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Nouvelles idées sur le cancer gastrique et l'ARN

Des recherches montrent le rôle de l'ARN dans la progression du cancer de l'estomac et les traitements potentiels.

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Table des matières

Le cancer de l'estomac, c'est un gros problème de santé dans le monde. C'est surtout fréquent dans des pays d'Asie de l'Est comme la Corée du Sud, la Chine et le Japon. Beaucoup de gens ne remarquent pas les symptômes au début, donc ils sont diagnostiqués tard, quand le cancer est déjà bien avancé. Même si les méthodes de diagnostic et de traitement se sont améliorées ces dernières années, les taux de survie des patients dans les stades avancés restent pas très bons.

Symptômes et diagnostic

Les symptômes du cancer de l'estomac ne sont pas clairs et peuvent être confondus avec d'autres problèmes. Ça fait que beaucoup de gens découvrent qu'ils ont un cancer de l'estomac seulement quand c'est déjà avancé. La détection précoce est super importante, parce que les traitements fonctionnent mieux quand la maladie est prise tôt. Malheureusement, beaucoup de patients rencontrent des difficultés dans leur traitement à cause de la complexité du cancer et des facteurs qui mènent à sa progression.

Le rôle de l'ARN dans le cancer

Les avancées récentes en recherche génétique ont mis en avant l'importance de différents types d'ARN dans les cellules, surtout dans leurs interactions. Un mécanisme intéressant s'appelle l'ARN compétitif endogène (ceARN). Dans ce système, différents types d'ARN peuvent influencer l'activité des autres en se battant pour les mêmes molécules appelées MicroARN.

Les ARN circulaires (CircARN) sont un type d'ARN qu'on trouve dans beaucoup de cellules vivantes. Ils sont uniques parce qu'ils forment une structure en boucle et peuvent jouer divers rôles dans la cellule, comme réguler l'activité des gènes et se lier à d'autres types de molécules. Les chercheurs pensent que les circARN pourraient être importants pour comprendre comment les cellules se divisent et grandissent, et ils pourraient aussi jouer un rôle dans le développement du cancer.

Recherche sur le réseau ceARN dans le cancer de l'estomac

Cette recherche s'est concentrée sur le rôle des circARN dans le cancer de l'estomac en créant un réseau ceARN qui montre comment différents types d'ARN interagissent. Des données liées au cancer de l'estomac ont été collectées à partir de bases de données publiques. En utilisant un outil logiciel appelé R, les chercheurs ont analysé les différences de niveaux d'ARN entre les tissus cancéreux et normaux. Ce travail leur a permis d'identifier des circARN, microARN et ARNm spécifiques qui se démarquaient par leurs niveaux d'expression.

En utilisant un autre outil appelé Cytoscape, les chercheurs ont pu visualiser les relations entre ces différents types d'ARN dans un réseau ceARN. L'objectif était de comprendre comment ces molécules d'ARN pouvaient affecter la progression du cancer et les taux de survie des patients.

Résultats de l'analyse des ARN

À travers leur travail, les chercheurs ont identifié plusieurs circARN, microARN et ARNm qui montraient des différences significatives d'expression entre les tissus cancéreux et non cancéreux. Des cartes thermiques ont été créées pour illustrer visuellement ces différences, montrant quels types d'ARN étaient plus actifs dans les tissus cancéreux par rapport aux tissus normaux.

Par exemple, certains circARN étaient moins actifs dans les tissus normaux mais très actifs dans les tissus cancéreux, ce qui suggère qu'ils pourraient jouer un rôle dans la croissance du cancer. Pendant ce temps, certains microARN étaient plus actifs dans les tissus normaux, ce qui indique leur potentiel rôle dans le contrôle de la progression du cancer.

Analyse plus approfondie des rôles de l'ARN

Après avoir construit le réseau ceARN, les chercheurs ont mené une analyse plus poussée pour déterminer les voies que ces molécules d'ARN pourraient influencer. Plus précisément, ils ont utilisé une plateforme appelée Gene Ontology (GO) et un autre outil appelé KEGG pour analyser les voies qui pourraient être affectées par les ARNm impliqués dans le réseau ceARN.

Les résultats ont pointé vers des voies de signalisation importantes, en particulier la voie de signalisation IL-17 et la voie de signalisation TNF, comme étant pertinentes pour le développement et la progression du cancer de l'estomac. Ces voies sont connues pour être impliquées dans l'inflammation et les réponses immunitaires, ce qui est significatif dans la biologie du cancer.

Données cliniques et analyse de survie

Pour relier ces résultats aux résultats réels, les chercheurs ont aussi examiné des données cliniques de patients atteints de cancer de l'estomac. Ils ont pu corréler les informations collectées à partir du réseau ceARN avec les données de survie des patients. Cette étape était cruciale pour déterminer si des molécules d'ARN spécifiques pouvaient servir d'indicateurs fiables du pronostic des patients.

