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L'essor des variants Omicron : un nouveau défi

Nouveaux variants d'Omicron montrent des changements qui influencent l'infection et la gravité de la maladie.

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À la fin de 2021, une nouvelle version du virus qui cause le COVID-19, connue sous le nom de SARS-CoV-2, a commencé à se répandre. Cette version s'appelait Omicron. Omicron avait beaucoup de changements dans sa structure par rapport aux versions précédentes, ce qui l'aidait à éviter la détection par le Système immunitaire. Au fil du temps, de nombreux nouveaux variants d'Omicron sont apparus, chacun avec plus de changements. L'un d'eux était le variant BA.2.86, découvert pour la première fois en 2023 et qui a rapidement circulé dans différents pays.

Les scientifiques ont remarqué que le variant JN.1, qui venait de BA.2.86, avait un changement unique qui le rendait moins efficace pour s'attacher aux cellules humaines. Cependant, ce même changement lui permettait de mieux échapper au système immunitaire que les anciens variants, ce qui a fait de lui la version la plus courante chez les gens.

Les variants Omicron actuels, y compris JN.1, semblent causer moins de maladies graves chez les animaux et les humains par rapport aux versions plus anciennes du virus. Il est possible que l'exposition précédente au COVID-19 ait donné à beaucoup de gens un certain niveau d'immunité, contribuant à cette tendance. Les chercheurs ont constaté que ces variants Omicron se reproduisent moins dans les tissus pulmonaires des animaux infectés, ce qui signifie qu'ils causent moins de dommages.

Alors que de nouveaux variants continuent d'émerger, les scientifiques étudient comment ils diffèrent les uns des autres, notamment en ce qui concerne leur façon d'infecter les cellules et de se propager. Cette recherche est cruciale pour savoir comment ces variants pourraient se comporter à l'avenir.

L'Émergence des Variants Omicron

Le variant Omicron a rapidement remplacé d'autres variants circulants de SARS-CoV-2 après son apparition. Sa structure était suffisamment différente pour qu'il puisse éviter une grande partie de l'immunité que les gens avaient accumulée suite à des infections ou des vaccinations précédentes. La nature évolutive d'Omicron a conduit à l'émergence de nombreux sous-variants, chacun apportant des caractéristiques uniques.

Les recherches montrent que ces nouveaux variants ont des mutations qui les aident à se lier aux récepteurs ACE2, un point d'entrée clé pour le virus dans les cellules humaines. À mesure que de nouveaux variants comme JN.1 émergeaient, ils changeaient fréquemment, échappant à la détection immunitaire tout en étant capables d'entrer dans les cellules.

Modèles Animaux et Méthodes de Recherche

Pour étudier ces variants, les chercheurs utilisent souvent des modèles animaux comme les hamsters syriens. Ces animaux représentent bien comment le virus agit chez les humains. Les chercheurs peuvent infecter des hamsters avec différents variants, puis observer comment le virus se propage, se reproduit et cause des maladies au fil du temps.

En plus d'utiliser des modèles animaux, les scientifiques cultivent des cellules humaines pour imiter les voies respiratoires, ce qui leur permet de voir comment le virus infecte ces cellules. Cela implique de créer des cultures à partir de cellules nasales et pulmonaires humaines qui ressemblent de près aux tissus humains réels.

L'Impact des Variants sur la Gravité de la Maladie

Les chercheurs ont étudié plusieurs variants Omicron récents, y compris XBB.1.5, XBB.1.16, EG.5.1 et JN.1, pour voir à quel point les maladies qu'ils causaient étaient graves et à quel point elles se propageaient facilement. Les premières expériences ont montré que bien que ces variants puissent bien se multiplier dans la partie supérieure des voies respiratoires, ils ne causaient pas de dommages significatifs aux poumons dans les modèles de hamster.

Dans leurs études, les chercheurs ont suivi les variations de poids des hamsters infectés et ont cherché des signes de dommages pulmonaires. Même si tous les variants pouvaient se reproduire dans les voies respiratoires supérieures, aucun ne causait de graves dommages aux poumons, montrant qu'ils étaient moins nocifs que les variants précédents.

Comprendre Comment les Variants se Propagent

Des études de Transmission ont également été menées. Les chercheurs ont mis des hamsters infectés avec des hamsters sains pour voir si le virus pouvait se propager par contact direct ou par voie aérienne. Bien que des variants comme BA.1 et EG.5.1 se propagent bien, JN.1 ne l'a pas fait.

Malgré une chance d'infecter d'autres hamsters, JN.1 n'a pas réussi à se transmettre efficacement, ce qui suggère que ce variant a un comportement différent en matière de propagation par rapport aux autres.

