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Nouveau biosenseur révèle le rôle de l'acide phosphatidique dans les cellules

Un nouveau biosenseur offre des aperçus plus profonds sur les effets de l'acide phosphatidique dans les fonctions cellulaires.

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L'acide phosphatidique (PA) est un type de graisse qu'on trouve dans nos cellules. Il a plusieurs rôles importants, comme aider au métabolisme, à la signalisation cellulaire et à garder la structure des membranes cellulaires intacte. Le PA est le point de départ pour fabriquer d'autres substances grasses, qui sont cruciales pour diverses fonctions biologiques.

Pourquoi l'acide phosphatidique est-il important ?

Le PA est super important parce qu'il sert de bloc de construction pour d'autres Lipides (graisses) comme le diacylglycérol (DAG) et l'acide lysophosphatidique (LPA). Chacune de ces substances grasses a son propre rôle dans la façon dont les cellules communiquent et fonctionnent. Le PA aide aussi à contrôler où certaines enzymes se trouvent et comment elles fonctionnent. Ça inclut des enzymes qui sont impliquées dans divers chemins de croissance et de signalisation cellulaire.

En plus, le PA influence la forme des membranes. Il peut faire courber les membranes d'une certaine manière, ce qui est important pour le transport des substances à l'intérieur et à l'extérieur des cellules. À cause de ses nombreuses fonctions, le PA a été ciblé pour des recherches dans plusieurs maladies, y compris le cancer et des problèmes cardiaques.

Comment l'acide phosphatidique est-il fabriqué ?

Le PA est principalement fabriqué dans la membrane plasmique des cellules par deux processus. Le premier implique des enzymes qui décomposent certains lipides, menant à la production de PA. Le deuxième processus fait intervenir un autre ensemble d'enzymes qui agissent sur les lipides pour créer du PA. Des recherches indiquent que ces processus se passent l'un après l'autre, le premier apportant des signaux importants qui activent le second.

Malgré les rôles connus du PA, il y a encore beaucoup de choses qu'on ne sait Pas sur sa régulation à l'intérieur des cellules. Un des défis pour étudier le PA est le manque de bons outils pour l'observer dans des cellules vivantes.

Outils pour étudier l'acide phosphatidique

Le meilleur moyen d'étudier des lipides comme le PA dans des cellules vivantes, c'est d'utiliser des protéines spéciales appelées Biosenseurs. Ces biosenseurs sont conçus pour se lier à des lipides spécifiques et peuvent être vus au microscope parce qu'ils sont marqués avec un marqueur fluorescent.

Cependant, ces biosenseurs doivent être soigneusement testés pour s'assurer qu'ils sont vraiment sensibles au lipide qu'ils sont censés mesurer. Plus précisément, les chercheurs se posent trois questions principales : Est-ce que le biosenseur se fixe seulement au PA ? Est-ce qu'il se déplace au bon endroit dans la membrane selon les niveaux de PA ? Et est-ce que le PA est suffisant pour attirer le biosenseur vers les membranes ?

Biosenseurs actuels et leurs limites

Plusieurs biosenseurs basés sur différents domaines ont été créés pour détecter le PA, mais aucun n'est parfait. Par exemple, certains biosenseurs pourraient réagir à d'autres types de lipides ou ne pas bien fonctionner quand les niveaux de PA sont bas.

Un des biosenseurs les plus courants utilise une protéine de levure appelée Spo20p. Ce capteur peut se lier au PA dans des expériences en laboratoire et montre une certaine capacité à le faire dans des systèmes vivants. Cependant, il a tendance à rester coincé dans le noyau des cellules, ce qui peut rendre difficile l'observation des changements de niveaux de PA à la membrane.

Pour surmonter ces problèmes, une version modifiée de ce biosenseur, appelée PASS, a été développée. Cette version peut éviter d'être piégée dans le noyau. Bien qu'elle soit meilleure que l'originale, elle a encore quelques limites, comme réagir à d'autres lipides aussi.

La quête d'un meilleur biosenseur

Les chercheurs continuent de chercher des biosenseurs plus efficaces pour étudier le PA. Une direction prometteuse a été l'investigation de protéines de la famille Nir. Ces protéines aident à transporter le PA et un autre lipide appelé phosphatidylinositol entre différentes parties de la cellule.

La famille de protéines Nir a une partie spéciale connue sous le nom de domaine LNS2, qui semble avoir des propriétés uniques qui pourraient en faire un bon candidat pour un nouveau biosenseur. Les études initiales suggèrent que ce domaine LNS2 peut se lier spécifiquement au PA et bien réagir en présence de ce lipide, ce qui en fait un bon choix pour des tests supplémentaires.

