Le voyage génétique des crabes terrestres
Des recherches montrent comment les crabes terrestres s'adaptent aux environnements secs grâce à des changements génétiques.
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La plupart des grosses variétés de plantes et d'animaux dans le monde se trouvent sur terre. Mais en fait, toute la vie a commencé dans les océans. Même si beaucoup d'espèces sont passées de la mer à la terre, ce n'est pas courant. La plupart des espèces terrestres peuvent retracer leurs racines jusqu'à quelques ancêtres marins, comme certaines plantes et animaux. Ces ancêtres se sont adaptés à la terre et ont évolué en plein de formes différentes. Cette transition rare est super importante pour façonner la diversité de la vie qu'on voit aujourd'hui, et ça montre aussi que passer à la terre pose des défis significatifs pour les animaux. Ces défis changent presque tout sur la façon dont un animal vit.
Les scientifiques savent que certains changements génétiques ont aidé les animaux à s'adapter à la vie terrestre. Par exemple, des changements dans la façon dont les cellules produisent de l'énergie, gèrent l'eau et s'occupent des échanges gazeux étaient cruciaux pour cette transition. Les études suggèrent que des traits génétiques anciens et de nouveaux développements génétiques étaient essentiels pour que ces animaux prospèrent sur terre. Bien que des recherches antérieures aient examiné des espèces qui ont fait le saut vers la terre il y a longtemps, comme certains escargots et poissons, il reste encore des zones floues dans notre compréhension de comment les gènes jouent un rôle dans ces Adaptations.
Un groupe fascinant d'animaux, ce sont les crabes terrestres. Ces crabes sont uniques parce qu'ils ont réussi à passer plusieurs fois des environnements marins à la terre au cours des 100 derniers millions d'années. Au moins dix-sept lignées différentes de crabes se sont adaptées à la terre, développant des moyens similaires de faire face aux défis de vivre hors de l'eau. Comme l'air et l'eau sont très différents, les crabes terrestres montrent une gamme d'adaptations physiques et comportementales pour survivre dans leurs nouveaux habitats. Ces adaptations incluent la gestion de la perte d'eau, la respiration d'air, le contrôle de la température corporelle et la reproduction réussie.
Les différentes adaptations des crabes terrestres sont influencées par leurs modes de vie variés et les environnements spécifiques qu'ils habitent. Les chercheurs ont essayé de classer ces adaptations en grades selon à quel point les crabes sont proches de leurs ancêtres marins et l'étendue de leurs adaptations à la terre. Le premier grade comprend les crabes qui ont encore besoin d'être proches de l'eau, tandis que les grades supérieurs incluent les crabes qui peuvent vivre dans des environnements arides.
Un des plus gros défis pour les crabes terrestres, c'est de rester hydratés. Ils vivent surtout dans des zones tropicales chaudes et humides où ils risquent constamment de se dessécher. Ça veut dire qu'ils doivent développer des traits spéciaux pour éviter de perdre trop d'eau. Beaucoup de crabes terrestres ont réduit leurs branchies, qu'ils utilisent encore pour réguler l'eau et éliminer les déchets. Certains ont même développé des organes respiratoires supplémentaires pour les aider à respirer.
Malgré les recherches en cours, on ne comprend toujours pas totalement le rôle de l'Expression génétique dans l'adaptation des crabes terrestres à leur environnement. Il n'y a pas beaucoup de ressources génétiques disponibles pour ces crabes, ce qui rend difficile de lier des gènes spécifiques à certains traits. L'objectif de cette étude était d'examiner comment différentes espèces de crabes terrestres réagissent à la sécheresse et quels gènes sont impliqués dans ces réponses.
Pour ça, les chercheurs se sont concentrés sur trois espèces de crabes terrestres étroitement liées. Ils ont regardé comment ces crabes changeaient l'expression des gènes lorsqu'ils étaient exposés à des conditions de sécheresse stressantes. Ils pensaient que des gènes liés au mouvement de l'eau, à la gestion des déchets, et à la Production d'énergie montreraient des changements d'expression notables lorsque les crabes faisaient face à la déshydratation.
Les chercheurs voulaient aussi voir si des gènes qui fonctionnaient ensemble montraient des patterns liés à leur degré d'adaptation à la terre ou à leur proximité génétique. Ils ont aussi examiné si les gènes impliqués étaient nouveaux ou venaient de familles de gènes anciens qui ont évolué au fil du temps.
L'étude a impliqué la collecte d'échantillons de crabes vivant dans différents habitats. Les crabes sélectionnés étaient gardés dans des conditions contrôlées et ensuite exposés progressivement à moins d'eau. Des échantillons étaient prélevés à différents moments pour évaluer comment l'expression des gènes changeait au cours du processus. Cela a aidé les chercheurs à voir comment chaque espèce gérait le stress de vivre sur terre.
Collecte d'échantillons et conditions expérimentales
Les crabes ont été collectés dans différents endroits. Une espèce a été prise dans un ruisseau d'eau douce, une autre dans des forêts côtières sèches, et la troisième a été achetée dans le commerce. Tous les crabes étaient gardés dans des conteneurs de taille similaire sous des niveaux de température et d'humidité contrôlés pour assurer des conditions constantes durant l'expérience.
Après avoir passé du temps dans l'installation expérimentale, les crabes ont été exposés à des conditions qui augmenteraient progressivement leur sécheresse pour simuler les défis rencontrés dans leurs habitats naturels. Des échantillons ont été prélevés à divers moments pendant l'expérience pour évaluer les changements d'expression génétique qui se produisaient durant les conditions sèches et après être revenus dans un environnement humide.
