Protéines N-myc : Acteurs clés dans le cancer
Les protéines N-myc sont super importantes dans la croissance des cellules et leur rôle dans le cancer est vraiment significatif.
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Table des matières
- Structure des Protéines Myc
- Le Rôle de N-myc dans le Cancer
- Différences Entre les Protéines Myc
- Le Domaine de Transactivation
- Interactions avec d'Autres Protéines
- L'Importance de la Phosphorylation
- Méthodes Pour Étudier N-myc
- Procédures Expérimentales
- Résultats et Conclusions
- Conclusion
- Directions Futures
- Source originale
- Liens de référence
Les protéines Myc sont un groupe de protéines qui jouent des rôles importants dans la croissance et le développement des cellules. On sait qu'elles sont impliquées dans divers cancers. Il existe trois types principaux de protéines Myc chez les mammifères : N-myc, L-myc et c-myc. Parmi celles-ci, N-myc est lié à des cancers qui commencent dans les cellules nerveuses, comme le neuroblastome, qui est un cancer courant chez les enfants. Quand il y a trop de copies du gène N-myc dans une cellule, ça conduit souvent à des résultats moins bons pour les patients atteints de neuroblastome.
Structure des Protéines Myc
Les protéines Myc sont constituées de nombreux acides aminés. Par exemple, N-myc a 464 acides aminés, tandis que L-myc est plus petite avec 364 acides aminés. Malgré ces différences de taille, leur structure globale est assez similaire. La partie terminale de ces protéines a une séquence spéciale qui leur permet de se lier à l'ADN et de réguler l'activité de certains gènes. Cette partie de la protéine interagit avec une autre protéine appelée Max, formant un complexe qui peut se fixer à des régions spécifiques de l'ADN appelées E-boxes, qu'on trouve dans les promoteurs de gènes.
Le Rôle de N-myc dans le Cancer
N-myc est particulièrement actif dans les cancers qui prennent naissance dans le système nerveux. Quand N-myc est trop présent, ça peut entraîner une croissance et une division cellulaire incontrôlées. Cette connexion entre N-myc et le cancer en fait une cible importante pour la recherche. Les protéines N-myc peuvent se lier à de nombreuses autres protéines, aidant à contrôler divers processus biologiques, y compris l'expression génique.
Différences Entre les Protéines Myc
Bien que N-myc et c-myc partagent certaines similitudes, ils peuvent aussi différer dans leur fonctionnement. Par exemple, c-myc a été étudié plus en profondeur. On sait qu'il améliore l'expression de nombreux gènes, mais il peut aussi supprimer l'activité génique dans certaines situations. Ces rôles variés peuvent dépendre de l'endroit où ils se lient et des protéines avec lesquelles ils interagissent.
Le Domaine de Transactivation
Une partie importante des protéines Myc s'appelle le domaine de transactivation (TAD). Cette section est responsable de l'activation d'autres gènes. Dans N-myc, le TAD est constitué d'une séquence d'acides aminés qui l'aide à interagir avec différentes protéines. Il est connu pour être flexible, ce qui signifie qu'il peut changer de forme, lui permettant de s'adapter à divers partenaires. Le TAD inclut plusieurs petites régions conservées appelées boîtes myc, qui aident à faciliter ces interactions.
Interactions avec d'Autres Protéines
N-myc a des régions spécifiques qui sont essentielles pour interagir avec diverses protéines. Ces interactions sont importantes pour sa fonction dans l'expression génique et d'autres processus. Par exemple, N-myc peut se lier à des complexes d'histone acétyltransférase, qui modifient la structure de l'ADN et influencent l'activité des gènes.
Des études montrent que N-myc peut aussi interagir avec des protéines comme Aurora-A kinase. Cette interaction est cruciale pour éviter les conflits entre la réplication de l'ADN et la transcription pendant la division cellulaire. La région de N-myc qui interagit avec Aurora-A peut adopter une structure hélicoïdale, ce qui peut aider à stabiliser la liaison entre ces protéines.
