Impact de l'ESCRT-I sur la dynamique énergétique cellulaire
Une étude montre comment l'ESCRT-I influence le métabolisme énergétique des cellules.
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Table des matières
- Sources d'énergie
- Rôle des Lysosomes
- Complexe ESCRT et métabolisme cellulaire
- Étude sur l'ESCRT et le métabolisme
- Effets sur le métabolisme Oxydatif
- Changements dans les voies glycolytiques
- Accumulation de lipides
- Fonction mitochondriale
- Production d'énergie
- Voies de signalisation
- Impacts de JNK et NFκB sur le métabolisme
- Inhibition de la dégradation lysosomale
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
Les cellules mammifères ont besoin d'énergie pour bien fonctionner et grandir. Elles obtiennent cette énergie grâce à des nutriments comme le glucose, les acides gras et les acides aminés. Ces nutriments passent par un processus appelé Métabolisme, où ils sont décomposés pour libérer de l'énergie. Une des premières étapes de ce processus consiste à créer une molécule appelée acétyl-CoA, qui joue un rôle clé dans la production d'énergie dans une partie de la cellule connue sous le nom de mitochondrie.
Sources d'énergie
En général, le glucose est la principale source d'énergie pour les cellules mammifères. Cependant, dans certaines situations, les cellules peuvent préférer utiliser des acides gras ou certains acides aminés à la place. Par exemple, lorsque le glucose n'est pas disponible, les cellules peuvent décomposer les acides gras grâce à un processus appelé β-oxydation pour obtenir de l'énergie.
Toutes les cellules n'utilisent pas le glucose de la même façon. Certaines cellules, comme les cellules souches, dépendent davantage d'un processus appelé Glycolyse, qui se produit en dehors des mitochondries dans le cytoplasme. La glycolyse décompose le glucose pour produire du pyruvate. Dans certains cas, comme avec les cellules souches, au lieu de convertir le pyruvate en acétyl-CoA, il est converti en lactate. Ce lactate peut être libéré de la cellule pour éviter qu'elle ne devienne toxique.
En plus des activités métaboliques normales, certains changements dans les conditions cellulaires peuvent modifier la façon dont les cellules utilisent de l'énergie. C'est ce qu'on appelle la reprogrammation métabolique. Par exemple, les cellules cancéreuses préfèrent souvent la glycolyse même quand l'oxygène est présent, un phénomène connu sous le nom d'effet Warburg. L'inflammation peut aussi entraîner un changement vers la glycolyse tout en inhibant la décomposition des acides gras.
Lysosomes
Rôle desDes études récentes suggèrent que le métabolisme cellulaire est étroitement lié à la fonction des lysosomes. Les lysosomes sont des structures cellulaires qui décomposent différents types de matériaux pris par la cellule. Ils digèrent des molécules externes qui entrent par un processus appelé endocytose, ainsi que des matériaux internes comme des organites endommagés par un processus appelé autophagie.
Quand les lysosomes dégradent certaines protéines, cela peut limiter leur capacité à envoyer des signaux à l'intérieur de la cellule, ce qui peut affecter les processus métaboliques. Ils jouent aussi un rôle dans le maintien des niveaux de divers nutriments comme les acides gras et les acides aminés, qui sont cruciaux pour la production d'énergie.
ESCRT et métabolisme cellulaire
ComplexeLes fonctions lysosomales peuvent être régulées par un groupe de protéines connues sous le nom d'ESCRT (complexes de tri endosomal nécessaires au transport). Ces protéines sont impliquées dans divers processus cellulaires, y compris le transport de matériaux vers les lysosomes. Quand la fonction de l'ESCRT est perturbée, cela peut entraîner des réponses de stress dans les cellules, ce qui peut encore affecter le métabolisme.
Une dysfonction de l'ESCRT peut provoquer une accumulation de certains récepteurs protéiques dans les cellules, menant à l'activation de voies de signalisation associées à l'inflammation. Cette inflammation peut influencer la façon dont les cellules métabolisent l'énergie, favorisant potentiellement des processus comme la glycolyse plutôt que l'oxydation.
