Nouvelle technique d'imagerie pour analyser les matrices de silice
Une étude révèle une méthode assistée par THz pour enquêter sur des matrices de silice sans abîmer les biomolécules.
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Table des matières
- Qu'est-ce que la tomographie par sonde atomique assistée par THz ?
- Caractéristiques clés de l'étude
- Le besoin de techniques d'imagerie avancées
- Comment les lasers THz aident
- L'importance de l'analyse chimique en biologie
- Un nouveau modèle computationnel
- Investigations expérimentales
- Résultats sur les matrices de silice
- Le rôle de la dynamique électronique
- Techniques expérimentales utilisées
- Observations de la spectrométrie de masse
- Implications pour la recherche future
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
Cet article parle d'une étude qui utilise une nouvelle technique, la tomographie par sonde atomique assistée par THz (APT), pour analyser des matrices de silice conçues pour encapsuler des Biomolécules. L'objectif est d'obtenir des infos sur la Composition chimique et l'arrangement structurel de ces matrices sans abîmer les échantillons biologiques fragiles. C'est super important quand on étudie des molécules organiques molles comme les protéines.
Qu'est-ce que la tomographie par sonde atomique assistée par THz ?
La tomographie par sonde atomique assistée par THz est une technique d'imagerie avancée qui permet aux scientifiques d'obtenir des infos détaillées sur les matériaux au niveau atomique. En utilisant des lasers terahertz (THz), les chercheurs peuvent analyser les matrices de silice sans les chauffer significativement. C'est crucial pour préserver l'intégrité des matériaux biologiques sensibles.
Caractéristiques clés de l'étude
Dans cette étude, les scientifiques ont trouvé que des impulsions THz, combinées à un champ électrique stable, peuvent provoquer l'Évaporation contrôlée des matrices de silice. Cela permet une imagerie 4D, où trois dimensions de l'espace sont combinées avec des infos sur la composition chimique. La sensibilité chimique de cette méthode est similaire à celle de méthodes plus traditionnelles, comme l'APT assistée par laser UV.
Pour soutenir leurs résultats, les chercheurs ont créé un modèle computationnel en utilisant la théorie de la fonctionnelle de densité dépendante du temps (TDDFT). Ce modèle aide à comprendre comment le rayonnement THz interagit avec les matrices de silice, capturant les dynamiques complexes impliquées dans le processus.
Le besoin de techniques d'imagerie avancées
Des avancées significatives ont été réalisées dans les outils de visualisation des structures protéiques avec une très haute résolution. Des techniques comme la cristallographie aux rayons X et la microscopie électronique cryogénique ont été révolutionnaires en biologie et en médecine. Cependant, pour obtenir des insights plus profonds, il faut développer ces techniques 3D en méthodes 4D qui fournissent aussi des données sur la composition chimique.
L'APT est une approche prometteuse qui offre des capacités d'imagerie 4D. Cette technique fonctionne en contrôlant l'évaporation des atomes à partir d'échantillons très petits (nanométriques), permettant aux chercheurs d'atteindre une haute résolution spatiale et une sensibilité chimique. Un défi des méthodes APT traditionnelles, en particulier celles utilisant des lasers UV, est qu'elles peuvent chauffer les échantillons. Ce chauffage peut altérer les structures des matériaux biologiques délicats.
Comment les lasers THz aident
Pour surmonter les limitations des lasers UV, les chercheurs proposent d'utiliser des lasers THz. Ces lasers ne chauffent pas les échantillons biologiques et peuvent quand même fournir une haute résolution et sensibilité. L'étude met aussi en avant des avancées dans la préparation des échantillons en encapsulant des biomolécules dans une matrice de silice à température ambiante, créant un environnement stable pour la mesure.
Les chercheurs soulignent que l'utilisation de l'APT assistée par THz n'a pas été testée de manière exhaustive sur des matériaux avec de plus grands gaps de bande, comme la silice. Donc, ils croient qu'une étude approfondie de la façon dont les impulsions THz interagissent avec la silice est essentielle.
