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Capire l’aumento dei focolai di Mpox

I casi di mpox aumentano in tutto il mondo, tracciando le modifiche genetiche e la diffusione in Nigeria.

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Mpox è una malattia causata dal virus mpox. Questo virus appartiene a un gruppo chiamato Orthopoxvirus. Ci sono due tipi principali di questo virus. Il primo tipo si trova soprattutto negli animali dell'Africa centrale, mentre il secondo vive negli animali dell'Africa occidentale.

Casi Iniziali

Il primo caso umano noto di mpox risale al 1970 nella Repubblica Democratica del Congo. Per molti anni dopo, non ci sono stati molti casi segnalati. Gli focolai erano piccoli e il virus raramente si diffondeva da persona a persona. La maggior parte dei casi riguardava bambini che vivevano in zone rurali dell’Africa.

Tuttavia, a settembre 2017, la Nigeria ha segnalato il suo primo focolaio di mpox in quasi 40 anni. Questo focolaio era diverso dai precedenti. Più adulti tra i 30 e i 40 anni sono stati infettati e molti di loro vivevano in aree urbane. Questo rappresentava un cambiamento rispetto ai casi precedenti che colpivano principalmente i bambini nei villaggi.

L'Outbreak Globale

Nel maggio 2022, un ceppo specifico del virus, noto come Clade IIb B.1, ha iniziato a diffondersi rapidamente in tutto il mondo, causando un focolaio globale di mpox. Questo nuovo ceppo sembrava diffondersi facilmente da persona a persona. Quando gli scienziati hanno confrontato questo nuovo ceppo con quelli precedenti, hanno scoperto che presentava molte differenze. Queste differenze indicavano che il virus stava cambiando rapidamente, probabilmente a causa dei tentativi del corpo umano di combatterlo.

I ricercatori si sono resi conto che questo focolaio del 2022 non era solo un evento casuale. Era probabilmente il risultato della diffusione del virus tra le persone nel corso di un lungo periodo. Hanno stimato che il virus ha iniziato a circolare tra gli esseri umani in Nigeria intorno al 2016, diffondendosi silenziosamente e evolvendosi in diversi tipi.

L'Origine Zoonotica

Anche se il virus è stato visto negli esseri umani, si crede che provenga originariamente dagli animali. Tuttavia, i ricercatori non hanno ancora identificato l'animale esatto responsabile di questo virus. Hanno trovato alcune prove di una stretta relazione tra i virus negli esseri umani e campioni più vecchi dagli animali, ma il percorso esatto che il virus ha seguito per raggiungere gli esseri umani è ancora poco chiaro.

Durante l'outbreak in Nigeria, i ricercatori hanno raccolto campioni da 202 genomi (materiale genetico) di casi di mpox. La maggior parte di questi campioni è stata prelevata dalle regioni meridionali della Nigeria, dove la malattia è apparsa per la prima volta. I ricercatori miravano a capire come il virus si fosse diffuso e fosse evoluto all'interno della popolazione umana.

Cambiamenti Genetici

I ricercatori hanno scoperto che molti dei cambiamenti genetici nel virus erano legati a un processo nel corpo umano chiamato APOBEC3. Questo processo aiuta a difendersi dai virus, ma può anche cambiare il DNA del virus. Hanno osservato un numero significativo di mutazioni nelle informazioni genetiche del virus causate da questo meccanismo.

Nella loro analisi, circa il 74% delle mutazioni nel virus sembravano influenzate da APOBEC3. D'altra parte, solo una piccola percentuale di mutazioni nelle linee virali trovate negli animali mostrava questo schema. Ciò suggerisce che il virus si è principalmente diffuso tra gli esseri umani per un lungo periodo, adattandosi a questo ambiente.

Schemi di Diffusione

In Nigeria, i casi di mpox sembravano concentrarsi in specifiche regioni. Gli scienziati hanno scoperto che gli stati meridionali erano la fonte iniziale della malattia. Lo Stato di Rivers era particolarmente importante, fungendo da hub da cui il virus si diffondeva verso le aree circostanti. Man mano che si verificavano focolai in altri stati, i ricercatori notavano un modello di diffusione continua e reintroduzione del virus in aree che avevano già vissuto dei casi.

I ricercatori hanno scoperto che il virus poteva viaggiare per lunghe distanze. Prima che venissero riportati i primi casi, si era già diffuso in diversi stati nigeriani. Molti stati avevano casi locali prima che l'outbreak fosse ufficialmente dichiarato.

Persistenza del Virus

I ricercatori hanno anche notato che il virus non si manifestava solo sporadicamente ma aveva stabilito catene di Trasmissione in corso in varie regioni. Il virus sembrava essere rimasto in alcune aree per anni, anche quando non venivano segnalati casi. Questo suggerisce che il virus stava circolando silenziosamente, possibilmente in persone non diagnosticate.

