Comprendere le infezioni da Campylobacter in Australia
Uno sguardo dettagliato alle infezioni da Campylobacter, i loro sintomi e i fattori di rischio in Australia.
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Indice
- Sintomi e gravità dell'infezione da Campylobacter
- Studio su Campylobacter in Australia
- Raccolta di campioni alimentari
- Analisi dei geni batterici
- Identificazione della resistenza agli Antibiotici
- Esame dei Fattori di virulenza
- Età e fattori di salute
- Uso degli Inibitori della Pompa Protonica
- Conclusione sulle infezioni da Campylobacter
- Raccomandazioni per la salute pubblica
- Fonte originale
- Link di riferimento
Campylobacter è una delle principali cause di infezioni batteriche allo stomaco nel mondo. In Australia, i tassi di queste infezioni sono tra i più alti nei paesi sviluppati. La maggior parte dei casi si verifica dopo che le persone mangiano carne contaminata, soprattutto pollo. I sintomi dell'infezione possono variare da leggeri disturbi gastrici e diarrea a forti dolori addominali e feci sanguinolente. Anche se la maggior parte delle persone si riprende da sola, alcuni potrebbero aver bisogno di cure mediche o addirittura di finire in ospedale.
Sintomi e gravità dell'infezione da Campylobacter
Quando qualcuno si ammala di Campylobacter, potrebbe provare vari sintomi. I segnali più comuni includono diarrea, crampi addominali, febbre e nausea. La gravità di questi sintomi può variare molto da persona a persona. Le persone più giovani spesso hanno sintomi più leggeri, mentre gli adulti più anziani o quelli con altri problemi di salute potrebbero sperimentare malattie più gravi e avere maggiori probabilità di essere ricoverati. Molti pazienti riferiscono di assumere farmaci per problemi legati allo stomaco, il che potrebbe influenzare il loro rischio di ammalarsi.
Studio su Campylobacter in Australia
In uno studio recente, i ricercatori hanno esaminato i casi di infezione da Campylobacter in Australia per capire la gravità e i tipi di batteri coinvolti. Hanno raccolto campioni da pazienti e li hanno testati per scoprire quale tipo di Campylobacter stesse causando l'infezione. Hanno anche raccolto informazioni dai pazienti sui loro sintomi, la storia clinica e i farmaci che stavano assumendo.
Per valutare la gravità della malattia, i ricercatori hanno utilizzato un sistema di punteggio che tiene conto di vari fattori come la durata dei sintomi e il numero di volte che una persona ha avuto diarrea. Questo punteggio ha aiutato a classificare i pazienti in categorie di malattia lieve, moderata o grave.
Raccolta di campioni alimentari
I ricercatori hanno anche raccolto campioni di pollo crudo e altre carni dai negozi per vedere se portassero Campylobacter. Dato che il pollo è una delle principali fonti di queste infezioni, si sono concentrati su di esso, insieme agli organi interni (le frattaglie). Questo li ha aiutati a confrontare i batteri trovati negli alimenti con quelli presenti nei pazienti.
Analisi dei geni batterici
Il passo successivo ha coinvolto l'analisi approfondita dei geni dei batteri. I ricercatori hanno estratto il DNA dai campioni e utilizzato un metodo chiamato sequenziamento dell'intero genoma. Questo metodo consente agli scienziati di vedere la composizione genetica completa dei batteri. Confrontando i geni dei batteri da pazienti infetti e quelli provenienti dal cibo, i ricercatori speravano di trovare collegamenti tra i batteri e la gravità della malattia.
Antibiotici
Identificazione della resistenza agliUn aspetto importante dello studio era controllare se i batteri fossero resistenti agli antibiotici. Alcune infezioni richiedono antibiotici per essere trattate, quindi sapere se i batteri possono resistere a questi farmaci è cruciale. I ricercatori hanno scoperto che una piccola percentuale di isolati umani mostrava resistenza agli antibiotici comuni. Tuttavia, la maggior parte dei batteri testati era ancora sensibile al trattamento.
Fattori di virulenza
Esame deiCampylobacter ha alcune caratteristiche, o fattori di virulenza, che lo aiutano a causare malattie. I ricercatori hanno cercato questi fattori nei batteri per vedere se potessero spiegare perché alcune persone si ammalassero più gravemente di altre. Anche se alcuni geni sono stati trovati nella maggior parte dei campioni, altri erano meno comuni. Non è stata trovata una forte relazione tra questi geni e malattia grave. Questo suggerisce che, sebbene alcuni batteri possano avere tratti che li rendono dannosi, questi tratti da soli non prevedono quanto una persona si ammalerà.
Età e fattori di salute
Lo studio ha mostrato che l'età e le condizioni di salute esistenti hanno avuto un grande impatto sulla gravità di un'infezione. I pazienti più anziani e quelli con malattie croniche avevano maggiori probabilità di essere ricoverati in ospedale. Sintomi come febbre e crampi addominali sono stati segnalati in modo diverso tra i gruppi di età. I pazienti più giovani hanno riportato sintomi più gravi, mentre i pazienti più anziani avevano sintomi meno comuni ma tassi di ospedalizzazione più elevati.
