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Nouvelles perspectives sur l'interaction entre le HPV-18 et les cellules de la peau

Des recherches montrent comment certains facteurs de transcription influencent le comportement du HPV-18 dans les cellules de la peau.

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Les papillomavirus humains (HPV) sont des infections super courantes qui se propagent par contact sexuel. Ils sont connus pour causer plein de cancers, ce qui en fait une vraie préoccupation de santé mondiale. En gros, l'HPV est responsable d'environ 5 % des nouveaux cas de cancer chaque année, touchant des zones comme le col de l'utérus et d'autres endroits génitaux, ainsi que la gorge. Parmi les différents types d'HPV, les HPV-16 et HPV-18 sont particulièrement importants car ils représentent plus de 70 % des cancers du col de l'utérus.

Cycle de vie de l'HPV

L'HPV prospère dans les couches superficielles de la peau et des muqueuses. Son cycle de vie est étroitement lié au développement des cellules de la peau. Les infections par l'HPV commencent dans la couche basale des cellules cutanées, où le matériel génétique du virus existe en petite quantité. À mesure que les cellules se multiplient et montent, le virus commence à créer ses protéines, qui sont essentielles pour que le virus continue son cycle. Ces protéines, connues sous le nom de E6 et E7, aident les cellules infectées à éviter le processus normal de maturation cellulaire et leur permettent plutôt de continuer à se diviser.

L'activité de certaines régions d'ADN dans le génome de l'HPV influence fortement ce processus viral. Les chercheurs ont identifié divers éléments dans l'ADN de l'HPV qui peuvent augmenter ou diminuer l'expression de ces gènes importants, qui contrôlent la façon dont le virus interagit avec les cellules hôtes.

Rôle des Facteurs de transcription (FT) dans l'HPV

Les facteurs de transcription sont des protéines qui aident à réguler l'expression des gènes. Ils peuvent se lier à des sections spécifiques de l'ADN et soit promouvoir soit inhiber l'activité des gènes. Dans les infections par l'HPV, certains facteurs de transcription jouent des rôles vitaux en contrôlant le comportement du virus dans les cellules infectées.

Des recherches ont montré que de nombreux facteurs de transcription peuvent se fixer à des parties du génome HPV, en particulier dans une région connue sous le nom de région de contrôle longue (RCL). Parmi les facteurs de transcription bien connus qui ont été identifiés, on trouve Oct-1, TEF2, NF1, AP-1 et YY1. Cependant, il y a encore beaucoup de facteurs de transcription que les chercheurs n'ont pas encore bien explorés, surtout dans le contexte de leur influence sur HPV-18.

Focus de recherche : Identifier les FT clés

Pour comprendre la connexion entre les facteurs de transcription et le cycle de vie de l'HPV-18, les chercheurs ont voulu identifier les facteurs clés qui régulent le comportement du virus durant les différentes étapes de la croissance et de la Différenciation des cellules de la peau. Ils ont comparé les activités de liaison de 345 facteurs de transcription dans des cellules de peau non différenciées et différenciées. Ce processus a révélé 40 facteurs de transcription qui montraient des changements dans leur capacité de liaison lorsque les cellules subissaient une différenciation.

Parmi ces facteurs, quatre ont été sélectionnés pour une enquête plus approfondie : PAX6, HMGB1, NFE2 et FOXI. Ces facteurs de transcription n'avaient pas été suffisamment étudiés en ce qui concerne leur influence sur HPV-18 et la différenciation des cellules cutanées.

Les chercheurs ont utilisé des techniques de laboratoire spécifiques pour confirmer que PAX6, HMGB1 et NFE2 se lient directement à la RCL de l'HPV-18, soulignant leur rôle potentiel dans la régulation du cycle de vie du virus.

L'effet de la différenciation sur l'activité des FT

Dans le tissu cutané normal, la différenciation cellulaire se produit à mesure que les cellules de la peau mûrissent et montent à travers les couches. Pendant ce processus, les niveaux et les activités de différents facteurs de transcription peuvent changer de manière spectaculaire. Cela signifie que le même facteur de transcription peut avoir des effets différents sur l'activité de l'HPV selon que les cellules de la peau sont dans un état non différencié ou complètement différencié.

