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# Biologia# Microbiologia

A Jornada das Bactérias do Solo para as Folhas

Pesquisas mostram como as bactérias colonizam as folhas das plantas e impactam o crescimento.

Matthew T. Agler, T. Mayer, E. Teutloff, K. Unger, P. Lehenberger

― 8 min ler


Bactérias nas Folhas dasBactérias nas Folhas dasPlantasbacteriana afeta a saúde das plantas.Estudo revela que a colonização
Índice

As folhas das Plantas são lar de muitos organismos minúsculos, incluindo Bactérias, fungos e outros micróbios. Esses organismos trabalham juntos para ajudar as plantas a sobreviver em situações difíceis, como seca, doenças e ataques de insetos. As bactérias nas folhas das plantas desempenham um papel essencial na proteção das plantas contra micróbios do solo e doenças. Embora o solo esteja cheio de vários micróbios, apenas um número pequeno realmente chega até as plantas. Atravessar do solo para as folhas das plantas não é fácil para essas bactérias. Elas enfrentam muitos desafios ao tentar colonizar o tecido das plantas.

Quando uma semente germina, as primeiras partes a crescer são a raiz e os cotilédones, que são as folhas iniciais. As folhas verdadeiras se desenvolvem depois. Para as bactérias do solo chegarem às folhas, elas precisam superar vários fatores no solo, competir por espaço e estabelecer uma comunidade nas folhas ou dentro delas. As primeiras fases dessa transição são cruciais, mas ainda não sabemos tudo sobre como funcionam.

Montagem da Comunidade Microbiana

As Comunidades microbianas se formam em vários ambientes, e o acaso tem um papel significativo em como elas se juntam. No contexto das plantas, esse acaso significa que um espaço pode ser preenchido por várias bactérias que conseguem sobreviver de maneira semelhante. Essa aleatoriedade pode ser essencial nas fases iniciais, quando as bactérias se movem do solo para as plantas jovens. Enquanto isso, uma vez que as folhas da planta se desenvolvem, fatores específicos começam a determinar quais bactérias estarão presentes. As interações entre a planta e seu ambiente influenciam muito as comunidades encontradas em folhas maduras.

Muitas vezes, a quantidade de bactérias específicas encontradas nas folhas corresponde à quantidade delas no solo, sugerindo que o acaso tem um papel. Mas algumas diferenças na comunidade podem ser explicadas pelas características únicas da planta. Novas tecnologias ajudam os pesquisadores a estudar essas comunidades e os efeitos do acaso em comparação com fatores específicos nas populações bacterianas nas plantas.

As interações entre as bactérias também podem moldar como as comunidades se formam. Por exemplo, patógenos que chegam cedo podem mudar como o sistema imunológico da planta responde, permitindo que outras bactérias se instalem. Alguns colonizadores iniciais podem absorver nutrientes vitais ou ocupar espaços favoráveis, influenciando quais bactérias podem se juntar depois.

Visão Geral do Experimento

Para aprender mais sobre como as bactérias se movem do solo para as folhas, os pesquisadores realizaram experimentos usando Arabidopsis thaliana, uma planta comum em estudos. Eles se concentraram em como o momento da Inoculação bacteriana-adicionar bactérias ao solo-afeta as comunidades que se formam nas folhas maduras. Compararam diferentes momentos para adicionar as bactérias: no início, uma semana após a germinação e duas semanas após a germinação. Eles também exploraram como bactérias que começam em números baixos ainda conseguem colonizar as folhas de forma eficiente.

Além disso, para entender melhor como as bactérias interagem, testaram como a adição de uma bactéria específica, conhecida por ser um patógeno oportunista, afeta a montagem da comunidade. Esses experimentos fornecem insights sobre quais nichos certas bactérias ocupam e como esses podem ser gerenciados.

Materiais da Planta

O estudo usou três tipos selvagens de Arabidopsis thaliana: Col-0, NG2 e PB. O Col-0 é um modelo popular para pesquisa, enquanto NG2 e PB vêm de populações selvagens na Alemanha. Os pesquisadores geraram linhagens intimamente relacionadas a partir de sementes individuais de cada tipo.

Experimento do Tempo de Inoculação

Para montar o experimento, os pesquisadores prepararam microcaixas contendo vasos menores. Depois de esterilizá-los, adicionaram água esterilizada para umedecer o solo. As sementes foram limpas e tratadas para promover a germinação. Cada genótipo de planta foi atribuído aleatoriamente a diferentes tempos de inoculação: no início, uma semana depois, ou duas semanas depois. Um grupo não recebeu bactérias vivas.

Para garantir que a única diferença fosse o tempo de introdução das bactérias vivas, outros receberam bactérias tratadas por calor. As plantas foram monitoradas quanto ao crescimento, e amostras foram coletadas em dias específicos para analisar as comunidades bacterianas.

Crescimento e Amostragem

As plantas foram cultivadas em ambientes controlados com temperatura e condições de luz específicas. Ao longo de várias semanas, amostras foram coletadas para estudar o crescimento e as mudanças nas comunidades bacterianas. Na última semana, apenas algumas folhas de cada planta foram amostradas devido ao seu tamanho.

O DNA foi extraído das amostras para análise posterior. A extração de DNA possibilitou estudar as bactérias presentes em diferentes folhas.

Isolamento In-Planta de Bactérias das Folhas

Os pesquisadores coletaram folhas de plantas selvagens para criar inoculo bacteriano. Esse inoculo foi preparado lavando e moendo as folhas, e então misturando-as com uma solução para uso posterior. O inoculo foi diluído para garantir que apenas algumas células fossem introduzidas nas mudas.

