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Pseudomonas aeruginosa : S'adapter au lactate dans les biofilms

Une étude révèle comment Pseudomonas aeruginosa utilise le lactate selon différentes conditions.

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Le lactate est un petit composé organique qu'on trouve partout. Il sert de nourriture pour les bonnes et les mauvaises bactéries. Certaines bactéries peuvent utiliser le lactate pour grandir en le transformant en un autre truc appelé pyruvate. Y'a des enzymes spécifiques, appelées lactate déshydrogénases, qui aident dans ce processus. Différentes bactéries ont différents types de ces enzymes, et dans certains cas, une seule bactérie peut avoir plus d'une enzyme qui peut agir sur le même type de lactate. Ça aide les bactéries à s'adapter à divers environnements.

Le Rôle des Bactéries Pseudomonas

Pseudomonas est un type de bactérie qu’on trouve souvent dans l’eau et le sol. Elles sont connues pour leur capacité à utiliser diverses sources de nourriture et préfèrent les acides organiques comme le lactate plutôt que les sucres. Un type, Pseudomonas Aeruginosa, peut causer des infections à l'hôpital, surtout chez les gens avec un système immunitaire affaibli. Cette bactérie peut utiliser les deux formes de lactate (D-lactate et L-lactate) pour se développer. Elle a deux enzymes redondantes, LldD et LldA, qui l’aident à décomposer L-lactate, ce qui soulève des questions sur pourquoi elle garde les deux enzymes.

Régulation Génétique dans Pseudomonas aeruginosa

Les gènes pour les lactate déshydrogénases dans Pseudomonas aeruginosa réagissent différemment aux deux types de lactate et à leurs concentrations. On a découvert que la production de ces gènes varie selon la concentration de L-lactate. Des expériences montrent qu'une enzyme, LldA, ne répond qu'à L-lactate alors que LldD réagit aux deux formes.

En plus, il y a une protéine régulatrice appelée LldS qui aide à contrôler l'expression de LldA en réponse à L-lactate. Le gène régulateur LldS est juste à côté du gène LldA. On pense que ce gène aide la bactérie à sentir la présence de L-lactate et à activer son utilisation.

Biofilms et Adaptation Environnementale

Pseudomonas aeruginosa est aussi connue pour sa capacité à former des biofilms. Les biofilms sont des amas de bactéries qui collent ensemble et sont entourés d'une barrière protectrice. Ces biofilms créent différents environnements à l'intérieur, ce qui représente des défis uniques pour les bactéries qui y vivent. Certaines zones peuvent avoir plein de ressources, alors que d'autres peuvent manquer de nutriments ou d'oxygène. Ça peut influencer comment les bactéries expriment des gènes vitaux pour leur survie.

Les enzymes LldA et LldD montrent des schémas d'expression différents dans les biofilms. En examinant les biofilms sous différentes conditions, on a découvert que LldA est plus actif dans les zones avec moins de fer. Ça suggère que la disponibilité du fer peut affecter comment Pseudomonas aeruginosa utilise le lactate.

Effets du Fer sur les Lactate Déshydrogénases L-lactate

L'expression du gène de la lactate déshydrogénase L, LldA, est particulièrement sensible aux niveaux de fer. Quand le fer est rare, l'expression de LldA augmente considérablement, tandis que LldD ne montre pas cette sensibilité. Ça pourrait être parce que des conditions de faible fer imitent l'environnement créé par un hôte humain, où le fer est souvent limité, rendant crucial pour la bactérie de s'adapter à utiliser efficacement le lactate.

Dans des expériences, on a montré que l'expression de LldA diminue quand on ajoute plus de fer. Ça mène à comprendre que le fer joue un rôle important dans la façon dont Pseudomonas aeruginosa équilibre son utilisation de lactate.

Effets des Métabolites sur l'Expression Génétique

En plus du fer, d'autres composés dans l'environnement influencent aussi l'expression des lactate déshydrogénases. Par exemple, l'alpha-hydroxybutyrate (α-HB) est un autre composé qui peut stimuler l'expression de LldA. Ça pourrait être important pour les bactéries lorsqu'elles rencontrent divers métabolites dans leur environnement.

En revanche, un autre composé appelé glycolate a été trouvé pour inhiber l'expression de LldD. Le glycolate se trouve dans de nombreux environnements, et sa présence peut impacter comment Pseudomonas aeruginosa fonctionne, surtout dans les biofilms.