Par exemple, lorsque les chercheurs ont examiné comment PAX6, HMGB1, NFE2 et FOXI se comportaient dans des cellules différenciées par rapport à des cellules non différenciées, ils ont constaté que PAX6 et HMGB1 réduisaient généralement l'activité de l'HPV-18 dans les cellules non différenciées. En revanche, FOXI semblait activer l'expression de l'HPV-18, en particulier dans l'état non différencié.

Impact de E6 et E7 sur les facteurs de transcription

Les HPV à haut risque, en particulier l'HPV-18, produisent des protéines E6 et E7 qui peuvent interférer avec les processus normaux des cellules infectées. Ces onc protéines peuvent modifier la façon dont les facteurs de transcription fonctionnent, ce qui pourrait, à son tour, affecter l'activité virale et potentiellement contribuer au développement du cancer.

Lorsque les chercheurs ont étudié des cellules de peau qui avaient été immortalisées avec E6 et E7 de l'HPV-18, ils ont remarqué que ces facteurs étaient exprimés plus largement dans toutes les couches cellulaires, contrairement à l'expression limitée de ce qu'on trouvait dans les cellules de peau normales. Cela suggère que E6 et E7 pourraient jouer un rôle dans la perturbation de la différenciation et de la prolifération normales des cellules de la peau, permettant au virus de persister et menant potentiellement au cancer.

Méthodologie pour analyser les FT

Les chercheurs ont utilisé une série de techniques de laboratoire avancées pour explorer les connexions entre les facteurs de transcription, l'HPV et la différenciation des cellules de la peau. Ils ont utilisé des cultures cellulaires, où ils pouvaient manipuler à la fois des cellules de peau non différenciées et différenciées pour observer comment divers facteurs de transcription se comportaient.

Culture cellulaire

Les premières étapes consistaient à cultiver des cellules de peau dans des conditions spécifiques. La lignée cellulaire HaCaT, un modèle populaire pour étudier le comportement des cellules cutanées, a été utilisée dans cette recherche. Les chercheurs ont induit la différenciation dans ces cellules en utilisant du calcium, ce qui simule l'environnement naturel du tissu cutané où les cellules mûrissent et se superposent.

Extraction de protéines nucléaires

Pour étudier comment les facteurs de transcription se lient à l'ADN, les chercheurs ont extrait des protéines nucléaires des cellules de peau. Cela a été suivi par l'analyse des activités de liaison des facteurs de transcription à l'aide d'essais spécialisés qui permettent de détecter les interactions protéine-ADN.

Immunoprécipitation de la chromatine

Des essais d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) ont été réalisés pour identifier spécifiquement où les facteurs de transcription se lient dans le génome de l'HPV-18. Cette technique implique le cross-linking des protéines et de l'ADN, puis l'utilisation d'anticorps pour extraire la protéine d'intérêt avec son ADN attaché. Les chercheurs peuvent ensuite analyser l'ADN pour voir quelles régions étaient associées à des facteurs de transcription spécifiques.

Résultats de l'étude

Les résultats de l'étude ont mis en avant l'interaction complexe entre les facteurs de transcription et l'HPV-18. Ils ont montré que PAX6, HMGB1 et NFE2 sont des acteurs clés dans la régulation du cycle de vie viral, surtout durant la différenciation des cellules de la peau. Ils se lient directement à la RCL de l'HPV-18, ce qui est essentiel pour contrôler l'expression du virus.

Fait intéressant, alors que PAX6 et HMGB1 réprimaient généralement la transcription de l'HPV-18, FOXI semblait l'activer, surtout dans des cellules non différenciées. Cela suggère que le contexte de l'état cellulaire influence significativement la façon dont ces facteurs de transcription interagissent avec le virus.

Implications des résultats

Les conclusions de cette recherche ont des implications importantes. Comprendre comment les facteurs de transcription interagissent avec l'HPV-18 peut fournir des aperçus cruciaux sur le cycle de vie du virus et sa relation avec la différenciation des cellules de la peau. Ce savoir pourrait aider à développer des thérapies ciblées qui perturbent ces processus et pourraient offrir de nouvelles stratégies pour lutter contre les maladies liées à l'HPV, y compris le cancer.

Directions futures

Pour l'avenir, il est crucial de continuer à explorer les rôles de divers facteurs de transcription dans le cycle de vie de l'HPV. Il reste de nombreuses questions sans réponse sur la façon dont ces facteurs interagissent entre eux, comment ils influencent l'activité virale dans différents types de cellules, et comment ils pourraient changer en réponse à l'infection ou au traitement.

