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Rétrovirus : Acteurs clés de la thérapie génique

Les rétrovirus sont super importants pour livrer des gènes dans des applis thérapeutiques, mais ils ont des défis d'intégration.

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Table des matières

Les rétrovirus sont un type de virus qui utilise l'ARN comme matériel génétique. Ils appartiennent à une famille appelée Retroviridae. Ces virus sont connus pour leur capacité à intégrer leur matériel génétique dans l'ADN de la cellule hôte, un processus qui consiste à transformer leur ARN en ADN grâce à une méthode appelée transcription inverse. Une fois intégré, ce nouveau matériel génétique, appelé provirus, devient une partie permanente de l'ADN de l'hôte. À cause de ça, les rétrovirus peuvent être à la fois difficiles à éliminer et utiles pour livrer des gènes dans les cellules.

Défis de l'utilisation des rétrovirus

Une fois qu'un rétrovirus s'intègre dans le génome d'un hôte, ça mène souvent à une infection durable. Ça complique le traitement des infections causées par les rétrovirus. En plus, parfois l'expression des gènes portés par ces virus peut être réduite par les mécanismes cellulaires de l'hôte, ce qui nuit à leur efficacité comme outils de Livraison de gènes.

L'endroit où un rétrovirus s'intègre dans l'ADN de l'hôte peut influencer si les gènes du virus sont exprimés de manière constante. L'intégration n'est pas aléatoire et est influencée par le type d'ADN et l'environnement autour dans les cellules hôtes. Par exemple, l'ADN près des gènes actifs ou des régions du génome qui sont ouvertes et accessibles a tendance à favoriser l'expression du provirus intégré.

Modèles d'intégration

Les rétrovirus s'intègrent dans tout le génome. Certaines régions de l'ADN sont plus favorables à l'intégration que d'autres. Des recherches montrent que des rétrovirus comme le VIH-1 sont plus susceptibles de s'intégrer près de gènes qui sont activement utilisés, comme les enhancers et les promoteurs. En comprenant ces modèles d'intégration, les scientifiques peuvent améliorer l'efficacité des rétrovirus comme outils de livraison de gènes.

Expérimenter avec les systèmes rétroviraux

Les scientifiques ont essayé différentes stratégies pour améliorer la livraison de gènes par rétrovirus. Par exemple, certains rétrovirus, comme les gammaretrovirus, affichent des préférences spécifiques pour les sites où ils s'intègrent. Quand les chercheurs ont changé les sites cibles d'intégration, ils ont constaté que l'expression des gènes viraux pouvait être affectée de manière significative. Une partie de cette recherche s'est concentrée sur comment ces sites pouvaient permettre une meilleure expression et moins d'effets de silenciation.

Des expériences avec différents systèmes rétroviraux ont montré que certains sites d'intégration favorisent une expression stable des gènes qu'ils livrent. Par exemple, quand l'ADN rétroviral s'intègre près de promoteurs actifs, les gènes peuvent être exprimés plus facilement.

Utiliser des vecteurs gammaretroviraux

Les gammaretrovirus, une sous-catégorie de rétrovirus, ont été étudiés pour leur comportement d'intégration et leurs mécanismes de livraison de gènes. Ces virus peuvent être conçus en laboratoire pour transporter des gènes spécifiques d'intérêt. Par exemple, les chercheurs ont travaillé avec des vecteurs dérivés de gammaretrovirus pour comprendre comment ils fonctionnent une fois intégrés dans le génome des cellules humaines.

En utilisant des vecteurs viraux spécifiques capables de transporter des gènes, les scientifiques ont cherché à livrer ces gènes efficacement dans les cellules humaines. Cette approche a conduit au développement de vecteurs modifiés qui peuvent cibler des zones plus avantageuses dans le génome de l'hôte pour une meilleure expression des gènes.

Le potentiel des Thérapies géniques

La thérapie génique est une technique où des gènes sont insérés, modifiés ou retirés des cellules d'une personne pour traiter des maladies. Les rétrovirus sont précieux dans ce domaine grâce à leur capacité à livrer du matériel génétique dans les cellules. Quand les vecteurs rétroviraux sont utilisés correctement, ils peuvent servir de véhicules pour que les gènes thérapeutiques atteignent leurs cibles.

Cependant, il y a toujours une préoccupation concernant la nature aléatoire de la façon dont ces virus s'intègrent dans le génome de l'hôte. Une intégration au mauvais endroit pourrait potentiellement avoir des conséquences néfastes, c'est pourquoi les scientifiques se concentrent sur l'amélioration de la spécificité de ces Intégrations.

Avancées de la technologie CRISPR

La technologie CRISPR représente une avancée significative dans l'édition de gènes. Les chercheurs ont commencé à utiliser CRISPR pour insérer des vecteurs rétroviraux directement dans des régions spécifiques d'un génome, comme les domaines associés à la lamina (LADs). Les LADs sont des zones du génome qui ne sont généralement pas très actives en termes d'expression génique. En ciblant ces régions, les scientifiques espèrent créer des intégrations géniques plus sûres et plus stables.