Inibitori della Pompa Protonica
Uso degliInteressante, lo studio ha scoperto che un numero significativo di pazienti più anziani aveva usato inibitori della pompa protonica (IPP) prima di ammalarsi. Questi farmaci sono usati per trattare i problemi di acidità gastrica, ma sono stati associati a periodi più lunghi di diarrea in alcuni pazienti. Questo indica che gli IPP potrebbero mettere alcune persone a maggior rischio di infezioni più gravi da Campylobacter.
Conclusione sulle infezioni da Campylobacter
In generale, le infezioni da Campylobacter in Australia hanno mostrato una gamma di sintomi e livelli di gravità. Lo studio ha rivelato che, mentre alcuni batteri avevano tratti che potevano renderli dannosi, fattori genetici specifici non predicevano in modo affidabile la gravità della malattia. I principali fattori per determinare la gravità della malattia erano l'età e le condizioni di salute preesistenti.
Raccomandazioni per la salute pubblica
Per migliorare la comprensione e il controllo delle infezioni da Campylobacter, è necessario un monitoraggio continuo dei batteri sia nella catena alimentare che nei casi umani. L'uso di test genetici avanzati può fornire informazioni utili su come questi batteri si comportano e cambiano nel tempo. Inoltre, le campagne di salute pubblica dovrebbero concentrarsi sulla cottura sicura delle carni, in particolare del pollo, e educare i pazienti sui rischi associati a farmaci come gli IPP.
Gli studi futuri dovrebbero continuare a esplorare le relazioni tra diversi batteri, i loro geni e come influenzano gli esiti sulla salute. Identificare fattori di rischio e modelli aiuterà i fornitori di assistenza sanitaria a essere meglio preparati per gestire le infezioni e trattare efficacemente i pazienti.
Raccogliendo dati completi su Campylobacter, le organizzazioni sanitarie possono lavorare per ridurre i tassi di infezione e migliorare gli esiti di salute per le persone colpite.
Titolo: Genomic and clinical characteristics of campylobacteriosis in Australia
Estratto: Campylobacter spp. are a common cause of bacterial gastroenteritis in Australia, primarily acquired from contaminated meat. We investigated the relationship between genomic virulence characteristics and the severity of campylobacteriosis, hospitalisation, and other host factors. We recruited 571 campylobacteriosis cases from three Australian states and territories (2018-2019). We collected demographic, health status, risk factors, and self-reported disease data. We whole genome sequenced 422 C. jejuni and 84 C. coli case isolates along with 616 retail meat isolates. We classified case illness severity using a modified Vesikari scoring system, performed phylogenomic analysis, and explored risk factors for hospitalisation and illness severity. On average, cases experienced a 7.5-day diarrhoeal illness with additional symptoms including stomach cramps (87.1%), fever (75.6%), and nausea (72.0%). Cases aged [≥]75 years had milder symptoms, lower Vesikari scores, and higher odds of hospitalisation compared to younger cases. Chronic gastrointestinal illnesses also increased odds of hospitalisation. We observed significant diversity among isolates, with 65 C. jejuni and 21 C. coli sequence types. Antimicrobial resistance genes were detected in 20.4% of isolates, but multidrug resistance was rare (0.04%). Key virulence genes such as cdtABC (C. jejuni) and cadF were prevalent (>90% presence) but did not correlate with disease severity or hospitalisation. However, certain genes appeared to distinguish human C. jejuni cases from food source isolates. Campylobacteriosis generally presents similarly across cases, though some are more severe. Genotypic virulence factors identified in the literature to-date do not predict disease severity but may differentiate human C. jejuni cases from food source isolates. Host factors like age and comorbidities have a greater influence on health outcomes than virulence factors. Author summaryThis study focused on Campylobacter, a common cause of gastroenteritis in Australia. We explored the relationship between Campylobacters genomic characteristics and disease severity, hospitalisation, and host-related factors. In 2018 - 2019, we collected data from 571 campylobacteriosis cases from Eastern Australia, focusing on demographics, health status, risk factors, and self-reported symptoms. We sequenced 422 C. jejuni and 84 C. coli case isolates and 616 retail meat isolates. We used a modified Vesikari scoring system to assess illness severity, performed phylogenomic analysis, and explored hospitalisation and severity risk factors. Cases experienced an average 7.5-day period of diarrhoea with additional symptoms including stomach cramps, fever, and nausea. Older individuals (75+ years) had milder symptoms but a higher chance of hospitalisation. Those with chromic gastrointestinal conditions faced increased hospitalisation odds. Case isolates showed considerable diversity. Antimicrobial resistance genes were detected in some isolates, but multidrug resistance was rare. Virulence genes did not predict severity or hospitalisation, but some genes did differentiate between case and food source C. jejuni isolates. Host-related factors including age and comorbidities are more important in determining health outcomes.
Autori: Danielle M. Cribb, C. R. Moffatt, R. L. Wallace, A. T. McLure, D. Bulach, A. V. Jennison, N. French, M. Valcanis, K. Glass, M. D. Kirk
Ultimo aggiornamento: 2023-10-17 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.16.23297105
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.16.23297105.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.
Link di riferimento
- https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31779668/
- https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32559359/
- https://github.com/tseemann/mlst
- https://github.com/MDU-PHL/abritamr
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/antimicrobial-resistance/AMRFinder/
- https://github.com/tseemann/abricate
- https://github.com/MDU-PHL/bohra
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra