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Comprendre l'évolution adaptative grâce au changement génétique

De nouvelles recherches montrent comment les changements génétiques influencent l'évolution.

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L'évolution adaptative, c'est comment les organismes vivants changent avec le temps pour mieux s'adapter à leur environnement. Ces changements peuvent toucher leurs traits physiques et leurs comportements. Parfois, ces changements sont bons pour les gens, l'agriculture ou l'industrie, et d'autres fois, ils peuvent être nuisibles. Mais prédire comment ces changements vont se produire, c'est pas simple.

Un des problèmes pour prédire ces changements, c’est que les effets des nouvelles MutationsGénétiques peuvent varier énormément selon la composition génétique de l'organisme, l'environnement où il vit, ou un mix des deux. Ça veut dire que la même mutation peut avoir des résultats différents selon le contexte d’où elle vient ou les conditions auxquelles elle fait face.

La complexité des interactions génétiques

La plupart des études passées se sont concentrées sur comment des changements génétiques spécifiques influencent des traits liés à la survie et à la reproduction. Ces changements peuvent être influencés par le bagage génétique de l'organisme et son environnement. Bien comprendre ces détails peut aider à prédire comment l'évolution pourrait se dérouler, mais c’est compliqué parce qu'il y a plein d'interactions possibles. Plus il y a de changements génétiques, plus le nombre d'interactions peut dépasser ce que les chercheurs peuvent gérer.

Certains chercheurs pensent qu’une approche plus large pourrait mieux marcher. Au lieu de se focaliser sur des mutations individuelles, ils suggèrent de voir comment les effets des mutations diffèrent selon les groupes d'organismes et les Environnements. Cette vision plus large pourrait être plus pratique pour faire des prédictions sur l'évolution.

Des études récentes montrent que beaucoup de mutations rendent les traits d'un organisme moins extrêmes, ce qui est un modèle courant pour des traits complexes. Ça veut dire que les chercheurs pourraient être capables d'estimer comment des mutations individuelles vont se comporter sans avoir à examiner toutes les interactions possibles. Si la plupart des mutations montrent cette tendance à être moins extrêmes, ça pourrait aider à simplifier les prévisions sur leurs effets.

Mesurer les effets génétiques

Pour tester ces idées, des scientifiques ont fait une expérience avec un type de levure. Ils ont mesuré comment environ 100 changements génétiques différents impactaient la croissance dans diverses souches de levure sous différentes conditions. La levure a été choisie parce qu'elle représentait un mélange de bagages génétiques et de stress environnementaux. Les chercheurs voulaient voir comment ces facteurs influençaient les Taux de croissance.

Pour déterminer si les mutations étaient bénéfiques ou nuisibles, ils ont établi un standard pour ce à quoi ressemblerait un changement neutre. Ils ont découvert que les effets des mutations sur la croissance variaient énormément, certaines mutations ralentissant la croissance et d'autres l'accélérant. Notamment, aucune mutation n’a été trouvée comme étant systématiquement utile ou nuisible dans toutes les souches et environnements, ce qui indique que la plupart des mutations ont des effets dépendants du contexte.

Épistasie globale et taux de croissance

Une théorie appelée épistasie globale suggère qu'à mesure que la forme physique ou le taux de croissance d'un organisme diminue, les effets des mutations pourraient changer. En gros, si une souche ne grandit pas bien, elle pourrait avoir plus de mutations bénéfiques disponibles. Ce lien a été observé dans l'étude sur la levure, où la proportion de mutations bénéfiques augmentait dans les souches à croissance plus lente.

Les chercheurs ont utilisé un modèle statistique pour comprendre comment les changements génétiques affectaient les taux de croissance dans différents environnements et bagages. Ils ont trouvé que le modèle était efficace pour prédire comment les mutations se comporteraient dans diverses situations, expliquant une grande partie de la variation des effets des mutations.

Modèles à travers les environnements

En examinant comment les mutations se comportaient dans différents environnements, les chercheurs ont remarqué que certains modèles émergeaient. L'impact des mutations était largement similaire, peu importe l'environnement. Ça veut dire que même si les conditions environnementales peuvent changer les taux de croissance globaux, la façon dont les mutations influencent la croissance ne varie pas beaucoup d'un cadre à l'autre.

Cette cohérence est utile parce qu'elle suggère que les scientifiques peuvent utiliser les résultats d'un environnement pour prédire comment les mutations pourraient se comporter dans un autre. Cependant, les effets réels pourraient encore varier à cause de facteurs imprévisibles qui n'ont pas été pris en compte dans le modèle.