Analyse des changements d'expression génétique
Une fois les échantillons collectés, les scientifiques ont examiné l'ARN pour comprendre quels gènes étaient actifs selon les différentes conditions. En comparant la quantité d'expression génétique à plusieurs moments, ils ont pu voir quels gènes réagissaient à la perte d'eau. Différents patterns d'expression ont été notés pour chaque espèce de crabe.
Les premières découvertes ont montré qu'une espèce, Tuerkayana celeste, a fortement réagi à la sécheresse dans ses branchies, indiquant une réponse de stress significative. Une autre espèce, Gecarcoidea natalis, a aussi montré un changement notable dans l'activité génique dans ses branchies, tandis que la troisième espèce, Tuerkayana magna, a présenté une réponse plus modérée.
À mesure que le stress de séchage augmentait, certains gènes liés à la production d'énergie et à la fonction cellulaire étaient activés. Cela indique que ces crabes se concentraient probablement sur des processus essentiels pour survivre au stress. Quand ils sont revenus à des conditions humides, l'expression des gènes a continué à changer, montrant des réponses de récupération dans leurs branchies et d'autres tissus.
Patterns de co-expression et perspectives évolutives
En regroupant les gènes en modules de co-expression, les chercheurs ont pu évaluer les relations évolutives entre les crabes. Ils ont découvert que certains patterns d'expression génétique étaient fortement influencés par l'histoire évolutive des espèces. Les espèces plus étroitement liées montraient des réponses similaires, soulignant l'impact d'ancêtres communs.
Fait intéressant, bien que certains gènes aient montré des patterns similaires entre les espèces, d'autres montraient des signes d'adaptation à différents modes de vie. Par exemple, les crabes vivant dans des environnements plus secs avaient tendance à avoir des gènes qui étaient activement exprimés pour les aider à prospérer malgré une disponibilité limitée d'eau. Ces résultats suggèrent que différentes adaptations sont nécessaires selon les défis spécifiques que chaque espèce rencontre dans son habitat.
Le rôle des gènes anciens et nouveaux
L'étude a aussi révélé que beaucoup des gènes actifs n'étaient pas juste des gènes anciens mais incluaient aussi des gènes nouveaux qui ont peut-être évolué spécifiquement pour la vie terrestre. Par exemple, certains gènes liés à la synthèse des protéines et à la production d'énergie étaient cruciaux en réponse à la déshydratation, ce qui souligne l'importance des traits génétiques hérités et nouvellement développés pour la survie.
Cette combinaison de vieux et de nouveaux gènes montre comment les crabes peuvent s'adapter à la vie terrestre en utilisant les deux chemins. Certains gènes anciens sont vitaux pour des fonctions biologiques essentielles, tandis que les gènes nouveaux apportent une polyvalence supplémentaire pour faire face aux défis uniques posés par leurs environnements.
Conclusions et perspectives futures
La recherche a souligné les adaptations génétiques complexes des crabes terrestres à la vie sur terre. En se concentrant sur la façon dont l'expression des gènes change en réponse à la sécheresse, les scientifiques peuvent mieux comprendre les mécanismes génétiques qui permettent à ces animaux de survivre hors de l'eau. Ces connaissances pourraient ouvrir la voie à d'autres études pour explorer comment d'autres animaux marins pourraient s'adapter à la terre.
Les informations recueillies peuvent être utiles pour des recherches ultérieures sur la façon dont les environnements changeants peuvent influencer l'évolution de diverses espèces. Alors que la planète continue de changer, des études comme celles-ci éclairent l'importance de l'adaptabilité génétique et de la résilience face aux défis environnementaux.
Grâce à des recherches plus approfondies et une meilleure compréhension génétique, les scientifiques espèrent découvrir les détails complexes de comment différentes espèces s'ajustent et prospèrent continuellement dans divers habitats. En appréciant les façons dont la vie peut s'adapter, on peut obtenir des aperçus plus profonds sur l'histoire continue de l'évolution sur Terre.
Titre: Transcriptomic responses of gecarcinid land crabs to acute and prolonged desiccation stress
Résumé: Decapod crabs have repeatedly and convergently colonized land. Because of their aquatic ancestry, desiccation is their greatest physiological challenge, yet the genetic basis of their responses to desiccation are unknown. For this study, we sought to identify osmoregulatory genes that were differentially expressed in their antennal glands and posterior gills in response to desiccation stress. We dehydrated and tracked gene expression across three confamilial species displaying increasing degrees of terrestrial adaptation: Tuerkayana celeste, T. magna, and Gecarcoidea natalis. We observed acute dramatic upregulation in the posterior gills of T. celeste and G. natalis and a more muted response in T. magna; however some genes with known osmoregulatory functions were downregulated throughout the trial. We also found that some modules of orthologous genes with correlated expression were associated with greater degrees of terrestriality whereas others reflected shared ancestry, suggesting that different parts of the transcriptome are under varying degrees of terrestrial selective pressure. Finally, while differentially expressed genes were likely to be conserved across the three species, genes from expanded gene families and species-specific genes may also play a role in how land crabs adapt to the unique selective challenges that accompany a terrestrial life.
Auteurs: Victoria M Watson-Zink, R. K. Grosberg, J. Lai, R. Bay
Dernière mise à jour: 2024-07-05 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.03.601969
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.03.601969.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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