As sementes foram limpas, e uma foi plantada em cada poço de uma placa cheia de meio de crescimento. Após duas semanas de crescimento, as folhas foram colhidas e o DNA extraído para identificar as bactérias que colonizaram as folhas.

Experimento de Emenda do Solo com P. viridiflava

Em outro experimento, os pesquisadores prepararam o solo para estudar como uma bactéria específica, Pseudomonas viridiflava 3D9-141, influenciou o crescimento das plantas e as comunidades bacterianas. Os solos foram tratados para criar diferentes ambientes para as plantas. As sementes foram plantadas e as bactérias foram introduzidas em diferentes níveis para observar seus efeitos.

Crescimento das Plantas e Estimativa da Carga Bacteriana

As plantas foram monitoradas regularmente após a germinação, e os brotos foram removidos para análise. Para medir as cargas bacterianas, amostras de folhas foram coletadas, esmagadas e avaliadas quanto à presença de bactérias. Isso incluiu quantificar o número total de bactérias e as cepas específicas introduzidas.

Caracterização da Comunidade Bacteriana

O DNA extraído das folhas foi usado para estudar as comunidades bacterianas. Os pesquisadores amplificaram e sequenciaram partes do DNA bacteriano para identificar diferentes espécies presentes nas folhas.

Eles também analisaram a diversidade dessas comunidades, observando quantos tipos diferentes de bactérias estavam presentes e quão uniformemente as populações estavam distribuídas.

Resultados da Colonização Inicial

A colonização inicial influenciou significativamente as comunidades bacterianas que se desenvolveram nas folhas. O tempo de inoculação importava mais do que dias específicos de amostragem ou tipos de plantas. Plantas inoculadas no início desenvolveram comunidades mais semelhantes em comparação com inoculações posteriores.

Diferentes tipos de plantas mostraram efeitos variados, com mais táxons sendo encontrados em plantas inoculadas mais cedo. Os achados indicam que bactérias iniciais podem moldar toda a comunidade bacteriana nas folhas maduras, levando a comunidades mais diversas e distintas.

Processos Estocásticos e Determinísticos

Embora o acaso tenha desempenhado um grande papel na colonização das folhas pelas bactérias, alguns grupos de bactérias passaram de forma mais determinística. Para muitas bactérias de plantas, os mecanismos de colonização foram influenciados pelo fato de conseguirem chegar cedo ou tarde do solo.

Muitas das bactérias que conseguiram transitar do solo para as folhas tendiam a fazê-lo de forma aleatória. No entanto, algumas tinham características específicas que lhes permitiram prosperar com base em fatores determinísticos. Isso significa que certas condições podem favorecer essas bactérias, permitindo que se estabeleçam no tecido da planta.

O Papel das Interações Bacterianas

As interações entre as bactérias também desempenharam um papel significativo na formação das comunidades. Algumas bactérias foram mais bem-sucedidas na colonização das folhas quando formaram parcerias com outras bactérias. Isso enfatiza a importância das relações entre os micróbios durante os processos de colonização.

Conclusão

Entender como as bactérias se movem do solo para as folhas é vital para aplicar esse conhecimento na agricultura e nos cuidados com as plantas. Esses achados, ricos em detalhes sobre as maneiras intrincadas que as bactérias se estabelecem e prosperam nas plantas, podem guiar esforços para aumentar as populações bacterianas benéficas.

Ao caracterizar como diferentes bactérias respondem a ambientes em mudança e interagem entre si, os pesquisadores podem desenvolver métodos para promover o crescimento saudável das plantas e proteger melhor as plantas de patógenos prejudiciais.

Fonte original

Título: Deterministic colonization arises early during the transition of soil bacteria to the phyllosphere and is shaped by plant-microbe interactions.

Resumo: BackgroundUpon seed germination, soil bacteria are activated to transition to the plant and eventually colonize mature tissues like leaves. These bacteria are poised to significantly influence plant health, but we know little about their colonization routes. We studied the mechanisms of the transition of soil bacteria to germinating plants and leaves by experimentally manipulating inoculation times and using in-planta isolation to understand bacteria that can make the complex soil-to-leaf transition. Using a trackable, labeled Pseudomonas viridiflava (Pv3D9) amended to soil, we tested how plant-microbe-microbe interactions shape assembly mechanisms in natural soil communites. ResultsWe found that the stages of the transition of bacteria from soil to leaves before true leaf emergence were important in establishing uniquely diverse leaf bacteriomes. A wide diversity of leaf-associated taxa can individually make this transition, but most are still shaped by stochastic processes. Interestingly, deterministic processes drove some important taxa only when they transitioned from soil to leaves, but not when they were inoculated later. The opportunistic pathogen Pv3D9 promoted plant growth in a natural soil, likely by activating plant immunity. These effects in turn strongly affected the soil-to-leaf transition of almost strictly taxa that colonized deterministically, demonstrating the important role of plant-microbe-microbe interactions in controlling deterministic processes. ConclusionsDiverse, well-adapted bacterial taxa make the soil-to-leaf transition during natural colonization resulting in characteristic diversity in healthy leaf microbiomes. The domination of stochastic mechanisms during this colonization indicates that many taxa must strongly compete to establish their niche. During this complex transition, however, specific important taxa emerge that are driven by deterministic processes, suggesting they occupy unique niches. The malleability of these processes suggests that they may be controlled, for example by targeted soil manipulations. This finding is significant given the important roles of these bacteria in plant health and offers directions forward for engineering beneficial plant microbiomes.

Autores: Matthew T. Agler, T. Mayer, E. Teutloff, K. Unger, P. Lehenberger

Última atualização: 2024-10-24 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.24.619992

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.24.619992.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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