Phosphorylation
L'Importance de laLa phosphorylation est une modification chimique qui peut changer le comportement des protéines. Dans N-myc, certains acides aminés peuvent être phosphorylés par des enzymes spécifiques. Par exemple, les protéines ERK1 et GSK3 peuvent ajouter des groupes phosphate à N-myc. La phosphorylation à des sites spécifiques peut influencer la stabilité de N-myc et comment il interagit avec d'autres protéines.
Quand N-myc est phosphorylé, il peut reconnaître et se lier au complexe Fbxw7–Skp1, qui est impliqué dans le marquage des protéines pour leur dégradation. C'est ainsi que les niveaux de N-myc dans la cellule peuvent être régulés. Si N-myc n'est pas correctement régulé, ça peut contribuer à la progression du cancer.
Méthodes Pour Étudier N-myc
Pour comprendre comment N-myc fonctionne, les chercheurs utilisent diverses techniques. Une méthode utile s'appelle la RMN (Résonance Magnétique Nucléaire), qui aide les scientifiques à voir comment les protéines bougent et interagissent. En étudiant N-myc avec la RMN, les scientifiques peuvent examiner sa structure et comprendre comment elle change lorsqu'elle se lie à d'autres protéines ou est modifiée.
Les études RMN ont permis aux chercheurs d'identifier des caractéristiques clés du TAD de N-myc, comme la façon dont certaines zones peuvent adopter différentes formes lors de l'interaction avec Aurora-A ou lors de la phosphorylation. Ce genre d'information aide à avoir une vision plus claire de comment N-myc fonctionne dans les cellules.
Procédures Expérimentales
Fabrication des Protéines N-myc
Pour étudier les protéines N-myc, les scientifiques créent des séquences d'ADN spéciales appelées constructions d'expression. Ces séquences sont insérées dans des bactéries, qui produisent les protéines N-myc. Une fois produites, les protéines sont purifiées en utilisant différentes techniques pour les séparer des autres composants cellulaires. Cette purification est importante pour s'assurer que les scientifiques étudient la protéine spécifique qui les intéresse.
Purification des Protéines
Après que les bactéries produisent les protéines N-myc, des étapes sont suivies pour les purifier pour des études ultérieures. Cela implique généralement de casser les bactéries, d'enlever les débris et d'utiliser des techniques comme la chromatographie d'affinité pour isoler N-myc. Les protéines purifiées peuvent alors être analysées en utilisant diverses méthodes, comme la spectroscopie RMN, pour mieux comprendre leurs propriétés.
Spectroscopie RMN
La RMN est un outil puissant pour étudier la dynamique et les interactions des protéines. Dans les expériences de RMN, le comportement de N-myc est observé à différentes températures et conditions. En collectant des données sur la façon dont la protéine se comporte en solution, les chercheurs peuvent apprendre sur sa structure et sur tous les changements qui se produisent quand elle interagit avec d'autres protéines ou est modifiée par phosphorylation.
Résultats et Conclusions
Assignation de la Structure de N-myc TAD
En utilisant les données de RMN, les chercheurs ont identifié et assigné la structure de base du TAD de N-myc. Cette assignation a révélé des informations sur la façon dont N-myc peut interagir avec d'autres protéines et les types de structures secondaires qu'il peut adopter.
Dynamique de N-myc
Les données RMN montrent également que N-myc n'est pas entièrement désordonné. Certaines régions de N-myc affichent moins de dynamisme, ce qui indique qu'elles peuvent avoir des structures qui peuvent aider à se lier à d'autres protéines. Ce comportement pourrait donner des aperçus sur la façon dont N-myc fonctionne dans les processus cellulaires.
Interaction avec Aurora-A
L'interaction entre N-myc et Aurora-A a été explorée davantage grâce aux études RMN. Ces études ont montré comment la liaison affecte les propriétés des deux protéines, notamment les changements dans les déplacements chimiques et les intensités de pics de N-myc. Les données indiquaient que plusieurs régions de N-myc sont impliquées dans cette interaction, suggérant une interface de liaison complexe.