Étude sur l'ESCRT et le métabolisme
Dans des expériences récentes, des chercheurs ont observé comment le manque de protéines ESCRT affecte les voies métaboliques dans les cellules. Ils ont spécifiquement étudié ce qui se passe lorsque deux composants clés du complexe ESCRT-I, TSG101 et VPS28, sont retirés des cellules. Ce retrait a entraîné des changements dans l'expression des gènes liés au métabolisme énergétique.
Oxydatif
Effets sur le métabolismeQuand les cellules manquaient d'ESCRT-I, les chercheurs ont constaté une diminution de l'expression des gènes responsables de la décomposition des acides gras et des acides aminés. Cela pourrait indiquer que moins d'énergie est produite à partir de ces nutriments quand l'ESCRT-I ne fonctionne pas correctement.
Une analyse approfondie a montré que plus de 800 gènes étaient régulés à la baisse en l'absence d'ESCRT-I, y compris de nombreux liés à la décomposition oxydative des acides gras et des acides aminés. Cela suggère que les cellules manquant d'ESCRT-I peuvent avoir des difficultés à générer de l'énergie par ces voies.
Changements dans les voies glycolytiques
Fait intéressant, les mêmes études ont montré une augmentation de l'expression des gènes impliqués dans la glycolyse lorsque l'ESCRT-I était absent. Des enzymes clés de la glycolyse comme HK2, ENO2 et PFKFB3 ont été trouvées en sur-expression dans les cellules manquant d'ESCRT-I. Cela indique que ces cellules peuvent changer leur mécanisme de production d'énergie, passant de l'oxydation des nutriments à la dépendance accrue à la glycolyse.
En conséquence, les chercheurs ont observé une augmentation des niveaux de lactate dans la cellule, qui est un sous-produit de la glycolyse. De plus, des mesures ont indiqué une augmentation de l'activité glycolytique globale dans les cellules manquant d'ESCRT-I.
Accumulation de lipides
Le manque d'ESCRT-I a également conduit à une accumulation de lipides au sein des cellules. C'est notable parce que l'expression réduite des gènes nécessaires à la décomposition des acides gras peut entraîner un stockage excessif de lipides. La recherche a montré des niveaux élevés d'acides gras libres et d'autres types de lipides, suggérant que le métabolisme lipidique a été significativement altéré dans ces cellules.
L'augmentation des gouttelettes lipidiques et les changements dans les structures membranaires au sein des cellules ont également été observés. Des endosomes et lysosomes élargis étaient évidents, ce qui semblait indiquer que la décomposition normale de ces lipides était altérée.
Fonction mitochondriale
Malgré les changements dans le métabolisme lipidique et le manque de certaines voies oxydatives, les chercheurs ont trouvé que la fonction mitochondriale n'était pas gravement altérée dans les cellules manquant d'ESCRT-I. En fait, il y avait une augmentation du nombre de mitochondries dans ces cellules, et elles pouvaient maintenir la production d'ATP.
Cependant, il a également été noté que ces mitochondries ne fonctionnaient pas toutes de manière optimale. Certaines mitochondries s'accumulaient et ne possédaient pas un potentiel membranaire adéquat, indiquant qu'elles pourraient ne pas être totalement fonctionnelles.
Production d'énergie
Bien que le taux global de production d'ATP soit resté stable, il y avait certaines préoccupations quant à l'efficacité de la production d'énergie de ces cellules. Les processus métaboliques semblaient se déplacer vers une utilisation plus efficace du glucose, avec une augmentation notable de l'activité glycolytique.
Les cellules manquant d'ESCRT-I parvenaient à maintenir leur production d'énergie grâce à un mélange de métabolisme oxydatif et de glycolyse, s'appuyant plus sur le glucose même lorsque le métabolisme des acides gras était compromis.
Voies de signalisation
L'étude s'est également concentrée sur l'identification des voies de signalisation impliquées dans ces changements métaboliques après le retrait de l'ESCRT-I. Il a été découvert que la signalisation générale de mTORC1, qui régule divers processus métaboliques, n'était pas significativement affectée. Cela suggère que la reprogrammation du métabolisme observée ne provenait pas de perturbations dans la signalisation de mTORC1.
