao que era tradicionalmente possível.
Além de uma melhor resolução, nossa configuração permite imagens mais claras de estruturas celulares ao reduzir o ruído de fundo. Isso é uma melhoria crucial pra quem estuda células, pois proporciona uma visão mais clara dos detalhes intrincados da anatomia celular.
Capacidades de Imagem de Células Vivas
Uma das características mais marcantes da nossa configuração é sua capacidade de realizar imagens de células vivas. Projetamos nosso sistema pra manter células vivas a uma temperatura constante, o que é crítico pra observar processos biológicos com precisão ao longo do tempo.
Em testes, capturamos sequências em tempo real de células vivas. Os resultados mostraram uma visão muito melhor da atividade celular em comparação com a imagem de campo amplo padrão. As capacidades de seccionar óptica da SIM tornaram mais fácil ver estruturas específicas dentro das células, fornecendo insights sobre como elas se comportam em seu ambiente natural.
Conclusão: Tornando a Imagem Avançada Acessível
Acreditamos que nosso complemento SIM de código aberto representa um passo importante pra tornar técnicas avançadas de imagem disponíveis pra mais pesquisadores. Ao reduzir custos e simplificar o processo de configuração, podemos garantir que mais laboratórios acessem capacidades de imagem de super-resolução.
Esse projeto oferece uma forma pra muitos grupos de pesquisa atualizarem seus microscópios existentes sem precisar de vasta expertise óptica ou orçamentos altos. Promovendo a colaboração e compartilhando conhecimentos, esperamos melhorar a qualidade da pesquisa científica nas ciências da vida e fornecer ferramentas valiosas pra estudar questões biológicas complexas.
Considerações Finais
A microscopia de fluorescência é uma ferramenta poderosa na pesquisa biológica, mas o acesso às técnicas avançadas de imagem tem sido limitado por custo e complexidade. Nossa abordagem oferece uma solução prática que não só melhora as capacidades de imagem, mas também torna ferramentas de pesquisa de alta qualidade disponíveis pra mais pessoas. Com desenvolvimentos constantes, estamos animados pra ver como essa tecnologia pode continuar a evoluir e beneficiar a comunidade científica.
Título: Fully-Automated Multicolour Structured Illumination Module for Super-resolution Microscopy
Resumo: In the rapidly advancing field of biological imaging, there is a great need for high-resolution imaging techniques that are both cost-effective and accessible, for example to better observe and understand dynamics in intracellular processes. Structured illumination microscopy (SIM) is the method of choice to achieve high axial and lateral resolution in living samples due to its optical sectioning and minimal phototoxicity. However, the high cost and complexity of conventional SIM systems limit their wide application. In our work, we present an open-source, fully-automated, two-color structured illumination module that is compatible with commercially available microscope stands. The compact design, consisting of low-cost single-mode fiber-coupled lasers and a digital micromirror device (DMD), is integrated into the open-source acquisition and control software (ImSwitch) in order to realize real-time super-resolution imaging. This developed system achieves up to a 1.55-fold improvement in lateral resolution compared to conventional wide-field microscopy. To rationally design this module, we developed a model to ensure optimal DMD diffraction per-formance using tilt and roll pixels, thus covering a wide range of low-cost video projectors for use in coherent SIM setups. Our goal is to democratize SIM-based super-resolution microscopy by providing both comprehensive open-source documentation and a modular software framework that works with various hardware components (e.g. cameras, stages) and reconstruction algorithms. In this way, we try to upgrade as many devices as possible to the super-resolution realm.
Autores: Benedict Diederich, H. Wang, P. T. Brown, J. Ullom, D. P. Shepherd, R. P. Heintzmann
Última atualização: 2024-07-08 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.04.601961
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.04.601961.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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