Différences dans l'Entrée et la Réplication du Virus

Lorsque les chercheurs ont investigué à quelle vitesse les variants pénètrent dans les cellules, ils ont découvert que les variants Omicron récents avaient des capacités améliorées pour entrer dans les cellules humaines par rapport aux variants plus anciens. Ils ont utilisé une technique spéciale avec des pseudovirus imitant de vraies infections pour voir comment différents variants pouvaient infecter des cellules humaines et de hamster.

Les études ont montré que les nouveaux variants, en particulier JN.1, étaient moins dépendants de certaines protéines nécessaires à l'infection, indiquant qu'ils s'étaient adaptés pour infecter les cellules plus efficacement.

Comportement des Variants dans les Cellules Humaines

Pour mieux comprendre le comportement de ces variants dans les tissus humains, les scientifiques ont créé des cultures d'épithélium nasal humain, qui représente les voies respiratoires supérieures. Après avoir infecté ces cultures, ils ont constaté que tous les variants testés se reproduisaient bien, certains variants croissant plus rapidement que d'autres.

Les chercheurs ont également mesuré combien de dommages les variants causaient aux cellules. Il s'est avéré que la plupart des variants ne nuisaient pas significativement aux cellules, même s'ils se multipliaient rapidement, indiquant une adaptation continue pour coloniser les voies respiratoires.

Regard sur la Réponse Immunitaire

Un autre domaine de recherche important était la façon dont ces variants réagissent au système immunitaire humain. Le système immunitaire peut reconnaître des parties du virus et se défendre contre lui. L'étude a montré que différents variants avaient des capacités variables à stimuler le système immunitaire.

Le variant XBB.1.16 a été trouvé pour créer une réponse immunitaire plus forte par rapport aux autres, tandis que certains variants, comme Delta, ne déclenchaient pas une grande réponse. Cela suggère que les derniers variants Omicron pourraient mieux échapper à la détection immunitaire que les versions précédentes.

Conclusion

Dans l'ensemble, l'émergence des variants Omicron marque un changement significatif dans l'évolution de SARS-CoV-2. Alors que ces variants continuent d'évoluer, ils montrent des adaptations qui améliorent leur capacité à se reproduire dans les voies respiratoires supérieures tout en étant moins nuisibles aux poumons.

Ce changement soulève de nouvelles questions sur la façon dont ces modifications affecteront la façon dont le COVID-19 se propage et la nature des réponses immunitaires chez les personnes exposées ou vaccinées. La recherche continue est cruciale pour suivre ces variants et comprendre leurs implications pour la santé publique.

Les scientifiques surveillent de près ces développements pour fournir des informations qui pourraient aider à gérer la pandémie en cours. Comprendre comment ces variants se comportent aide à informer les stratégies de traitement et de vaccination, visant à protéger contre les maladies graves au fur et à mesure que le virus évolue.

Alors que le monde continue de faire face au COVID-19, l'évolution de ces variants jouera un rôle clé dans la façon dont la pandémie est gérée à l'échelle mondiale.

Source originale

Titre: Evolution of Omicron lineage towards increased fitness in the upper respiratory tract in the absence of severe lung pathology

Résumé: The emergence of the Omicron lineage represented a major genetic drift in SARS-CoV-2 evolution. This was associated with phenotypic changes including evasion of pre-existing immunity and decreased disease severity. Continuous evolution within the Omicron lineage raised concerns of potential increased transmissibility and/or disease severity. To address this, we evaluated the fitness and pathogenesis of contemporary Omicron variants XBB.1.5, XBB.1.16, EG.5.1, and JN.1 in the upper (URT) and lower respiratory tract (LRT). We compared in vivo infection in Syrian hamsters with infection in primary human nasal and lung epithelium cells and assessed differences in transmissibility, antigenicity, and innate immune activation. Omicron variants replicated efficiently in the URT but displayed limited pathology in the lungs compared to previous variants and failed to replicate in human lung organoids. JN.1 was attenuated in both URT and LRT compared to other Omicron variants and failed to transmit in the hamster model. Our data demonstrate that Omicron lineage evolution has favored increased fitness in the URT.

Auteurs: Vincent Munster, A. Wickenhagen, M. Flagg, J. Port, C. K. Yinda, K. Goldin, S. Gallogly, J. E. Schulz, T. Lutterman, B. Williamson, F. Kaiser, R. Mukesh, S. Van Tol, B. Smith, N. van Doremalen, C. Russell, E. de Wit

Dernière mise à jour: 2024-06-14 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598902

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598902.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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