L'importance de l'analyse chimique en biologie
Une compréhension complète de la façon dont les impulsions THz interagissent avec les matrices de silice devrait ouvrir la voie à de nouvelles applications dans l'APT et d'autres techniques basées sur THz. Cela inclut des méthodes comme la spectroscopie dépendante du temps et la microscopie à effet tunnel scanné pilotée par THz.
Les approches computationnelles, comme la dynamique moléculaire (MD) et les méthodes ab initio, sont importantes pour comprendre comment l'APT peut être appliquée aux matériaux biologiques mous. Des simulations MD classiques ont été utilisées dans des études précédentes pour examiner comment les protéines s'incorporent dans leur environnement de silice. Cependant, pour étudier de manière complète l'émission d'ions induite par THz, les chercheurs doivent se pencher sur le comportement électronique des matériaux.
Un nouveau modèle computationnel
Cette étude introduit un modèle computationnel utilisant la TDDFT pour examiner comment la matrice de silice réagit à la fois à un champ électrique statique et à la lumière laser THz. Les chercheurs ont utilisé Si(OH) comme molécule modèle puisque c'est un précurseur pour fabriquer la matrice de silice.
Les chercheurs mettent l'accent sur la nécessité d'une approche dépendante du temps pour capturer les interactions entre la matrice de silice et la source THz. C'est crucial pour identifier les champs laser THz clés qui déclenchent l'évaporation des groupes hydroxyles dans Si(OH).
Investigations expérimentales
L'équipe a mené des expériences pour examiner les structures de la silice amorphe en utilisant un échantillon en forme d'aiguille nanométrique. Ils ont réussi à réaliser l'évaporation contrôlée de la silice en utilisant des impulsions THz combinées à un champ électrique statique stable.
La configuration pour l'APT incluait une surface de détection qui permettait une analyse détaillée par spectrométrie de masse, révélant la distribution spatiale et le timing des ions produits pendant l'évaporation. En contrôlant soigneusement le processus d'évaporation, les chercheurs ont pu reconstruire la structure atomique 3D et déterminer la nature chimique de l'échantillon.
Résultats sur les matrices de silice
L'analyse a révélé une petite diminution de la perte d'oxygène avec l'augmentation de la force du champ électrique, ce qui est en accord avec les prédictions des calculs numériques. Cela suggère que l'émission d'ions assistée par THz peut fonctionner efficacement dans des matériaux isolants.
L'équipe a aussi appris sur les états de charge des atomes évaporés, constatant que leurs simulations correspondaient bien aux spectres de masse observés. Les matrices de silice ont différents arrangements de liaison et défauts, ce qui en fait des matériaux complexes à étudier.
Le rôle de la dynamique électronique
La recherche a impliqué la simulation de la dynamique des atomes au sein de la matrice de silice sous des champs externes, capturant comment les atomes se comportaient lorsqu'ils étaient soumis aux champs THz et électriques statiques. L'étude a trouvé que la présence d'un champ électrique statique augmentait la probabilité d'évaporation pour certains atomes, spécifiquement l'hydrogène et l'oxygène.
L'équipe a noté qu'une intensité spécifique du champ THz était nécessaire pour induire l'évaporation. Ils ont déterminé que l'atome d'hydrogène pouvait être évaporé à des amplitudes de champ plus faibles que l'oxygène, qui nécessitait des champs plus forts.
Techniques expérimentales utilisées
Pour obtenir les échantillons de silice, les chercheurs ont utilisé une technique de prélèvement précise avec un microscope électronique à balayage à faisceau ionique focalisé. Cette méthode leur a permis de créer des échantillons fins et en forme d'aiguille pour l'analyse.