L'analyse a révélé deux réseaux ceARN notables qui semblaient être liés aux résultats des patients. Un réseau impliquait le circARN hsa_circ_0055521, qui était associé à un microARN (hsa-miR-204-5p) et un gène cible connu sous le nom de FAP. Le deuxième réseau incluait plusieurs circARN qui influençaient l'expression d'un autre gène appelé FNDC1 à travers un autre microARN (hsa-miR-32-3p).

Analyse immunohistochimique

Pour soutenir les résultats de l'analyse des ARN, les chercheurs ont réalisé une analyse immunohistochimique des protéines produites par FAP et FNDC1. Cette méthode aide à visualiser où et combien d'une protéine spécifique est présente dans des échantillons de tissus. Les résultats ont montré des différences significatives dans les niveaux de protéines de ces gènes entre les tissus cancéreux et les tissus normaux adjacents, suggérant qu'ils pourraient jouer un rôle dans le cancer de l'estomac.

Implications pour le traitement

La découverte des circARN et de leurs rôles régulateurs potentiels ouvre de nouvelles pistes pour développer des traitements contre le cancer de l'estomac. Comprendre ces réseaux d'ARN peut aider à identifier de nouvelles cibles thérapeutiques. Cibler les interactions spécifiques dans le réseau ceARN pourrait conduire à de meilleures stratégies pour gérer le cancer de l'estomac.

L'étude met en lumière la complexité de la biologie du cancer et souligne l'importance de continuer la recherche sur comment différentes molécules interagissent au sein des cellules. Elle indique que les voies de signalisation IL-17 et TNF pourraient être importantes dans l'étude future et le traitement du cancer de l'estomac.

Directions futures

Bien que ces résultats soient prometteurs, d'autres enquêtes sont nécessaires pour confirmer les rôles de ces circARN et de leurs voies associées dans le cancer de l'estomac. Des études expérimentales en laboratoire seront essentielles pour mieux comprendre les mécanismes en jeu. Les recherches futures pourraient aussi explorer comment modifier l'activité de circARN ou de microARN spécifiques pourrait affecter le développement du cancer et la survie des patients.

L'objectif ultime est de traduire ces connaissances en pratique clinique, ce qui pourrait mener à de nouveaux outils de diagnostic et options de traitement pour ceux touchés par le cancer de l'estomac. De tels avancées pourraient donner de l'espoir aux patients et améliorer les résultats d'une maladie qui reste un défi de santé majeur dans le monde.

Source originale

Titre: A multi-database based ceRNA regulatory network for gastric cancer prognosis

Résumé: ObjectiveCircular RNA(circRNA) is a kind of endogenous non-coding RNA, which may be related to the occurrence and development of cancer. Based on the GEO database, this paper constructs a circRNA as a competitive endogenous RNAs(ceRNAs) that binds with microRNAs (miRNAs) to affect and regulate the expression of target genes. The ceRNA regulatory network based on circRNA-miRNA-mRNA model plays an important role in tumor prognosis and treatment. This paper explores the mechanism of circRNA-related ceRNA regulatory network in gastric cancer. MethodCircRNA, miRNA and mRNA data sets related to gastric cancer were downloaded from The Gene Expression Omnibus (GEO), and the limma package of R software (R 4.2.1 version) was used to identify the differences between gastric cancer tissues and adjacent normal tissues of gastric cancer. DEcircRNA, DEmiRNAs, and DEmRNAs. Based on circBase database, we explored the interactions among circRNA, miRNA and mRNA, and constructed the circRNA-miRNA-mRNA ceRNA network by using Cytoscape_v3.8.0. Then KEGG, GO and survival analysis of ceRNA-related genes were performed. Then, the prognostic data of gastric cancer were extracted from the TCGA database to construct the prognostic subnetwork of gastric cancer. ResultsKEGG analysis of ceRNAs mRNA showed that the pathway was mainly enriched in IL-17 signaling pathway, TNF signaling pathway and so on, which affected the prognosis of gastric cancer. hsa_circ_0055521/hsa-miR-204-5p/FAP, (hsa_circ_0005051, hsa_circ_0007613, hsa_circ_0045602, hsa_circ_0034398, hsa_circ_0006089) /hsa-miR-32-3p/FNDC1 were the ceRNA networks related to the prognosis of gastric cancer collaterals. ConclusionThis study found that IL-17 signaling pathway and TNF signaling pathway may affect the occurrence, development and prognosis of gastric cancer. And hsa_circ_0055521/hsa-miR-204-5p/FAP, (hsa_circ_0005051, hsa_circ_0007613, hsa_circ_0045602, hsa_circ_0034398, hsa_circ_0006089) /hsa-miR-32-3p/FNDC1 two circrNa-based stomachs The cancer ceRNA prognostic network is a new prognostic related ceRNA network for gastric cancer. FNDC1 and FAP may be potential therapeutic targets for gastric cancer.

Auteurs: longkuan yin, Q. Li

Dernière mise à jour: 2023-08-04 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.01.23293496

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.01.23293496.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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