Profondeur du Biofilm et Gradients de Nutriments

L'agencement des nutriments et de l'oxygène varie souvent dans les biofilms. Dans les zones plus proches de la surface, où il y a plus d'oxygène, l'expression de LldA est élevée, tandis que celle de LldD est plus basse. Ça suggère que différentes conditions dans le biofilm peuvent dicter quelle enzyme est plus avantageuse pour les bactéries.

En examinant les bactéries dans les biofilms, on a noté que la présence de glycolate s'aligne avec des zones qui montrent une faible expression de LldD. L'interaction entre les niveaux d'oxygène, la disponibilité des nutriments et la présence de divers métabolites montre la complexité de la vie dans les biofilms.

Rôle de L-lactate dans les Infections

Pendant les infections, les niveaux de lactate ont tendance à augmenter, ce qui sert de source d'énergie pour les bactéries. Pseudomonas aeruginosa a été observée prospérer dans de telles conditions, indiquant son adaptabilité. Sa capacité à utiliser le lactate efficacement contribue à son succès en tant que pathogène opportuniste.

Des études récentes ont montré que les lactate déshydrogénases L travaillent ensemble pendant les infections. Des expériences menées avec des macrophages (un type de cellule immunitaire) ont démontré que les deux LldD et LldA sont essentiels pour la bactérie afin de survivre à l'intérieur de ces cellules. Quand une des enzymes manque, les bactéries ont du mal à maintenir leur présence.

Conclusion

Globalement, la façon dont Pseudomonas aeruginosa régule ses gènes de lactate déshydrogénase souligne son adaptabilité dans différents environnements. Elle peut utiliser le lactate efficacement, réagissant à divers indices nutritifs, surtout dans les biofilms et durant les infections. L’interaction des métabolites et de la disponibilité du fer donne un aperçu de comment cette bactérie survit et prospère dans des conditions difficiles. Comprendre ces mécanismes peut aider à développer de meilleures stratégies pour lutter contre les infections causées par ce pathogène polyvalent.

Source originale

Titre: The L-lactate dehydrogenases of Pseudomonas aeruginosa are conditionally regulated but both contribute to survival during macrophage infection

Résumé: Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that thrives in environments associated with human activity, including soil and water altered by agriculture or pollution. Because L-lactate is a significant product of plant and animal metabolism, it is available to serve as a carbon source for P. aeruginosa in the diverse settings it inhabits. Here, we evaluate P. aeruginosas production and use of its redundant L-lactate dehydrogenases, termed LldD and LldA. We confirm that the protein LldR represses lldD and identify a new transcription factor, called LldS, that activates lldA; these distinct regulators and the genomic contexts of lldD and lldA contribute to their differential expression. We demonstrate that the lldD and lldA genes are conditionally controlled in response to lactate isomers as well as to glycolate and {square}-hydroxybutyrate, which, like lactate, are {square}-hydroxycarboxylates. We also show that lldA is induced when iron availability is low. Our examination of lldD and lldA expression across depth in biofilms indicates a complex pattern that is consistent with the effects of glycolate production, iron availability, and cross-regulation on enzyme preference. Finally, macrophage infection assays revealed that both lldD and lldA contribute to persistence within host cells, underscoring the potential role of L-lactate as a carbon source during P. aeruginosa-eukaryote interactions. Together, these findings help us understand the metabolism of a key resource that may promote P. aeruginosas success as a resident of contaminated environments and animal hosts. ImportancePseudomonas aeruginosa is a major cause of lung infections in people with cystic fibrosis, hospital-acquired infections, and wound infections. It consumes L-lactate, which is found at substantial levels in human blood and tissues. In this study, we investigated the spatial regulation of two redundant enzymes, called LldD and LldA, which enable L-lactate metabolism in P. aeruginosa biofilms. We uncovered mechanisms and identified compounds that control P. aeruginosas LldD/LldA preference. We also showed that both enzymes contribute to its ability to survive within macrophages, a behavior that is thought to augment the chronicity and recalcitrance of infections. Our findings shed light on a key metabolic strategy used by P. aeruginosa and have the potential to inform the development of therapies targeting bacterial metabolism during infection.

Auteurs: Lars E.P. Dietrich, L. C. Florek, X. Lin, Y.-C. Lin, A. Chakraborty, M.-H. Lin, A. Price-Whelan, L. Tong, L. Rahme

Dernière mise à jour: 2024-03-23 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.21.586142

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.21.586142.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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