Études de Phosphorylation
Les études de phosphorylation utilisant la RMN ont aidé les scientifiques à suivre les changements dans N-myc lorsqu'il subit des modifications par des enzymes. Cela a permis une compréhension approfondie de la façon dont la phosphorylation affecte la stabilité de N-myc et ses interactions avec d'autres protéines, y compris le complexe Fbxw7–Skp1.
Conclusion
Les protéines Myc, en particulier N-myc, sont des acteurs cruciaux dans la croissance cellulaire et le cancer. Comprendre leur structure et leurs interactions est essentiel pour dévoiler leurs rôles dans les processus cellulaires et les maladies. Les études RMN fournissent des informations précieuses sur le fonctionnement de N-myc et comment il peut être régulé par la phosphorylation et les interactions avec d'autres protéines.
Les chercheurs continuent d'explorer de nouvelles façons de cibler N-myc dans le traitement du cancer, visant à développer des stratégies qui pourraient inhiber sa fonction dans les cellules cancéreuses. À mesure que de plus en plus d'informations sur N-myc deviennent disponibles, cela pourrait conduire à des percées dans la compréhension et le traitement des cancers associés à cette protéine importante.
Directions Futures
L'étude continue de N-myc offre des promesses pour faire avancer notre compréhension de la biologie du cancer. En élucidant les mécanismes qui sous-tendent sa fonction, les scientifiques espèrent développer des thérapies ciblées qui peuvent efficacement relever les défis posés par les cancers impliquant N-myc. La recherche future pourrait se concentrer sur les nuances structurelles de N-myc, les effets des diverses modifications post-traductionnelles et l'identification de cibles médicamenteuses potentielles.
En résumé, N-myc n'est pas juste une seule protéine ; c'est une entité complexe avec plusieurs rôles dans la santé et la maladie. Comprendre sa dynamique, ses interactions et ses mécanismes de régulation sera vital pour développer de nouvelles thérapies contre le cancer qui peuvent aider à améliorer les résultats des patients.
Titre: Exploring the dynamics and interactions of the N-myc transactivation domain through solution NMR
Résumé: The myc family of proteins (c-, N- and L-myc) are transcription factors (TFs) responsible for maintaining the proliferative program in cells. They consist of a C-terminal domain that mediates heterodimerisation with Max and DNA binding, and an N-terminal disordered region culminating in the transactivation domain (TAD). The TAD participates in many protein-protein interactions, notably with kinases that promote stability (Aurora-A) or degradation (ERK1, GSK3) via the ubiquitin-proteasome system. Structural characterization of the TAD of N-myc, is very limited, with the exception of a crystal structure of Aurora-A bound to a helical region of N-myc. We probed the structure, dynamics and interactions of N-myc TAD using nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy following its complete backbone assignment enabled by a truncation approach. Chemical shift analysis revealed that N-myc has two regions with clear helical propensity: one region within Trp77-Glu86 and the second between Ala122-Glu132. These regions also have more restricted ps-ns motions than the rest of the TAD, and, along with another known interaction site (myc box I), have comparatively high transverse (R2) 15N relaxation rates, indicative of slower timescale dynamics and/or chemical exchange. Collectively these features suggest differential propensities for structure and interaction, either internal or with binding partners, across the TAD. Solution studies on the interaction between N-myc and Aurora-A revealed a previously uncharacterised binding site. The specificity and kinetics of sequential phosphorylation of N-myc by ERK1 and GSK3 were characterised using NMR and showed no significant structural changes through the rest of the TAD. When doubly phosphorylated on residues Ser62 and Thr58, N-myc formed a robust interaction with the Fbxw7-Skp1 complex. Our study provides foundational insights into N-myc TAD dynamics and a backbone assignment that will underpin future work on the structure, dynamics, interactions and regulatory post-translational modifications of this key oncoprotein.
Auteurs: Richard Bayliss, E. Rejnowicz, M. Batchelor, E. Leen, M. S. Ahangar, M. W. Richards, A. Kalverda
Dernière mise à jour: 2024-05-23 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.22.595265
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.22.595265.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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