Ce processus permet aux scientifiques de s'assurer que les gènes insérés sont moins susceptibles d'interférer avec les fonctions cellulaires normales. Utiliser CRISPR avec des vecteurs rétroviraux offre un environnement plus contrôlé pour la livraison et l'expression des gènes.

L'importance du choix du site cible

Choisir le bon site cible dans le génome est crucial pour une thérapie génique efficace. En sélectionnant des sites plus favorables à l'expression des gènes, les chercheurs peuvent minimiser le risque de silenciation génique, qui peut se produire si les gènes intégrés sont placés dans des régions moins accessibles.

Des études ont montré que lorsque des vecteurs rétroviraux s'intègrent dans des régions du génome qui sont transcriptionnellement actives, la stabilité de l'expression génique est significativement améliorée. Cette compréhension aide à concevoir de meilleures thérapies géniques qui peuvent atteindre une expression thérapeutique à long terme et cohérente.

Surmonter les limitations

Malgré les progrès réalisés, il reste encore beaucoup à apprendre sur l'intégration rétrovirale et l'expression génique. Une grosse limitation est la variabilité dans la façon dont différentes cellules réagissent à la présence de gènes rétroviraux intégrés. Certains vecteurs rétroviraux peuvent bien fonctionner dans un type de cellule mais échouer dans un autre.

En plus, maintenir une expression stable dans le temps reste un défi. Alors que certaines intégrations peuvent sembler prometteuses au départ, l'expression peut diminuer, suscitant des questions sur la viabilité à long terme de l'utilisation des rétrovirus pour la livraison de gènes.

Directions futures

La recherche continue d'évoluer, avec des efforts en cours pour affiner les vecteurs rétroviraux et améliorer leurs capacités de livraison. De nouvelles stratégies visent à améliorer la ciblage des sites d'intégration, augmenter la stabilité de l'expression des transgènes et réduire les risques associés à des intégrations aléatoires.

Le travail dans ce domaine a le potentiel de mener à de meilleures thérapies géniques pour une variété de maladies, y compris les troubles génétiques, les cancers et les infections virales. En tirant parti des propriétés uniques des rétrovirus et de la précision de la technologie CRISPR, les scientifiques ouvrent la voie à des traitements innovants qui pourraient changer le paysage de la médecine.

Conclusion

Les rétrovirus jouent un rôle significatif dans le domaine de la thérapie génique, principalement grâce à leur capacité à s'intégrer dans le génome hôte et à délivrer des gènes thérapeutiques. Cependant, les défis de la maîtrise de l'intégration, du maintien d'une expression stable et de la minimisation des effets indésirables existent toujours.

En utilisant des techniques modernes comme CRISPR et en se concentrant sur des sites d'intégration favorables, les chercheurs visent à développer des systèmes de livraison de gènes plus sûrs et plus efficaces. L'exploration continue des vecteurs rétroviraux et de leurs applications dans la thérapie génique offre de grandes promesses pour les avancées médicales futures.

Source originale

Titre: Long Terminal Repeats of Gammaretroviruses Retain Stable Expression After Integration Retargeting or Knock-In into the Restrictive Chromatin of Lamina-Associated Domains

Résumé: Retroviruses integrate their genomes into the genomes of infected host cells and form a genetic platform for stable gene expression. Epigenetic silencing can, however, hamper the expression of integrated provirus. As gammaretroviruses ({gamma}RVs) preferentially integrate into sites of active promoters and enhancers, the high expression activity of {gamma}RVs can be attributed to the integration preference. Long terminal repeats (LTRs) of some {gamma}RVs were shown to act as potent promoters for gene expression. Here, we investigate the capacity of different {gamma}RV LTRs to drive stable expression inside a non-preferred epigenomic environment using diverse retroviral vectors and CRISPR-Cas9-directed vector knock-in. We demonstrate that different {gamma}RV LTRs are either rapidly silenced or long-term active with active proviral population prevailing under normal and retargeted integration. In addition, we show that lamina-associated domains (LADs) can be targeted by CRISPR-Cas9 for vector insertion leading to {gamma}RV LTR-driven long-term stable gene expression. Alternatively to established {gamma}RV systems, the LTRs of feline leukemia virus and koala retrovirus are capable of driving stable, albeit intensity-diverse, transgene expression in LADs. Altogether, we show that despite the occurrence of rapid silencing events, the majority of {gamma}RV LTRs can drive stable expression after retrovirus integration or CRISPR-Cas9-directed knock-in outside of the preferred chromatin landscape.

Auteurs: Jiri Hejnar, D. Miklik, M. Slavkova, D. Kucerova, C. Mekadim, J. Mrazek

Dernière mise à jour: 2024-05-31 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596639

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596639.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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