In alcune regioni, le catene di trasmissione erano forti e durature. I ricercatori hanno scoperto che il virus circolava nello Stato di Rivers per più di due anni prima che venisse effettuata la prima segnalazione pubblica della malattia.

Fattori Socioeconomici

Diversi fattori hanno contribuito alla diffusione del virus. Il movimento delle persone, l'urbanizzazione e la densità di popolazione di alcune aree hanno giocato ruoli significativi. I ricercatori hanno notato che una combinazione di comportamenti, demografia e connettività regionale probabilmente ha facilitato la diffusione continua del virus.

Inoltre, la risposta dei sistemi sanitari all'outbreak non è stata uniforme. Alcune aree avevano risorse e sforzi di risposta migliori rispetto ad altre, facilitando la diffusione del virus da regioni più connesse ad altre.

Implicazioni per la Salute Pubblica

Date le scoperte, i funzionari della salute pubblica devono concentrarsi su aree specifiche, in particolare il sud della Nigeria, per controllare efficacemente il virus. Con la trasmissione continua e il potenziale di ulteriori focolai, è necessaria una sorveglianza potenziata.

I ricercatori hanno evidenziato l'importanza delle risorse per la diagnostica, i vaccini e i trattamenti. L'accesso a queste risorse è stato diseguale a livello globale, influenzando particolarmente le nazioni africane. Senza un adeguato supporto, potrebbero verificarsi ulteriori diffusione e focolai, portando a più malattie e complicazioni.

Necessità di Sorveglianza

Lo studio ha messo in evidenza che ci sono limiti nella comprensione di come il virus si diffonde. Anche se è stata raccolta una buona quantità di informazioni, la raccolta dei campioni non è sempre stata completa o rappresentativa. C'è bisogno di migliorare i sistemi sanitari e i metodi di sorveglianza nelle aree colpite per avere un quadro più chiaro della diffusione del virus.

Le interventi di salute pubblica dovrebbero essere personalizzati per mirare a regioni in cui il virus è attivo. Rilevamento e risposta tempestivi possono aiutare a prevenire focolai più grandi e controllare efficacemente la malattia.

Conclusione

Mpox ha dimostrato di poter evolversi e diffondersi tra gli esseri umani. Comprendere il percorso del virus e come colpisce diverse popolazioni è cruciale per gestire il suo impatto futuro. Sono necessari ricerca continua, migliori risorse sanitarie e risposte più forti della salute pubblica per affrontare questa sfida in corso.

Concentrandosi sulla salute della comunità e migliorando l'accesso a risorse importanti, c'è speranza di controllare mpox in Nigeria e oltre.

Fonte originale

Titolo: Genomic epidemiology uncovers the timing and origin of the emergence of mpox in humans

Estratto: Five years before the 2022-2023 global mpox outbreak Nigeria reported its first cases in nearly 40 years, with the ongoing epidemic since driven by sustained human-to-human transmission. However, limited genomic data has left questions about the timing and origin of the mpox virus (MPXV) emergence. Here we generated 112 MPXV genomes from Nigeria from 2021-2023. We identify the closest zoonotic outgroup to the human epidemic in southern Nigeria, and estimate that the lineage transmitting from human-to-human emerged around July 2014, circulating cryptically until detected in September 2017. The epidemic originated in Southern Nigeria, particularly Rivers State, which also acted as a persistent and dominant source of viral dissemination to other states. We show that APOBEC3 activity increased MPXVs evolutionary rate twenty-fold during human-to-human transmission. We also show how Delphy, a tool for near-real-time Bayesian phylogenetics, can aid rapid outbreak analytics. Our study sheds light on MPXVs establishment in West Africa before the 2022-2023 global outbreak and highlights the need for improved pathogen surveillance and response.

Autori: Edyth Parker, I. Omah, P. Varilly, A. Magee, A. O. Ayinla, A. E. Sijuwola, M. I. Ahmed, O. O. Ope-Ewe, O. A. Ogunsanya, A. Olono, P. Eromon, C. H. Tomkins-Tinch, J. R. Otieno, O. Akanbi, A. Egwuenu, O. Ehiakhamen, C. Chukwu, K. Suleiman, A. Akinpelu, A. Ahmad, K. I. Imam, R. Ojedele, V. Oripenaye, K. Ikeata, S. Adelakun, B. Olajumoke, L. L. M. Essengue, D. D. Djuicy, M. H. M. Yifomnjou, M. Zeller, K. Gangavarapu, A. O'Toole, D. Park, G. Mbowa, S. Kiffle Tessema, Y. K. Tebeje, O. Folarin, A. Happi, P. Lemey, M. A. Suchard, K. G. Andersen, P. Sabeti, Rambau

Ultimo aggiornamento: 2024-06-19 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.24309104

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.24309104.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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