Au lieu de cela, deux autres voies ont été impliquées : la voie NFκB et la voie JNK. L'activation de la signalisation NFκB était associée à une expression plus faible des gènes responsables de l'oxydation des acides aminés et des acides gras. En revanche, la signalisation JNK semblait jouer un rôle dans la promotion de l'expression des gènes glycolytiques.
Impacts de JNK et NFκB sur le métabolisme
L'activation de la signalisation NFκB a montré qu'elle inhibait l'expression des gènes importants pour le métabolisme oxydatif, suggérant que l'inflammation au sein de la cellule pourrait limiter sa capacité à traiter les acides gras et les acides aminés de manière efficace. Pendant ce temps, la signalisation JNK semblait encourager la glycolyse, suggérant un passage dans la façon dont les cellules génèrent de l'énergie lorsque l'ESCRT-I est dysfonctionnel.
Inhibition de la dégradation lysosomale
Pour mieux comprendre comment ces voies interagissent, les chercheurs ont traité les cellules avec une substance appelée Bafilomycin A1, qui inhibe la dégradation lysosomale. Ce traitement a imité les effets observés dans les cellules déficientes en ESCRT-I, entraînant une expression altérée des gènes métaboliques et une augmentation de l'accumulation lipidique.
Les résultats suggèrent que lorsque la dégradation lysosomale est altérée, cela peut entraîner des changements métaboliques qui ressemblent à ceux observés dans les cellules sans ESCRT-I fonctionnel. Cela renforce l'idée qu'une fonction lysosomale adéquate est cruciale pour maintenir un métabolisme cellulaire normal.
Conclusion
La recherche met en évidence la relation complexe entre le complexe ESCRT-I, la fonction lysosomale et le métabolisme cellulaire. Le changement de sources d'énergie des voies oxydatives vers la glycolyse en l'absence d'ESCRT-I ouvre des pistes pour une exploration plus approfondie de la régulation métabolique. Comprendre ces mécanismes pourrait fournir des éclairages sur diverses conditions, y compris le cancer et les troubles métaboliques, où le métabolisme énergétique joue un rôle critique.
En résumé, l'étude démontre que l'ESCRT-I joue non seulement un rôle dans la structure cellulaire et les voies de dégradation, mais influence également significativement la façon dont les cellules gèrent leur production d'énergie. L'équilibre entre le métabolisme oxydatif et la glycolyse semble être finement réglé par des facteurs tels que la fonction de l'ESCRT, l'inflammation et la disponibilité des nutriments. De futures recherches seront essentielles pour déchiffrer ces réseaux métaboliques complexes et leurs implications pour la santé et la maladie.
Titre: NF-kappaB and JNK pathways mediate metabolic adaptation upon ESCRT-I deficiency
Résumé: Endosomal Sorting Complexes Required for Transport (ESCRTs) are crucial for delivering membrane receptors or intracellular organelles for lysosomal degradation. Yet, how ESCRT dysfunction affects cell metabolism remained elusive. To address this, we analyzed transcriptomes of cells lacking TSG101 or VPS28 proteins, components of ESCRT-I subcomplex. ESCRT-I deficiency reduced the expression of genes encoding enzymes involved in oxidation of fatty acids and amino acids, and increased the expression of genes encoding glycolytic enzymes. Although depletion of ESCRT-I components did not impair mitochondrial biogenesis and ATP-linked respiration it caused intracellular accumulation of lipids and increased lactate production, hallmarks of aerobic glycolysis. Mechanistically, the observed transcriptional reprogramming towards glycolysis in the absence of ESCRT-I occurred due to activation of the canonical NF{kappa}B and JNK signaling pathways. Moreover, inhibiting lysosomal activity phenocopied the altered expression of metabolic genes and lipid homeostasis observed for ESCRT-I deficiency, indicating that ESCRT-I restricts glycolysis by mediating lysosomal degradation.
Auteurs: Jaroslaw Cendrowski, M. Wrobel, M. Mazur, B. Jary, S. Wang, M. Korostynski, A. Dziewulska, M. Rohm, A. Dobrzyn, A. Zeigerer, M. Miaczynska
Dernière mise à jour: 2024-06-13 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.12.598606
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.12.598606.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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