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Il Ruolo delle Cianobatteri nella Natura

Le cianobatteri sono microorganismi fondamentali con ruoli ecologici importanti e relazioni diverse.

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Le Cianobatteri sono un tipo di batteri che possono fare fotosintesi, il processo che permette alle piante e a certi batteri di trasformare la luce solare in energia. Sono in giro da tantissimo tempo, con fossili che mostrano che esistevano quasi 1,9 miliardi di anni fa. Oggi puoi trovare i cianobatteri in tutto il mondo, in posti come oceani, laghi, deserti, e anche in climi molto freddi o caldi.

Questi piccoli organismi hanno sviluppato modi per sopravvivere in condizioni difficili. Ad esempio, possono resistere a situazioni di estrema secchezza, sopportare calore e freddo intensi, tollerare ambienti salati e difendersi da germi dannosi. Tuttavia, i cianobatteri possono anche creare problemi sia per la natura che per la salute umana. Quando crescono in grandi quantità, possono rilasciare tossine dannose nell'acqua che possono influenzare le forniture di acqua potabile.

I cianobatteri non sono solo dannosi; svolgono anche ruoli importanti in vari ecosistemi. Le ricerche mostrano che questi batteri spesso hanno alleanze con altre forme di vita, come piante e funghi. Queste alleanze si chiamano relazioni simbiotiche.

Importanza delle Relazioni Simbiotiche

Uno degli eventi storici più significativi che coinvolgono i cianobatteri è quando formarono un'alleanza con un altro tipo di cellula circa 2,1 miliardi di anni fa. Questa relazione portò allo sviluppo dei cloroplasti, che sono le parti delle cellule vegetali che effettuano la fotosintesi. A causa di questo, molte piante oggi si affidano ai cianobatteri per l'energia.

I cianobatteri possono vivere con una varietà di organismi, comprese creature microscopiche (protisti), animali più grandi (metazoi), funghi e alghe. Forniscono molti benefici ai loro ospiti, come nutrienti importanti e energia. I modi in cui vivono insieme possono variare molto. Ad esempio, alcuni si attaccano alla superficie di altre piante, mentre altri vivono dentro le cellule del loro ospite.

I fossili mostrano che alcune alleanze tra cianobatteri e i loro ospiti esistono da centinaia di milioni di anni. Questo lungo tempo insieme può aver portato a cambiamenti sia nei cianobatteri che nei loro ospiti, rendendoli più adatti a vivere insieme.

Come Comunicano i Cianobatteri

Per funzionare bene con i loro ospiti, i cianobatteri spesso hanno bisogno di modi per inviare e ricevere segnali. Un metodo per questa comunicazione potrebbe coinvolgere sostanze chimiche speciali chiamate Metaboliti secondari. Questi composti non sono necessari per la sopravvivenza dei batteri, ma li aiutano ad interagire con altre specie.

I metaboliti secondari possono avere molti ruoli, come aiutare a proteggere i batteri dai germi o assistere nella formazione di alleanze. È noto che i cianobatteri producono un numero vasto di queste sostanze-oltre 1.100 tipi unici, in effetti. Il loro materiale genetico include spesso molte istruzioni per produrre questi metaboliti secondari.

La varietà di sostanze chimiche prodotte dai cianobatteri può servire a diversi scopi, inclusa la protezione dai raggi solari e la difesa dai predatori. Alcuni chimici aiutano anche nelle loro interazioni con i partner vegetali. Ad esempio, in un tipo di cianobatteri chiamato Nostoc, una sostanza chimica specifica è nota per ridurre la formazione di cellule dannose o infette quando il cianobatterio è vicino a un ospite vegetale.

Ricerca sui Genomi dei Cianobatteri

Gli scienziati hanno studiato il materiale genetico dei cianobatteri per capire meglio come funzionano e interagiscono con l'ambiente circostante. Recentemente, i ricercatori hanno raccolto dati su 1.078 specie di questi batteri da un grande database genetico. Hanno anche incluso 27 genomi aggiuntivi raccolti da licheni, che sono organismi complessi composti da funghi e da alghe o cianobatteri.

Nella loro ricerca, gli scienziati hanno cercato di scoprire da dove provengono questi cianobatteri e quali tipi di ambienti abitano. Li hanno classificati in base a se vivevano liberamente nell'ambiente o avevano una relazione stretta con altri organismi. La maggior parte dei cianobatteri studiati è stata trovata in acqua, mentre solo una piccola parte è stata prelevata da alleanze con altre piante e funghi.

Costruire un Albero Genealogico dei Cianobatteri

Per capire le relazioni all'interno della famiglia dei cianobatteri, i ricercatori hanno costruito un albero genealogico basato sulle loro informazioni genetiche. Questo lavoro aiuta a visualizzare come le diverse specie siano collegate. Hanno scoperto che la maggior parte dei batteri studiati appartiene a gruppi specifici, che riflettono la loro storia evolutiva.