Les expériences ont été menées dans une chambre à ultra-haut vide sur mesure, maintenant une très basse pression pour empêcher la contamination. Les échantillons ont été refroidis à des températures spécifiques, et des champs électriques ont été appliqués pour améliorer le processus d'évaporation lorsqu'il était stimulé par des impulsions THz.
Observations de la spectrométrie de masse
L'équipe a utilisé des techniques avancées de spectrométrie de masse pour mesurer la composition chimique des échantillons de silice. Ils ont analysé le spectre de masse résolu spatialement, qui a révélé des pics majeurs correspondant au silicium et à l'oxygène, entre autres éléments.
Le spectre de masse indiquait la présence de divers ions, soulignant la nature complexe de la matrice de silice. Certains pics étaient en corrélation avec des ions moléculaires connus de silice, tandis que d'autres laissaient suggérer l'existence d'éléments supplémentaires qui avaient peut-être été introduits pendant le processus de préparation.
Implications pour la recherche future
L'étude démontre que l'APT assistée par THz peut analyser efficacement les propriétés structurelles et chimiques des matrices de silice utilisées pour l'encapsulation des biomolécules. Le faible chauffage associé aux techniques THz est un avantage significatif, permettant une imagerie haute résolution sans compromettre l'intégrité des échantillons sensibles.
Les résultats indiquent un changement dans la façon dont les matériaux peuvent être étudiés au niveau atomique, surtout pour des applications biologiques. Alors que les chercheurs continuent d'explorer ces techniques, ils anticipent de nouveaux développements dans la compréhension des dynamiques matérielles dans des contextes biologiques complexes.
Conclusion
En résumé, cette recherche met en avant le potentiel de l'APT assistée par THz pour fournir de nouvelles informations sur les caractéristiques structurelles et chimiques des matrices de silice pour encapsuler des biomolécules. En minimisant le chauffage des échantillons et en utilisant des techniques computationnelles avancées, l'étude ouvre la voie à une exploration plus poussée dans le domaine de l'imagerie biologique.
Le travail futur se concentrera sur l'étude de l'évaporation des ions moléculaires et du comportement des atomes d'oxygène chargés négativement, ce qui pourrait mener à une compréhension encore plus grande dans le domaine de la recherche biologique. L'approche interdisciplinaire adoptée dans cette étude ne fait pas seulement avancer les techniques de microscopie, mais promet aussi un large éventail d'applications en science des matériaux et en biologie.
Titre: Evaporation of cations from non-conductive nano-samples using single-cycle THz pulses: an experimental and theoretical study
Résumé: This study investigates the emission of cations from silica samples by single-cycle THz pulses, focusing on the influence of pulse polarity. Negative THz pulses were found to efficiently trigger the evaporation of cations from nanoneedles in amorphous silica samples compared to positive pulses. Conversely, this dependence on pulse polarity could not be found in samples with metallic behaviour such as LaB$_6$ and when multi-cycle pulses in different frequency ranges such as ultraviolet (UV) are used. First-principles simulations focus on silica under THz laser irradiation and show critical fields for ion evaporation of hydroxyl groups from Si(OH)$_4$, which serves as a model precursor molecule for the amorphous solid matrix. To explain our experimental results, we propose a simplified theoretical model that determines the role of the polarity of the THz pulse by taking into account the differences in electron mobility between silica and semi-metallic samples. The study explores the nonlinear microscopic mechanisms of atomic evaporation under external static and THz laser fields and clarifies the dynamics of THz-enhanced APT and related applications.
Auteurs: Matteo De Tullio, Giovanni Novi Inverardi, Michella Karam, Jonathan Houard, Marc Ropitaux, Ivan Blum, Francesco Carnovale, Gianluca Lattanzi, Simone Taioli, Gustav Eriksson, Mats Hulander, Martin Andersson, Angela Vella, Tommaso Morresi
Dernière mise à jour: 2024-09-30 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2403.04470
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2403.04470
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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