Les chercheurs devraient également envisager d'examiner d'autres types d'HPV à haut risque pour voir si des modèles similaires existent, car cela pourrait conduire à une compréhension plus large de la biologie de l'HPV et de ses implications pour la santé humaine.

Conclusion

En résumé, la recherche a mis en avant les rôles vitaux de certains facteurs de transcription dans la régulation de l'activité de l'HPV-18 en réponse à la différenciation des cellules de la peau. Les preuves suggèrent que ces facteurs influencent non seulement le cycle de vie viral, mais pourraient également interagir avec les onc protéines E6 et E7 de l'HPV, impactant le comportement cellulaire et contribuant potentiellement au développement du cancer. Comprendre ces mécanismes mieux pourrait ouvrir la voie à des traitements innovants et des stratégies préventives contre les maladies liées à l'HPV.

Source originale

Titre: Virus-host interaction: investigating novel transcription factors involved in coupling HPV life cycle and epithelial differentiation.

Résumé: High-risk human papillomavirus (HPV) causes almost all cervical cancer, and HPV-18 is the second most prevalent type. The HPV life cycle is intimately associated with the epithelial differentiation program, and the repertoire of cellular transcription factors (TFs) has a crucial role in coordinating viral gene expression across epithelial layers. We aimed to identify host TFs involved in the virus differentiation-dependent life cycle. We initially compared the DNA binding activity of 345 TFs in nuclear extracts of undifferentiated and high calcium-induced differentiated HaCaT cells. Next, we searched in silico for putative binding sites within the HPV-18 long control region (LCR) for the TFs affected by differentiation. Chromatin immunoprecipitation assays (ChIP) were used to assess direct binding of selected TFs, protein levels were evaluated by immunohistochemistry in rafts obtained from human foreskin keratinocytes (HFK) and HPV-18 E6/E7 immortalized HFK, and the impact upon LCR activity was measured in reporter assays. The binding activity of 40 TFs was influenced by differentiation among which 16 putative binding sites within the LCR were identified. We next focused our analysis in PAX6, HMGB1, FOXI1, and NFE2, and all bound to the LCR except FOXI1. Whether FOXI1 activates HPV-18 early promoter activity, PAX6, HMGB1, and NFE2 inhibit viral transcription in undifferentiated normal HFK in which these proteins are mostly expressed. Finally, HPV-18 E6/E7 impaired the normal expression of these TFs throughout epithelial layers. In conclusion, we describe the involvement of PAX6, HMGB1, NFE2, and FOXIl in coupling HPV-18 transcriptional regulation with the epithelia differentiation program, a key event for the productive HPV life cycle. Furthermore, these TFs may also be relevant for HPV-driven carcinogenesis. The identification of proteins involved in the differentiation-dependent HPV life cycle and viral induced transformation may contribute to unveiling novel therapeutic targets for HPV-related malignancies. Author SummaryHPV-16 and HPV-18 respond together for over 70% of cervical cancers. HPV infection is established in basal layers cells of the stratified epithelia and the viral life cycle is highly dependent on the epithelial differentiation program. In this study, we focused on identifying host transcription factors (TFs) involved in the finely tuned regulation of the HPV-18 differentiation-dependent life cycle. We initially screened 345 cellular TFs and found 40 with differential binding activity after differentiation, among which we chose to focus on PAX6, HMGB1, FOXI1, and NFE2. Besides investigating TFs binding to HPV-18 LCR in silico and with immunoprecipitation assays, we evaluated protein levels throughout epithelial layers and demonstrated that the impact of these TFs upon HPV-18 early promoter activity depends on the differentiation status of cells. Finally, we show that HPV-18 oncoproteins lead to abnormal expression of these TFs. Our results contribute to a clearer understanding of pivotal mechanisms governing spatiotemporal regulation of viral early transcription and open avenues for innovative therapeutic strategies for HPV-associated diseases.

Auteurs: Aline Lopes Ribeiro, V. T. Nunes, A. S. Caodaglio, R. A. Lima, J. S. Pereira Sobrinho, L. Sichero

Dernière mise à jour: 2024-06-22 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.21.599992

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.21.599992.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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