Dopo aver analizzato queste relazioni, gli scienziati hanno trovato che il gruppo più significativo contenente simbionti cianobatterici era la famiglia Nostocaceae. L'albero genealogico ha rivelato vari cladi (o rami) all'interno della famiglia Nostocaceae che corrispondono a diversi tipi di organismi ospiti con cui si associano, come le briofite (muschi), le cicadi (un tipo di pianta) e i licheni.

Funzioni Genetiche nei Cianobatteri Associati agli Ospiti

I ricercatori hanno identificato molti geni all'interno dei genomi cianobatterici che svolgono diverse funzioni, come scomporre nutrienti o produrre sostanze chimiche utili. Hanno analizzato queste funzioni per vedere come variavano tra i cianobatteri liberi e quelli associati agli ospiti.

Hanno scoperto che alcune funzioni chiave, come la Fissazione dell'azoto (il processo di conversione dell'azoto dall'atmosfera in una forma utilizzabile dalle piante), erano più comuni nei cianobatteri che avevano relazioni strette con gli ospiti. Al contrario, alcune funzioni erano meno probabili da trovare in questi batteri simbiotici, suggerendo che i loro ruoli nell'ecosistema possono cambiare a seconda della loro situazione abitativa.

Cluster Genici Biosintetici (BGC)

Lo studio dei cluster genici biosintetici (BGC) ha rivelato come i cianobatteri producono una vasta gamma di metaboliti secondari. Attraverso metodi avanzati, i ricercatori sono stati in grado di identificare 8.815 BGC attraverso i genomi cianobatterici che hanno esaminato.

Hanno trovato che diversi stili di vita-essere liberi o far parte di una relazione con un ospite-avevano un impatto significativo sul numero e sui tipi di BGC. I cianobatteri che vivono in relazioni con altri organismi avevano solitamente meno BGC in totale. Questa tendenza era particolarmente evidente nel caso dei cianobatteri associati alla felce d'acqua Azolla, noti per essere simbionti permanenti.

Diversità nei Simbionti Cianobatterici

I simbionti cianobatterici associati a diversi ospiti mostrano caratteristiche varie nelle loro capacità biosintetiche. Alcuni gruppi di cianobatteri avevano BGC simili condivisi tra organismi liberi e associati a ospiti, mentre altri sembravano unici per ambienti specifici.

Ad esempio, i simbionti trovati negli alberi da frutto avevano una maggiore presenza di determinati tipi di BGC rispetto a quelli trovati nei licheni o nelle cicadi. Questo suggerisce che le pressioni evolutive e i contesti ecologici che circondano i diversi ospiti plasmano la diversità genetica all'interno delle popolazioni cianobatteriche.

Conclusione

I cianobatteri sono microorganismi affascinanti che hanno svolto ruoli cruciali negli ecosistemi per miliardi di anni. La loro capacità di fotosintetizzare, la loro diversità negli ambienti di vita e le loro relazioni complesse con altri organismi evidenziano la loro importanza nella natura.

Lo studio del patrimonio genetico dei cianobatteri rivela una ricchezza di informazioni sulle loro capacità funzionali e sulla natura delle loro interazioni con vari ospiti. La ricerca futura può concentrarsi sull'esplorazione dei ruoli specifici di diversi metaboliti secondari e su come questi batteri si adattano ai loro ambienti, oltre a comprendere meglio le loro complesse relazioni simbiotiche. Attraverso l'analisi continua, possiamo ottenere una maggiore comprensione della storia evolutiva e del significato ecologico dei cianobatteri nel nostro mondo di oggi.

Fonte originale

Titolo: Specialization in Molecular Functions and Secondary Metabolite Production Potential in Cyanobacterial Symbionts

Estratto: Cyanobacteria are globally occurring photosynthetic bacteria notable for their contribution to primary production and their production of toxins which have detrimental impacts on ecosystems. Beyond this, cyanobacteria can form mutualistic symbiotic relationships with a diverse set of eukaryotes, ranging from land plants to fungi. Nevertheless, not all cyanobacteria are found in symbiotic associations suggesting symbiotic cyanobacteria have evolved specializations that facilitate host-interactions. Photosynthetic capabilities, nitrogen fixation, and the production of complex biochemicals are key functions provided by host-associated cyanobacterial symbionts. To explore if additional specializations are associated with such lifestyles in cyanobacteria, we have conducted comparative phylogenomics of molecular functions and of biosynthetic gene clusters (BGCs) in 977 cyanobacterial genomes. Cyanobacteria with host-associated and symbiotic lifestyles were concentrated in the family Nostocaceae, where eight monophyletic clades correspond to specific host taxa. In agreement with previous studies, symbionts are likely to provide fixed nitrogen to their eukaryotic partners. Additionally, our analyses identified chitin metabolising pathways in cyanobacteria associated with specific host groups, while obligate symbionts had fewer BGCs. The conservation of molecular functions and BGCs between closely related symbiotic and free-living cyanobacteria suggests that there is the potential for additional cyanobacteria to form symbiotic relationships than is currently known.

Autori: Robert D. Finn, E. S. Cameron, S. Sanchez, N. Goldman, M. Blaxter

Ultimo aggiornamento: 2024-03-23 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.22.586251

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.22.586251.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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