Implications pour la distribution des effets sur la forme physique

Au fur et à mesure que les chercheurs récoltaient plus de données, ils voulaient comprendre comment ces modèles affectaient la forme physique globale des souches de levure. Ils ont découvert que les effets typiques des mutations variaient avec les conditions de croissance des souches. Plus précisément, ils ont constaté que l'effet moyen des mutations avait tendance à diminuer quand le taux de croissance était faible.

Les mutations variaient énormément dans leurs effets, et cette variabilité était prédite pour suivre certains modèles. Les chercheurs ont noté qu'à mesure que les conditions changeaient, la distribution globale de la façon dont les mutations affectaient la forme physique changeait aussi. Ça veut dire que différents environnements entraînaient différentes chances que les mutations soient bénéfiques ou nuisibles.

L'importance des taux de croissance

Une découverte clé était que l'environnement semblait influencer un paramètre spécifique connu sous le nom de taux de croissance pivot. Ce taux indiquait les conditions auxquelles l'effet d'une mutation typique passerait de positif à négatif. Les chercheurs ont trouvé qu'ils pouvaient prédire la distribution des effets sur la forme physique en se basant sur ce taux de croissance pivot.

En examinant différentes souches de levure dans divers environnements, les chercheurs ont confirmé que les souches avec des taux de croissance similaires avaient des réponses plus comparables aux mutations. Ça suggère que comprendre le taux de croissance pourrait aider à prédire comment les mutations vont affecter la forme physique à travers différents bagages génétiques et environnements.

Implications plus larges

Les résultats de cette recherche ont plusieurs implications potentielles. Dans le domaine de la génétique, de meilleures prévisions sur comment les mutations affectent les traits pourraient mener à des avancées dans l'amélioration des cultures et l'élevage des animaux. En conservation, comprendre comment des organismes à faible forme physique peuvent encore avoir accès à des mutations bénéfiques pourrait aider dans les efforts pour protéger les espèces menacées.

De plus, en biologie évolutive, les résultats pointent vers une potentialité de similarité dans la manière dont les mutations affectent généralement la forme physique à travers différents organismes et conditions. Ça pourrait aider à expliquer pourquoi les stratégies évolutives semblent souvent similaires à travers des formes de vie diverses.

Directions futures

Même si ces résultats s'alignent bien avec les théories existantes, d'autres recherches sont nécessaires pour voir s'ils s'appliquent largement à travers différents organismes, types de changements génétiques et conditions environnementales. Les scientifiques sont désireux d'explorer cette régularité dans des situations plus extrêmes ou dans des cas où des processus biologiques spécifiques sont ciblés.

Au final, la recherche éclaire la question classique de comment divers facteurs façonnent la performance et l’adaptation des organismes. L'idée que les interactions génétiques peuvent limiter la complexité de la manière dont les traits sont hérités offre une nouvelle perspective sur les dynamiques évolutives. Ça ouvre des avenues excitantes pour les scientifiques pour enquêter sur les contraintes biologiques qui guident l'évolution et comment elles pourraient changer avec le temps.

En gros, l'évolution adaptative est un processus complexe influencé par plein de facteurs changeants. Les interactions entre les mutations génétiques et leurs effets peuvent être difficiles à prédire, mais de nouveaux modèles et recherches fournissent des aperçus précieux. En continuant d’étudier ces modèles et leurs implications, les scientifiques découvrent de plus en plus sur les processus fondamentaux qui animent la diversité de la vie sur Terre.

Source originale

Titre: Environment-independent distribution of mutational effects emerges from microscopic epistasis

Résumé: Predicting how new mutations alter phenotypes is difficult because mutational effects vary across genotypes and environments. Recently discovered global epistasis, where the fitness effects of mutations scale with the fitness of the background genotype, can improve predictions, but how the environment modulates this scaling is unknown. We measured the fitness effects of [~]100 insertion mutations in 42 strains of Saccharomyces cerevisiae in six laboratory environments and found that the global-epistasis scaling is nearly invariant across environments. Instead, the environment tunes one global parameter, the background fitness at which most mutations switch sign. As a consequence, the distribution of mutational effects is predictable across genotypes and environments. Our results suggest that the effective dimensionality of genotype-to-phenotype maps across environments is surprisingly low. One Sentence SummaryThe effects of mutations on microbial growth rate follow a pattern of global epistasis that is invariant across environments.

Auteurs: Sergey Kryazhimskiy, S. Ardell, A. Martsul, M. S. Johnson

Dernière mise à jour: 2024-07-09 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.18.567655

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.18.567655.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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