Test du nouveau biosenseur

Dans cette recherche, les scientifiques se sont fixés comme objectif de valider le domaine Nir1-LNS2 comme un nouveau et efficace biosenseur pour le PA. Ils ont réalisé diverses expériences pour voir à quel point ce biosenseur fonctionnait dans des systèmes artificiels et dans des cellules vivantes.

Les scientifiques ont découvert que Nir1-LNS2 se lie fortement au PA et montre des mouvements clairs vers la membrane cellulaire lorsque les niveaux de PA augmentent. Cela en fait un outil prometteur pour mesurer les niveaux de PA avec précision. Ils ont aussi confirmé que ce biosenseur peut bien fonctionner dans différents types de cellules, montrant sa polyvalence.

Une autre découverte importante était que le biosenseur Nir1-LNS2 n'interfère pas avec d'autres processus liés au PA dans les cellules. Ça veut dire qu'il peut être utilisé pour étudier le PA dans un cadre naturel sans perturber les fonctions normales de la cellule.

Observation de la production d'acide phosphatidique

Les chercheurs ont utilisé le nouveau biosenseur pour voir comment les niveaux de PA changent quand les cellules sont stimulées pour activer des voies spécifiques. Ils ont découvert que quand un récepteur de surface cellulaire était activé, le biosenseur pouvait détecter les augmentations des niveaux de PA avec succès. C'est significatif car ça aide à déchiffrer les façons complexes dont le PA est produit et régulé à l'intérieur des cellules.

Quand les scientifiques ont utilisé une autre méthode pour inhiber certaines enzymes, ils ont remarqué que les niveaux de PA baissaient, soutenant l'idée que ces enzymes contribuent à la production de PA dans les cellules vivantes.

L'importance des biosenseurs à haute affinité

Les résultats indiquent que les biosenseurs à haute affinité, comme Nir1-LNS2, peuvent aider les scientifiques à comprendre des changements plus subtils dans les niveaux de PA qui pourraient passer inaperçus avec des biosenseurs plus anciens. C'est crucial parce que le PA est impliqué dans de nombreuses voies de signalisation importantes, et même de petits changements peuvent avoir des effets significatifs.

Cependant, les chercheurs mettent en garde que même si Nir1-LNS2 est un outil puissant, il ne remplace pas entièrement les biosenseurs existants. Avoir plusieurs types de biosenseurs est bénéfique parce que chacun peut fournir une perspective différente sur le comportement des lipides dans les cellules.

Conclusion

Pour résumer, l'acide phosphatidique est un lipide vital qui joue de nombreux rôles dans la fonction cellulaire. Le développement du nouveau biosenseur Nir1-LNS2 offre aux chercheurs un meilleur outil pour étudier les niveaux de PA dans les cellules vivantes. Ce biosenseur montre une spécificité pour le PA et est assez réactif pour détecter les changements de ses niveaux avec précision.

Avec ces avancées, les scientifiques peuvent explorer davantage les rôles de l'acide phosphatidique dans la santé et la maladie, ouvrant de nouvelles avenues de recherche qui pourraient mener à de meilleurs traitements pour diverses conditions.

Grâce à la recherche continue, les informations obtenues en étudiant l'acide phosphatidique pourraient s'avérer essentielles pour comprendre les processus biologiques fondamentaux et développer des stratégies thérapeutiques pour les maladies impactées par la signalisation lipidique.

Source originale

Titre: Nir1-LNS2 is a novel phosphatidic acid biosensor that reveals mechanisms of lipid production

Résumé: Despite various roles of phosphatidic acid (PA) in cellular functions such as lipid homeostasis and vesicular trafficking, there is a lack of high-affinity tools to study PA in live cells. After analysis of the predicted structure of the LNS2 domain in the lipid transfer protein Nir1, we suspected that this domain could serve as a novel PA biosensor. We created a fluorescently tagged Nir1-LNS2 construct and then performed liposome binding assays as well as pharmacological and genetic manipulations of HEK293A cells to determine how specific lipids affect the interaction of Nir1-LNS2 with membranes. We found that Nir1-LNS2 bound to both PA and PIP2 in vitro. Interestingly, only PA was necessary and sufficient to localize Nir1-LNS2 to membranes in cells. Nir1-LNS2 also showed a heightened responsiveness to PA when compared to biosensors using the Spo20 PA binding domain (PABD). Nir1-LNS2s high sensitivity revealed a modest but discernible contribution of PLD to PA production downstream of muscarinic receptors, which has not been visualized with previous Spo20-based probes. In summary, Nir1-LNS2 emerges as a versatile and sensitive biosensor, offering researchers a new powerful tool for real-time investigation of PA dynamics in live cells.

Auteurs: Gerald R Hammond, C. C. Weckerly, T. A. Rahn, M. Ehrlich, R. C. Wills, J. G. Pemberton, M. V. Airola

Dernière mise à jour: 2024-02-28 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582557

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.582557.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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